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        淡水環(huán)境中抗生素抗性基因的來源、歸趨和風(fēng)險

        2021-09-22 13:20:42陳笑雪王智源管儀慶陳求穩(wěn)黃玉嚴(yán)晗璐杜云彬劉小華劉超
        生態(tài)毒理學(xué)報 2021年3期
        關(guān)鍵詞:磺胺類淡水抗性

        陳笑雪,王智源,管儀慶,陳求穩(wěn),黃玉,嚴(yán)晗璐,杜云彬,劉小華,劉超

        1. 河海大學(xué)水文水資源學(xué)院,南京 210098 2. 水利部/交通運輸部/國家能源局南京水利科學(xué)研究院生態(tài)環(huán)境研究所,南京 210029

        自20世紀(jì)40年代青霉素投入臨床使用以來,抗生素作為人類和動物體內(nèi)病原性目標(biāo)致病菌的致死藥物,被廣泛應(yīng)用于醫(yī)療臨床及畜禽和水產(chǎn)養(yǎng)殖。全球抗生素使用量近15年上升了65%[1],我國抗生素生產(chǎn)量和使用量全球居首,年均使用量超過15萬t[2]??股氐漠a(chǎn)能過剩、過量使用以及抗生素廢水的處理與排放缺乏有效監(jiān)管,導(dǎo)致大量未被生物體充分吸收和代謝的抗生素隨城市尾水、養(yǎng)殖廢水等途徑直接或間接進入河湖水生態(tài)系統(tǒng),因此河湖水體中抗生素檢出率不斷上升[3]??股氐某志眯原h(huán)境殘留對環(huán)境微生物群落施加進化選擇壓力,催生了具有多重耐藥基因的抗性細菌[4]。

        抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)兼具“可自我復(fù)制和傳播擴散”的生物特性與“不易消亡和環(huán)境持久”的物化特征,可在不同細菌間橫向轉(zhuǎn)移甚至自我擴增,導(dǎo)致微生物耐藥性快速擴散,被認(rèn)定為一種新型環(huán)境污染物[5]。目前在養(yǎng)殖場廢水、污染處理廠、淡水地表水、飲用水、土壤、沉積物和空氣等不同環(huán)境介質(zhì)中檢測出的ARGs高達50余種[6]。耐藥菌株大量繁殖的后果是抗生素的治療效能逐漸降低甚至消失,最終導(dǎo)致無藥可醫(yī)。全球每年約70萬人死于耐藥性病原菌感染,淡水體中抗生素耐藥菌及ARGs的廣泛分布和快速傳播已成為全球性的環(huán)境健康熱點問題[7]。本文綜述了國內(nèi)外淡水環(huán)境中ARGs主要來源、分布特征、傳播擴散途徑和風(fēng)險形成機制的研究進展,歸納了未來一段時期關(guān)于淡水環(huán)境中ARGs的研究熱點和趨勢,以期為ARGs環(huán)境與健康風(fēng)險管控提供參考。

        1 淡水環(huán)境中抗生素及抗性基因的主要來源(Main source of antibiotics and resistance genes in freshwater environment)

        1.1 醫(yī)療及制藥廢水

        醫(yī)療和制藥廢水中抗生素的殘留濃度較高,易誘導(dǎo)產(chǎn)生ARGs。人體通過口服或注射服用抗生素后,腸道內(nèi)會誘導(dǎo)產(chǎn)生耐藥菌株。這些耐藥菌株隨糞便排出體外進入醫(yī)療廢水,大大增加了醫(yī)療廢水中耐藥抗性菌株和ARGs的檢出頻率。例如,我國河南省新鄉(xiāng)市3家醫(yī)院廢水中tetO絕對豐度高達(8.34±1.23)×107copies·mL-1[8]。ermB在北京海淀區(qū)某醫(yī)院醫(yī)療廢水中的相對豐度高達2.1×10-2copies·16S-rRNA-1[9]。國外醫(yī)療廢水中的ARGs豐度也處于較高水平。例如,羅馬尼亞的克魯日醫(yī)院廢水中磺胺類抗性基因sul1相對豐度為5.33×10-2~1.94×10-1copies·16S-rRNA-1,β-內(nèi)酰胺類抗性基因blaSHV的相對豐度為1.69×10-3~4.39×10-3copies·16S-rRNA-1[10]。ARGs的高檢出率和豐度水平表明醫(yī)院廢水是ARGs污染的主要來源。

        醫(yī)療廢水中以四環(huán)素類、大環(huán)內(nèi)酯類、磺胺類、喹諾酮類和β-內(nèi)酰胺類抗性基因居多。中國北方醫(yī)院[8-9, 11]廢水中含有四環(huán)素類、大環(huán)內(nèi)酯類、磺胺類、喹諾酮類和β-內(nèi)酰胺類ARGs。荷蘭醫(yī)院廢水中以大環(huán)內(nèi)酯類(ermB、ermF)、四環(huán)素類(tetB、tetM)、喹諾酮類(qnrS)和β-內(nèi)酰胺類(blaOXA、blaSHV)抗性基因為主[12]。美國密西根州[13]、新加坡[14]、越南[15]、瑞典[16]和印度中部[17]醫(yī)院廢水中檢出較高豐度的β-內(nèi)酰胺類抗性基因。

        抗生素類藥品生產(chǎn)過程中排放廢水的抗生素殘留含量通常較高,選擇性誘導(dǎo)ARGs的幾率大大增加。中國東南部地區(qū)制藥廢水中檢測出ermB、ermC和qnrS等24種抗性基因,其中ermB含量高達(2.96±0.88)×108copies·mL-1,aac、aph次之,絕對豐度分別為(1.63±2.10)×107copies·mL-1和(2.22±2.72)×107copies·mL-1[18]。中國北方地區(qū)制藥廠廢水中檢測出的ARGs絕對豐度范圍為(1.46±0.34)×102~(1.78±0.51)×108copies·mL-1,其中最終排放廢水中intI1日負荷高達(7.74±0.92)×1016copies[19]。由此可見,制藥廢水中ARGs含量也處于較高水平,已成為水環(huán)境中ARGs的潛在儲存庫。

        醫(yī)療和制藥廢水一般要經(jīng)過自帶的污水系統(tǒng)處理后才能排放到外界,但廢水處理后仍含有較高水平的ARGs。例如,我國遼寧省制藥廢水處理系統(tǒng)可以有效去除四環(huán)素類抗性細菌,但是會使磺胺類抗性細菌濃度上升(5.01×104CFU·mL-1)[20];烏魯木齊醫(yī)院污水處理系統(tǒng)可去除0.86~1.81個數(shù)量級的細菌,但處理后的水中仍然含有濃度為1.01×108~1.39×108CFU·mL-1的抗生素抗性細菌(antibiotic resistance bacteria, ARBs)[21]。歐洲醫(yī)院自帶的污水處理系統(tǒng)僅能將ARGs的相對豐度降低1~3個數(shù)量級,而tetA、blaSHV和sul1只能略微去除[10]。由此可見,處理后的醫(yī)院和制藥廢水依然含有一定水平的ARGs,排入淡水環(huán)境中可能導(dǎo)致ARGs進一步傳播擴散。

        1.2 污水處理廠尾水

        污水處理廠尾水中微生物群落結(jié)構(gòu)復(fù)雜,殘留的抗生素處于亞抑菌濃度級別(指小于最低抑菌濃度的抗菌藥物濃度,可在不影響細菌生長的前提下對細菌耐藥性、致病性等生理學(xué)特性產(chǎn)生影響[22]),已成為ARGs在抗生素選擇性壓力下發(fā)生橫向轉(zhuǎn)移進而傳播擴散的理想場所,尾水中ARGs豐度水平通常處于較高水平。我國江西省北部某地區(qū)污水處理廠尾水中氨基糖苷類、β-內(nèi)酰胺類、磺胺類和四環(huán)素類等9種類型ARGs均有檢出,其中氨基糖苷類抗性基因相對豐度最高,平均豐度達到0.32 copies·16S-rRNA-1[23]。波蘭中部13個污水處理廠均檢出基因blaTEM,平均豐度為103~104copies·mL-1[24]。韓國大光州地區(qū)2個大型污水處理廠尾水中ARGs日負荷高達4.2×1018copies,其中一個污水處理廠尾水中磺胺類抗性基因和β-內(nèi)酰胺類抗性基因水平最高,日負荷分別為2.1×1018copies和1.5×1018copies[25]。

        傳統(tǒng)污水處理工藝中沒有針對ARGs的去除流程,而膜反應(yīng)器、高級氧化等一些新型污水處理技術(shù)雖然對污水中的ARGs有一定的去除效果,但無法實現(xiàn)完全去除[24]。例如,氯消毒工藝可使ARGs減少2.98~3.24個數(shù)量級,紫外線照射使ARGs降低2.48~2.74個數(shù)量級[26];膜生物反應(yīng)器可以使四環(huán)素抗性基因豐度(tetA、tetM和tetW)分別下降了0.88、3.47和2.51個數(shù)量級[27]。氯消毒、紫外照射和膜生物反應(yīng)器的去除機制主要基于ARGs從廢水向污泥、生物膜或沉積物的遷移,而不是從環(huán)境中清除[28]。高級氧化工藝和雙金屬系統(tǒng)可以有效滅活甚至殺死ARBs,達到真正意義上的環(huán)境清除,但氧化劑的去除效果容易受到廢水中腐殖質(zhì)、碳水化合物和脂肪酸等有機物的影響[29-30]。Fenton氧化技術(shù)對sul1、tetX、tetG和intI1的去除率可分別達到3.98、3.80、2.57和4.62個數(shù)量級;UV/H2O2氧化技術(shù)可使尾水中ARGs豐度減少2.8~3.5個數(shù)量級[31]。mFe/nCu雙金屬系統(tǒng)可以有效殺滅ARBs和ARGs,DNA去除效率高達57%,tetA、tetE、tetQ、ermB、sul2和intI1的DNA分別可以去除2.69、2.31、2.18、2.97、2.08和2.76個數(shù)量級[32]。

        污水處理廠尾水中的ARGs排放到淡水環(huán)境后往往導(dǎo)致受納水體ARGs豐度大幅上升,污水處理廠尾水已成為淡水環(huán)境中ARGs的重要來源。我國四川地區(qū)污水處理廠上游檢出sul1 5.40×104copies·mL-1、intI1 4.03×105copies·mL-1以及其他基因(qnrS、tetX、blaTEM和ermB)102~103copies·mL-1,污水處理廠尾水入河后下游水體tetX、blaTEM、ermB和intI1的相對豐度分別高出1.46~3.51倍[33];海河流域子牙河系某支流接受污水處理廠尾水后,四環(huán)素類抗性基因tetA絕對豐度由1.93×104copies·L-1增加到1.26×107copies·L-1,磺胺類抗性基因sul1和sul2的絕對豐度分別從2.85×106copies·L-1和9.18×107copies·L-1增加到1.59×106copies·L-1和8.40×106copies·L-1[34]。

        1.3 養(yǎng)殖廢水

        近年來獸用抗生素在養(yǎng)殖業(yè)廣泛使用,致使畜禽和漁業(yè)養(yǎng)殖廢水成為淡水環(huán)境中ARGs的重要儲存庫。我國北京和江西兩地的養(yǎng)殖廢水中檢出較高豐度的四環(huán)素類抗性基因(tetM、tetX)和大環(huán)內(nèi)酯類抗性基因(ermB、ermF和ermA),絕對豐度分別為(6.91~24.3)×1010copies·mL-1和(7.16~14.5)×1010copies·mL-1[35];西北地區(qū)最大的鱘魚養(yǎng)殖內(nèi)陸湖瀛湖中檢出8類共59種ARGs,養(yǎng)殖水域ARGs相對豐度為5.59×10-6~2.30×10-2copies·16S-rRNA-1,遠高于上游非養(yǎng)殖型水域[36];江蘇省12個畜牧場廢水中檢出5類22種ARGs,其中tetM、sul1、sul2和acrB檢出率為100%,tetG、tetW、tetC、ermB、aph、qnrD和acrA檢出率高于90%[37]。越南隆安蝦類養(yǎng)殖區(qū)分離菌株中sul1、sul2、qnrA和ermB檢出率分別達到94.1%、82.4%、88.2%和94.1%[38]。

        養(yǎng)殖廢水中四環(huán)素類、磺胺類及喹諾酮類抗性基因檢出率最高,與該類抗生素在養(yǎng)殖業(yè)的大量使用密切相關(guān)[39]。我國珠三角鴨魚混養(yǎng)塘中磺胺類抗性基因(sul1和sul2)所占比例超過50%[40];杭州灣河口的水產(chǎn)養(yǎng)殖區(qū)磺胺類抗性基因sul1豐度最高,喹諾酮類抗性基因qnrS次之,相對豐度分別為9.97×10-3copies·16S-rRNA-1和1.94×10-2copies·16S-rRNA-1[41]。但是,養(yǎng)殖場的凈水設(shè)施并不能完全去除ARGs。我國武漢市養(yǎng)豬場廢水凈化后,ARGs豐度仍高達3.1×104~7.1×108copies·L-1,其中4%~57%持續(xù)存在于下游小溪和鄰近土壤中[42];江蘇省金壇市養(yǎng)殖廢水處理后,總ARG的相對豐度降低了84%,厭氧消化、初級沉淀和人工濕地有助于去除ARGs,但次級沉淀則增加了ARGs總含量[43]。

        1.4 源解析與通量估算

        淡水環(huán)境中ARGs污染來源復(fù)雜(圖1),準(zhǔn)確判斷ARGs的排放通量并解析其負荷來源,可以為遏制ARGs環(huán)境污染和規(guī)避生態(tài)風(fēng)險提供理論基礎(chǔ)。Duarte等[44]整合大量文獻中抗生素和ARGs數(shù)據(jù),使用線性混合模型描述兩者整體關(guān)系,并根據(jù)不同抗生素特定的耐藥性選擇效應(yīng)校正濃度系數(shù),建立了一個抗生素選擇潛力聚合風(fēng)險度量模型,可根據(jù)抗生素壓力和環(huán)境隔室的類型預(yù)測ARGs的總體豐度變化。另一方面,ARGs的來源解析面臨許多挑戰(zhàn),來自本地遺傳成分的干擾、其他污染物的選擇作用和ARGs調(diào)查的不全面都會使ARGs追蹤發(fā)生偏差[45]。crAssphage是一種最近發(fā)現(xiàn)的DNA噬菌體,已用于追蹤人類糞便ARGs污染對河流沉積物中ARGs的影響[46-47],并證實河流沉積物中ARGs很大程度受到人類糞便污染程度的影響(50%~63.7%)[48-49]。Chen等[48]結(jié)合快速期望最大化的微生物源跟蹤方法(fast expectation-maximization microbial source tracking, FEAST)與線性判別效應(yīng)分析方法(linear discriminant analysis effect size method, LEfSe),基于高通量測序的宏基因組和crAssphage噬菌體分析,建立了淡水環(huán)境中ARGs來源解析方法,發(fā)現(xiàn)白洋淀80%以上的ARGs負荷來自府河。Chen等[49]使用微生物來源分析工具SourceTracker和crAssphage噬菌體,結(jié)合ARGs和微生物分類的宏基因組特征,系統(tǒng)厘清了ARGs的源匯關(guān)系,量化了不同污染來源對河流沉積物中ARGs的潛在貢獻,證實了污水處理廠尾水貢獻了河流沉積物中81.6%~92.1%的ARGs和49.3%~68.1%的微生物。總體而言,宏基因組學(xué)是構(gòu)建ARGs源追蹤方法框架的核心,對ARGs源解析具有深遠意義[45]。

        圖1 淡水環(huán)境中抗生素抗性基因(ARGs)的賦存特征、主要源通量與源解析方法Fig. 1 Occurrence characteristics, main source fluxes and source analysis methods of antibiotic resistance genes (ARGs) in freshwater environment

        2 淡水環(huán)境中抗生素抗性基因多介質(zhì)分布和歸趨特征(Multimedia distribution and fate characteristics of antibiotic resistance genes in freshwater environment)

        近年來ARGs在淡水不同環(huán)境介質(zhì)中被廣泛檢出(圖2),檢出率最高的是四環(huán)素類抗性基因和磺胺類抗性基因。國內(nèi)外典型河流和湖泊的ARGs豐度水平如表1和表2所示。我國北江河中磺胺類ARGs含量最高的是sul1和sul2(平均值分別為1.41×10-2copies·16S-rRNA-1和1.58×10-3copies·16S-rRNA-1),四環(huán)素類ARGs中tetC的相對豐度最高(8.30×10-2~13.20 copies·16S-rRNA-1)[50]。我國海河流域中磺胺類抗性基因sul1是優(yōu)勢ARGs,豐度高達6.4×109copies·mL-1[51];海河流域子牙河支流檢出含量最高的ARGs為四環(huán)素類抗性基因和磺胺類抗性基因,其中tetA和tetB抗性基因的絕對豐度范圍是1.93×104~1.26×107copies·L-1和2.22×104~9.96×104copies·L-1,sul1和sul2抗性基因的絕對豐度是2.85×106~9.18×107copies·L-1和1.59×106~8.40×106copies·L-1[34]。我國西安巴河檢出23種不同類別的ARGs,其中tetC是四環(huán)素類抗性基因中相對豐度最高的ARGs(6.50×10-3~4.50×10-1copies·16S-rRNA-1)[52]。我國太湖sul1的檢出率為100%,其豐度范圍為1.9×103~7.9×105copies·mL-1[53]。淡水環(huán)境已成為ARGs潛在的富集庫和釋放源。

        表1 國內(nèi)外典型河流水相抗生素抗性基因(ARGs)豐度Table 1 The antibiotic resistance genes (ARGs) abundance of typical rivers at home and abroad

        表2 國內(nèi)外典型湖泊ARGs豐度Table 2 ARGs abundance of typical lakes at home and abroad

        圖2 淡水環(huán)境中抗生素抗性基因的主要來源和傳播擴散路徑Fig. 2 The main source and spread of antibiotic resistance genes in freshwater environment

        國內(nèi)淡水ARGs豐度水平整體高于國外,與抗生素水平、人類活動強度和開發(fā)程度有關(guān)[3, 54-55]。在我國,海河、珠江和長江下游人類活動強度高、抗生素使用量大,抗生素排放強度位居全國前3位[54]。長三角80%兒童尿液中檢出獸用抗生素,水源水、飲用水廠、自來水管網(wǎng)及飲用水系統(tǒng)末端中廣泛檢出ARGs,抗生素和ARGs污染問題及其引起的健康風(fēng)險較為突出[56]。相對于河流,湖泊的水體交換能力較弱、換水周期更長,具有更大的潛力來儲存和積累ARGs,抗生素及ARGs的停留時間增加并在湖泊內(nèi)緩慢循環(huán);另一方面,湖泊水產(chǎn)養(yǎng)殖更為普遍,投放的餌料中含有大量抗生素,導(dǎo)致ARGs表達水平上升[3, 57]。長江下游太湖、洪澤湖等淺水湖泊畜禽漁業(yè)養(yǎng)殖發(fā)達,抗生素水環(huán)境賦存量高,導(dǎo)致湖泊中ARGs豐度水平普遍高于河流[58-59]。

        淡水沉積物中ARGs豐度普遍高于上覆水。在我國,西安巴河ARGs最高豐度為5.49×106copies·mL-1,而沉積物中ARGs豐度高達4.38×107copies·g-1[52];長江口沉積物中sul1絕對豐度為3.29×105~2.04×106copies·g-1,比上覆水(2.26×104~3.19×105copies·mL-1)高出1個數(shù)量級;沉積物中的acc(6’)-Ib基因豐度范圍為2.51×106~6.37×106copies·g-1,而在水樣中的豐度范圍2.68×104~3.05×104copies·mL-1[60];太湖地表水和沉積物樣品中所有ARGs的豐度范圍分別為4.8×105~1.5×108copies·mL-1和5.4×106~3.0×1010copies·g-1[53]。

        關(guān)于地下水中ARGs污染的報道相對較少,但已逐漸引起關(guān)注。在我國,深圳茅洲河地下水中檢出127種ARGs和10種可移動遺傳元件,其中116種ARGs與地表水檢出種類一致,主要與地表污水入滲有關(guān)[61];洪湖地下水中含有27種ARGs,其中qnrB、qnrS和tetQ含量均高于地表水[62];廈門東南部垃圾填埋場地下水中檢測出171種ARGs和8種可移動遺傳元件(mobile genetic elements, MGEs),ARGs絕對豐度范圍為2.5×109~1.27×1011copies·L-1,其中多抗基因及β-內(nèi)酰胺類、四環(huán)素類抗性基因含量最高[63]。羅日尼亞地下水中檢出blaSHV、floR、sul1和tetA等11種ARGs,其相對豐度為6.61×10-7~2.30×10-1copies·16S-rRNA-1,其中四環(huán)素類抗性基因(tetC、tetO和tetW)遵循了環(huán)境污染的規(guī)律,可將這組基因作為探尋人類影響的環(huán)境示蹤劑[64]。

        生物膜是淡水環(huán)境中ARGs的重要載體。西班牙托德拉河流域生物膜中含有的sul1和ermB相對豐度分別為10-2copies·16S-rRNA-1和10-3copies·16S-rRNA-1[65],加泰羅尼亞周邊河流生物膜樣本中檢測出高豐度的sul1(10-2.5copies·16S-rRNA-1)、sul2(10-3.2copies·16S-rRNA-1)、ermB(10-2.9copies·16S-rRNA-1)、tetW(10-3.7copies·16S-rRNA-1)和tetO(10-3.3copies·16S-rRNA-1)[66]。中國長江中游生物膜樣品中intI1、sul1、sul2、aac(6’)-Ib、tetA、tetQ和tetW等7種抗性基因的檢出率為100%,磺胺類抗性基因中sul1豐度最高(范圍為3.20×107~2.50×1011copies·g-1)、sul2次之(平均豐度為5.94×108copies·g-1);喹諾酮類抗性基因中acc(6’)-Ib和qnrS絕對豐度最高(范圍為9.75×104~7.44×107copies·g-1和7.28×106~2.52×109copies·g-1);四環(huán)素類抗性基因tetA豐度范圍為2.68×105~4.29×109copies·g-1,大環(huán)內(nèi)酯類抗性基因ermB的最高豐度為1.50×107copies·g-1[60]。

        淡水生態(tài)系統(tǒng)中的各類水生生物也是ARGs的重要載體。細菌和噬菌體間的相互作用促進了ARGs在它們之間的水平轉(zhuǎn)移[81]。淡水細菌和浮游動物間的互作對ARGs轉(zhuǎn)移具有正面影響,例如水蚤相關(guān)的細菌群是tetA的潛在載體,而這些細菌的生物膜結(jié)構(gòu)可能促進ARGs水平轉(zhuǎn)移[82]。葡萄牙地表水分離出的藍藻菌株中檢出strA-strB、sul1和intI1這3種ARGs,且這些菌株對抗生素敏感性較低,這是藍藻可能從環(huán)境中獲得耐藥性并傳播到其他微生物的有力證據(jù)[83]。細菌、噬菌體甚至是胞外DNA都可吸附在水生生物表面或消化道中,水生動物糞便將ARGs釋放到水環(huán)境中使其進一步傳播擴散[3, 57]。ARBs被魚攝入后與腸道細菌接觸,ARGs經(jīng)質(zhì)粒介導(dǎo)在體內(nèi)發(fā)生轉(zhuǎn)移并隨細菌增殖,將近15%的腸道細菌含有編碼抗性基因的質(zhì)粒,魚糞中ARBs是攝入數(shù)量的8倍;斑馬魚后腸ARBs濃度幾乎是前腸的25倍,轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)合體總數(shù)超過108CFU,已成為促進ARGs傳播的重要區(qū)域[84]。

        3 影響抗生素抗性基因水環(huán)境歸趨的主要環(huán)境因子(Main environmental factors affecting the fate of antibiotic resistance genes in water environment)

        整合子、轉(zhuǎn)座子及質(zhì)粒等MGEs是ARGs水平轉(zhuǎn)移的重要載體,其水平轉(zhuǎn)移是促進ARGs傳播擴散的主要機制[85]。密歇根湖沉積物中發(fā)現(xiàn)與質(zhì)粒相關(guān)的ARGs占已鑒定總數(shù)的32%~100%[86]。漳溪河中除萬古霉素抗性基因外的ARGs總豐度與MGEs呈顯著正相關(guān)(P<0.01)[87]。

        菌落結(jié)構(gòu)對ARGs水平轉(zhuǎn)移影響顯著。Zheng等[87]發(fā)現(xiàn)變形細菌(Proteobacteria)的氫藻(Hydrogenophaga)和擬桿菌屬(Bacteroidetes)的小球藻(Prevotella)與ARGs呈顯著正相關(guān)(P<0.05)。Reddy和Dubey[88]發(fā)現(xiàn)美國Cuyahoga河中ARGs豐度與細菌群落組成密切相關(guān),方差分解分析(variance partitioning analysis, VPA)表明細菌群落間的相互作用可解釋80.7%的ARGs豐度變化。印度恒河水中ARGs與桿菌、擬桿菌、甲烷桿菌、假單胞菌、副細菌和酸性細菌顯著相關(guān)[89]。

        溫度是影響ARGs及其載體存活的重要因素,在一定程度上影響ARGs的豐度水平和傳播擴散過程。加拿大Sumas河流域的四環(huán)素類ARGs豐度與溫度呈正相關(guān)(P<0.05),細菌濃度在降雨量較少且溫度較高的夏季較低,而ARGs豐度卻保持較高水平[90]。春季我國寧波市某城郊河道ARGs絕對豐度顯著低于其他季節(jié)(12%~36%),而夏季ARGs絕對豐度最高(2.81×109copies·mL-1),表明溫度升高可能導(dǎo)致ARGs傳播擴散;16S rRNA基因與ARGs之間的顯著相關(guān)性表明溫度也是驅(qū)動ARGs基因轉(zhuǎn)移的潛在因素[87]。

        水環(huán)境中ARGs豐度水平與人類活動強度關(guān)系密切。我國寧波市水庫、森林附近河流中的ARGs豐度與農(nóng)田、城鎮(zhèn)附近河流中的ARGs豐度存在顯著差異,農(nóng)田附近河流樣品中ARGs的絕對豐度比水庫和森林附近河流高3.47倍~5.58倍,而下游城鎮(zhèn)人類活動強度相對較高,附近河流ARGs水平最高[87]。我國北江中ARGs數(shù)量和多樣性主要與污水處理廠、水產(chǎn)養(yǎng)殖場和牲畜廢水等污染源相關(guān),中游地區(qū)的人口密度和污染源少于上游和下游地區(qū),ARGs豐度也相對較低[91]。

        淡水環(huán)境中重金屬、有機物等其他污染物也會影響ARGs的豐度水平。我國北江沿岸的tetW和重金屬可能存在關(guān)聯(lián)[91]。印度恒河中ARGs豐度與重金屬抗性基因(metal resistance genes, MRGs)豐度呈顯著正相關(guān)(P<0.05),這可能源于重金屬的選擇性壓力或ARGs與MRGs之間的共變,但這種穩(wěn)定相關(guān)性表明河流系統(tǒng)中可能發(fā)生了ARGs和MRGs的共選過程[88]。我國溫瑞塘河中總有機碳(total organic carbon, TOC)、溶解性總氮(total dissolved nitrogen, TDN)與ARGs絕對豐度呈正相關(guān),與氨基糖苷類、β-內(nèi)酰胺類、大環(huán)內(nèi)酯-林可酰胺-鏈陽菌素B(MLSB)和四環(huán)素類ARGs豐度的相關(guān)性更強(P<0.01)[92]。我國湖州市染色廢水中孔雀石綠、苯乙烯等6種有機化合物促進RP4質(zhì)粒共軛轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移效率最高超過空白對照組219倍[93]。

        4 淡水環(huán)境中抗生素抗性基因的傳播擴散途徑(Transmission and diffusion of antibiotic resistance genes in freshwater environment)

        盡管淡水地表水環(huán)境中抗生素的賦存水平維持在微克或納克級,但低濃度抗生素的長期暴露不可避免地會通過基因突變誘導(dǎo)、水平傳遞和代際遺傳的方式促使細菌耐藥性產(chǎn)生和擴散。ARGs可通過接合、轉(zhuǎn)化和傳導(dǎo)等多種方式進行水平基因轉(zhuǎn)移(horizontal gene transfer, HGT)[94],水平轉(zhuǎn)移可使非親子生物之間進行遺傳物質(zhì)共享,被認(rèn)為是ARGs傳播的主要機制[95]。整合子、轉(zhuǎn)座子及質(zhì)粒等MGEs在水相和沉積物相中對ARGs傳播的貢獻最大[96]。質(zhì)粒是多種ARGs的攜帶載體,可通過供體菌和受體菌借助抗性菌毛相互連接形成的通道進行傳播[97]。DNA和質(zhì)粒也可在游離狀態(tài)下被感受態(tài)或者開放損傷誘導(dǎo)系統(tǒng)的細菌接受[98],從而完成ARGs在同屬或不同屬細菌間的轉(zhuǎn)移[99]。噬菌體也可幫助ARGs進行水平轉(zhuǎn)移[100],在侵蝕細菌的同時獲得ARGs,在產(chǎn)生新的噬菌體-細菌裂解-釋放新噬菌體-侵蝕新細菌的循環(huán)中積累擴散,噬菌體的蛋白外殼使其在胞外環(huán)境中具有更高的持久性,在ARGs水平轉(zhuǎn)移過程中扮演重要角色[101]。

        ARGs另一個傳播途徑是垂直轉(zhuǎn)移(vertical gene transfer, VGT),指攜帶ARGs的菌株通過自我繁殖將ARGs傳給子代的過程。自然水環(huán)境中有些微生物自帶對抗生素具有抗性的基因序列,這些基因序列可以通過繁殖垂直傳給下一代,使子代也對抗生素具有抗性,而這種ARGs就能在代際增殖過程中繼續(xù)傳播[102]。VGT還有另一種模式,即在發(fā)生水平基因轉(zhuǎn)移的情況下,受體與原始供體結(jié)合后形成的轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)合物通過繼發(fā)性HGT和細胞共同生長,并進一步促進ARGs傳播。轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)合體從獲得的ARGs中發(fā)展出新的性狀,成為ARGs通過VGT傳播的主要驅(qū)動力[100]。

        5 淡水環(huán)境中抗生素抗性基因風(fēng)險形成機制與評價方法(Risk formation mechanism and evaluation method of antibiotic resistance gene in freshwater environment)

        淡水環(huán)境中的ARBs和ARGs無法被降解、稀釋等自然過程完全去除,且ARBs一般不會通過微生物降解或紫外降解失活,即使失活后其含有ARGs的游離DNA仍保持完整并將ARGs傳遞給非抗性菌株[103]。自然淡水體中病原性ARGs轉(zhuǎn)移是罕見且隨機的事件,但病原體仍可能會因為與抗生素抗性菌株接觸足夠長時間而發(fā)生HGT[104]。ARGs通過飲水、食用水產(chǎn)品和農(nóng)產(chǎn)品等途徑進入人體系統(tǒng)后會在腸道菌群內(nèi)部轉(zhuǎn)移[103],促使細菌尤其是致病菌的耐藥性進一步增加,導(dǎo)致抗生素治療效能逐漸降低甚至消失[105]。因此,建立完善ARGs生態(tài)健康風(fēng)險評估體系顯得尤為重要。

        學(xué)術(shù)界已提出包括危害識別、危害評估、暴露評估和風(fēng)險評估的抗生素耐藥性風(fēng)險評估框架[106-107],但微生物功能群落和ARGs之間的關(guān)系[106]、傳播途徑中ARBs數(shù)量以及各種健康后果仍不明確[108]。如何減少這些不確定性對風(fēng)險評估最終結(jié)果的影響,是ARGs風(fēng)險評估方法亟待解決的問題。Ashbolt等[108]提出了基于最小選擇性濃度(minimum selective concentration, MSC)的ARBs發(fā)生閾值評估方法,基于問題表述(危害、風(fēng)險設(shè)置和途徑)、危害暴露評估(ARBs和ARGs)、劑量-反應(yīng)關(guān)系等評估病原體致病風(fēng)險,通過這種病原體風(fēng)險評估(microbial risk assessment, MRA)定性或定量地評估病原體暴露水平及其對人類健康的后續(xù)風(fēng)險,但體外數(shù)據(jù)庫和計算毒理學(xué)研究是ARGs風(fēng)險評估不確定性最小化的關(guān)鍵因素。因此,淡水環(huán)境ARGs轉(zhuǎn)移擴散的分子生物學(xué)調(diào)控機制、風(fēng)險形成過程和人體暴露評估是建立ARGs風(fēng)險評估體系需要突破的關(guān)鍵問題。

        6 結(jié)論與展望(Conclusions and prospects)

        開展ARGs在水生態(tài)系統(tǒng)中的多介質(zhì)環(huán)境行為與生物安全研究,闡明其在淡水環(huán)境中的源匯機制和生物生態(tài)效應(yīng),對ARGs環(huán)境與健康風(fēng)險管控、淡水飲用水安全保障和水生態(tài)系統(tǒng)健康修復(fù)具有重要的理論意義和實踐價值。國內(nèi)外學(xué)者圍繞淡水環(huán)境中ARGs的主要來源、多介質(zhì)分布、轉(zhuǎn)移機制及抗生素抗性與微生物群落的互作機制開展了一系列研究,但目前相關(guān)研究工作仍處于初期發(fā)展階段,關(guān)于ARGs產(chǎn)生過程與歸趨特性的認(rèn)識仍相對局限。建議后期加強關(guān)于ARGs在水生食物鏈中動態(tài)歸趨特征、傳播擴散過程和暴露風(fēng)險形成機制的研究,盡快建立淡水環(huán)境ARGs生態(tài)健康風(fēng)險的系統(tǒng)評估方法。

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