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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對(duì)接方法探討黃山藥干預(yù)冠心病的作用機(jī)制研究*

        2021-09-08 15:04:52但文超劉紅旭何慶勇妍2蔣燕君2連妍潔2
        關(guān)鍵詞:冠心病信號(hào)

        但文超,劉紅旭,何慶勇,婁 妍2,,蔣燕君2,,連妍潔2,**

        (1.中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院廣安門(mén)醫(yī)院 北京100053;2.北京中醫(yī)藥大學(xué)研究生院 北京100029;3.首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京中醫(yī)醫(yī)院 北京100010;)

        冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟?。ü谛牟。┦怯蓜?dòng)脈粥樣硬化(atherosclerosis,AS)引起管腔狹窄,導(dǎo)致心肌缺血、缺氧或壞死,又稱缺血性心臟病,是最常見(jiàn)的心血管疾病之一。隨著社會(huì)人口年齡結(jié)構(gòu)分布的改變,冠心病發(fā)病率逐年攀升,根據(jù)《中國(guó)心血管病報(bào)告2018》概要[1],估算我國(guó)心血管病現(xiàn)患人數(shù)2.9億,其中冠心病患者數(shù)量高達(dá)1100萬(wàn),居各類心臟病之首。世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)評(píng)估報(bào)告表明[2],截止2030年全球?qū)⒂?3.3億人左右死于冠心病。心血管疾病,尤其是缺血性心臟病,仍然是世界范圍內(nèi)主要的死亡原因和長(zhǎng)期發(fā)病率的重要原因[3]。可見(jiàn),世界人群的冠心病患病率已成重大公共衛(wèi)生問(wèn)題。

        黃山藥為我國(guó)特有的薯蕷科薯蕷屬植物,是國(guó)家級(jí)(五類)新藥地奧心血康軟膠囊(成都地奧制藥集團(tuán)有限公司,批號(hào)0603024,DAXXK)的主要藥源。地奧心血康具有活血化瘀、行氣止痛、宜痹通陽(yáng)等功效,有關(guān)臨床研究顯示地奧心血康可緩解患者心肌缺血癥狀,并改善心臟血流動(dòng)力學(xué)指標(biāo)[4-7],部分基礎(chǔ)研究亦顯示地奧心血康具有抗氧化損傷、抑制細(xì)胞凋亡、降低炎性因子的表達(dá)[8-10],延長(zhǎng)凝血酶原時(shí)間和抑制纖維蛋白[11]的作用。有Meta分析結(jié)果顯示,地奧心血康膠治療冠心病心絞痛,在單用或與常規(guī)藥物聯(lián)合運(yùn)用的情況下,在提高總療效、改善心電圖方面具有更大的優(yōu)勢(shì),且藥物安全性較好[12]。研究表明[13]黃山藥含有多種甾體皂苷類物質(zhì)及活性多糖等有效成分,具有改善心血管功能、抗血小板聚集、降血脂等多種藥理作用,但目前對(duì)于黃山藥干預(yù)冠心病的藥理學(xué)作用機(jī)制的研究相對(duì)匱乏。

        網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是運(yùn)用高通量篩選、網(wǎng)絡(luò)可視化及分析技術(shù)揭示藥物、靶點(diǎn)、疾病之間復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,分析、預(yù)測(cè)藥物的藥理學(xué)機(jī)制的研究方法[14]。李梢教授等[15]利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從生物網(wǎng)絡(luò)調(diào)控角度對(duì)中藥方劑現(xiàn)代研究的方證關(guān)系、病證關(guān)系和方劑的多靶點(diǎn)作用等問(wèn)題進(jìn)行了探索并取得了有意義的結(jié)果。分子對(duì)接是預(yù)測(cè)蛋白與配體親和能力和結(jié)合模式的強(qiáng)有力的工具,對(duì)于給定的蛋白質(zhì)和配體(蛋白質(zhì)、DNA/RNA、小分子),可通過(guò)預(yù)測(cè)它們的結(jié)合模式及結(jié)合自由能,進(jìn)而對(duì)其功能及作用機(jī)制進(jìn)行研究?;诜肿訉?duì)接方法的虛擬篩選已成為針對(duì)特定靶蛋白藥物研發(fā)的必備流程之一[16]。

        為更好地了解黃山藥干預(yù)冠心病的作用機(jī)制,本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接的方法,在分子的水平上,從化學(xué)成分、作用靶點(diǎn)和信號(hào)傳導(dǎo)通路對(duì)黃山藥干預(yù)冠心病的作用機(jī)制進(jìn)行系統(tǒng)研究,以期為進(jìn)一步揭示黃山藥的藥理作用機(jī)制提供理論基礎(chǔ),研究流程圖見(jiàn)圖1。

        圖1 研究流程圖

        1 材料與方法

        1.1 黃山藥相關(guān)成分及靶點(diǎn)篩選

        通 過(guò)ETCM(The Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine)數(shù)據(jù)庫(kù)[17](http://www.tcmip.cn/ETCM/index.php/Home/Index/)并結(jié)合查閱文獻(xiàn)對(duì)黃山藥的化學(xué)成分信息進(jìn)行收集,將收集的化學(xué)成分逐一通過(guò)Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù)[18]獲得成分的分子結(jié)構(gòu)圖并以3Dsdf的格式存儲(chǔ)。將所獲取化合物結(jié)構(gòu)輸入SwissADME平臺(tái)[19](http://www.swissadme.ch/)。設(shè)置潛在核心化合物的標(biāo)準(zhǔn)為:①腸胃吸收(gatrointestinal absortion;GIabsortion)為“High”,表明成分具備良好口服生物利用度,可被吸收②設(shè)置5類藥性預(yù)測(cè)(Lipinski、Ghose、Veber、Egan、Muegge)結(jié) 果 中 有2個(gè) 及2個(gè) 以 上 為“Yes”。其后通過(guò)文獻(xiàn)核查根據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn)所排除的化合物,若化合物藥理作用明顯且與研究主題相關(guān),仍予以納入,最終獲得研究主題相關(guān)的潛在化合物。再利用基于藥效團(tuán)匹配法的PharmMapper數(shù)據(jù)庫(kù)[20](http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/index.php)獲取潛在化合物的靶點(diǎn),選擇Normalized Fit Score(NF)≥0.9的靶點(diǎn)蛋白,并根據(jù)已發(fā)表的藥物相關(guān)成分文獻(xiàn)報(bào)道,補(bǔ)充未預(yù)測(cè)到的活性化合物的已知靶點(diǎn)。

        1.2 冠心病相關(guān)靶點(diǎn)篩選

        為保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性與全面性,以“coronary heart disease”、“coronary disease”“coronary atherosclerotic heart disease”“CHD”等冠心病相關(guān)名詞為關(guān)鍵詞,搜索GeneCards數(shù) 據(jù) 庫(kù)[21](https://www.genecards.org)、DisGeNet數(shù) 據(jù) 庫(kù)[22](http://www.disgenet.org/home/)、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)數(shù)據(jù)庫(kù)[23](http://www.omim.org)、DRUGBANK數(shù)據(jù)庫(kù)[24](https://www.drugbank.ca/)以獲得冠心病核心靶點(diǎn)。其中DRUGBANK數(shù)據(jù)庫(kù)基于臨床試驗(yàn)藥物證據(jù)構(gòu)建而成,提供了豐富的藥物數(shù)據(jù)與全面的藥物靶標(biāo)信息。OMIM、GeneCards、DisGeNet數(shù)據(jù)庫(kù)基于文獻(xiàn)構(gòu)建,各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)之間各有優(yōu)勢(shì)、相互補(bǔ)充。將上述數(shù)據(jù)庫(kù)所獲取的靶點(diǎn),刪除重復(fù)值后進(jìn)行合并。再根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道補(bǔ)充未預(yù)測(cè)到的活性成分的已知靶點(diǎn)。使用UniProt蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)[25](https://www.uniprot.org)將疾病靶點(diǎn)與藥物成分的潛在靶點(diǎn)統(tǒng)一規(guī)范為Gene Symbol,其后將兩者進(jìn)行映射,以獲得黃山藥潛在干預(yù)冠心病的靶點(diǎn)。

        1.3 黃山藥成分-冠心病靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(protein-protein interaction,PPI)是指從生物化學(xué),信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和遺傳網(wǎng)絡(luò)的角度研究化合物和疾病相關(guān)蛋白質(zhì)分子之間的相關(guān)性。為闡明靶點(diǎn)蛋白在系統(tǒng)水平上的作用,將上述靶點(diǎn)上傳至STRING11.0數(shù)據(jù)庫(kù)[26](https://string-db.org),選擇物種為“智人”,設(shè)置靶點(diǎn)關(guān)聯(lián)的置信度為0.40,以獲得PPI網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,并通過(guò)CytoScape3.7.2軟件[27]制作PPI網(wǎng)絡(luò)圖。利用CytoScape3.7.2中的MCODE插件[28]對(duì)蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系進(jìn)行分析,得到潛在蛋白質(zhì)功能模塊并分析相關(guān)功能。

        1.4 黃山藥成分與冠心病靶點(diǎn)GO功能富集和KEGG通路富集

        1.5 成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建

        將“1.4”項(xiàng)下的交集靶點(diǎn)與KEGG富集出生物通路的相互作用信息與“1.2”項(xiàng)下篩選出的藥物成分與交集靶點(diǎn)合并,上傳到Cytoscape3.7.2中構(gòu)建出藥物成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖。利用CytoScape3.7.2內(nèi)置的Network Analyzer分析有效成分及靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù),包括連接度(Degree)、介度(Betweenness)及緊密度(Closenesss)等,并根據(jù)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)參數(shù)判斷核心靶點(diǎn)及干預(yù)冠心病的主要活性成分。

        1.6 分子對(duì)接評(píng)估

        選擇分析得到黃山藥成分-冠心病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖中度值排名為前6的靶點(diǎn)。通過(guò)RCSB數(shù)據(jù)庫(kù)[30](htp://www.rcsb.org/pdb)下載靶點(diǎn)蛋白的三維晶體結(jié)構(gòu),并以pdb格式進(jìn)行保存。將候選化合物的3D化學(xué)結(jié)構(gòu)通 過(guò)Open Babel3.1.1[31](http://openbabel.org/wiki/Main_Page)轉(zhuǎn)換為pdb格式文件。采用Autodock Tools1.5.6[32](http://autodock.scripps.edu/resources/tools)進(jìn)行除水、加氫,計(jì)算Gasteiger電荷,儲(chǔ)存為pdbqt格式文件。對(duì)潛在核心成分配體進(jìn)行能量最小化處理,賦予配體原子類型、計(jì)算電荷,儲(chǔ)存為pdbqt格式。利用MOE2019[33]進(jìn)行分子對(duì)接操作,以對(duì)接評(píng)分Affinity來(lái)篩選結(jié)合活性較好的活性成分與靶點(diǎn),其中對(duì)接評(píng)分Affinity<-4.25 kcal·mol-1可認(rèn)為配體與靶點(diǎn)之間具有結(jié)合活性,得分<-5.0表明結(jié)合活性較佳,得分<-7.0 kcal·mol-1兩者之間有強(qiáng)烈的對(duì)接活性[34]。

        2 結(jié)果

        2.1 黃山藥的主要活性成分靶點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果

        綜合查閱文獻(xiàn)[35-39],包括2015年版《中華人民共和國(guó)藥典》(第十版)、高效液相色譜法研究、綜述進(jìn)展等共獲得黃山藥相關(guān)的30種化合物結(jié)構(gòu),其有效成分主要為甾體皂苷類物質(zhì),包括偽原薯蕷皂苷、薯蕷皂苷元、異螺甾烷醇類皂苷、呋甾烷醇類及其他類皂苷等成分,還包括少數(shù)非甾體皂苷成分,如棕櫚酸。通過(guò)SwissADME篩選出11種活性最高的成分,結(jié)構(gòu)見(jiàn)表1。利用PharmMapper預(yù)測(cè)并選擇NF≥0.9的靶點(diǎn),去除所有重復(fù)基因后共計(jì)139個(gè)預(yù)測(cè)靶點(diǎn)。

        表1 黃山藥11種活性最高的成分

        續(xù)表

        2.2 黃山藥干預(yù)冠心病相關(guān)靶點(diǎn)獲取

        在Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)中得到冠心病相關(guān)作用靶點(diǎn)6810個(gè),選擇相關(guān)度得分Score≥20.48的靶點(diǎn)作為冠心病的潛在靶點(diǎn),獲得1703個(gè)相關(guān)靶點(diǎn)。結(jié)合DisGeNet、OMIM、DRUGBANK數(shù)據(jù)庫(kù)補(bǔ)充相關(guān)靶點(diǎn),除重后合并,最終得到1975個(gè)冠心病相關(guān)靶點(diǎn)。將黃山藥有效成分的139個(gè)靶點(diǎn)與1975個(gè)冠心病相關(guān)靶點(diǎn)取交集,獲得62個(gè)共同靶點(diǎn),并通過(guò)R3.6.1繪制VENN圖(圖2)。

        圖2 藥物靶點(diǎn)和疾病靶點(diǎn)VENN圖

        2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

        將62個(gè)交集靶點(diǎn)上傳至String11.0數(shù)據(jù)庫(kù),獲得PPI網(wǎng)絡(luò)信息并利用Cytoscape 3.7.2重新構(gòu)建靶蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)(圖3)。得到PPI網(wǎng)絡(luò)后,運(yùn)用CytoScape3.7.2中的MCODE插件,對(duì)PPI網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行進(jìn)一步分析,得到潛 在Module(圖4),推 測(cè)MPK1、MPK8、MPK14、PIK3R1等為主要靶點(diǎn)。根據(jù)P值,分別保留PPI網(wǎng)絡(luò)與Module中3個(gè)最佳評(píng)分的生物學(xué)進(jìn)程并描述其功能(表2)。

        圖3 黃山藥-冠心病靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)

        圖4 黃山藥-冠心病靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)中的Module

        表2 黃山藥-冠心病靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)功能描述

        2.4 GO功能富集和KEGG通路富集

        利用Bioconductor中ClsuterProfiler程序包對(duì)黃山藥干預(yù)冠心病相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行生物信息分析(圖5)。圖7-A表明黃山藥干預(yù)冠心病主要涉及生物學(xué)過(guò)程的對(duì)類固醇激素的反應(yīng)(response to steroid hormone)、調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)(regulation of inflammatory response)、對(duì)營(yíng)養(yǎng)水平的反應(yīng)(response to nutrient levels)。圖7-D為KEGG通路分析結(jié)果,圖中顯示了黃山藥干預(yù)冠心病排名前20的信號(hào)通路,關(guān)鍵通路包括絲裂原活化蛋白激酶信號(hào)通路(MAPK signaling pathway)、雌激素信號(hào)通路(Estrogen signaling pathway)、Ras信號(hào)通路(Ras signaling pathway)、PI3K-Akt信 號(hào) 通 路(PI3K-Akt signaling pathway)等。

        圖5 黃山藥主要成分潛在靶點(diǎn)的富集分析

        2.5 黃山藥成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

        運(yùn)用CytoScape3.7.2構(gòu)建“黃山藥成分-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)圖,并通過(guò)其內(nèi)置工具分析黃山藥干預(yù)冠心病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)參數(shù),得到核心成分及核心作用靶點(diǎn)。如圖6所示,此網(wǎng)絡(luò)由62個(gè)節(jié)點(diǎn)和215條邊構(gòu)成,紅色節(jié)點(diǎn)代表潛在靶點(diǎn),橙色節(jié)點(diǎn)代表黃山藥中的活性成分,綠色節(jié)點(diǎn)代表潛在信號(hào)通路,連線代表三者之間的相互作用,圖中節(jié)點(diǎn)面積越大、顏色越深表明其對(duì)冠心病的影響越大。

        圖6 黃山藥干預(yù)冠心病成分-靶點(diǎn)-通路圖

        Cytoscape網(wǎng)絡(luò)分析中,每種活性成分對(duì)應(yīng)多個(gè)靶點(diǎn),每個(gè)靶點(diǎn)連接多種成分,體現(xiàn)了黃山藥內(nèi)含的多種成分,可能通過(guò)多靶點(diǎn)干預(yù)冠心病。其中HSY-3(新甾體皂苷)度值為15,介度為0.127,緊密度為0.480,預(yù)測(cè)新甾體皂苷為黃山藥干預(yù)冠心病的主要成分,其次為HSY-8(胡蘿卜苷)(連接度為14,介度為0.107,緊密度為0.473),HSY-5(progeninⅢ)(連接度為8,介度為0.0446,緊密度為0.414)(表3)。MAPK1、MAPK10、MAPK8、MAP2K1、PIK3R1靶點(diǎn)基因的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)度排位靠前,連接度分別為22、16、15、15、14,預(yù)測(cè)促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPKs)家族為黃山藥干預(yù)冠心病的核心靶點(diǎn),PIK3R1、EGFR、RAC1、PRKACA、IGF1亦為相對(duì)重要的靶點(diǎn)(表4)。由表5可知,通路與通路之間是通過(guò)共有靶點(diǎn)連接而非獨(dú)立分開(kāi)的,表明黃山藥可通過(guò)各條通路之間可發(fā)揮協(xié)同作用起到干預(yù)冠心病的作用。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 20.0軟件對(duì)研究數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)量資料以表示,數(shù)據(jù)比較采用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料以[例(%)]表示,數(shù)據(jù)比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        表3 黃山藥主要活性成分網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)特征參數(shù)

        表4 黃山藥主要活性成分靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)特征參數(shù)

        表5 黃山藥干預(yù)冠心病靶點(diǎn)通路富集結(jié)果

        2.6 分子對(duì)接篩選

        將11種核心澘在化合物與6個(gè)核心靶點(diǎn)ALB(PDBID:6RQ7)、EGFR(PDBID:5GTY)、MAPK1(PDBID:1PME)、SRC(PDBID:4U5J)、IGF1(PDBID:3LVP)、CASP3(PDBID:1NMS)進(jìn)行分子對(duì)接,最終得到60組受體-配體對(duì)接結(jié)果。在60組受體-配體結(jié)果中,其 中Affinity<-5 kcal·mol-1的 組 合 共 有59組,Affinity<-7 kcal·mol-1的 有30組,占50%。在 化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)中的組合有15個(gè),平均值為-7.641 kcal·mol-1,其中對(duì)接得分最高的為:EGFR-新甾體皂苷(3β,26-二醇-25(R)-?5,20(22)-二烯-呋甾-26-O-β-D-吡喃葡萄糖苷),分值為-8.728kcal·mol-1,對(duì)接得分最低的為ALB-panthogenin-B,分值為-6.551 kcal·mol-1,這表明所篩選的的潛在核心化合物與核心靶點(diǎn)之間可能具有較好的結(jié)合活性。網(wǎng)外45個(gè)組合排名前三的 組 合 有:daucosterol-ALB(-9.356 kcal·mol-1),trillin-EGFR(-9.051 kcal·mol-1),daucosterol-EGFR(-8.937 kcal·mol-1)。網(wǎng)外組合平均值為-7.080 kcal·mol-1,分值均小于-4.25 kcal·mol-1,提示均有良好的對(duì)接活性。對(duì)接結(jié)果可為今后進(jìn)一步開(kāi)展相關(guān)中藥及成分的實(shí)驗(yàn)篩選設(shè)計(jì)提供數(shù)據(jù)支撐,分子對(duì)接結(jié)果見(jiàn)圖7,部分核心化合物對(duì)接模式見(jiàn)圖8。

        圖7 分子對(duì)接結(jié)果

        圖8 黃山藥部分核心化合物分子對(duì)接模式

        3 討論

        祖國(guó)醫(yī)學(xué)中雖無(wú)冠心病的病名,但古代醫(yī)籍中早有其典型臨床表現(xiàn)的記載,當(dāng)屬于“胸痹”、“心痛”、“真心痛”的范疇,《素問(wèn)》云:“心痹者,脈不通”。中醫(yī)認(rèn)為氣滯、血瘀、痰濁、寒凝,以及氣血陰陽(yáng)的不足為主要致病因素,進(jìn)而導(dǎo)致心脈痹阻而發(fā)病,病變于心,屬本虛標(biāo)實(shí)之證,活血化瘀法是治療冠心病的重要法則[40-42]?,F(xiàn)代臨床研究表明[43]冠心病患者存在血液流變性異常,血流動(dòng)力學(xué)改變,微循環(huán)障礙等病理改變,其主要病理學(xué)基礎(chǔ)為動(dòng)脈粥樣硬化和血脂代謝異常。黃山藥性溫,味微辛,可通過(guò)擴(kuò)張冠狀動(dòng)脈血管,減小血液黏稠度以及血小板的聚集率來(lái)改善血循環(huán)[44],研究顯示,以黃山藥為主要藥源的地奧心血康具活血化瘀、行氣止痛、擴(kuò)張冠脈血管和改善心肌缺血等功效,廣泛運(yùn)用于臨床干預(yù)心血管疾病。

        3.1 潛在有效成分分析

        地奧心血康主要成分為薯蕷皂苷元(diosgenin)和偽原薯蕷皂苷(pseudoprotodioscin)[45]。薯蕷皂苷元是一種重要的甾體皂苷元,廣泛存在于薯蕷科等多種植物中,楊柏等人研究發(fā)現(xiàn)[46]薯蕷皂苷元可抑制PARP/p53和p38絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)表達(dá)而減輕冠心病模型豬的氧化應(yīng)激和炎癥反應(yīng)。馬海英等[47]通過(guò)實(shí)驗(yàn)證實(shí)薯蕷皂苷元在體外有明顯的抗血小板聚集活性。薯蕷皂苷元的分子結(jié)構(gòu)與雌激素類似,亦有基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)[48]表明其能夠顯著上調(diào)血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A(VEGF-A),這種作用是經(jīng)由雌激素受體相關(guān)的PI3K/Akt通路調(diào)節(jié)的。此外,本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法初步篩選出黃山藥干預(yù)冠心病的主要活性成分尚有新甾體皂苷(3β,26-二醇-25(R)-?5,20(22)-二烯-呋甾-26-O-β-D-吡 喃 葡 萄 糖 苷)、胡 蘿 卜 苷(daucosterol)、延齡草苷(trillin)、panthogenin-A等。AS是導(dǎo)致冠心病主要危險(xiǎn)因素,炎癥反應(yīng)是AS形成中的一個(gè)重要因素[49],故降低炎癥反應(yīng)的作用更有利于減少AS形成,并起到保護(hù)心血管的作用。胡蘿卜苷是一種廣泛存在于植物中的植物甾醇糖苷,HUNG等[50]在研究胡蘿卜苷的藥理作用時(shí),證實(shí)胡蘿卜苷可抑制MAPK、JNK等相關(guān)炎癥反應(yīng)信號(hào)通路的活化。阿司匹林作為冠心病的一級(jí)預(yù)防藥物[51],具有抗血小板聚集的作用,可顯著減少主要心血管事件。KOO等[52]發(fā)現(xiàn)胡蘿卜苷抗2-5 μg·L-1膠原誘導(dǎo)的血小板聚集作用約為阿司匹林的2倍,證明胡蘿卜苷有良好的抗血小板聚集作用。NO可通過(guò)促使氧化應(yīng)激損傷、能量代謝障礙、炎癥反應(yīng)發(fā)展發(fā)生等加重心肌損傷。延齡草苷具有明顯的抗高脂血癥和抗氧化作用[53],有研究發(fā)現(xiàn)[54]其能抑制NO的釋放,同時(shí)減少誘導(dǎo)細(xì)胞死亡,降低TNF-α、IL-6、COX-2 mRNA等炎性基因的表達(dá),并可通過(guò)上調(diào)Sirt1的表達(dá)、下調(diào)NF-Kβ和TNF-α的表達(dá),從而提高抗氧化能力,降低炎癥因子損傷[55]。除此之外,存在一些尚未被報(bào)道的有效成分亦可能為黃山藥干預(yù)冠心病的主要有效成分,如3β,26-二醇-25(R)-?5,20(22)-二烯-呋甾-26-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、panthogenin-A等,預(yù)測(cè)這些有效成分的功效將成為未來(lái)研究黃山藥干預(yù)冠心病的潛在方向,其藥效學(xué)及作用機(jī)制有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

        分子對(duì)接結(jié)果顯示,黃山藥中的核心化合物胡蘿卜苷、延齡草苷、新甾體皂苷、progeninⅢ等與主要靶點(diǎn)(ALB、EGFR、SRC、MAPK1)的結(jié)合活性較強(qiáng),這在側(cè)面反映了網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果的可靠性。故今后在設(shè)計(jì)相關(guān)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)或臨床研究時(shí)可重點(diǎn)關(guān)注胡蘿卜苷、延齡草苷、新甾體皂苷等在干預(yù)冠心病相關(guān)機(jī)制中的作用。

        3.2 靶點(diǎn)分析

        通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)成分篩選、靶點(diǎn)預(yù)測(cè)和網(wǎng)絡(luò)分析,可發(fā)現(xiàn)占據(jù)網(wǎng)絡(luò)中心位置的主要為白蛋白(ALB)、表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)、有絲裂原活化蛋白激酶(MAPKs),包 括MAPK1、MAPK2、MAPK8、MAPK10等,這些靶點(diǎn)在黃山藥干預(yù)冠心病的生物過(guò)程中可能起關(guān)鍵作用。既往研究表明[56]ALB減低可能是冠心病事件風(fēng)險(xiǎn)和短期死亡率增加的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。ALB有抑制血小板活化和聚集,減少血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的作用,在血小板誘導(dǎo)冠心病的發(fā)展過(guò)程中起到調(diào)節(jié)作用[57],與冠心病嚴(yán)重程度的指標(biāo)呈負(fù)相關(guān)[58];EGFR分布于所有血管上皮細(xì)胞,可通過(guò)參與RAS/RAF/MEK/MAPK,PI3K/PDK1/AKT兩條主要途徑發(fā)揮干預(yù)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、增殖等作用,EGFR與配體(EGF)特異性結(jié)合后可促進(jìn)心血管系統(tǒng)中ROS的形成并有助于血管收縮,李偉新等[59]研究發(fā)現(xiàn)EGFR可能是肥胖相關(guān)心血管疾病的治療靶點(diǎn),與心肌炎癥、纖維化、凋亡和功能障礙相關(guān);MAPKs屬于酪氨酸激酶系統(tǒng),在氧化應(yīng)激狀態(tài)下可被激活[60]。MAPK1作為炎癥常用通路中的一員為重要的炎癥評(píng)價(jià)指標(biāo),與炎癥的嚴(yán)重程度有密切關(guān)系[61],可參與冠心病的炎性反應(yīng),還可影響冠心病的脂代謝和凝血功能[62]。MAPK8是MAPK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途經(jīng)中重要的信號(hào)分子,當(dāng)機(jī)體發(fā)生炎癥反應(yīng)時(shí),能夠誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,同時(shí)促進(jìn)炎癥因子TNF-α、IL-1β的活化[63]。

        3.3 生物富集分析

        通過(guò)GO功能富集分析可知,生物學(xué)進(jìn)程包括對(duì)類固醇激素的反應(yīng)、炎癥反應(yīng)調(diào)節(jié)、對(duì)營(yíng)養(yǎng)水平的反應(yīng)等,主要涉及內(nèi)肽酶活性、類固醇激素受體活性、類固醇結(jié)合等方面的功能,通過(guò)KEGG富集分析可推斷,黃山藥干預(yù)冠心病的信號(hào)通路主要與炎癥反應(yīng)、免疫反應(yīng)相關(guān),例如MAPK信號(hào)通路、雌激素信號(hào)通路、Ras信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路等。

        全身炎癥是CHD的一個(gè)重要病理生理因素。在KEGG富集分析中,MAPK信號(hào)通路是富集基因最多的信號(hào)通路且與炎癥反應(yīng)密切相關(guān),因此推測(cè)MAPK通路可能是通過(guò)抗炎干預(yù)冠心病的關(guān)鍵通路。MAPK信號(hào)通路可介導(dǎo)細(xì)胞產(chǎn)生各種反應(yīng),Logatkina等[64]發(fā)現(xiàn)MAPK信號(hào)通路成分的增加可導(dǎo)致冠心病患者全血細(xì)胞持續(xù)炎癥激活。在MAPK信號(hào)通路中JUNK/p38MAPK通路是控制炎癥反應(yīng)最主要的MAPK家族成員之一,與細(xì)胞炎癥、凋亡、生長(zhǎng)有關(guān),其中p38MAPK與多種病理過(guò)程如心肌病變、心臟缺血/再灌注、動(dòng)脈硬化的發(fā)生等相關(guān)[65],激活p38MAPK信號(hào)通路可使血管平滑肌細(xì)胞從中膜進(jìn)入內(nèi)膜并發(fā)生增殖,促進(jìn)AS的發(fā)生和發(fā)展[66]。周茜等[67]研究表明通過(guò)促進(jìn)MAPK通路中ERK的活化、減少促凋亡通路中JNK和p38MAPK的激活,可減輕心肌纖維化,從而保護(hù)心肌靶器官。

        基礎(chǔ)研究顯示[68-71]雌激素可通過(guò)調(diào)節(jié)凝血功能、抗炎作用及動(dòng)員血管內(nèi)皮細(xì)胞,并促進(jìn)血管內(nèi)皮細(xì)胞缺血損傷后修復(fù)來(lái)實(shí)現(xiàn)保護(hù)血管內(nèi)皮細(xì)胞,以達(dá)到防止AS,保護(hù)心血管系統(tǒng)的作用。王宇等[72]研究顯示雌激素主要通過(guò)與其受體結(jié)合后激活包括PKB/Akt、ERK1/2、p38-MAPK在內(nèi)的信號(hào)通路,抑制內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激及引起的血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡,保護(hù)心血管系統(tǒng),從而防止As的發(fā)生。因此推測(cè)雌激素信號(hào)通路為黃山藥發(fā)揮抗炎、保護(hù)血管的一條潛在通路。

        PI3K/Akt是調(diào)節(jié)心臟功能相關(guān)的重要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,通過(guò)調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞凋亡、血管再生、促進(jìn)細(xì)胞能量代謝等影響冠心病的發(fā)生和發(fā)展[73-75]。Ravingerova等[76]通過(guò)大鼠實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)PI3K/Akt信號(hào)通路的級(jí)聯(lián)反應(yīng)對(duì)大鼠心臟具有保護(hù)機(jī)制。PI3K/Akt信號(hào)通路還可以使糖原合酶激酶-3(glycogensynthase,GSK-3)磷酸化,降低GSK-3的活性,增加心肌對(duì)葡萄糖的攝取和脂代謝能力,從而保護(hù)心臟[77]。在Ras信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中,Ras蛋白作為分子開(kāi)關(guān)參與信息傳遞可激活下游信息傳遞途徑如MARK信號(hào)途徑、PI3K/Akt信號(hào)通路、GalGEF信號(hào)通路等,參與調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝、凋亡、增殖和分化。由此可以推測(cè)Ras信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路等在黃山藥干預(yù)冠心病過(guò)程中亦發(fā)揮重要作用。

        綜上所述,已有相關(guān)報(bào)道的和冠心病相關(guān)的生物通路主要與炎癥、免疫反應(yīng)相關(guān),提示黃山藥可能通過(guò)MAPK信號(hào)通路、雌激素信號(hào)通路、Ras信號(hào)通路、PI3K/Akt信號(hào)通路干預(yù)冠心病。

        4 結(jié)語(yǔ)

        本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接的研究方法,通過(guò)靶點(diǎn)預(yù)測(cè)、蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)、GO富集分析和KEGG通路富集分析,提示黃山藥主要活性成分胡蘿卜苷、延齡草苷、新甾體皂苷等,可能通過(guò)ALB、EGFR、SRC、MAPKs等靶點(diǎn),作用于MAPK、雌激素、Ras、PI3K/Akt等信號(hào)通路干預(yù)冠心病。需要注意的是,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是依據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)和已有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)的建模,由于原始實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、圖譜信息來(lái)源于不同的實(shí)驗(yàn)條件,故實(shí)驗(yàn)存在一定的假陽(yáng)性率和假陰性率[78]。本文基于理論層面對(duì)黃山藥干預(yù)冠心病的作用機(jī)制進(jìn)行了預(yù)測(cè)分析,預(yù)測(cè)分析結(jié)果與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)不盡相同,希望本分析結(jié)果可為下一步深入研究提供新的思路,也期待更為豐富的研究結(jié)果。后續(xù)研究團(tuán)隊(duì)將持續(xù)關(guān)注黃山藥藥理研究進(jìn)展,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步進(jìn)行動(dòng)物或細(xì)胞實(shí)驗(yàn),以深入探討黃山藥干預(yù)冠心病的靶點(diǎn)及機(jī)制。

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