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        靈芝酸生物合成及代謝調(diào)控研究進(jìn)展

        2021-09-14 04:36:26袁愷何偉楊云麗朱威宇彭超安泰李麗周衛(wèi)強(qiáng)
        生物技術(shù)通報(bào) 2021年8期
        關(guān)鍵詞:甾醇信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)靈芝

        袁愷 何偉 楊云麗 朱威宇 彭超 安泰 李麗 周衛(wèi)強(qiáng)

        (1. 中糧營(yíng)養(yǎng)健康研究院有限公司,北京102209;2. 營(yíng)養(yǎng)健康與食品安全北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 102209;3. 北京工商大學(xué)化學(xué)與材料 工程學(xué)院,北京 100048)

        靈芝酸(ganoderic acids,GAs)是靈芝三萜酸的簡(jiǎn)稱,約占靈芝三萜類物質(zhì)的三分之一[1]。盡管已經(jīng)被證明其具有出色的藥用價(jià)值,但是從天然靈芝的子實(shí)體和孢子中提取GAs,存在靈芝栽培工作量大、時(shí)間長(zhǎng)、生長(zhǎng)環(huán)境要求高、GAs含量低等問題,極大地限制了其商業(yè)應(yīng)用和開發(fā)。近年來(lái),靈芝菌深層液體發(fā)酵技術(shù)逐漸成為獲取GAs的重要方法,而靈芝酸生物合成途徑的解析和調(diào)控對(duì)于解決發(fā)酵生產(chǎn)靈芝酸低產(chǎn)量問題又意義重大。本文從GAs的合成代謝途徑出發(fā),首先介紹了利用基因工程手段對(duì)GAs合成代謝途徑進(jìn)行調(diào)控的實(shí)施案例,隨后系統(tǒng)梳理了信號(hào)傳導(dǎo)途徑以及生物表觀遺傳在提高GAs積累量方面的作用原理,并繪制出示意圖,希望為今后進(jìn)一步提高深層液體發(fā)酵產(chǎn)GAs產(chǎn)量提供研究思路。

        1 靈芝酸

        1.1 靈芝酸簡(jiǎn)介

        靈芝酸是靈芝菌的主要活性成分之一[2]。自1982年Kubota[3]首次分離得到靈芝酸A、靈芝酸B以來(lái),已經(jīng)超過100多種GAs被分離出來(lái),其主要結(jié)構(gòu)見圖1。GAs已經(jīng)被證明具有抗腫瘤[4-6]、抗炎[7]、抑菌[4]、抗衰老[8]、助睡眠[9]等作用。例如,靈芝酸A具有抑制炎癥、治療人膠質(zhì)瘤、保肝、抑菌等作用[4,7],靈芝酸DM可以抑制黑色素瘤[10],靈芝酸D可以抑制結(jié)腸癌[5]等。在靈芝菌深層液體發(fā)酵生產(chǎn)GAs的過程中,發(fā)酵參數(shù),如溫度、pH、溶氧等,外源物質(zhì),如植物激素、油脂、苯巴比妥等都對(duì)GAs的生物合成代謝有直接影響作用[11-12]。

        1.2 靈芝酸的合成代謝途徑

        Shiao通過13C同位素標(biāo)記證明GAs的生物合成是由甲羥戊酸(MVA)合成代謝途徑起始[13],并通過3個(gè)階段合成(圖1)。第一階段:前體物質(zhì)生成。首先3分子的乙酰輔酶A經(jīng)過2次縮合形成3-羥-3-甲基戊二酰輔酶A(HMG-CoA),隨后在3-羥-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR)的作用下生成MVA。再經(jīng)過甲基戊酸激酶(MK)和甲羥戊酸激酶(MPK)焦磷酸化、甲羥戊酸脫羧酶(MVD)脫羧化作用下生成異戊烯焦磷酸(IPP)。IPP在異戊二烯焦磷酸異構(gòu)酶(IDI)激活下可異構(gòu)化生成二甲丙烯焦磷酸(DMAPP)。2分子IPP和1分子DMAPP在法尼基磷酸合酶(FPS)催化下頭尾縮合成法尼基焦磷酸(FPP)。第二階段:羊毛甾醇骨架生成。首先FPP在鯊烯合成酶(SQS)催化下轉(zhuǎn)化為鯊烯,隨后在羊毛甾醇合成酶(LSS)催化下生成羊毛甾醇。第三階段:GAs的合成。羊毛甾醇經(jīng)過氧化、羥基化和糖基化生成不同結(jié)構(gòu)的GAs。

        圖1 靈芝酸生物合成途徑Fig.1 Biosynthesis pathways of GAs

        在GAs的合成途徑中,第一、二階段已經(jīng)得到了系統(tǒng)性的研究,涉及的重要酶也被鑒定和表征。但是第三階段的生物轉(zhuǎn)化過程還未完全闡明。Chen等[14]發(fā)現(xiàn)細(xì)胞色素P450單加氧酶(CYP450)催化羊毛甾醇成為不同的GAs。同時(shí)基因測(cè)序發(fā)現(xiàn)有214個(gè)CYPs與靈芝酸下游合成途徑相關(guān),其中有78個(gè)CYPs與LSS共表達(dá),猜測(cè)這78個(gè)CYPs可能參與到靈芝酸骨架結(jié)構(gòu)修飾中。另外有198個(gè)CYPs分屬于24個(gè)基因簇,其中有5個(gè)基因簇與LSS共表達(dá),說明它們?cè)贕As生物合成中發(fā)揮作用[15]。例 如CYP512U6負(fù) 責(zé) 催 化 合 成 靈 芝 酸ZXYL[16],CYP505D13則配合生成環(huán)狀靈芝三萜[17]等。

        2 靈芝酸合成代謝途徑的基因調(diào)控

        作為次級(jí)代謝產(chǎn)物,尤其是存在多種支路的情況下,GAs的合成和積累嚴(yán)格受限于合成代謝途徑中關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄水平。因此,代謝通路中關(guān)鍵酶的過表達(dá)和異源表達(dá)成為獲得GAs高積累量的最直接最有效手段。

        2.1 關(guān)鍵酶基因的過表達(dá)

        在GAs合成代謝途徑的上游有HMGR、FPS、SQS、LSS[18]這4個(gè)關(guān)鍵酶,其基因表達(dá)量與GAs的積累量密切相關(guān)。鐘建江課題組[19]使用同源標(biāo)記基因Cbxr,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化法將N端截?cái)嗟膆mgr(t-HMGR)基因片段導(dǎo)入靈芝細(xì)胞中,對(duì)HMGR催化域進(jìn)行過表達(dá)。在發(fā)酵的第8天,fps、sqs、ls的基因轉(zhuǎn)錄水平出現(xiàn)上調(diào),GAs水平急劇升高,發(fā)酵結(jié)束后t-HMGR基因過表達(dá)菌株中角鯊烯、羊毛甾醇和GAs含量比出發(fā)菌株分別高6.7、3.8、2倍。

        作為MVA生物合成途徑的第一個(gè)多分支點(diǎn),F(xiàn)PS活性直接影響異戊烯焦磷酸(IPP)的催化路徑[20]。Fei等[21]通過過表達(dá)fps發(fā)現(xiàn),基因sqs和ls轉(zhuǎn)錄水平分別上調(diào)2.8倍和1.73倍,GAs、靈芝酸T、靈芝酸S、靈芝酸Me的含量分別為2.76、41、21、28 μg/100 mg菌絲體,比空白組分別高出2.28、2.27、2.62、2.80倍。與Ding等[22]上調(diào)fps轉(zhuǎn)錄水平的結(jié)果相同。類似于FPS,SQS通過控制法尼基焦磷酸將代謝流引向靈芝酸合成代謝途徑,從而避免形成半倍萜。Zhou等[23]通過過表達(dá)sqs,轉(zhuǎn)錄水平提高15.6倍,鯊烯和羊毛甾醇含量分別增加1.55倍和1.68倍,靈芝酸Mk、T、Me、S的含量分別是16、40、43、53 μg/100 mg,比出發(fā)菌株高2.86、2.67、1.95、1.25倍。

        LSS催化2,3-氧化鯊烯形成羊毛甾醇,過表達(dá)lss可以為GAs的生物合成提供足夠的前體物質(zhì)。研究結(jié)果顯示原基時(shí)期的lss表達(dá)量顯著高于菌絲體中的lss表達(dá)量,GAs含量呈現(xiàn)相同趨勢(shì)[24]。Zhang等[25]過表達(dá)lss后羊毛甾醇積累量提高了2.3倍,靈芝酸O、Mk、T、S、MI、Me的含量分別達(dá)到4.66、24.30、69.80、28.90、15.4、26.70 μg/100 mg,相 比出發(fā)菌株提高6.1、2.2、3.2、4.8、2.0、1.9倍。

        2.2 關(guān)鍵基因的異源表達(dá)

        發(fā)酵周期長(zhǎng)是制約GAs商業(yè)應(yīng)用的另一個(gè)主要因素。根據(jù)其他次級(jí)代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)經(jīng)驗(yàn),在合適的底盤微生物中實(shí)現(xiàn)異源表達(dá)將有效縮短發(fā)酵周期,同時(shí)也利于進(jìn)一步提升GAs積累量。青蒿酸[26]、彌羅松酚[27]、人參皂苷[28-29]等植物來(lái)源的天然產(chǎn)物已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了異源表達(dá),但是目前GAs的異源表達(dá)報(bào)道十分少。Wang等[30]通過體外酶促實(shí)驗(yàn)證明羊毛甾醇氧化酶CYP510L8通過3步催化羊毛甾醇的第二十六位碳轉(zhuǎn)化成為靈芝酸Z,經(jīng)異源表達(dá)cyp150l8,又成功實(shí)現(xiàn)靈芝酸Z在釀酒酵母中的合成,發(fā)酵120 h后產(chǎn)量約為14.5 mg/L。為了進(jìn)一步提高CPY510L8活力,研究人員構(gòu)建了新的異源表達(dá)體系CYP510L8-iGLCPR融合蛋白(一種細(xì)胞色素P450還原酶),實(shí)現(xiàn)胞內(nèi)H+的快速轉(zhuǎn)移,從而靈芝酸Z產(chǎn)量提升至154.45 mg/L,相比出發(fā)菌株提高了10倍[31]。毫無(wú)疑問,基因工程手段可以實(shí)現(xiàn)GAs的異源表達(dá),而且更方便進(jìn)行代謝調(diào)控、過程調(diào)控等方面的優(yōu)化。其次,選擇合適的宿主也十分重要。比如上述研究中選擇釀酒酵母,一方面是因?yàn)樗梢宰孕泻铣裳蛎薮?,為GAs合成提供前提物質(zhì)。另一方面是利用其內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和翻譯修飾系統(tǒng)可以表達(dá)CYP510L8和iGLCPR的優(yōu)勢(shì)。

        由此可見,通過基因工程手段對(duì)重要節(jié)點(diǎn)的酶的基因進(jìn)行過表達(dá)或抑制,可以將胞內(nèi)代謝流導(dǎo)向GAs的合成代謝分支,直接有效達(dá)到目標(biāo)產(chǎn)物產(chǎn)量積累的目的。此外,盡管還存在關(guān)鍵酶功能解析不完全、合適宿主的選擇困難等諸多障礙,但是通過構(gòu)建異源表達(dá)系統(tǒng)提高GAs的生產(chǎn)效價(jià)這一路徑極有發(fā)展前景。

        3 靈芝酸合成代謝途徑的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控

        信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑即細(xì)胞對(duì)某些特定刺激做出反應(yīng)的分子途徑。通過信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)實(shí)現(xiàn)對(duì)微生物代謝途徑的調(diào)控已經(jīng)發(fā)展成為一種強(qiáng)有力的策略。在GAs代謝途徑中,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)導(dǎo)信號(hào)包括鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)、活性氧信號(hào)、細(xì)胞壁完整性信號(hào)、茉莉酮酸(JA)及其衍生物信號(hào)、NO信號(hào)、cAMP信號(hào)等 (表1)[32-34]。

        表1 靈芝酸生物合成途徑的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控Table 1 Signal transduction regulation of ganoderma acid biosynthesis pathway

        3.1 鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)

        鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)的作用途徑是,細(xì)胞內(nèi)Ca2+濃度升高并與鈣調(diào)蛋白(基因cam)形成Ca2+/鈣調(diào)蛋白復(fù)合物,隨后與鈣調(diào)磷脂酶的催化亞基(基因cna)相互作用并激活轉(zhuǎn)錄因子鋅指蛋白(基因crz1)[32]。在GAs合成代謝途徑中,基因sqs和lss的啟動(dòng)子區(qū)域有一個(gè)CDRE序列,受CRZ1的正向調(diào)節(jié)。Xu等[35]發(fā)現(xiàn)當(dāng)在培養(yǎng)基中加入Ca2+后,參與鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)的cam、cna、crz1和GAs合成代謝途徑的關(guān)鍵酶基因hmgr、sqs、lss的表達(dá)量均出現(xiàn)明顯上調(diào),GAs含量增加了3.7倍,靈芝酸MK、靈芝酸T、靈芝酸S和靈芝酸Me分別增加了2.6倍、4.5倍、3.2倍和3.8倍。Na+和Mn2+具有相同作用機(jī)制,通過胞內(nèi)Ca2+濃度增加并激活鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)從而實(shí)現(xiàn)GAs合成代謝途徑的正向調(diào)節(jié),分別將GAs含量提高了2.8倍和2.7倍[36-37]。

        3.2 活性氧信號(hào)

        活性氧(reactive oxygen species,ROS)平衡調(diào)節(jié)系統(tǒng)是一種廣泛存在于細(xì)胞內(nèi)的復(fù)雜調(diào)節(jié)機(jī)制,涉及多種氧化應(yīng)激相關(guān)基因,對(duì)微生物合成代謝途徑影響較大[43-44]。Glswi6是G. lucidum ACCC53264的APSES轉(zhuǎn)錄因子,其轉(zhuǎn)錄表達(dá)與靈芝菌的發(fā)育以及生物合成代謝途徑密切相關(guān)。相比于野生型菌株,Zhang等[38]發(fā)現(xiàn)Glswi6沉默菌株的NAHD氧化酶活性下降48%,H2O2含量下降50%。同時(shí),GAs合成代謝途徑的關(guān)鍵基因hmgr、sqs、lss轉(zhuǎn)錄水平均下調(diào),GAs產(chǎn)量降低25%。通過回補(bǔ)1 mmol/L H2O2,關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄水平和GAs的產(chǎn)量恢復(fù)至野生型菌株水平。轉(zhuǎn)錄因子GlSkn7參與細(xì)胞壁的合成、孢子形成及胞內(nèi)氧化應(yīng)激反應(yīng),是ROS系統(tǒng)不可或缺的一部分,維持ROS的穩(wěn)態(tài)。以靈芝菌G. lucidum ACCC53264為原始菌株,通過敲除Glskn7獲得的Skn7i-5和Skn7i-7菌株,H2O2含量上升73.7%和76.4%,ROS水平是原始菌株的1.78和1.82倍,GAs分別提高了52.1%和55.9%。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)顯示hmgr轉(zhuǎn)錄水平上升56%、52%,sqs上調(diào)49%、53%,lss上調(diào)95%、93%。在突變菌株中加入5 mmol/L活性氧清除劑N-乙酰半胱氨酸(NAC),GAs濃度降低至與野生型菌株相同水平[39]。同樣地,當(dāng)轉(zhuǎn)錄因子PacC沉默時(shí),胞內(nèi)SOD、CAT、Gpx、Apx等抗氧化酶活性下降幅度超過40%,ROS水平上升幅度超過2倍,GAs積累量明顯提升[40],而回補(bǔ)1 mmol/L NAC 和 2 mmol/L維生素C時(shí),突變菌株的GAs水平下降并與出發(fā)菌株持平[41]。這些研究結(jié)果表明胞內(nèi)ROS水平與GAs合成代謝水平存在相關(guān)性,隨著胞內(nèi)ROS水平的變化,轉(zhuǎn)錄因子隨之變化并對(duì)GAs合成代謝途徑產(chǎn)生調(diào)控作用[45]。

        3.3 細(xì)胞壁完整性信號(hào)

        當(dāng)植物生存環(huán)境受到外界脅迫時(shí),會(huì)產(chǎn)生對(duì)植物具有保護(hù)作用的次級(jí)代謝物質(zhì),提高生存競(jìng)爭(zhēng)力[46],而細(xì)胞壁是植物應(yīng)答外界脅迫的第一環(huán)節(jié)。細(xì)胞壁完整性(cell wall intesrity,CWI)信號(hào)由絲裂原激活蛋白激酶(MAPK)模塊組成,主要參與細(xì)胞壁完整性調(diào)控。經(jīng)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)比、功能域和進(jìn)化樹分析,在G. lucidum HG菌株發(fā)現(xiàn)了編碼MAPK模塊的基因mapk4。與野生型菌株相比,多株mapk4沉默菌株都表現(xiàn)出生長(zhǎng)速率減慢、菌絲分叉增多、細(xì)胞壁厚度減小。關(guān)鍵基因hmgr、sqs、lss轉(zhuǎn)錄水平下調(diào)明顯,鯊烯、羊毛甾醇含量分別下降55%和50%,GAs含量最大降低40%。同時(shí),研究人員還發(fā)現(xiàn)部分mapk4沉默菌株中H2O2含量約減少70%,NADPH氧化酶家族(noxA、noxB、noxR)基因表達(dá)量降低[42],這與Glswi6的調(diào)控路徑高度一致。

        由此看來(lái),Ca2+、ROS、CWI、NO、cAMP、JA以及其衍生物的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑并不是單獨(dú)作用,而是相互影響的,并且主要以鈣調(diào)磷脂酶信號(hào)和ROS信號(hào)為主(圖2)。其次,與以單個(gè)基因?yàn)榘悬c(diǎn)的關(guān)鍵酶過表達(dá)方法不同,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑通過影響涉及多個(gè)代謝途徑的大量基因,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)這些途徑的整體上調(diào)或下調(diào)。

        圖2 靈芝菌胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)示意圖Fig. 2 Schematic diagram of intracellular signal transduction in G. lucidum

        4 全局性調(diào)控因子與生物表觀遺傳的調(diào)控

        不同于調(diào)控單一基因的特異性調(diào)控因子,全局性調(diào)控因子能夠同時(shí)調(diào)控多個(gè)基因簇內(nèi)的基因表達(dá),實(shí)現(xiàn)對(duì)多種次級(jí)代謝產(chǎn)物的生物合成干預(yù)。生物表觀遺傳是微生物調(diào)控自身次級(jí)代謝產(chǎn)物合成的一種方式,其分子機(jī)制有DNA甲基化、羥甲基化、組蛋白修飾、染色體重塑、核小體定位以及非編碼RNA調(diào)控等。

        4.1 全局性調(diào)控因子LaeA

        靈芝菌中全局性調(diào)控因子LaeA可以通過激活沉默基因表達(dá)實(shí)現(xiàn)增加GAs積累量的目的。賀望興等[47]發(fā)現(xiàn)振蕩培養(yǎng)和液體靜置培養(yǎng)兩種方式下LaeA表達(dá)出現(xiàn)差異,靜置培養(yǎng)下LaeA表達(dá)量和GAs含量均高于振蕩培養(yǎng),倍數(shù)分別為3.3和9.4倍,因此研究人員猜測(cè)蛋白LaeA通過轉(zhuǎn)錄調(diào)控影響GAs的次級(jí)代謝途徑。有人推測(cè)類似于構(gòu)巢曲霉,LaeA是與Velvet蛋白家族的2個(gè)成員形成LaeAVeA-VelB三聚體復(fù)合物從而調(diào)控著靈芝的次級(jí)代 謝[48-49],但是真正的機(jī)制有待探索。

        4.2 DNA甲基化

        DNA甲基化是維持植物正常發(fā)育必須的,具有不可替代的作用。藍(lán)麗雯等[50]利用DNA甲基化抑制劑5-氮雜胞苷(5-azacytidine,5-AC)對(duì)GAs的代謝進(jìn)行誘導(dǎo)。研究發(fā)現(xiàn),在靈芝的液體靜置培養(yǎng)基中添加1 mmol/L 5-AC時(shí),靈芝孢子中靈芝酸Mk、T、S、Me含量達(dá)到最高,是對(duì)照組的3-4倍。靈芝酸Mk和靈芝酸S的含量分別達(dá)到13.10和12.33 mg/g。hmgr、sqs、se和lss的表達(dá)量分別是對(duì)照組的6.26、3.10、3.42和4.32倍。同時(shí),研究人員還發(fā)現(xiàn)全局性調(diào)控因子LaeA的表達(dá)量是對(duì)照組的2.83倍,間接證明激活LaeA的表達(dá)有利于提高GAs積累量。

        4.3 組蛋白乙?;?/h3>

        組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferases,HATs)可以通過開啟沉默基因?qū)崿F(xiàn)對(duì)次級(jí)合成代謝途徑的調(diào)控。辛二酰苯胺異羥肟酸(vorinostat,SAHA)能有效抑制組蛋白去乙?;福╤istone deacetylase,HDAC)的活性,從而促進(jìn)組蛋白的乙酰化。通過向培養(yǎng)基中加入180 μmol/L的SAHA,靈芝培養(yǎng)第9天時(shí)組蛋白去乙?;窻PD3水平上調(diào),其轉(zhuǎn)錄水平是對(duì)照組的6倍,組蛋白H3乙酰化的水平無(wú)差異,組蛋白H4乙?;乃绞菍?duì)照組的1.6倍。在靈芝培養(yǎng)第6、12天時(shí)檢測(cè)GAs的含量比對(duì)照組降低36%、45%。向培養(yǎng)基中加入60 μmol/L和180 μmol/L的SAHA,在第6天檢測(cè)hmgr、sqs、se和lss基因表達(dá)量均高于空白組,而在第12天時(shí)這4個(gè)基因表達(dá)量均低于空白組。對(duì)全局性調(diào)控因子LaeA和Velvet檢測(cè)發(fā)現(xiàn),不同SAHA濃度、不同天數(shù)下靈芝菌的LaeA和Velvet表達(dá)均受到抑制[51]。因此猜測(cè)靈芝中的組蛋白乙?;降纳仙种屏巳终{(diào)控因子LaeA和蛋白Velvet的表達(dá),從而導(dǎo)致GAs的積累量降低。

        綜上發(fā)現(xiàn),全局調(diào)控因子與表觀遺傳存在緊密的聯(lián)系。通過抑制DNA甲基化,全局性調(diào)控因子LaeA的表達(dá)量增加,GAs合成代謝途徑正向激活。組蛋白乙?;瘯?huì)抑制全局調(diào)控因子LaeA和Velvet的表達(dá),導(dǎo)致GAs的積累量降低。

        5 總結(jié)與展望

        在GAs合成代謝途徑方面,前兩個(gè)階段的多個(gè)關(guān)鍵酶已經(jīng)被克隆表征,并得到研究。第3個(gè)階段中,目前發(fā)現(xiàn)78個(gè)CYP450可能參與到GAs骨架結(jié)構(gòu)修飾中,但是僅僅闡明cyp5150l8、cyp512U6、cyp505D13這3種基因參與下游途徑,其余CYP450s的作用機(jī)制仍不清晰,這將是未來(lái)研究的重點(diǎn)方向之一。在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑方面,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑以及之間存在的相互作用,未來(lái)將會(huì)聚焦到轉(zhuǎn)錄因子對(duì)GAs合成基因的影響機(jī)理上,例如利用染色質(zhì)免疫沉淀-測(cè)序等技術(shù)揭示調(diào)控元件的高維相互關(guān)系水平,并從頭注釋新的功能基因組區(qū)域。在全局性調(diào)控因子與生物表觀遺傳方面,構(gòu)建靈芝工程菌時(shí)可以通過減少DNA甲基化水平和組蛋白乙酰化水平以促進(jìn)GAs的合成代謝。

        完全解析GAs的合成代謝途徑、共表達(dá)多個(gè)關(guān)鍵酶以增強(qiáng)代謝流、挖掘信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的深層作用機(jī)制、尋找合適的底盤生物實(shí)現(xiàn)其異源表達(dá),整合轉(zhuǎn)錄、RNA加工和翻譯,以及翻譯后的修飾等多水平調(diào)控,將在靈芝深層液體發(fā)酵工藝中實(shí)現(xiàn)周期短、效價(jià)高的最終目的,并為GAs商業(yè)應(yīng)用的進(jìn)一步擴(kuò)大打下基礎(chǔ)。

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