蔡明軒 魏兵 廖世峨 付金月 劉亞軍 李令雪
(中國(guó)人民解放軍北部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院,遼寧沈陽(yáng)110016)
支氣管哮喘(簡(jiǎn)稱哮喘)是一種以慢性氣道炎癥和氣道高反應(yīng)性為特征的異質(zhì)性疾病,也是兒童時(shí)期最常見(jiàn)的慢性氣道疾病之一[1]。哮喘的患病率呈逐年上升趨勢(shì),我國(guó)兒童哮喘發(fā)病率從1990年的0.91%至2010年的3.02%[2-3],近二十年間“翻了兩番”。2013年,一項(xiàng)國(guó)際研究發(fā)現(xiàn)6~7歲和13~14歲兒童哮喘的患病率已分別達(dá)到11.7%和14.1%[4]。哮喘已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問(wèn)題之一,然而哮喘的發(fā)病機(jī)制尚未明確,目前認(rèn)為哮喘是由基因與環(huán)境因素之間復(fù)雜的相互作用導(dǎo)致的多基因遺傳性疾病。越來(lái)越多的研究集中于哮喘的分子生物學(xué)和遺傳學(xué)上,預(yù)知基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)/單倍型與兒童哮喘易感性相關(guān)的研究成為熱點(diǎn)領(lǐng)域。
染色體5q31-q33是與哮喘有關(guān)的主要基因座之一,β2腎上腺素受體(β2-drenergic receptor,ADRB2)基因是一個(gè)由1 239個(gè)核苷酸組成的無(wú)內(nèi)含子區(qū),其位于5q31-q32的哮喘易感片段內(nèi)[5]。該基因大部分功能性啟動(dòng)子位于ATG起始密碼子上游549 bp片段內(nèi),該片段呈現(xiàn)多種遺傳多態(tài)性[6]。目前,對(duì)ADRB2基因SNP與哮喘的相關(guān)性研究多是位于編碼區(qū)多態(tài)性位點(diǎn)的研究,對(duì)ADRB2基因調(diào)控區(qū)SNP研究較少。單個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)作為疾病遺傳學(xué)指標(biāo)有一定的局限性,單倍型的分析比單個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)更適合哮喘表型的相關(guān)研究,國(guó)內(nèi)外有關(guān)ADRB2調(diào)控區(qū)單倍型與兒童哮喘表型的研究未見(jiàn)報(bào)道。我們擬研究中國(guó)東北地區(qū)漢族兒童ADRB2基因調(diào)控區(qū)rs11168070(-468C/G)、rs17108803(-839T/G)、rs2053044(-1023G/A)、rs12654778(-654G/A)、rs11959427(-367T/C)、rs2895795(-1429T/A)位點(diǎn)SNP/單倍型與兒童哮喘易感的關(guān)系,從而進(jìn)一步探索兒童哮喘的發(fā)病機(jī)制。
本研究為前瞻性研究,選取2016年10月至2020年10月就診于本院的哮喘急性發(fā)作期患兒152例,去除信息填寫(xiě)不詳者9例,共納入143例為哮喘組,均符合《兒童支氣管哮喘診斷與防治指南(2016年版)》的診斷標(biāo)準(zhǔn)[1]。入組年齡5~12歲,平均年齡(7.1±1.4)歲;女52例,男91例。根據(jù)哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重度分為輕度組61例,中重度組82例。對(duì)照組兒童選取同期于我院兒童保健診室體檢的健康兒童137例,年齡5~12歲,平均年齡(7.2±1.6)歲;女54例,男83例。所有入組兒童均為東北地區(qū)漢族兒童,三代內(nèi)無(wú)血緣關(guān)系,入組前4周無(wú)呼吸道感染史。哮喘組和對(duì)照組兒童年齡(t=0.781,P=0.435)和性別(χ2=0.277,P=0.599)差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。本研究經(jīng)本院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)[倫審Y(2020)054號(hào)],所有患兒家屬均簽署知情同意書(shū)。
應(yīng)用在線Primer3軟件設(shè)計(jì)引物,延伸引物用于單堿基延伸,引物信息見(jiàn)表1。
表1 引物信息
收集兩組受檢兒童靜脈血2 mL于EDTA抗凝管,存于-80℃冰箱待檢。DNA提取采用TIANGEN公司血液/細(xì)胞/組織基因組DNA提取試劑盒(離心柱型)。
采用SNaPshot SNP技術(shù),對(duì)ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行等位基因的檢測(cè),行三重PCR擴(kuò)增,取0.5 μL純化后的延伸產(chǎn)物,與0.5 μL片段化分析標(biāo)準(zhǔn)品及9 μL高度去離子甲酰胺混勻,于95℃變性5 min后放置于ABI3730XL測(cè)序儀上進(jìn)行測(cè)序,ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)電泳峰型見(jiàn)圖1~6,箭頭所指即為基因型所在位置,單個(gè)箭頭為純合型,兩個(gè)箭頭為雜合型。
圖1 rs2053044位點(diǎn)電泳峰型圖 A為GG基因型;B為GA基因型;C為AA基因型。
圖2 rs2895795位點(diǎn)電泳峰型圖 A為AA基因型;B為T(mén)A基因型;C為T(mén)T基因型。
圖3 rs12654778位點(diǎn)電泳峰型 A為GG基因型;B為GA基因型;C為AA基因型。
圖4 rs11168070位點(diǎn)電泳峰型圖 A為CC基因型;B為CG基因型;C為GG基因型。
圖5 rs11959427位點(diǎn)電泳峰型圖 A為T(mén)T基因型;B為T(mén)C基因型;C為CC基因型。
圖6 rs17108803位點(diǎn)電泳峰型圖 A為T(mén)T基因型;B為GT基因型。
采用SPSS 24.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)數(shù)資料采用例數(shù)和百分率(%)表示,率的比較采用卡方檢驗(yàn);應(yīng)用二元logistic回歸分析ADRB2基因6個(gè)位點(diǎn)SNP/單倍型與哮喘相關(guān)性,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。連鎖不平衡及單倍型分析采用Haploview軟件。運(yùn)用Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)以驗(yàn)證入組樣本的群體代表性,P>0.05為群體代表性好。
應(yīng)用Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)檢測(cè)兩組rs11168070、rs17108803、rs2053044、rs12654778、rs11959427、rs2895795位點(diǎn)的基因型頻率,哮喘組P值分別為1.000、1.000、0.448、0.448、1.000、0.377,對(duì) 照 組P值 分 別 為1.000、0.192、0.826、1.000、1.000、1.000,兩組研究樣本符合Hardy-Weinberg平衡定律,提示群體代表性好。
rs2895795、rs2053044和rs12654778位點(diǎn)基因型及等位基因頻率在兩組兒童中的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05),rs11168070、rs17108803和rs11959427位點(diǎn)基因型及等位基因頻率在兩組兒童中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)。進(jìn)一步經(jīng)二元logistic回歸分析顯示,rs2895795、rs2053044和rs12654778位點(diǎn)中攜帶A等位基因者患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)OR分 別 為0.443(95%CI:0.259~0.756)、2.124(95%CI:1.232~3.661)和2.087(95%CI:1.260~3.457)(表2)。
表2 ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因在兩組中的分布及l(fā)ogistic回歸分析[n(%)]
6個(gè)位點(diǎn)基因型在哮喘輕度組和中重度組分布的分析顯示,rs2895795和rs11168070位點(diǎn)基因型在病情嚴(yán)重程度組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);rs2053044、rs12654778、rs17108803和rs11959427位點(diǎn)基因型在輕度組和中重度組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表3。
表3 ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)基因型與兒童哮喘嚴(yán)重程度的關(guān)系[n(%)]
經(jīng)Haploview軟件分析發(fā)現(xiàn),哮喘組和對(duì)照組兒童ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)間均存在連鎖不平衡,連鎖強(qiáng)度見(jiàn)圖7,共構(gòu)成5種單倍型(表4),哮喘組中頻率最高的是TGTACT(42.7%)。單倍型TATGCT、TATGGC和AGTGCT的頻率在哮喘組和對(duì)照組分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別χ2=6.554、5.403、11.297,均P<0.05);通過(guò)二元logistic回歸分析結(jié)果顯示,其中單倍型TATGCT和TATGGC患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)OR分別為1.792(95%CI:1.142~2.812,P<0.05)和1.946(95%CI:1.102~3.438,P<0.05);單倍型AGTGCT患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)OR為0.523(95%CI:0.357~0.765,P<0.05)。
表4 ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)單倍型與哮喘的logistic回歸分析[n(%)]
圖7 連鎖不平衡強(qiáng)度圖 白色小方框中數(shù)值為連鎖不平衡系數(shù)(D')的百分?jǐn)?shù),數(shù)值越大表示連鎖性越強(qiáng),沒(méi)有數(shù)值表示D'=1,代表完全連鎖不平衡。數(shù)字1、3、4、5、6、7代表位點(diǎn)在基因片段上所在位置順序。
單倍型TATGCT和AGTGCT頻率在輕度組和中重度組間分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別χ2=6.075、4.858,均P<0.05),其中單倍型TATGCT在中重度組分布頻率較輕度組高,為輕度組的1.885倍,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.075,P<0.05);單倍型AGTGCT在輕度組分布頻率較中重度組高,為中重度組的1.671倍,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.858,P<0.05);單倍型TATGGC、AGGGCT和TGTACT分布頻率在兩組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表5。
表5 ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)單倍型在哮喘不同嚴(yán)重程度中的分布[n(%)]
哮喘是一種病因復(fù)雜具有異質(zhì)性的慢性呼吸系統(tǒng)疾病,其發(fā)病機(jī)制被認(rèn)為是全球性醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的難點(diǎn)問(wèn)題。伴隨研究的逐漸深入,大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為哮喘是由遺傳因素和環(huán)境因素長(zhǎng)期相互作用所致,其中遺傳因素約占48%~79%[7-8]。Khan等[9]針對(duì)雙胎和有兄弟姐妹的家庭進(jìn)行研究,結(jié)果顯示哮喘的遺傳方式不遵循孟德?tīng)栠z傳學(xué)定律,表現(xiàn)為家庭聚集的趨勢(shì)。ADRB2在肺組織、支氣管平滑肌細(xì)胞和支氣管上皮細(xì)胞中高度表達(dá)并調(diào)節(jié)肺功能,ADRB2基因SNP/單倍型可以改變ADRB2的功能[10-13]。ADRB2基因5’調(diào)控區(qū)內(nèi)含開(kāi)放性閱讀框架,編碼ADRB2基因上游啟動(dòng)子區(qū)的一個(gè)多肽,已證明該區(qū)域有個(gè)常見(jiàn)的SNP,即-47位點(diǎn)上的C突變?yōu)門(mén),導(dǎo)致編碼的第19位精氨酸變?yōu)榘腚装彼幔?4]。
本研究分析ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感性的關(guān)系,rs2895795位點(diǎn)檢測(cè)出TT、TA和AA 3種基因型,與Cai等[15]研究新疆哈薩克族和維吾爾族人群ADRB2調(diào)控區(qū)基因多態(tài)性結(jié)果一致,其中AA基因型在哮喘組中明顯低于對(duì)照組,提示rs2895795位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感相關(guān),次等位基因A降低兒童患哮喘的風(fēng)險(xiǎn),是兒童哮喘易感的保護(hù)性因素,我們推測(cè)可能由于次等位基因A參與了正向調(diào)節(jié)ADRB2基因啟動(dòng)子活性,使ADRB2活性及表達(dá)增加。本研究rs2053044位點(diǎn)檢測(cè)出G和A兩種等位基因,次等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)在哮喘組和對(duì)照組兒童中有明顯差異,攜帶次等位基因A且為AA基因型時(shí)兒童患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)增高,提示次等位基因A與兒童哮喘易感相關(guān),是兒童哮喘的危險(xiǎn)因素,與Skouen等[16]的研究結(jié)果相似,但de Souza Tesch等[17]對(duì)巴西人群ADRB2基因rs2053044位點(diǎn)SNP分析時(shí)未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)SNP改變ADRB2基因的表達(dá),考慮結(jié)論差異可能與地域因素有關(guān)。本研究中rs17108803位點(diǎn)只檢測(cè)出TT和GT兩種基因型,未檢測(cè)到GG基因型,TT和TG基因型頻率在哮喘組和對(duì)照組分布無(wú)差異,提示該位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感不相關(guān)。rs12654778位于ADRB2基因上游654 bp處,存在GG、GA和AA 3種基因型,MAF分布在哮喘組和對(duì)照組兒童中有顯著差異,與Li等[18]研究結(jié)論相似,本研究提示rs12654778位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感相關(guān),攜帶次等位基因A且為AA基因型時(shí)兒童患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)增高。rs11168070位點(diǎn)有CC、CG、GG 3種基因型,分析得出該位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感不相關(guān),Sio等[19]研究316名亞洲人群中發(fā)現(xiàn)rs11168070位點(diǎn)G等位基因增強(qiáng)了ADRB2的表達(dá),這與研究結(jié)果不一致,考慮可能與種族差異和樣本量大小有關(guān)。本研究rs11959427位點(diǎn)共檢測(cè)出TT、CT和CC 3種基因型,未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感相關(guān)。
本研究顯示rs2895795和rs11168070位點(diǎn)SNP在輕度組和中重度組有明顯差異,表明上述2個(gè)位點(diǎn)與哮喘病情嚴(yán)重程度相關(guān)。這與Ramphul等[20]關(guān)于毛里求斯、印度和中國(guó)3個(gè)不同地域的385名哮喘兒童ADRB2基因調(diào)控區(qū)SNP影響ADRB2啟動(dòng)子的活性導(dǎo)致該基因差異性表達(dá)的研究結(jié)果相似。但不同的是,陳慧芬等[21]研究未發(fā)現(xiàn)ADRB2基因多態(tài)性位點(diǎn)與哮喘病情嚴(yán)重程度有關(guān)。一項(xiàng)基于歐洲人群的多中心縱向隊(duì)列研究通過(guò)隨訪604名哮喘患兒10年發(fā)現(xiàn)ADRB2基因SNP與哮喘病情嚴(yán)重程度有關(guān)[22]。本研究中rs11168070位點(diǎn)SNP與兒童哮喘易感不相關(guān),進(jìn)一步分析時(shí)發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)SNP與兒童哮喘病情程度相關(guān),考慮該位點(diǎn)可能參與了某種未知的機(jī)制,從而改變了ADRB2基因的表達(dá)。本研究并未發(fā)現(xiàn)rs11959427、rs17108803、rs12654778和rs2053044位點(diǎn)SNP與哮喘病情程度有關(guān)。
連鎖不平衡又稱為等位基因關(guān)聯(lián),是指同一條染色體上的兩個(gè)等位基因非隨機(jī)相關(guān)。目前對(duì)單倍型的研究較少,中國(guó)人群和其他種族人群之間與哮喘易感性有關(guān)的單倍型頻率存在差異[23-24]。一項(xiàng)針對(duì)墨西哥人群中421名哮喘兒童和430名健康兒童的病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)ADRB2基因AGGACC、AGGAAG、TGAGAG、AGGAAC和AAGGAG單倍型與兒童時(shí)期哮喘易感性有關(guān)[25]。Liu等[26]基于中國(guó)漢族人群ADRB2基因研究得出單倍型CCGGC促進(jìn)了哮喘發(fā)生的結(jié)論。Akparova等[27]在哈薩克族人群中分析ADRB2基因16和27多態(tài)性位點(diǎn)組成的單倍型時(shí)發(fā)現(xiàn)Arg16Gly/Gln27Gln和Arg16Gly/Gln27Glu單倍型在哈薩克族哮喘患者中更為常見(jiàn)。Chung等[28]針對(duì)2 979例白種人的病例對(duì)照研究顯示ADRB2基因上11個(gè)位點(diǎn)中有3個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)存在連鎖不平衡,構(gòu)成的單倍型ATA和AGG與哮喘易感性有關(guān)。Tian等[29]對(duì)298例哮喘兒童和304例健康兒童研究發(fā)現(xiàn)ADRB2基因47和79位點(diǎn)SNP構(gòu)成的單倍型可能增加兒童哮喘的易感性。Shah等[30]研究112例南印度人群ADRB2基因SNP與哮喘的發(fā)生時(shí)發(fā)現(xiàn)GGCG單倍型致哮喘的發(fā)生增加了3.1倍,GGCG單倍型與哮喘風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān)。本研究對(duì)ADRB2基因調(diào)控區(qū)6個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)構(gòu)成的單倍型進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)單倍型TATGCT、TATGGC和AGTGCT與兒童哮喘易感相關(guān),其中單倍型TATGCT是兒童哮喘的危險(xiǎn)因素,且TATGCT者患中重度哮喘較多,單倍型AGTGCT是兒童哮喘的保護(hù)因素,進(jìn)一步分析病情程度時(shí)發(fā)現(xiàn)攜帶AGTGCT單倍型者患哮喘的程度較輕,表明TATGCT和AGTGCT與哮喘嚴(yán)重程度相關(guān)。
ADRB2基因多態(tài)性廣泛存在于不同地域、不同種族人群中,其變異的復(fù)雜性和潛在性可能決定著哮喘的大量或部分表型,本研究發(fā)現(xiàn)ADRB2基因調(diào)控區(qū)SNP/單倍型與中國(guó)東北地區(qū)兒童哮喘易感性相關(guān),其構(gòu)成的單倍型TATGCT和TATGGC是兒童哮喘的危險(xiǎn)因素,為探討中國(guó)哮喘遺傳機(jī)制提供了循證醫(yī)學(xué)依據(jù)。但本研究樣本量相對(duì)較小,需加大樣本量做進(jìn)一步研究。此外,本研究?jī)H檢測(cè)了ADRB2基因調(diào)控區(qū)的6個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),并未對(duì)其他位置多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行分析和完整單倍型的研究,其他位置可能存在某些具有功能性的多態(tài)性位點(diǎn),多基因聯(lián)合研究對(duì)哮喘遺傳機(jī)制的揭示有重要的意義,或許可成為以后的研究方向。