徐鳳宇,邱子怡,孫 亮,馬紅霞,高云航,么乃全
(1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林 長春 130118;2.動物生產(chǎn)及產(chǎn)品質(zhì)量安全教育部重點實驗室,吉林 長春 130118)
鏈球菌分布廣泛,有些可致人或動物敗血癥、乳腺炎、肺炎、化膿性疾病及腦膿腫等[1]。隨著抗生素廣泛應(yīng)用,鏈球菌對抗生素的耐藥性逐漸增強,關(guān)琳等[2]報道15株豬鏈球菌9型對大環(huán)內(nèi)酯類及林可胺類耐藥率為100%,對四環(huán)素及鏈霉素耐藥率為93.3%,所有菌株達七重耐藥。主動外排機制和靶位修飾、核糖體保護蛋白、鈍化或滅活抗生素、產(chǎn)生生物被膜等是鏈球菌耐藥的原因[3];豬鏈球菌對桿菌肽的抗性與包含SstF、SstE、SstG的ABC 轉(zhuǎn)運系統(tǒng)有關(guān)[4]。為防治鏈球菌病,研究者不懈開發(fā)新生物防治劑,內(nèi)溶素、噬菌體及其裂解酶[5-6]等成為研究目標。
除直接防治鏈球菌病外,噬菌體在鏈球菌群體形成、遺傳變異、致病性、抗生素抗性等方面也扮演重要角色[7];研究噬菌體可幫助了解細菌生態(tài)學(xué)和進化,如含噬菌體SMP的溶原性豬鏈球菌SS2-4(SMP)毒力明顯強于野生株、生長更快、菌鏈變短[8];噬菌體也被添加于選擇培養(yǎng)基,抑制雜菌生長,降低分離培養(yǎng)假陰性率[9]。本研究以分離自牛子宮內(nèi)膜炎的致病性鏈球菌為宿主,分離鏈球菌毒性噬菌體,研究其主要生物學(xué)特性,為更深入研究和應(yīng)用鏈球菌噬菌體提供資料。
1.1 菌株 宿主菌鏈球菌48株,由本實驗室分離自患子宮內(nèi)膜炎的奶牛子宮;指示菌S-1株、S-2株、S-3株、S-4株、S-5株、S-6株、S-7株、S-8株、S-9株、S-10株鏈球菌,由本實驗室分離鑒定并保存。
1.2 主要試劑與儀器 DNaseI、RNaseA,均購自北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;限制性內(nèi)切酶,購自寶生物工程(大連)有限公司;TSA、TSB培養(yǎng)基,購自青島高科技工業(yè)園海博生物技術(shù)有限公司;上層TSB培養(yǎng)基(含0.75%瓊脂)、下層TSA培養(yǎng)基、2×TSB培養(yǎng)液按說明書配制;SM液按《分子克隆實驗指南》(第3版)[10]附錄1配制。Himac CP100MX超速離心機由日立公司生產(chǎn);TEM-100CX透射電鏡由TEOLLTD公司生產(chǎn)。
1.3 方法
1.3.1 宿主菌的準備 取凍存的宿主菌在TSA平板上劃線培養(yǎng),次日取單菌落于5 mL TSB培養(yǎng)基中,37 ℃、150 r/min 振搖培養(yǎng)。
1.3.2 噬菌體的分離、純化 以鏈球菌懸液為宿主,用2×TSB作濃縮培養(yǎng)基,以從長春市某處新采集的污水為樣品,參考文獻[11]中材料與方法3,37 ℃ 分離噬菌體,重復(fù)增殖5次,12 000 r/min離心15 min,細菌濾器過濾得擬含鏈球菌噬菌體的原液。
點滴法驗證:將100 μL過夜培養(yǎng)的鏈球菌(濃度約1.0×106CFU/mL)于TSA平板上涂勻,靜置20 min,滴加噬菌體原液5 μL,陰性對照組滴加等量生理鹽水,37 ℃培養(yǎng)12 h后觀察。
雙層平板法純化噬菌體:參考文獻[11]中材料與方法5進行,略有改動。
1.3.3 噬菌體的電鏡觀察 取適當稀釋噬菌體,經(jīng)雙層平板培養(yǎng)成噬菌斑網(wǎng),加入3 mL SM液,4 ℃冰箱中振蕩10 h,吸出噬菌體液,12 000 r/min離心20 min,取上清30 μL滴于銅網(wǎng)上,靜置30 s,2%磷鎢酸負染90 s,晾干,透射電鏡觀察。
1.3.4 噬菌體基因組酶切分析 參考文獻[10]中從大規(guī)模培養(yǎng)物提取λ噬菌體基因組方法得噬菌體核酸,分別用BlnⅠ、EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ、NcoI和Xhol I將核酸在適宜溫度下酶切10 h,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測酶切片段。
1.3.5 噬菌體效價測定及裂解譜分析 用TSB培養(yǎng)基將噬菌體原液10倍梯度稀釋,將100 μL宿主菌液、氯化鈣和100 μL適當稀釋的噬菌體混勻,靜置,移入50 ℃保溫的半固體培養(yǎng)基,鋪雙層平板,37 ℃培養(yǎng)12 h,記噬菌斑數(shù)。噬菌體效價(PFU/mL)=平均噬菌斑數(shù)×稀釋倍數(shù)×10。
點滴法分析噬菌體裂解譜:將10株指示菌(106CFU/mL)各100 μL分別均勻涂于TSA培養(yǎng)基表面,室溫靜置30 min后,滴加5 μL純化噬菌體液,吸收5 min,37 ℃培養(yǎng)過夜,觀察細菌、噬菌體生長情況。
1.3.6 氯仿、乙醚敏感性測定 (1)氯仿敏感性測定:將50 μL氯仿與950 μL噬菌體液(6.2×108PFU/mL)混勻,對照組不加氯仿,4 ℃冰箱孵育過夜,測噬菌體效價。(2)乙醚敏感性測定:將200 μL 乙醚與800 μL噬菌體液(6.2×108PFU/mL)混勻,對照組不加乙醚,冰浴振蕩1 h,3 000 r/min離心15 min,測噬菌體效價。
1.3.7 噬菌體的熱穩(wěn)定性與酸堿穩(wěn)定性測定 設(shè)8個不同水浴溫度,在每個溫度下放1支裝有1 mL新擴增噬菌體液的1.5 mL EP管,分別作用20、40 min 和60 min,取出冷卻至室溫,測效價。
用1.5 mL滅菌EP管分裝900 μL pH 2~13的TSB培養(yǎng)基,37 ℃水浴預(yù)熱30 min,在各離心管中分別加入100 μL噬菌體液,混勻,繼續(xù)放置3 h,取出置室溫下測效價。
1.3.8 最佳感染復(fù)數(shù)測定 取對數(shù)期宿主菌,適當稀釋噬菌體和宿主菌懸液,按表1加入等量噬菌體和宿主菌,37 ℃ 50 r/min振蕩培養(yǎng)5 h,4 ℃下12 000 r/min 離心30 min,取上清液,用雙層平板測各組效價,篩選最佳感染復(fù)數(shù)(Multiplicity of infection,MOI)。
1.3.9 一步生長曲線繪制 按最佳MOI將宿主菌與噬菌體混勻,37 ℃水浴中孵育15 min,4 ℃、12 000 r/min 離心60 s,棄上清,用TSB洗滌沉淀2次,加入37 ℃預(yù)熱TSB培養(yǎng)基,37 ℃ 50 r/min振搖培養(yǎng),每隔10 min取500 μL培養(yǎng)物,4 ℃、12 000 r/min離心20 min,取上清測噬菌體效價。以效價對數(shù)為縱坐標,以感染時間為橫坐標繪制一步生長曲線。
2.1 噬菌體分離純化 富集5次后,點滴法驗證結(jié)果表明,鏈球菌48株生長的TSA平板上滴加噬菌體原液處呈明顯噬菌現(xiàn)象,對照處菌苔正常,說明原液中含鏈球菌毒性噬菌體。經(jīng)反復(fù)純化,得空斑一致、清晰透亮、邊緣整齊的純化噬菌體(培養(yǎng)12 h),命名為SP48。
2.2 噬菌體電鏡觀察 透射電鏡觀察到SP48呈蝌蚪狀復(fù)合對稱,頭部大小(79.0±0.33)nm×(73.0±0.38)nm,尾長(354±0.25)nm,屬于長尾噬菌體科(圖1)。
圖1 噬菌體SP48電鏡圖Fig.1 Electron micrograph of phage SP48
2.3 噬菌體基因組酶切分析 分別用BlnⅠ、EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ、NcoⅠ、XholⅠ酶切,電泳發(fā)現(xiàn),SP48含有EcoR Ⅰ、XholⅠ和BlnⅠ的酶切位點,表明噬菌體SP48核酸為雙鏈DNA。經(jīng)EcoR Ⅰ酶切可見7個條帶,經(jīng)XholⅠ酶切可見5個條帶,經(jīng)BlnI酶切可見3個條帶(圖2),與Marker比對、計算可知噬菌體SP48的基因組大于60 kb。
圖2 噬菌體SP48基因組酶切電泳圖Fig.2 Enzyme digestion of phage SP48 genomeM:DL-15 000 marker;1:EcoR Ⅰ的酶切產(chǎn)物;2:BamH I的酶切產(chǎn)物;3:XholⅠ的酶切產(chǎn)物;4:BlnⅠ的酶切產(chǎn)物;5:NcoⅠ的酶切產(chǎn)物M:DL-15 000 marker;1:Products of EcoR Ⅰ digestion;2:Products of BamH I digestion;3:Products of XholⅠ digestion;4:Products of Bln Ⅰ digestion;5:Products of Nco Ⅰ digestion
2.4 噬菌體的效價測定及裂解譜分析 經(jīng)雙層平板法測得噬菌體SP48的效價為6.2×108PFU/mL。點滴法測定SP48的宿主譜,發(fā)現(xiàn)其僅裂解宿主菌鏈球菌48株,說明其特異性很強。
2.5 氯仿、乙醚敏感性試驗 乙醚、氯仿分別與噬菌體SP48作用后,測得效價分別為5.8×108PFU/mL和4.3×108PFU/mL,說明噬菌體SP48對乙醚和氯仿不敏感,推測其無囊膜。
2.6 噬菌體的熱穩(wěn)定性與酸堿穩(wěn)定性 SP48的熱穩(wěn)定性結(jié)果見中插彩版圖3,在40~45 ℃作用60 min 后的效價低于作用20 min和40 min的效價;50 ℃以下作用時間短于40 min時,對噬菌體感染性幾乎無影響;高于50 ℃作用60 min時,噬菌體效價明顯降低;60 ℃作用20 min噬菌體SP48完全失活。
圖3 噬菌體SP48的熱穩(wěn)定性Fig.3 Thermal stability of phage SP48
噬菌體SP48在pH 5~10的條件下效價變化不大(圖4),在強酸或強堿環(huán)境下(pH≤4或≥12時)失活。
圖4 噬菌體SP48的pH穩(wěn)定性Fig.4 Stability of phage SP48 in different pH conditions
2.7 噬菌體的最佳MOI測定 當MOI為10時,噬菌體SP48的效價為2.6×109PFU/mL,在7個MOI中最高,為最佳MOI(表1)。
表1 噬菌體SP48最佳感染復(fù)數(shù)測定結(jié)果Table 1 Determination results of optimal multiplicity of infection of phage SP48
2.8 噬菌體的一步生長曲線 繪制噬菌體SP48的一步生長曲線(圖5),發(fā)現(xiàn)SP48感染宿主菌后30 min 內(nèi),噬菌體的效價變化不明顯,此時處于潛伏期;在感染后的30~110 min,噬菌體效價逐漸升高,為爆發(fā)期;隨后的40 min,噬菌體效價穩(wěn)定;根據(jù)公式爆發(fā)量=爆發(fā)結(jié)束時噬菌體效價/感染初期宿主菌濃度,得SP48爆發(fā)量約45 PFU/cell。
圖5 噬菌體SP48的一步生長曲線Fig.5 One-step growth curve of phage SP48
已報道的鏈球菌噬菌體基因組均為dsDNA,大多屬長尾病毒科,一些屬短尾病毒科,罕見肌尾病毒科成員[12]。Harhala等[13]分離到2株化膿鏈球菌溶原性噬菌體Str01和Str03,尾長分別為186 nm、162 nm,基因組分別為37 030 bp和32 296 bp;柏琴琴等[14]以無乳鏈球菌為宿主從乳腺炎奶樣中分離出LYGO9、HZ04,從牛源無乳鏈球菌中誘導(dǎo)出溶原性噬菌體pA11,與該實驗室前期分離的JX01均為長尾噬菌體,推算4株噬菌體的基因組約38~45 kb。本研究從污水中分離到的鏈球菌噬菌體SP48也屬長尾噬菌體,基因組較前述鏈球菌噬菌體更大,尾更長。
關(guān)于鏈球菌噬菌體對環(huán)境抵抗力,Luo等[15]分離的無乳鏈球菌長尾噬菌體HN4對60~80 ℃和pH 3~5敏感;Harhala等[13]報道Str01、Str03在40 ℃下作用60 min 的存活率(88%、96%)低于作用15 min 的存活率(98%、100%),在60 ℃下作用15 min 可保持15%、23%的存活率,作用60 min全被滅活;本研究分離到的SP48在40~60 ℃時隨作用時間延長和溫度升高,存活率也降低。Str01、Str03在pH=7時最穩(wěn)定,1 h存活率為92%、99%,5 h 存活率為83%、90%,在pH≤4或≥12環(huán)境下存活不超過1 h[13];SP48在pH≤4或≥12時存活3 h以下。無乳鏈球菌噬菌體LYGO9的潛伏期僅5 min,爆發(fā)期25 min,平均爆發(fā)量30 PFU/細胞[14];SP48較LYGO9的潛伏期、爆發(fā)期長,爆發(fā)量約為LYGO9的1.5倍,二者的殺菌能力有待試驗確定。
噬菌體有一定裂解譜,能跨種裂解的噬菌體較少,也是用噬菌體用于細菌性疾病治療的優(yōu)勢之一。鏈球菌噬菌體的裂解譜可能與宿主分型有關(guān),Str01、Str03對37株A群鏈球菌的裂解率分別為13.5%、51%,對34株B群鏈球菌的裂解率分別為3%和0[13];噬菌體LYGO9、HZ04、pA11、JX01可裂解的鏈球菌莢膜多糖分型以Ⅰa居多,但并非所有Ⅰa型無乳鏈球菌均被裂解,8株莢膜多糖Ⅱ型菌均不被裂解[14]。查濤等[16]發(fā)現(xiàn),噬菌體phiYe-F10對O∶3小腸結(jié)腸炎耶爾森菌的裂解率為84.5%,不裂解O∶5、O∶9血清型和其他菌株,而O抗原位于細胞壁脂多糖(LPS)外側(cè),推測與噬菌體phiYe-F10的受體相關(guān)。本研究獲得的噬菌體SP48僅裂解宿主鏈球菌,不裂解10株指示菌,推測可能的原因為指示菌與宿主48株鏈球菌非同種或者非同型。