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        結(jié)核分枝桿菌rpoB基因和突變檢測技術(shù)在結(jié)核性腦膜炎中的診斷價值

        2021-10-25 06:47:18焦向陽白廣紅仵倩紅
        關(guān)鍵詞:檢測

        李 靜,焦向陽,白廣紅,仵倩紅

        (陜西省結(jié)核病防治院檢驗科,陜西 西安 710100)

        結(jié)核性腦膜炎(tuberculousmeningitis,TBM)是臨床上一種常見的肺外結(jié)核,被認為是最嚴重的肺外結(jié)核(EPTB),約占EPTB病例中的5%~10%[1],死亡率高達67.2%[2],該病多發(fā)于青壯年,發(fā)病無明顯季節(jié)性[3-4]且發(fā)病隱匿,常繼發(fā)于其他系統(tǒng)的感染,大多為結(jié)核分枝桿菌經(jīng)血循環(huán)進入顱內(nèi)而發(fā)病。臨床表現(xiàn)缺乏特異性,病原學陽性檢出率很低[5],所以早期診斷極為困難。早期快速的實驗室診斷方法能夠為患者的治療和預(yù)后提供較大幫助。由于條件限制,對于基層而言,實驗室診斷TBM常用的檢測方法是:抗酸桿菌(AFB)涂片和分枝桿菌培養(yǎng)。AFB涂片雖然快速、價低,但是腦脊液標本陽性檢出率及敏感性都很低,而分枝桿菌培養(yǎng)周期長、不能滿足臨床早期、快速診治的需求,故尋求一種新的快速、準確且高敏感度和高特異度的實驗室診斷方法成為TBM檢測工作的重要目標。GeneXpert是以全自動半巢式實時PCR技術(shù)為基礎(chǔ),以rpoB基因為靶基因,在2 h內(nèi)同時快速檢測結(jié)核分枝桿菌和利福平(rifampin,RIF)耐藥。2013年GeneXpert檢測作為新型分子診斷技術(shù)被WHO推薦用于肺外結(jié)核的診斷[6-7]。但目前GeneXpert用于腦脊液樣本的診斷價值說法不一,本研究中,通過對比分析AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)、GeneXpert檢測對TBM的診斷效能,進一步評估GeneXpert檢測對TBM的診斷價值。

        1 資料和方法

        1.1 臨床資料

        收集2019年1月至2020年6月陜西省結(jié)核病防治院收治的同時采用AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)和GeneXpert檢測的142例疑似TBM患者,其中確診TBM組中男52例(63.4%)、女30例(36.6%);年齡12~76歲,中位年齡為32(25,47);非TBM組中男33例(55.0%)、女27例(45.0%),年齡14~81歲,中位年齡為30(25,56)。所有患者臨床確診資料均來源于臨床原始病例記錄,且通過本院倫理委員會審核,獲得所有患者知情同意。

        1.2 診斷依據(jù)

        參照2010年國際TBM協(xié)作組[8]制定的評分標準,按此標準,臨床診斷為TBM患者共82例(包括確診的TBM 46例,很可能的TBM 26例,可能的TBM 10例);非TBM組60例患者(包括臨床評分<6分的疑似結(jié)核性腦膜炎患者38例,化膿性腦膜炎15例,病毒性腦膜炎7例)。

        1.3 主要試劑和儀器

        抗酸染色試劑為實驗室自配萋尼染色試劑;MGIT960檢測系統(tǒng)所用的培養(yǎng)儀及試劑均由美國BD公司提供;GeneXpert檢測系統(tǒng)及配套試劑盒均購于美國Cepheid公司。

        1.4 實驗室檢測方法

        按照無菌采集標本的要求收集留取腦脊液≥5 mL,每份標本均進行AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)和GeneXpert檢測。

        1.4.1 AFB涂片 嚴格按照《結(jié)核病實驗室檢驗規(guī)程》[9]操作。將腦脊液標本用一次性吸管吸取少許于潔凈玻片上涂片,大小約為1 cm×2 cm、干燥后萋尼染色鏡檢,按照檢驗規(guī)程報告結(jié)果。

        1.4.2 MGIT960培養(yǎng) 嚴格按照《結(jié)核病實驗室檢驗規(guī)程》[9]操作。取0.5 mL腦脊液標本接種至MGIT960培養(yǎng)管中,加入0.8 mL營養(yǎng)添加劑(OADC)和雜菌抑制劑(PANTA)的混合液,嚴格按照說明進行操作。將接種好的MGIT960培養(yǎng)管放入MGIT960系統(tǒng)中孵育,儀器對分枝桿菌的生長進行自動監(jiān)測。儀器報陽后采用結(jié)核分枝桿菌抗原檢測試劑盒(MPB64)進行結(jié)核分枝桿菌和非結(jié)核分枝桿菌的初步鑒定[10]。

        1.4.3 GeneXpert 嚴格按照操作說明書進行檢驗。將1 mL腦脊液標本與2 mL GeneXpert系統(tǒng)前處理液混合,擰緊瓶蓋,渦旋振蕩15 s,室溫靜置15 min,使標本充分液化,將消化后的2 mL樣品用無菌吸管吸入GeneXpert系統(tǒng)測試盒中,上機檢測,約2 h報告結(jié)果。

        1.5 統(tǒng)計學方法

        采用SPSS 20.0軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學分析。以臨床確診患者為參考標準,評價AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)、GeneXpert技術(shù)的敏感度、特異度、符合率、陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值。組間率的比較采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 不同檢測方法對TBM的陽性檢出率

        回顧性分析臨床確診142例的住院患者,其中臨床確診為結(jié)核性腦膜炎有(TBM組)82例(82/142,57.7%),其中AFB涂片檢出陽性3例,陰性79例,陽性檢出率為3.7%(3/82);MGIT960培養(yǎng)檢出陽性20例,陰性62例,陽性檢出率為24.4%(20/82);Xpert分子檢出陽性33例,陰性49例,陽性檢出率為40.2%(33/82)。

        2.2 不同檢測方法診斷TBM的檢測效能

        以臨床確診患者為標準,AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)、GeneXpert對TBM的檢測效能見表1。腦脊液標本AFB涂片的敏感度低于MGIT960培養(yǎng)(χ2=14.615,P<0.05),GeneXpert檢測的敏感度高于AFB涂片的敏感度(χ2=32.031,P<0.05)和MGIT960培養(yǎng)(χ2=4.711,P<0.05)。

        表1 不同檢測方法對TBM診斷效能分析

        3 討論

        TBM是神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)核病最常見的類型,由結(jié)核分枝桿菌侵入蛛網(wǎng)膜下隙引起軟腦膜、蛛網(wǎng)膜病變進而累及腦血管,部分可累及腦實質(zhì),在我國為常見病,致殘率及死亡率高[11]。由于TBM早期臨床癥狀不明顯和缺乏特異性常常導(dǎo)致診斷的延誤,從而影響患者的生存質(zhì)量并危及生命。傳統(tǒng)的細菌學檢測方法仍是結(jié)核病診斷的“金標準”,然而與痰標本不同,腦脊液標本實驗室檢查中AFB涂片查找抗酸桿菌的陽性率很低,而分枝桿菌培養(yǎng)周期長、不能滿足臨床早期、快速、準確診治的需求,故尋求一種新的快速、準確且高敏感度和高特異度的診斷方法成為TBM檢測工作的重要目標。而GeneXpert作為新型分子診斷技術(shù),其在肺外結(jié)核中的診斷價值已被多項研究評估[12-14],認為應(yīng)用GeneXpert檢測胸腔積液、骨關(guān)節(jié)結(jié)核部位膿液標本具有較高的敏感度和檢測方法的優(yōu)越性,被認為可用于肺外結(jié)核的各種類型的臨床標本檢測的確證性診斷試驗,但對于腦脊液的診斷敏感度還存在爭議[15-17],需要進行更深入的研究[18]。2019年鄭立恒,等[19]以臨床診斷為診斷標準比較了AFB涂片和GeneXpert檢測方法在TBM中的診斷敏感度,分別為4.44%(2/45)和35.56%(16/45)。鄭會強,等[20]以臨床診斷為標準比較了MGIT960培養(yǎng)和GeneXpert檢測方法在TBM中的診斷敏感度,分別為19.7%(14/71)和42.3%(30/71)。本研究中以臨床確診為診斷標準比較了AFB涂片、MGIT960培養(yǎng)和GeneXpert3種檢測方法在TBM中的診斷敏感度,分別為3.7%(3/82;95%CI:0.4%~7.7%),24.4%(20/82;95%CI:15.1%~33.7%)和40.2%(33/82;95%CI:29.6%~50.9%)。相比于上面提到的研究,本研究中AFB涂片敏感度較低,分析原因主要有以下2點:①腦脊液標本含菌量本就較低,而由于腦脊液所處位置特殊,每次所留取樣本量較少,含菌量更少,使得AFB涂片陽性檢出率更低;②本研究中AFB涂片法的腦脊液標本染色具體實驗操作方法同痰液,冷染0.5 h,而腦脊液標本相比痰液黏附率本身就很低[21],冷染時間長,固定效果減弱沖片時更容易脫落,且AFB涂片需抗酸桿菌達到5×103~1×104個/mL的濃度才能檢測出陽性結(jié)果,涂片樣本量難以達到檢測需求故而陽性檢出率更低。MGIT960培養(yǎng)的敏感度較高的可能原因為:①本研究入選TBM患者選擇嚴格;②MGIT960培養(yǎng)對環(huán)境要求極高,操作較為復(fù)雜,但所有操作人員均受到嚴格的訓(xùn)練,操作規(guī)范。

        本研究中,GeneXpert檢測的敏感度明顯高于其他兩種檢測方法,其中MGIT960培養(yǎng)和GeneXpert的檢測陽性者僅有10例為同時陽性,重疊比例較低,這可能的原因為:本研究中大多TBM患者在留取樣本之前已服用抗結(jié)核藥物治療,而結(jié)核菌培養(yǎng)主要檢測的是活的結(jié)核分枝桿菌,GeneXpert主要檢測的是結(jié)核分枝桿菌的DNA,抗結(jié)核藥物會影響結(jié)核分枝桿菌的培養(yǎng)陽性檢出率,且MGIT960培養(yǎng)與GeneXpert的細菌濃度陽性閾值檢測限也不同(前者為10~100條/mL,后者為131條/mL)。在這3種檢測方法中GeneXpert檢測有明顯的優(yōu)點:操作簡便、快速、2 h可在患者標本中直接檢測結(jié)核分枝桿菌,敏感度高,對TBM的早期診斷、治療和預(yù)后有很大的幫助,且能檢測利福平是否耐藥。

        本研究也存在一定的局限性,①雖然統(tǒng)計了一年半的疑似病例,但最終納入的TBM患者樣本量仍然很少;②由于實驗室檢測條件有限,無法對不相符的檢測結(jié)果進行深入研究。

        綜上所述,AFB涂片檢測TBM的陽性率極低,MGIT960培養(yǎng)周期較長,不適于TBM的早期診斷。GeneXpert檢測的敏感度明顯高于傳統(tǒng)的AFB涂片和結(jié)核菌培養(yǎng),且生物安全風險性極低,對TBM早期診斷具有良好的指導(dǎo)意義。在臨床工作中優(yōu)先選擇GeneXpert檢測用于診斷,幫助TBM患者早期診斷,減少漏診及誤診,降低死亡率。

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