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        基于數(shù)據(jù)挖掘和網絡藥理學研究慢性阻塞性肺疾病的中藥用藥規(guī)律及機制

        2021-10-26 12:57:08李澤庚董昌武王小樂高雅婷楊勤軍
        中成藥 2021年10期
        關鍵詞:陳皮半夏靶點

        吳 凡, 李澤庚, 董昌武, 朱 潔, 王小樂, 高雅婷, 楊勤軍

        (1.安徽中醫(yī)藥大學中醫(yī)學院,安徽 合肥 230012;2.安徽省中醫(yī)藥科學院中醫(yī)呼吸病防治研究所,安徽 合肥 230038;3.安徽省教育廳重點實驗室中醫(yī)藥防治肺系重大疾病重點實驗室,安徽 合肥 230038)

        慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是以持續(xù)存在的呼吸道癥狀和氣流受限為特征的一種常見疾病,與有害顆粒或氣體的顯著暴露和(或)肺泡異常相關[1],具有患病率、病死率、致殘率高的特點[2]。目前西醫(yī)治療COPD的方案包括抗感染、抗炎、擴張支氣管等,并不能有效控制進行性發(fā)展的氣道炎癥和逆轉肺功能下降[3];中醫(yī)防治COPD有顯著的療效,通過辨證論治,能夠有效控制癥狀,延緩疾病進程,提高患者生活質量[4]。本研究擬通過收集中藥治療COPD醫(yī)案處方,應用數(shù)據(jù)挖掘對其用藥規(guī)律進行總結,再采用網絡藥理學篩選高頻藥對的關鍵靶點,探索其發(fā)揮藥效的可能機制,為COPD的臨床辨治和實驗探索提供參考。

        1 資料與方法

        1.1 資料來源 分別以“慢性阻塞性肺疾病、COPD、肺脹、喘證、中醫(yī)、醫(yī)家、經驗”等關鍵詞或者主題詞,檢索中國知網(CNKI)、萬方數(shù)據(jù)庫(WanFang Data)、維普網(VIP)、中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫(CBM),文獻發(fā)表時間1988年1月至2019年12月,搜索應用中醫(yī)藥復方治療COPD的臨床文獻。排除綜述、重復文獻、干預措施不符合文獻,共收集165篇,有效處方439首。

        1.2 文獻納入標準 ①中藥治療COPD的臨床病案;②明確提及患者為COPD,無其他兼癥;③方藥組成完備;④臨床療效確切;⑤僅采用中藥湯劑內服治療。

        1.3 文獻排除標準 ①COPD患者出現(xiàn)合并癥;②重復出現(xiàn)的方劑;③結合針灸、外敷等中醫(yī)治療方法,或中西醫(yī)結合治療,無法判斷是否為中藥產生療效的臨床研究。

        1.4 數(shù)據(jù)規(guī)范 以2015年版《中國藥典》[5]為標準,同時參考《中藥學》[6]將別名統(tǒng)一,合并同類藥物,如山茱萸、山萸肉統(tǒng)一為山茱萸,生熟地分別為生地黃、熟地黃,仙靈脾、淫羊藿統(tǒng)一為淫羊藿,法半夏、清半夏統(tǒng)一為半夏。

        1.5 統(tǒng)計學方法 ①藥物頻次統(tǒng)計分析,應用Excel 2010進行;②關聯(lián)規(guī)則分析,采用SPSS Modeler 18.0中Apriori算法進行,支持度為包含某種中藥組合的方劑數(shù)量與全部方劑數(shù)量的百分比,含有A的方劑中含有B的頻率稱中藥A→中藥B的置信度;③復雜網絡分析,采用SPSS Modeler 18.0 Web進行,根據(jù)藥物之間的關聯(lián)關系繪制用藥整體與核心處方的Web網絡圖;④聚類分析,應用SPSS Statistic22.0的分析模塊進行,歸納常用藥物組合,繪制聚類樹狀圖;④因子分析,應用SPSS Statistics 22.0建立原始指標的相關系數(shù)矩陣,在降維視角下尋找少數(shù)的中藥數(shù)據(jù)來反映所有方藥特征,應用KMO與Bartlett等方法對因子進行適應型檢驗。

        1.6 網絡藥理學分析 通過中藥系統(tǒng)藥理學分析平臺(TCMSP),篩選高頻藥對的有效成分及相應靶點,并與Genecards和OMIM數(shù)據(jù)庫篩選出COPD的靶點相映射并取交集,作為其治療COPD的潛在靶點。將上述靶點導入STRING11.0數(shù)據(jù)庫中,構建PPI網絡,根據(jù)degree值篩選出關鍵靶點,應用R語言進行KEGG通路富集分析,依據(jù)count值篩選重要通路。

        2 結果

        2.1 頻次分析 本研究共納入有效處方439首,涉及中藥332味,總頻次6 693次,歸18類,補虛藥、化痰止咳平喘藥、解表藥、清熱藥及利水滲濕藥用藥頻次位居前5,見表1;332味中藥中用藥頻次≥50次共計39味,見表2。

        表1 藥物類別分布

        表2 高頻藥物頻次分布(頻次>50次)

        2.2 關聯(lián)規(guī)則分析 運用SPSS Modeler18.0中的Apriori模塊對高頻藥物進行關聯(lián),二項關聯(lián)規(guī)則設置支持度10%,置信度65%;三項關聯(lián)設置支持度10%,置信度75%,支持度最高的二項和三項關聯(lián)組合見表3~4。由此可知,二項關聯(lián)多是健脾化濕、補益脾肺、化痰止咳及溫肺化飲的組合,三項關聯(lián)多為健脾化濕、降氣化痰及益氣健脾的組合。

        表3 二項關聯(lián)規(guī)則分布(按支持度排序)

        2.3 復雜網絡分析 采用SPSS modeler 18.0 Web復雜網絡繪制COPD的用藥整體網絡圖、核心處方網絡圖,通過粗線、細線和虛線表示藥物之間鏈接的強弱程度,見圖1~2,可知核心處方主要由二陳湯和三拗湯加減化裁組成。

        圖1 用藥整體網絡圖

        圖2 核心處方網絡圖

        表4 三項關聯(lián)規(guī)則分布(按支持度排序)

        2.3 常用中藥聚類組合 采用SPSS Statistics 22.0系統(tǒng)聚類對頻次≥50次中藥進行分析,度量區(qū)間采用平方Euclidean距離,通過Ward方法構建樹狀聚類,見圖3;共得到12組藥物聚類組合,見表5。

        圖3 藥物聚類分析圖

        表5 常用藥物系統(tǒng)聚類組合

        2.4 常用中藥因子分析 采用SPSS Statistics 22.0對頻數(shù)≥50次中藥進行因子分析,結果顯示Bartett球形檢驗P=0(<0.001),KMO=0.614,χ2=3 671.513,df=780,表明適合進行因子分析。采用主成分分析法,進行方差最大化旋轉,特征根大于1時,用藥累計貢獻率為58.002%,提取載荷系數(shù)大于0.3的中藥變量組成公因子,共提取出15個公因子,見表6。橫軸為因子序號,縱軸表示特征值大小,生成碎石圖(圖4),根據(jù)點間聯(lián)線坡度的陡緩程度可比較因子的重要性。根據(jù)“旋轉元件矩陣”生成旋轉空間原件(圖5),能直觀看出各變量之間的聚集關系?;陉P聯(lián)和聚類及因子分析可知,半夏與陳皮關系最為密切。

        表6 高頻藥物因子分析

        圖4 因子分析碎石圖

        圖5 旋轉空間原件圖

        2.5 基于網絡藥理學分析高頻藥對半夏、陳皮治療COPD的機制

        2.5.1 藥物活性成分及作用靶點的篩選 通過中藥系統(tǒng)藥理學分析平臺(TCMSP)檢索半夏與陳皮化學成分,以口服生物利用度(OB)≥30%、藥物相似性(DL)≥0.18作為條件,共篩選出候選化合物半夏13個,陳皮5個,作用靶點118個。

        2.5.2 COPD相關靶點的篩選 GeenCards數(shù)據(jù)庫按照relevance score高低篩選前300位相關靶點,OMIM數(shù)據(jù)庫得到與COPD相關靶點533個,篩重后獲得疾病相關靶點520個;與TCMSP數(shù)據(jù)庫預測的靶點相映射,共得到半夏和陳皮治療COPD靶點21個。

        2.5.3 蛋白互作(PPI)網絡的構建 將共同靶點上傳至String在線平臺數(shù)據(jù)庫,設置物種為人,置信度大于0.4,得到PPI網絡(圖6),關鍵靶點蛋白21個,71條邊代表了蛋白之間的相互作用,據(jù)degree值篩選列舉出“陳皮-半夏”治療COPD排名前10的關鍵靶點(圖7)。

        圖6 半夏-陳皮治療COPD靶點的 PPI 網絡

        圖7 半夏-陳皮治療COPD的關鍵靶點

        2.5.4 KEGG通路分析 將上述共同靶點應用R語言軟件計算KEGG通路,觀察靶點在通路中的分布情況和藥理作用機制中可能性較大的通路,并進一步篩選與COPD相關的信號通路,按照Count值篩選出排名前20的通路富集,涉及到到PI3K-Akt信號通路、cAMP信號通路、凋亡通路、TNF信號通路及Relaxin信號通路等。見表7。

        表7 KEGG通路富集

        3 討論

        3.1 痰為COPD關鍵病因,化痰止咳平喘為基本治法 化痰止咳平喘藥使用頻次位居第二,前二十位高頻藥物中有半夏、苦杏仁、紫菀、款冬花、葶藶子、桔梗、桑白皮7味化痰止咳平喘藥。二項關聯(lián)及因子分析中陳皮-半夏和三項關聯(lián)的陳皮-茯苓-半夏組合,體現(xiàn)了化痰在中醫(yī)藥治療COPD中的關鍵作用。聚類分析中C3前胡、桔梗和C8紫苑、款冬花及F4紫菀、款冬花、百部均能降氣化痰、止咳平喘,且紫菀祛痰尤佳,款冬花止咳更甚[7]。痰飲同源,C5和F2中細辛、干姜,為常用的溫肺化飲、止咳平喘組合。

        3.2 COPD發(fā)作源于表邪誘導,治療不忘解表驅邪 解表藥使用頻次高居第三,高頻藥物中紫蘇、麻黃、桂枝及細辛等具有解表之功。麻黃與細辛及麻黃-紫蘇→苦杏仁的配伍體現(xiàn)COPD治療需解表驅邪,防止疾病深入。核心處方及聚類組合有麻黃、苦杏仁和甘草,為三拗湯組方,麻黃中麻黃堿能松弛支氣管平滑肌,杏仁中苦杏仁苷能促使呼吸運動趨于安靜而鎮(zhèn)咳平喘,甘草具有鎮(zhèn)咳祛痰解毒等作用[8],三藥合用,可治療外感風寒誘發(fā)的咳喘。

        3.3 COPD易于化熱夾瘀,理當清熱化瘀 聚類分析C9黃芩和丹參,以及因子分析F6魚腥草、黃芩和丹參在治療COPD中經常使用。研究顯示魚腥草富含揮發(fā)油、黃酮類、有機酸、生物堿及維生素等化合物,具有解熱、抗炎、抗菌、抗病毒、增強機體免疫功能、抗過敏及鎮(zhèn)咳等作用[9];黃芩主要成分黃芩苷能抑制NF-κB、TNF-α、IL-β及IL-6的表達,減少炎性細胞浸潤,可清除自由基及超氧陰離子等氧自由基,具有抗氧化作用[10];丹參中脂溶性成分(如丹參酮ⅡA、隱丹參酮)及水溶性成分(如丹酚酸A、丹酚酸B)均具有降低血液黏稠度、降壓、擴張血管、清除氧自由基等作用[11-12],三藥合用,清肺化痰、涼血散瘀,是治療痰瘀熱結證COPD的常用藥物組合。

        3.4 培土生金,調理脾胃,以益肺絕痰 二項關聯(lián)支持度前三位藥對分別是半夏-陳皮、茯苓-白術和甘草-白術;置信度前四位分別是茯苓-白術、甘草-白術、甘草-黨參和黃芪-黨參。聚類分析C10,以及因子分析F3中黃芪、黨參、茯苓、白術及甘草等藥物。黨參、黃芪、白術等健脾益氣,體現(xiàn)了中醫(yī)藥治療COPD從脾論治的理念。甘涼滋胃潤肺亦是培土生金法的具體表現(xiàn),因子分析F9麥冬與南沙參組合,取自沙參麥冬湯,養(yǎng)胃清肺潤燥而不戀邪傷。

        3.5 金水相生,調補肺腎,以納氣平喘 二項關聯(lián)中五味子-熟地黃及黃芪-補骨脂兩對藥表明,COPD治療過程中肺腎兩虛亦為常見證候,五味子斂肺滋腎,常用于肺虛咳喘;熟地黃、黃芪均味甘、性微溫,熟地黃補腎填精,黃芪補肺氣固衛(wèi)表,兩者合補腎健脾功效之補骨脂,對肺腎兩虛咳喘有良效。系統(tǒng)聚類中的C1與因子分析中的F1藥物組成相同,山茱萸、山藥和熟地黃作為六味地黃丸三補組合,在臨床治療肺脾腎三臟俱虛的虛損性咳喘中經常使用。

        3.6 高頻藥對“半夏-陳皮”治療COPD機制呈多靶點和多通路特性 通過分析高頻藥對“半夏-陳皮”治療COPD的潛在機制呈現(xiàn)多靶點和多通路特點,主要靶點為CAT、JUN、NOS2、CYCS、MPO、VEGFA、MMP-9、SOD及HIF-1α等,它們參與氧化還原、細胞老化、轉錄因子激活、RNA聚合酶Ⅱ轉錄因子結合、胞質靶蛋白結合、電子載體蛋白結合、內皮細胞增殖及抑制細胞凋亡等生物學過程。R語言KEGG富集分析,篩選出PI3K-Akt信號通路(PI3K-Akt signaling pathway)、cAMP信號通路(cAMP signaling pathway)、IL-17信號通路(IL-17 signaling pathway)及TNF信號通路(TNF signaling pathway)等為重要通路。研究證實上述關鍵靶點和重要通路在COPD的發(fā)病過程中有致病作用[13-16],表明“半夏-陳皮”藥對治療COPD有潛在研究價值。

        4 結論

        本研究通過數(shù)據(jù)挖掘技術總結439例中醫(yī)藥治療COPD處方的用藥規(guī)律,揭示中醫(yī)藥治療COPD多從痰、熱、虛、瘀等多方面認識,發(fā)作緣于外邪誘發(fā),易于化熱夾瘀,治療多以清熱化痰祛瘀為法,并透散表邪;本虛以肺脾腎三臟虧虛為主,重視培土生金和金水相生治療原則,為臨床治療COPD提供參考,但具體機制還需進一步臨床和實驗驗證。

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