潘姣,肖文潔,鮑新坤,孫光軍,林愛珍
1.湖北中醫(yī)藥大學(xué),湖北 武漢 430065;2.湖北省中醫(yī)院,湖北 武漢 430065
便秘是一種臨床常見的功能性胃腸疾病,女性和65歲以上的群體發(fā)病率較高[1],其主要臨床表現(xiàn)為排泄物在腸道內(nèi)長時間滯留、排泄不通暢或者內(nèi)容物干結(jié)缺水致使排出困難等[2]。便秘不僅會導(dǎo)致胃腸神經(jīng)功能紊亂,誘發(fā)心腦血管意外,在結(jié)直腸癌、肝性腦病的發(fā)生也有重要作用,嚴(yán)重影響人們的生存質(zhì)量[3]。研究表明,腸道菌群通過與宿主免疫系統(tǒng)產(chǎn)生相互作用參與機體的生理功能,一旦宿主微生物群的紊亂則會導(dǎo)致腸道功能障礙[4]。因此,便秘的發(fā)生與機體內(nèi)腸道菌群失調(diào)有一定的相關(guān)性。
Citespace軟件[5]是由陳超美教授研發(fā)的能夠?qū)⒛硞€知識領(lǐng)域繪制成知識圖譜的信息分析軟件,可了解該領(lǐng)域研究前沿的突現(xiàn)和發(fā)展進程,探測該學(xué)科的研究熱點和發(fā)展前沿。近年來,腸道菌群與便秘的關(guān)系備受關(guān)注,基于腸道菌群的便秘研究層出不窮。本研究應(yīng)用Citespace5.6.R5版本,以SCI-EXPANDED、SSCI、CCR-EXPANDED、IC數(shù)據(jù)庫為文獻來源[6],對2001—2019年來腸道菌群和便秘的研究現(xiàn)狀進行文獻計量學(xué)及可視化分析,以掌握該領(lǐng)域的研究現(xiàn)狀及方向。
1.1文獻來源與檢索策略文獻來源于Web of Science核心合集數(shù)據(jù)庫;檢索策略:檢索式:TS=(colonic inertia OR constipation OR dyschezia)AND TS=(microbe OR gut microbiota OR intestinal flora OR intestinal microflora OR gut flora OR bacteria)語種:English,時間跨度:2001—2019年,索引:SCIEXPANDED,CCR-EXPANDED,SSCI,IC。將檢索結(jié)果的全記錄與引用的參考文獻以純文本的格式導(dǎo)出,并以“download_xxxx”格式命名,置于Input文件夾中。
1.2方法運用Citespace 5.3.R5軟件和EXCEL表格分別從年度發(fā)文量、國家-機構(gòu)分布情況、作者分布情況、期刊被引、關(guān)鍵詞及文獻被引進行分析與可視化。通過關(guān)鍵詞來推測腸道菌群與便秘的研究現(xiàn)狀、熱點與研究趨勢。
2.1年度發(fā)文量分析通過對基于腸道菌群的便秘研究年度發(fā)文量進行統(tǒng)計分析揭示該領(lǐng)域2001—2019年的研究文獻量變化,從總體上把握國際上該領(lǐng)域的研究態(tài)勢。研究發(fā)現(xiàn),腸道菌群的便秘期刊發(fā)文量和文獻被引頻次呈上升趨勢。①2001—2007年共發(fā)表71篇,年平均發(fā)文10.14篇,總被引頻次824次,均篇117.7次,為該領(lǐng)域緩慢上升期;②從2008—2012年開始發(fā)文量小幅度上升,發(fā)文量共75篇;③2012—2014年發(fā)文量呈下降趨勢,文獻被引頻次總體處于上升期,總被引頻次2 243次;④2015—2019年該領(lǐng)域研究處于蓬勃發(fā)展期,2019年發(fā)文量為近年來最高值,高達78篇,總被引頻次8 419次,均篇1 683.8次。見表1,圖1、圖2。
表1 2001—2019年基于腸道菌群的便秘研究的年度分布情況
圖1 年度發(fā)文趨勢
圖2 年度引文趨勢
2.2國家與機構(gòu)分布應(yīng)用Citespace軟件可生成國家可視化圖譜:網(wǎng)絡(luò)節(jié)點數(shù)量28個,連線44條;機構(gòu)可視化圖譜:網(wǎng)絡(luò)節(jié)點數(shù)量85個,連線97條。發(fā)文量前5位的國家是美國、中國、日本、意大利、韓國,從發(fā)文量及中心性推斷美國、意大利、中國是腸道菌群和便秘領(lǐng)域的研究主力,而美國、意大利在該領(lǐng)域合作緊密,對于提高發(fā)文量具有獨特的優(yōu)勢。發(fā)文量排名前5位的機構(gòu):南京大學(xué)、重慶大學(xué)、美國Cedars-Sinai醫(yī)學(xué)中心、美國梅奧診所、西南大學(xué),從發(fā)文量及中心性推斷美國梅奧診所在該領(lǐng)域的影響最大,中國的機構(gòu)發(fā)文量躋身于前5位,表明我國在該領(lǐng)域研究進展處于前沿,但是機構(gòu)發(fā)文量中心性較低,未進入前5名,表明文獻在國際上影響力較低。見表2、表3,圖3、圖4。
表2 發(fā)文量和中心性排名前5位的國家
表3 發(fā)文量和中心性排名前5位機構(gòu)
圖3 國家可視化圖譜
圖4 機構(gòu)可視化圖譜
2.3作者分布與作者共被引分析通過作者合作網(wǎng)絡(luò)共現(xiàn)圖譜和作者共被引圖譜分析可以發(fā)現(xiàn),該領(lǐng)域的核心作者以及主要研究團體,可為團體之間開展合作提供參考依據(jù)。運用Citespace5.6.R5軟件生成作者合作網(wǎng)絡(luò)共現(xiàn)圖譜(圖5)發(fā)現(xiàn),網(wǎng)絡(luò)節(jié)點數(shù)量114個,連線284條;生成作者共被引可視化圖譜(圖6),網(wǎng)絡(luò)節(jié)點數(shù)量456個,連線1 603條。發(fā)文量≥5篇的作者是XIN ZHAO 8篇、HAO ZHANG 6篇(Centrality:0.01)、XIAOLONG GE 6篇、NING LI 6篇、HONGLIANG TIAN 6篇、JIANFENG GONG 6篇、CHAO DING 6篇、YU QIAN 5篇、JIANXIN ZHAO 5篇、MARK PIMENTEL 5篇、WEI CHEN5篇。研究者以XIN ZHAO和YU QIAN、HONGLIANG TIAN和CHAO DING為主的研究團隊形成緊密的合作交流關(guān)系,其中以XIN ZHAO為首的研究者在便秘領(lǐng)域占主導(dǎo)地位。研究的主要內(nèi)容是發(fā)酵乳桿菌對由活性炭誘導(dǎo)便秘小鼠的治療和預(yù)防作用[7-8]。HAO ZHANG發(fā)文量排名第2,但中心性排名最高,說明其文獻在國際上影響力較大,主要研究乳桿菌和雙歧桿菌對改善便秘癥狀的作用機制[9]。作者共被引頻次前5名的研究者分別是:PIMENTEL M(63次)、LONGSTRETH GF(58次)、DROSSMAN DA(56次)、GIBSON GR(52次)、ZHU LX(41次);其中引文量最高的作者為PIMENTELM,主要研究:①腸道菌群與腸易激綜合征相關(guān)性[10];②利福昔明對腸易激綜合征患者臨床癥狀的影響[11];③腸道菌群多樣性及代謝產(chǎn)物對結(jié)腸轉(zhuǎn)輸時間的影響研究[12]。作者共被引中心性前5名研究者分別是:GIBSON GR(0.28)、CUMMINGS JH(0.19)、DROSSMAN DA(0.14)、CAMILLERI M(0.14)、KHALIF IL(0.13)。中心性排名最高的作者為GIBSONGR,主要研究方向是益生菌調(diào)整腸道微生物群結(jié)構(gòu)的作用機制[13]。
圖5 作者合作網(wǎng)絡(luò)共現(xiàn)圖譜
圖6 作者共被引可視化圖譜
2.4期刊被引分析運用Citespace軟件分析得到期刊共被引圖譜,生成網(wǎng)絡(luò)節(jié)點165個、連線474條,見圖7。期刊共被引排名前5位的期刊分別是:GASTROENTEROLOGY(291次)、GUT(262次)、AM J GASTROENTEROL(234次)、ALIMENT PHARM THER(185次)、DIGEST DIS SCI(171次);中心性排名前5的期刊分別是:APPL ENVIRON MICROB(0.25)、BRIT J NUTR(0.21)、J NUTR(0.19)、GUT(0.18)、AM J CLIN NUTR(0.17)。結(jié)合期刊共被引排名及中心性分析,推測期刊GASTROENTEROLOGY、GUT、APPL ENVIRON MICROB在腸道菌群與便秘的研究領(lǐng)域影響力較高。
圖7 期刊共被引圖譜
2.5關(guān)鍵詞分析通過關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析可以發(fā)現(xiàn)基于腸道菌群的便秘研究熱點,關(guān)鍵詞聚類分析可以發(fā)現(xiàn)該領(lǐng)域研究的主要方向。運用Citespace軟件分析,合并gut microbiota,intestinal microbiota,gut microbiome,intestinal microflora等詞,得到關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜,形成節(jié)點215個、連線947條,見圖8、圖9,共形成8個不同的聚類,關(guān)鍵詞聚類分析結(jié)果表明,腸道菌群紊亂誘發(fā)與便秘相關(guān)疾病研究、微觀發(fā)病機制研究及臨床治療是腸道菌群和便秘領(lǐng)域的主要研究方向。高頻關(guān)鍵詞有constipation(177次)、gut microbiota(143次)、microflora(95次)、probiotics(88次);中心性高的關(guān)鍵詞有diarrhea(0.19)、constipation(0.18)、metabolism(0.14)、gastrointestinal symptom(0.10)。從圖譜可以看出,除去與檢索策略相關(guān)的constipation和gut microbiota,共現(xiàn)頻次最高的詞是probiotics,即益生菌。益生菌是胃腸道系統(tǒng)內(nèi)的微生物,參與維持宿主機體健康,其作用機制主要包括抑制潛在病原菌生長、調(diào)節(jié)宿主微生物群、改善腸黏膜屏障功能以及刺激宿主產(chǎn)生免疫及清除功能[14]。此外,雙歧桿菌、乳酸菌、鏈脂肪酸、益生元、丁酸鹽、甲烷、新陳代謝等出現(xiàn)的頻率較高。由此可見,這些腸道細(xì)菌及其代謝產(chǎn)物是基于腸道菌群的便秘研究熱點。
圖8 高頻關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜
圖9 關(guān)鍵詞聚類圖譜
2.6文獻被引分析文獻共被引[15]指2篇不同的參考文獻被同一篇施引文獻同時引用,可以揭示特定領(lǐng)域的知識結(jié)構(gòu)演變及發(fā)展趨勢。運用Citespace軟件分析得到腸道菌群的便秘研究文獻共引圖譜,共有387個節(jié)點、1 183條連線,見圖10。從被引頻次來看,2001—2019年基于腸道菌群的便秘研究在國際上被引頻數(shù)最高的文獻是Lixin Zhu于2014年發(fā)表在《基因組學(xué)雜志》(Physiol Genomics)的文章,題為“便秘患者腸道微生物群的結(jié)構(gòu)改變”,其引用頻次為40次,運用橫斷面研究進行試驗,深入探討腸道微生物群變化對便秘患者發(fā)生發(fā)展的影響[16]。研究引用軌跡發(fā)現(xiàn),該文從2014—2019年處于持續(xù)被引用中,能夠看出基于腸道微生物群的便秘研究受到諸多學(xué)者關(guān)注。從中心性排名分析,影響力最高的被引文獻是以Manimozhiyan Arumugam為主MetaHIT團隊于2011年發(fā)表在《自然》(Nature)的文章,題為“人類腸道微生物群的腸型”[17],該研究首次提出“腸型”概念,將腸道菌群分為bacteroides、prevotella、firmicutes共3類,按照腸型對腸道菌群結(jié)構(gòu)分類具有潛在的臨床意義[18]。
圖10 文獻被引分析
文獻共被引分析結(jié)果,共形成10個聚類領(lǐng)域(聚類序號越大表明該聚類中包含的文獻越少),分別是:#0慢傳輸型便秘、#1腸易激綜合征、#2腸道微生物群、#3行為問題、#4文獻綜述、#5評估甲烷呼氣試驗、#6糞便質(zhì)地、#7吸煙相關(guān)、#8帕金森病、#9胃腸道菌群的改變。圖11中實線長短代表該聚類的時間跨度,顏色的深淺代表時間的遠近。其中聚類#8是最新形成的聚類,可以認(rèn)為是腸道菌群和便秘領(lǐng)域的研究前沿和發(fā)展方向。由圖11可知,該領(lǐng)域早期研究的重點在臨床試驗和診斷方面(#4review article、#5evaluating breath methane),#4主要通過收集腸道細(xì)菌參與腸易激綜合征、炎癥性腸病、胰腺炎和慢性肝病發(fā)病機制相關(guān)臨床試驗證據(jù),證明益生菌可能通過參與調(diào)節(jié)腸道菌群和激活人體免疫系統(tǒng)發(fā)揮治療作用,揭示了益生菌治療的重點在于選擇針對疾病適應(yīng)證的菌株。評估呼吸甲烷[19]等標(biāo)志物使診斷慢性便秘及便秘型腸易激綜合征變得更為準(zhǔn)確。在此之后研究熱點轉(zhuǎn)向病因與發(fā)病機制(#2enteric microbiota、#7linking smoking、#9altered gastrointestinal microbiota)。便秘發(fā)生與體內(nèi)乳桿菌、雙歧桿菌以及擬桿菌數(shù)量減少,梭桿菌和腸桿菌數(shù)量增加相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),吸煙會影響腸道微生物的組成,主要涉及擬桿菌屬、厚壁菌門和放線菌門等[20]。關(guān)注與腸道菌群相關(guān)的病種研究及臨床治療(#0slow transit constipation、#1irritable bowel syndrome、#3behavioral problem、#6stool consistency、#8parkinsons disease)。由腸道菌群紊亂誘發(fā)與便秘相關(guān)的疾病主要包括便秘型腸易激綜合征、自閉癥譜系障礙、帕金森病、慢性輸型便秘。研究表明,中樞神經(jīng)系統(tǒng)控制腸道微生物群主要通過腎上腺素能神經(jīng)元傳遞信號,并參與調(diào)節(jié)腸運動和神經(jīng)免疫應(yīng)答[21]?!熬?腸-腦軸”學(xué)說的發(fā)展為帕金森病的治療提供了新的方向。微生態(tài)制劑、糞菌移植等可以通過調(diào)節(jié)微生態(tài)平衡改善糞便黏稠度、增加糞便排出頻率、減少結(jié)腸轉(zhuǎn)運時間達到治療目的,進而提高患者的生活質(zhì)量[22]。
圖11 文獻被引timeline視圖
近年來,腸道菌群和便秘的研究領(lǐng)域發(fā)文量明顯增加,引起諸多學(xué)者的廣泛關(guān)注。通過對關(guān)鍵作者分析,其中XIN ZHAO、HAO ZHANG等發(fā)文量位居前列,上述作者部分合作頻繁,部分交流較少,僅限于單個小團體。研究的國家及機構(gòu)遍布全球,該領(lǐng)域研究最成熟的國家是美國和中國,主要研究機構(gòu)集中在大學(xué)。其中美國Cedars-Sinai醫(yī)學(xué)中心以及梅奧診所作為權(quán)威機構(gòu),與各國之間開展合作關(guān)系,共同推進該領(lǐng)域的發(fā)展,影響力深遠。通過對關(guān)鍵詞的分析,可以了解腸道菌群和便秘的研究熱點主要是腸道細(xì)菌及其代謝產(chǎn)物。便秘患者的腸道菌群中糞腸桿菌、乳酸鏈球菌、芽孢桿菌和埃希-志賀菌屬占主導(dǎo)地位[23],這些菌群的微生態(tài)失衡是引起便秘的一個重要原因,而益生菌如乳酸桿菌、酪酸桿菌產(chǎn)生醋酸和乳酸等酸性代謝產(chǎn)物[24],能有效降低腸腔內(nèi)pH值,刺激腸道蠕動輔助排便,為微生態(tài)制劑運用于便秘的治療提供了理論基礎(chǔ)。通過文獻共被引分析發(fā)現(xiàn),該領(lǐng)域研究的動態(tài)為腸道菌群失調(diào)誘發(fā)與便秘相關(guān)疾病研究、病因與發(fā)病機制及臨床治療。便秘型腸易激綜合征、自閉癥誘系障礙、帕金森病、慢性傳輸型便秘是腸道菌群與便秘相關(guān)的臨床研究熱點病種。帕金森病和便秘的關(guān)系與腸道微生物群通過免疫反應(yīng)影響循環(huán)中抗感染與促炎因子水平相關(guān),間接影響大腦功能及行為活動[25]。隨著“菌群-腸-腦軸”學(xué)說的深入研究,使帕金森病的研究成為該領(lǐng)域的新近前沿。表明腸道菌群的便秘研究領(lǐng)域在疾病譜中不斷延伸。目前治療上西醫(yī)聚焦于對具體菌種種植的研究和微生態(tài)制劑的應(yīng)用,中醫(yī)藥在臨床中治療便秘不良反應(yīng)少且兼有補益功效,展現(xiàn)出獨特的優(yōu)勢。通過口服中藥調(diào)控腸道菌群平衡治療便秘的機制研究在不斷發(fā)展完善中。通過對期刊分析發(fā)現(xiàn),GASTROENTEROLOGY雜志刊載了該領(lǐng)域的高影響力文獻,方便為后續(xù)科研人員提供信息來源。
本文運用Citespace5.6.R5軟件對近十年腸道菌群和便秘的研究現(xiàn)狀進行文獻計量學(xué)和可視化分析,并進行知識圖譜繪制,協(xié)助相關(guān)專業(yè)人士梳理全球范圍內(nèi)腸道菌群和便秘研究的現(xiàn)狀,羅列出關(guān)鍵作者和核心機構(gòu)并分析其研究方向,以便及時掌握該領(lǐng)域的研究熱點和未來的研究趨勢。同時為各科研機構(gòu)及作者之間拓展合作網(wǎng)絡(luò),搭建學(xué)術(shù)交流提供信息平臺,進一步鞏固團隊在腸道菌群和便秘研究領(lǐng)域的學(xué)術(shù)地位,共同提高科研水平、推動腸道菌群和便秘研究領(lǐng)域向新的里程發(fā)展。但是本研究存在不足之處,僅納入了Web of Science核心合集文獻,文獻數(shù)量有限,雖然對某些意義相同的專業(yè)術(shù)語進行了合并,但存在偏倚可能。