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        Pi9基因分子標(biāo)記輔助選擇改良水稻不育系豐源A的稻瘟病抗性

        2021-11-01 07:04:16吳婷婷陳海龍李博文賴怡帆鄒玉瑩車凡昊劉金靈劉雄倫
        華北農(nóng)學(xué)報(bào) 2021年5期
        關(guān)鍵詞:保持系抗病稻瘟病

        吳婷婷,陳海龍,黃 俊,梁 毅,張 婷,李博文,賴怡帆,鄒玉瑩,車凡昊,吳 俊,劉金靈,2,3,劉雄倫,2,3

        (1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,湖南 長沙 410128;2.作物基因工程湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長沙 410128;3.水稻油菜抗病育種湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長沙 410128;4.湖南雜交水稻研究中心,湖南 長沙 410125)

        水稻(Oryzasativa)是人類賴以生存的重要糧食作物。由子囊真菌(Magnaportheoryzae)引起的稻瘟病(Rice blast),是水稻生產(chǎn)中的主要病害,全球至少有80個(gè)國家報(bào)道了稻瘟病的發(fā)生[1],近年來我國稻瘟病年發(fā)生面積約500萬hm2[2]。稻瘟病危害不僅減產(chǎn),而且防治稻瘟病大量使用殺菌劑也增加了水稻的生產(chǎn)成本,同時(shí)破壞水土生態(tài)環(huán)境。因此,利用已鑒定的抗性基因培育推廣抗病水稻品種,是防控稻瘟病最經(jīng)濟(jì)有效和綠色環(huán)保的對策。廣譜持久抗稻瘟病基因Pi9來源于小粒野生稻(Oryzaminuta),經(jīng)遠(yuǎn)緣雜交導(dǎo)入到秈稻品系75-1-127,之后被精細(xì)定位到水稻6號染色體的Pi2/9位點(diǎn),并被成功克隆[3-4]。而分子標(biāo)記輔助選擇育種的選擇效率高、操作較簡單、相對成本較低,通過篩選還能獲得農(nóng)藝性狀、產(chǎn)量和品質(zhì)性狀都比較優(yōu)良的后代,因此,尤其備受育種家們青睞。目前,Pi9基因已被廣泛應(yīng)用于水稻稻瘟病抗性改良的育種實(shí)踐,如李永聰?shù)萚5]利用Pi9基因通過MAS回交育種改良水稻恢復(fù)系R389的稻瘟病抗性。本研究以75-1-127為Pi9基因供體,先后用三系保持系豐源B及其不育系豐源A為受體親本,利用Pi9基因內(nèi)特異功能標(biāo)記,通過分子標(biāo)記輔助選擇(MolecularMarker-assistedSelection,MAS),定向改良豐源A及其保持系豐源B的稻瘟病抗性。

        1 材料和方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        水稻材料:秈稻品系75-1-127,Pi9基因供體;三系不育系豐源A及其保持系豐源B,Pi9基因受體;水稻品系CO39,稻瘟病感病對照。

        稻瘟菌:33份來自國內(nèi)外的稻瘟菌菌株,用于抗菌譜分析。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 稻瘟病抗性表型鑒定與抗菌譜分析 稻瘟病室內(nèi)人工接種:分別用33份稻瘟菌菌株接種豐源B、豐源A、75-1-127和CO39,調(diào)查苗瘟抗性表型、分析抗菌譜。接種方法及抗性分級分類標(biāo)準(zhǔn)參考廖花等[6]的方法,用33份國內(nèi)外不同稻區(qū)的稻瘟菌菌株,人工氣候室內(nèi)接種豐源A、豐源B和75-1-127,并以CO39作感病對照。在人工氣候室內(nèi)用塑料育苗盤播種供試水稻材料,溫度控制在 26~28 ℃,待水稻苗長至3葉1心時(shí)期,用 0.025%的Tween20水溶液將稻瘟菌分生孢子配制成密度約為1×105個(gè)/mL的單菌株孢子懸浮液進(jìn)行噴霧接種。先在避光、保濕、26 ℃條件下培養(yǎng) 24 h;然后在12 h光照、高濕條件下誘導(dǎo)發(fā)病 5~6 d,調(diào)查發(fā)病情況。其中0~2級劃為抗病類型,3~5級劃為感病類型。

        田間病圃苗瘟鑒定:參考廖花等[6]的方法,試驗(yàn)于2020年5月中旬,將供試水稻材料播種于湖南瀏陽大圍山稻瘟病病圃,6月13日調(diào)查苗瘟抗性,鑒定篩選優(yōu)異抗病純系。供試水稻材料包括親本、改良保持系和改良不育系,用CO39作誘發(fā)品種和感病對照。

        1.2.2 標(biāo)記基因型分析 PCR模板DNA提?。河? mL滅菌離心管取候選水稻單株小分蘗葉片約0.2 g,液氮研磨后CTAB法提取總DNA[7]。具體操作步驟如下:將所取葉片用液氮速凍后研磨成粉,加入預(yù)熱至65 ℃左右的600 μL CTAB混合液,搖勻后65 ℃溫浴30 min。再加入600 μL氯仿,并放入離心機(jī)中以12 000 r/min轉(zhuǎn)速離心10 min,取上清液轉(zhuǎn)移至加有600 μL異丙醇的1.5 mL離心管中,隨后放到-20 ℃冰箱冷藏20 min,12 000 r/min轉(zhuǎn)速離心機(jī)中離心10 min后倒掉上清液,加入75%乙醇600 μL,離心洗滌2次。最后置于超凈臺(tái)上吹干或者靜置2~3 h風(fēng)干后,用100 μL蒸餾水溶解,藏于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        標(biāo)記基因型鑒定:用本團(tuán)隊(duì)開發(fā)的InDel共顯性專利標(biāo)記ClonDF1R1,鑒定各單株標(biāo)記基因型。PCR體系(10.0 μL):模板DNA 1.0 μL,5 U/μLTaq酶0.1 μL,2.5 mmol/L dNTPs 0.2 μL,2 pmol/μL primer pairs 1.0 μL,10×Buffer 1.0 μL,ddH2O 6.7 μL。PCR熱循環(huán)參數(shù):94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min。用1%瓊脂糖凝膠電泳分析PCR產(chǎn)物。

        1.2.3 分子標(biāo)記輔助選擇育種實(shí)踐 用豐源B作母本及輪回親本,75-1-127作父本,2009-2015年在長沙和三亞兩地開展分子標(biāo)記輔助選擇連續(xù)回交育種,用ClonDF1R1(F:5′-ATCCACGAAACATCCACC

        ATCC-3′;R:5′-GATTCGACAGATGGTGCAACA-3′)標(biāo)記基因型做Pi9基因前景選擇,用田間主要農(nóng)藝產(chǎn)量性狀代替單株基因組背景選擇,于2015年夏季獲得性狀整齊穩(wěn)定、高抗稻瘟病的BC6F4群體(株系)。2016年起,用豐源A作母本,用優(yōu)異改良豐源B保持系作父本及輪回親本,結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇,于2019年獲得穩(wěn)定的BC5F1群體,2020年經(jīng)稻瘟病抗性、田間農(nóng)藝產(chǎn)量性狀和不育特性鑒定分析,育成優(yōu)異改良抗病豐源A不育系。

        1.2.4 不育系不育特性調(diào)查 參考田芳慧等[8]的方法,觀察調(diào)查豐源A和改良豐源A的不育特性:

        柱頭外露率:不育系抽穗揚(yáng)花結(jié)束后,隨機(jī)選取30穗,調(diào)查總穎花數(shù)和柱頭外露穎花數(shù)(包括單邊外露和雙邊外露),計(jì)算柱頭外露率。柱頭單邊外露率=柱頭單邊外露穎花數(shù)÷總穎花數(shù)×100%;柱頭雙邊外露率=柱頭雙邊外露穎花數(shù)÷總穎花數(shù)×100%;柱頭總外露率=柱頭單邊外露率+柱頭雙邊外露率。

        自交結(jié)實(shí)率:不育系孕穗末期,隨機(jī)取10株用羊皮紙袋套袋,15 d后調(diào)查不育株率自交結(jié)實(shí)率。不育株率=不育株數(shù)÷30×100%;自交結(jié)實(shí)率=總結(jié)實(shí)粒數(shù)÷總穎花數(shù)×100%。

        花粉鏡檢:不育系開花盛期,隨機(jī)取10個(gè)稻穗的混合花粉,1%I2-KI染色后鏡檢,觀察花粉育性及敗育類型。無花粉粒的即為無花粉型;有花粉粒的每個(gè)鏡片觀測3~5個(gè)視野,觀測花粉粒300個(gè)以上,觀察分析花粉育性及花粉粒類型,并計(jì)算花粉敗育度。圓形藍(lán)黑色的為正?;ǚ哿?;圓形不染色的為圓敗花粉粒,形狀不規(guī)則且不染色的為典敗花粉粒,兩者均為敗育花粉粒。

        1.2.5 農(nóng)藝產(chǎn)量性狀調(diào)查 調(diào)查豐源B、豐源A、改良豐源B和改良豐源A群體的播始?xì)v期;每材料隨機(jī)取10株,調(diào)查株高和有效穗數(shù),以及主穗總穎花數(shù)、劍葉長和劍葉寬,計(jì)算相應(yīng)平均值,記載標(biāo)準(zhǔn)參考應(yīng)存山[9]:播始?xì)v期是計(jì)算水稻從播種到長出始穗的天數(shù);株高是測量從泥面至上部最長葉尖的長度;有效穗數(shù)是計(jì)算每株的單穗實(shí)粒數(shù)不少于10粒的稻穗;主穗總穎花數(shù)是指計(jì)數(shù)每株主穗的穎花總數(shù);劍葉長是測量劍葉從葉枕到葉尖的長度,而劍葉寬則是測量劍葉最寬處的寬度。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 供試親本材料的苗瘟抗性表型及抗菌譜

        33份供試稻瘟菌菌株室內(nèi)接種親本材料的抗性表型及抗菌譜結(jié)果見表1。Pi9基因供體親本75-1-127對日本菌株KOH、韓國菌株ROR1、中國菌株95097AZC13和X2007A-7 表現(xiàn)感病,對其余29份菌株表現(xiàn)抗病,抗性頻率為87.9%。豐源B和豐源A對11份菌株表現(xiàn)抗病(CHL438、CHL440、CHL473、87-4、110-2、195-2-2、RB14、M2006123A1、CHNOS60-2-3、KOH、KJ105),而對其余22份菌株表現(xiàn)感病,抗性頻率為33.3%。2個(gè)受體親本的抗性表型和抗菌譜非常吻合,說明這2個(gè)材料的稻瘟病抗性受細(xì)胞核基因控制、且兩者核背景一致。有趣的是,4份對75-1-127致病菌株中的3份(X2007A-7、95097AZC13和ROR1),對豐源B和豐源A也是致病的,但KOH對后者不致病,即供體親本和受體親本間存在交叉抗菌譜。感病對照CO39對33份供試菌株都表現(xiàn)感病。另一方面,田間病圃苗瘟抗性鑒定結(jié)果表明,75-1-127 表現(xiàn)高度抗病,而豐源B 和豐源A均高度感病(圖1)。以上結(jié)果表明,Pi9基因的稻瘟病抗性水平高抗菌譜較廣,并且與2個(gè)受體親本間存在交叉抗譜,可望通過MAS育種實(shí)踐,培育出抗性更好的新不育系及其保持系。

        表1 親本材料稻瘟病抗性及抗菌譜Tab.1 Resistance and resistance spectrum of parental materials to 33 tested M.oryzae isolates

        2.2 ClonDF1R1標(biāo)記輔助選擇育成抗病不育系豐源A-Pi9-5

        根據(jù)Pi9基因序列信息開發(fā)了1個(gè)共顯性InDel標(biāo)記ClonDF1R1。該標(biāo)記從75-1-127基因組中擴(kuò)增出一條320 bp的亮帶,而對豐源B和豐源A基因組的擴(kuò)增產(chǎn)物大小均為450 bp左右(圖2)。利用ClonDF1R1開展連續(xù)多年的MAS育種實(shí)踐,于2015年夏季獲得性狀整齊穩(wěn)定、高抗稻瘟病的豐源B改良BC6F4群體(株系)17個(gè),綜合各改良株系的農(nóng)藝產(chǎn)量性狀,篩選出1個(gè)穩(wěn)定的優(yōu)異抗病系豐源B-Pi9-5(圖1,2)。在此基礎(chǔ)上,用豐源B-Pi9-5與豐源A雜交并連續(xù)回交,經(jīng)ClonDF1R1標(biāo)記基因型鑒定,于2019年夏季獲得農(nóng)藝和遺傳性狀穩(wěn)定的BC5F1群體(系),2020年經(jīng)病圃苗瘟抗性鑒定和農(nóng)藝產(chǎn)量性狀及不育特性調(diào)查分析,育成豐源B-Pi9-5的改良抗病不育系豐源A-Pi9-5(圖1,2)。

        2.3 豐源A-Pi9-5不育特性

        本試驗(yàn)結(jié)果表明,豐源A-Pi9-5與對照豐源A的不育株率均為100%,套袋自交結(jié)實(shí)率均為0;豐源A-Pi9-5的柱頭外露率為65.6%,與對照豐源A非常相近(67.1%);2個(gè)不育系的花藥大小顏色非常相似,短小呈淺白色;花粉鏡檢表明,2個(gè)不育系花粉粒少,且均以典敗為主,碘染率均為0。相應(yīng)地,2個(gè)保持系豐源B-Pi9-5和豐源B田間結(jié)實(shí)正常,花粉育性正常(圖3)??梢?,改良抗病不育系豐源A-Pi9-5不育性穩(wěn)定徹底,異交習(xí)性好,為實(shí)現(xiàn)三系配套應(yīng)用打下了基礎(chǔ)。

        2.4 改良抗病不育系及其保持系主要農(nóng)藝產(chǎn)量性狀

        主要農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀的調(diào)查結(jié)果見表2。豐源A-Pi9-5及其保持系豐源B-Pi9-5的播始?xì)v期為86 d,比受體不育系豐源A及其保持系豐源B長2~3 d。改良不育系及其保持系的株高比相應(yīng)對照略有降低,但還是有90 cm左右、稍微偏高。兩組材料的葉形整體相似,葉片上舉。此外,豐源A-Pi9-5和豐源B-Pi9-5的田間株形緊湊。產(chǎn)量性狀方面,兩組材料的單株有效穗數(shù)和主穗長都很接近;而改良不育系(保持系)的單穗穎花數(shù),比受體不育系(保持系)增加較明顯??梢?,經(jīng)過多年多代連續(xù)回交,兩組材料在主要農(nóng)藝性狀上整體一致,產(chǎn)量性狀更好,實(shí)現(xiàn)了定向改良稻瘟病抗性的育種目標(biāo)。

        表2 不育系和保持系主要農(nóng)藝產(chǎn)量性狀Tab.2 Main agronomic and yield traits of sterile lines and maintainers

        3 討論與結(jié)論

        水稻稻瘟病抗性是典型的質(zhì)量-數(shù)量性狀,抗病表型很大程度上受溫濕度、光照、病原菌等因素影響,因而通過表型選擇的傳統(tǒng)抗病育種效率低?;跇?biāo)記基因型鑒定的分子標(biāo)記輔助選擇(MAS),能大大提高選擇準(zhǔn)確性和育種效率,近年來受到稻瘟病抗性育種者的青睞,如倪大虎等[10],利用分子標(biāo)記輔助選擇和田間/溫室抗性鑒定,將廣譜高抗白葉枯病的Xa21基因和高抗稻瘟病的Pi9(t)基因聚合到同一品系中,獲得雙基因純合且農(nóng)藝性狀穩(wěn)定的株系;殷所得等[11]利用Pi9基因結(jié)合田間農(nóng)藝性狀選擇和分子標(biāo)記輔助選擇,培育出抗稻瘟病性優(yōu)于親本的雜交組合;Jiang等[12]利用輔助選擇育種提高金23B的稻瘟病抗性;曹志等[13]以75-1-127(Pi9)、谷梅2號(Pi25)、谷梅4號(Pigm)、天津野生稻(Pi2-1和Pi51(t))、湘資3150(Pi47和Pi48)和魔王谷(Pi49)共6個(gè)廣譜抗稻瘟病水稻品種為供體親本,改良了水稻兩用核不育系C815S的稻瘟病抗性。此外,還有許多育種家通過MAS育種培育出了大量抗病水稻新品系或新種質(zhì),如楊豐宇等[14]利用廣譜持久抗瘟基因Pigm定向改良早秈稻1701的稻瘟病抗性,育成一個(gè)遺傳背景與受體親本相似的抗瘟水稻新品系1701-Pigm;張禮霞等[15]通過雜交、回交并結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇,將Pigm基因?qū)胝?4B中以改良其稻瘟病抗性;Chen等[16]通過回交和基因聚合結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇(MAS),將Pi49和Bph14、Bph15基因?qū)隤TGMS系C815S中,最后構(gòu)建了幾個(gè)改良的PTGMS系C815S;姜思達(dá)[17]利用Pi9基因的供體親本75-1-127與易感品種稻花香進(jìn)行雜交,使雜交后代攜帶Pi9基因以改良稻花香的稻瘟病抗性;劉樹芳等[18]采用回交的方法將2個(gè)廣譜抗稻瘟病的基因Piz-t和Pi9導(dǎo)入農(nóng)藝性狀優(yōu)良但稻瘟病抗性弱的云粳優(yōu)5號、云資粳41號和楚粳28號這3個(gè)品種中,以改良它們的抗稻瘟病特性;文紹山等[19]將廣譜高抗稻瘟病基因Pi-9(t)導(dǎo)入雜交水稻恢復(fù)系瀘恢17中,并選育出2個(gè)株葉型、抗稻瘟病及配合力較好,且農(nóng)業(yè)性狀已穩(wěn)定的株系WR1023和WR1056。豐源A是國內(nèi)早前由鄧應(yīng)德等[20]培育出的一個(gè)育性穩(wěn)定、配合力強(qiáng)、異交結(jié)實(shí)率高、米質(zhì)較優(yōu)、抗逆性較強(qiáng)的優(yōu)良秈型三系不育系,但由于稻瘟病抗性差等原因,沒有大面積推廣應(yīng)用。本研究利用已克隆的廣譜持久抗稻瘟病基因Pi-9的序列信息,開發(fā)了共顯性標(biāo)記ClonDF1R1,能高效區(qū)分純合體和雜合體。通過11a的連續(xù)回交MAS育種實(shí)踐,先后獲得高抗稻瘟病的新不育系豐源A-Pi9及其保持系豐源B-Pi9。通過田間不育系、異交習(xí)性和主要農(nóng)藝產(chǎn)量性狀分析,最終育成了綜合性狀優(yōu)良的抗病不育系豐源A-Pi9-5及其配套保持系豐源B-Pi9-5為三系配套利用雜種優(yōu)勢奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

        接下來,將在本研究成果基礎(chǔ)上,利用獲得的改良不育系/保持系進(jìn)一步開展以下工作:使用更多的稻瘟菌菌株開展人工接種,進(jìn)一步明確改良不育系/保持系的抗菌譜;在不同生態(tài)稻區(qū)做稻瘟病抗性鑒定,尤其是穗瘟抗性鑒定,明確改良不育系/保持系及雜交種的適宜種植區(qū)域;利用改良不育系廣泛配組,盡快選配出抗病、優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、廣適性的強(qiáng)優(yōu)勢雜交組合應(yīng)用于生產(chǎn),同時(shí)分析改良不育系與受體豐源A的恢復(fù)源是否發(fā)生變化。此外,筆者還將繼續(xù)利用Pi9基因改良其他骨干水稻親本的稻瘟病抗性,并開展多基因分子聚合育種實(shí)踐。

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