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        多種遺傳標(biāo)記在一起同母異父半同胞關(guān)系鑒定中的綜合應(yīng)用

        2021-11-15 11:03:26陳婷婷孫麗娟馬婭萍杜應(yīng)雄葉峻杰
        中國(guó)生育健康雜志 2021年6期

        陳婷婷 孫麗娟 馬婭萍 杜應(yīng)雄 葉峻杰

        同胞關(guān)系分為同父同母的全同胞關(guān)系(full sibling,F(xiàn)S)和同父異母或同母異父的半同胞關(guān)系(half sibling,HS)。在同胞關(guān)系鑒定實(shí)際案件中,為了獲得可靠的鑒定結(jié)論,除了常染色體短串聯(lián)重復(fù)(short tandem repeat,STR)遺傳標(biāo)記的檢測(cè)外,還要增加其他遺傳標(biāo)記的檢測(cè)以獲得更多可靠的判定依據(jù)。本文在實(shí)際工作中受理一起同胞鑒定案例,由于當(dāng)事人敘述無(wú)法判別兩個(gè)被鑒定人是否為全或半同胞關(guān)系,根據(jù)案件的具體情況在進(jìn)行常染色體STR遺傳標(biāo)記檢測(cè)后,運(yùn)用狀態(tài)一致性評(píng)分法(identity by state,IBS)、ITO法和判別函數(shù)法多種判定方法,并聯(lián)合Y染色體STR遺傳標(biāo)記和線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)序列分析對(duì)案件中被鑒定人的關(guān)系進(jìn)行綜合分析判斷,獲得了可靠的結(jié)論。

        材料與方法

        1.材料:男子甲早年移居緬甸,現(xiàn)回國(guó)認(rèn)親,自述父母已故,國(guó)內(nèi)有一弟弟乙,甲委托本鑒定中心鑒定二者之間是否存在同胞關(guān)系。根據(jù)鑒定的需求,用特制的濾紙(flinders technology associates,F(xiàn)TA)卡采集甲和乙的血液樣本進(jìn)行檢驗(yàn)。

        2.方法:常染色體STR基因座分型使用PromegaPowerPlex?21試劑盒(Promega公司,美國(guó))進(jìn)行STR復(fù)合擴(kuò)增,Y染色體STR基因座使用ABI Yfiler plus(ABI,美國(guó))進(jìn)行STR復(fù)合擴(kuò)增;線粒體DNA測(cè)序檢測(cè)用針對(duì)mtDNA高變I 區(qū)(hypervariable segment-I,HVS-I)特異引物進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)純化后用BigDye?Terminator v3.1測(cè)序試劑盒(AB,美國(guó))進(jìn)行測(cè)序反應(yīng)。用ABI3500型遺傳分析儀(ABI,美國(guó))對(duì)PCR復(fù)合擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳,在GeneMapper ID-X 1.5軟件上分析數(shù)據(jù),得到基因分型結(jié)果。通過(guò)IBS法、ITO法和判別函數(shù)法進(jìn)行計(jì)算、分析。

        結(jié)果

        1.常染色體STR分型結(jié)果分析:

        (1)IBS法。甲和乙血樣的D3S1358等19個(gè)常染色體STR基因分型結(jié)果見(jiàn)表1。按照《生物學(xué)全同胞關(guān)系鑒定實(shí)施規(guī)范》[1],依據(jù)19個(gè)常染色體STR基因座的分型結(jié)果進(jìn)行全同胞關(guān)系鑒定時(shí),通過(guò)計(jì)算兩名被鑒定人間的累計(jì)狀態(tài)一致性評(píng)分(IBS),對(duì)被鑒定人之間是否存在生物學(xué)全同胞關(guān)系做出判斷。當(dāng)IBS≥22時(shí),傾向于認(rèn)為被鑒定人之間具有全同胞關(guān)系; 13

        表1 常染色體STR基因座分型結(jié)果及IBS值計(jì)算

        (2)ITO法。為進(jìn)一步明確甲與乙之間的同胞關(guān)系,依據(jù)常染色體STR基因分型結(jié)果,參照文獻(xiàn)[2]中的ITO法計(jì)算甲與乙全同胞指數(shù)(full sibling index,FSI)、半同胞指數(shù)(half sibling index,HSI)和FSI:HIS的值(表2)。FSI值為0.1720,HSI值為21.7010,FSI:HSI的值為0.0079。FSI≥19與FSI<1分別作為全同胞和無(wú)關(guān)個(gè)體的判斷標(biāo)準(zhǔn);以HSI≥19與HSI<1分別作為半同胞和無(wú)關(guān)個(gè)體的判斷標(biāo)準(zhǔn);當(dāng)FSI與HSI介于l~19時(shí)暫作為“無(wú)法判斷”;以FSI:HSI≥l與FSI:HSI<1分別作為全同胞和半同胞的判斷標(biāo)準(zhǔn)。本案中,甲與乙HSI>19,F(xiàn)SI:HSI<1,甲與乙傾向于半同胞親緣關(guān)系。

        表2 ITO法計(jì)算同胞關(guān)系指數(shù)結(jié)果

        (3)判別函數(shù)法。參照文獻(xiàn)[3]中建立的全同胞-半同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體判別函數(shù)法計(jì)算得甲與乙DFSi=27.9700,DHSi=29.6490,DRi=26.7830。全同胞-半同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體判別法則為Di(S)=max[DFSi、DHSi、DRi],即比較樣本的DFSi、DHSi、DRi,以最大D值所在的組為該樣本所屬組別。本案中,甲與乙最大D值為DHSI,支持甲與乙存在半同胞親緣關(guān)系。判別函數(shù)法判定結(jié)果和ITO法判定結(jié)果一致。

        2. Y-STR分型結(jié)果分析:為支持甲與乙之間半同胞關(guān)系,對(duì)甲與乙進(jìn)行Y-STR基因分型。Y染色體STR基因座是人類(lèi)的遺傳標(biāo)記,Y染色體為男性所特有,呈父系遺傳,即同一父系家族成員,Y-STR基因座基因分型相同。本案檢測(cè)25個(gè)Y-STR基因座,基因分型結(jié)果見(jiàn)表3。甲與乙的18個(gè)Y-STR基因座的基因分型不相同,根據(jù)遺傳規(guī)律,排除甲和乙來(lái)源于同一生父。

        表3 Y染色體STR基因座分型結(jié)果

        3.mtDNA 測(cè)序結(jié)果分析:進(jìn)一步分析甲與乙之間的關(guān)系,對(duì)甲與乙mtDNA序列進(jìn)行分析。mtDNA呈母系遺傳,同一母系個(gè)體的mtDNA序列相同,因此mtDNA序列分析技術(shù)作為STR分型技術(shù)的補(bǔ)充手段[4]。mtDNA序列不相同,排除存在母系遺傳關(guān)系;mtDNA序列相同,則不排除存在母系遺傳關(guān)系。甲與乙mtDNA高變I 區(qū)測(cè)序結(jié)果見(jiàn)表4。甲與乙在mtDNA HVS-I序列5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)上的基因型一致,根據(jù)遺傳學(xué)原理和遺傳規(guī)律,不排除甲與乙來(lái)自同一生母。綜合常染色體STR分型結(jié)果以及Y-STR分型結(jié)果,支持甲與乙為同母異父的半同胞關(guān)系。

        表4 mtDNA HVS-I測(cè)序結(jié)果

        討論

        同胞關(guān)系鑒定具有復(fù)雜性和特殊性[5],由于同胞之間不一定有必須的等位基因,因而同胞關(guān)系鑒定比較困難[6]。在實(shí)際案例中,會(huì)遇到被鑒定人不能明確是全同胞或者是半同胞親緣關(guān)系,采用多種遺傳標(biāo)記進(jìn)行檢驗(yàn),進(jìn)而運(yùn)用多種判定方法綜合分析得出結(jié)論就顯得非常重要[7]。

        本案中,父母已故無(wú)法參與檢驗(yàn),參與鑒定的人數(shù)較少,委托人無(wú)法明確哪種同胞鑒定,在確定二者的親緣關(guān)系時(shí)應(yīng)全面考慮全同胞、半同胞和無(wú)關(guān)個(gè)體3種可能的關(guān)系,所以常染色體STR分型結(jié)果運(yùn)用了3種不同計(jì)算分析方法進(jìn)行相互驗(yàn)證。《生物學(xué)全同胞關(guān)系鑒定實(shí)施規(guī)范》[1]適用于在雙親皆無(wú)情形下甄別生物學(xué)全同胞與無(wú)關(guān)個(gè)體關(guān)系,檢測(cè)19個(gè)STR基因座時(shí),該檢測(cè)系統(tǒng)的效能約為0.7500,得出的傾向性鑒定意見(jiàn)的準(zhǔn)確性不低于99%。本案甲與乙采用IBS法計(jì)算累計(jì)IBS值介于全同胞和無(wú)關(guān)個(gè)體的閾值之間,無(wú)法給出傾向性意見(jiàn)。在實(shí)施鑒定時(shí),若兩名被鑒定人間存在其他親緣關(guān)系(如半同胞、堂表親等),本規(guī)范不適用。因此鑒定人應(yīng)詳細(xì)了解被鑒定人間是否存在其它可能的親緣關(guān)系,注意適用范圍及系統(tǒng)效能,需要使用其他方法和增加遺傳標(biāo)記加以甄別和相互驗(yàn)證[8]。

        ITO法是計(jì)算兩個(gè)體有某種血緣關(guān)系的經(jīng)典方法,和判別函數(shù)法一樣可用于全同胞、半同胞、無(wú)關(guān)個(gè)體關(guān)系鑒定。研究表明,半同胞鑒定時(shí),單獨(dú)使用ITO法或判別函數(shù)法錯(cuò)判風(fēng)險(xiǎn)較大[3],且當(dāng)無(wú)法明確屬于哪種同胞鑒定,盲目錯(cuò)誤的選取計(jì)算公式可能會(huì)導(dǎo)致錯(cuò)誤的結(jié)論,因此需要運(yùn)用多種判定方法來(lái)相互驗(yàn)證結(jié)論。本案中,用ITO法與判別函數(shù)法計(jì)算得出的結(jié)果均傾向于甲與乙為半同胞親緣關(guān)系。相關(guān)文獻(xiàn)提示在全同胞-半同胞鑒定中,F(xiàn)SI:HIS值是一個(gè)有效的指標(biāo),有助于提高鑒定結(jié)論的準(zhǔn)確性[5]。本案中,經(jīng)過(guò)計(jì)算 FSI:HSI<1,支持甲和乙為半同胞關(guān)系。目前半同胞關(guān)系鑒定沒(méi)有明確的標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范,為了獲得嚴(yán)謹(jǐn)可靠的鑒定意見(jiàn),除進(jìn)行常染色體STR檢測(cè)外,還需其他遺傳標(biāo)記的支持[9-10]。

        性染色體STR由于其特殊的遺傳規(guī)律在半同胞關(guān)系鑒定中可提供有效的認(rèn)定或排除信息。本案被鑒定人均為男性,因此選擇增加Y染色體STR遺傳標(biāo)記檢驗(yàn),用來(lái)進(jìn)行父系親緣關(guān)系鑒定[11]。mtDNA呈母系遺傳[12],是常染色體或性染色體遺傳標(biāo)記的重要補(bǔ)充,可用來(lái)進(jìn)行母系親緣關(guān)系鑒定,無(wú)論被鑒定人的性別如何,在同母異父半同胞鑒定中具有排除能力。本案中,Y染色體STR基因分型結(jié)果不相同,排除了甲和乙來(lái)源于同一生父的可能,同時(shí)線粒體DNA高變I區(qū)多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果相同提示甲與乙來(lái)自同一生母,支持甲與乙為同母異父半同胞關(guān)系,這與常染色體STR分型檢測(cè)結(jié)果相互驗(yàn)證和補(bǔ)充。因此,應(yīng)用三種遺傳標(biāo)記進(jìn)而通過(guò)多種判定方法綜合分析得出甲和乙傾向于同母異父半同胞關(guān)系。

        同胞關(guān)系的鑒定結(jié)論有一定的風(fēng)險(xiǎn)和不確定性,盡可能多的檢驗(yàn)已知血緣關(guān)系的同胞,讓被鑒定人生母參與鑒定是提高鑒定有效性和可靠性的途徑[13]。當(dāng)鑒定實(shí)踐中遇到僅有兩個(gè)被鑒定人,且生母無(wú)法參與鑒定時(shí),除檢測(cè)常染色體STR位點(diǎn)外,還需增加Y-STR、X-STR和mtDNA等遺傳標(biāo)記,提高鑒定的嚴(yán)謹(jǐn)性和鑒定意見(jiàn)的可靠性。正確利用多種遺傳標(biāo)記和判定方法對(duì)半同胞關(guān)系的鑒定有著重要的意義。

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