李悄 李國政 張博 王偉
1首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院,北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所耐藥結(jié)核病研究北京市重點實驗室細菌免疫室(北京101149);2安徽醫(yī)科大學生命科學學院遺傳學教研室(合肥230032);3安徽醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院腫瘤科(合肥230601)
據(jù)國際腫瘤研究機構(gòu)統(tǒng)計,隨著人口老齡化、環(huán)境惡化等問題日益突出,2020年全球大約有1 930 萬新發(fā)腫瘤病例和1 000 萬死亡病例,腫瘤負擔不斷加重,如何有效預(yù)防和控制腫瘤是世界范圍內(nèi)的一個重要公共衛(wèi)生問題[1]。研究發(fā)現(xiàn)能夠編碼蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄本僅占人類基因組序列的不到2%,非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)占大多數(shù),根據(jù)序列的長短,一般將大于200 nt 的ncRNA 命名為長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA),因其可參與調(diào)控基因表達以及與多種腫瘤的細胞增殖、凋亡、侵襲以及轉(zhuǎn)移等密切相關(guān),成為了近年來研究的熱點[2-5]。肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)是最早發(fā)現(xiàn)的lncRNA之一,在多種腫瘤中表達異常,與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展進程密切相關(guān),并且在腫瘤的早期診斷、治療及預(yù)后評估等領(lǐng)域也存在著潛在的應(yīng)用價值[6]。本文即結(jié)合國內(nèi)外關(guān)于MALAT1 的最新研究結(jié)果,對MALAT1 在腫瘤研究領(lǐng)域的進展做一綜述,為臨床及科研工作提供一定的參考。
MALAT1 定位于人類染色體11q13,長度約為8.5 kb,在肺、胰腺等健康器官和非小細胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)中均有高表達,于2003年由JI 等[7]在早期NSCLC 的研究中首次發(fā)現(xiàn)并命名,因其高度富集于核斑點-前體mRNA 儲存及剪切的區(qū)域,又稱為核富集轉(zhuǎn)錄本2(nuclearenriched abundant transcript 2,NEAT2)。MALAT1 3′端的腺苷酸聚集區(qū)和尿嘧啶聚集片段形成保守的三股螺旋結(jié)構(gòu),能夠降低3′→5′外切酶活性,使其更加穩(wěn)定地進行翻譯[8]。
MALAT1 雖然先發(fā)現(xiàn)于NSCLC,但是近些年來的研究發(fā)現(xiàn)MALAT1 在許多腫瘤組織中均呈高表達,如MALAT1 在肝癌中表達上調(diào),通過Wnt/β-連環(huán)素通路活化與絲氨酸/精氨酸富集剪接因子1(serine/arginine-rich splicing factor 1,SRSF1)誘發(fā)原癌基因的作用,促進肝癌細胞增殖[9];且MALAT1的表達與細胞運動相關(guān)基因的表達呈正相關(guān),促進肺癌細胞侵襲與轉(zhuǎn)移[10];而抑制結(jié)腸癌中MALAT1 的表達可以通過抑制Wnt/β-連環(huán)素信號通路來促進細胞凋亡等[11]。這些研究發(fā)現(xiàn)MALAT1作為“分子海綿”競爭結(jié)合一些內(nèi)源性的microRNA并調(diào)節(jié)下游基因的表達水平,也可以通過MAPK/ERK、PI3K/AKT、Wnt/β-連環(huán)素和NF-κB 等多種信號通路調(diào)控細胞的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移以及凋亡等過程,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起到重要的作用[12-13]。此外,研究還發(fā)現(xiàn)MALAT1 3′端的6918-8441nt 片段發(fā)生突變時,其促進腫瘤細胞增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移的作用會喪失,表明該片段可能是MALAT1 的功能域[14]。同時,越來越多的數(shù)據(jù)表明,MALAT1 在腫瘤組織中的異常表達可以作為腫瘤診斷和預(yù)后的生物標志物以及治療靶點,具有較好的應(yīng)用前景。
早期檢測對于腫瘤的治療至關(guān)重要,盡管目前有各種腫瘤診斷方式如實驗室檢查、影像學檢查、病理學檢查等,卻不能完全滿足早期診斷的需求,而近來研究表明MALAT1 有作為診斷性生物標志物的潛力。
研究發(fā)現(xiàn)MALAT1 在血清外泌體中可以作為非侵入性生物標記物用于NSCLC 的診斷[15],且外周血中的MALAT1 符合診斷標志物的重要特性如微創(chuàng)、高特異性和穩(wěn)定性。但是MALAT1 作為單一的生物標記物,靈敏度較低,可能無法用于診斷血液細胞部分中的NSCLC;于是將MALAT1 與RMRP、NEAT1、TUG1 聯(lián)合使用,能夠提高診斷效率,成為早期NSCLC 診斷的便捷工具[16],診斷ROC 曲線下的面積(AUC)見表1。此外,MALAT1還用于如乳腺癌[17]、膀胱癌[18]、鼻咽癌[19]以及上皮性卵巢癌[20]等其他腫瘤的診斷。
表1 MALAT1 在腫瘤中的診斷應(yīng)用Tab.1 Diagnostic application of MALAT1 in tumor
這些結(jié)果表明,MALAT1 對多種腫瘤具有較高的特異性和靈敏度,單獨使用或與其他診斷指標聯(lián)用可以作為診斷腫瘤的有效生物標志物。
目前臨床上的腫瘤治療方法有很多,包括手術(shù)切除、放療、化療、介入治療以及靶向藥物治療等等,各有優(yōu)缺點,而靶向腫瘤細胞的方法學進展也為MALAT1提供了作為腫瘤治療靶標的機會[21]。
在骨肉瘤中,體外敲低MALAT1 能夠抑制腫瘤細胞增殖和遷移,并導致細胞周期停滯和凋亡,異種移植模型也驗證了沉默MALAT1 可以抑制腫瘤生長,表明MALAT1 在骨肉瘤中起著致癌作用,可能是治療骨肉瘤患者的潛在靶標[22]。利用鋅指核酸酶(ZFN)技術(shù)將人肺癌細胞中的MALAT1敲低1 000 倍,結(jié)果細胞的遷移能力受損,且在異種移植小鼠模型中形成的腫瘤結(jié)節(jié)更少,提示MALAT1 作為肺癌轉(zhuǎn)移標記可能是治療轉(zhuǎn)移性肺癌的潛在策略[23]。MALAT1 在轉(zhuǎn)移性管腔B 型乳腺癌小鼠模型中高表達,當通過皮下注射反義寡核苷酸降低其表達水平后,具有較高肺轉(zhuǎn)移可能性的侵襲性乳腺癌向轉(zhuǎn)移性較弱的囊性腫瘤轉(zhuǎn)變,表明MALAT1 可以作為顯著降低腫瘤轉(zhuǎn)移風險的靶標,為乳腺癌的抗MALAT1 療法提供了有力的根據(jù)[24]。在宮頸癌中,高表達MALAT1 可能是通過下調(diào)miR-429 促進了宮頸癌進程,HeLa 細胞裸鼠異種移植模型結(jié)果顯示下調(diào)MALAT1 會抑制腫瘤大小和重量[25]。
除了上文提及的反義寡核苷酸、ZFN 技術(shù)之外,還有siRNA、miRNA、TALEN 以及CRISPR/Cas9等[26],這些短雙鏈RNA 分子和基因組編輯技術(shù)在通過敲低MALAT1 治療腫瘤的策略上具有重要作用。此外,MALAT1 敲除可以通過誘導固有凋亡相關(guān)信號觸發(fā)5-氟尿嘧啶介導的HepG2 細胞凋亡,即MALAT1 與化療藥物合用也有可能成為一條腫瘤治療途徑[27]。
MALAT1 是從初期NSCLC 患者腫瘤細胞中篩選出來的轉(zhuǎn)錄本,不但有助于識別發(fā)生轉(zhuǎn)移的高風險初期患者,而且是判斷腫瘤預(yù)后的重要指標。研究發(fā)現(xiàn)MALAT1、NEAT1 以及Oct4 在124 例肺癌患者中的共表達是預(yù)測患者預(yù)后不良的獨立因素[28];而位于MALAT1 上的rs3200401 T 等位基因的遺傳變異與晚期肺腺癌患者的良好預(yù)后相關(guān),患者的中位生存時間(median survival time,MST)平均延長10.6 個月,可以作為新指標預(yù)測肺腺癌患者的臨床結(jié)局[29]。WANG 等[30-31]在509 例原發(fā)性乳腺癌手術(shù)切除的患者中驗證MALAT1 表達與無復發(fā)生存率(relapse-free survival,RFS)的相關(guān)性,結(jié)果顯示,在激素受體陽性或腫瘤分級低的患者中,MALAT1 高表達的患者復發(fā)風險比低表達者增加了2 倍,且初次手術(shù)至最早出現(xiàn)復發(fā)證據(jù)的時間間隔更短,即MALAT1 高表達與RFS 較低相關(guān)。再者,通過檢測146 例接受根治性手術(shù)切除的Ⅱ/Ⅲ期結(jié)直腸癌患者的腫瘤組織,發(fā)現(xiàn)MALAT1 在腫瘤組織中的表達水平是正常組織的2.26倍,且無病生存率(disease free survival,DFS)更低,預(yù)后相對較差[32-33]。而骨髓瘤患者的MALAT1表達水平經(jīng)抗腫瘤治療后顯著下調(diào),患者的無進展生存率(progression-free survival,PFS)比對照組平均延長13 個月;同時,MALAT1 水平變化的臨界值可以用于預(yù)測出現(xiàn)早期進展的患者(PFS ≤18個月),其陽性預(yù)測值為76.5%、準確性為75%[34]。
此外,還有其他腫瘤如膀胱癌[35]、胰腺癌[36]等,MALAT1高表達的患者與預(yù)后較差相關(guān)(表2)。這些研究結(jié)果表明MALAT1 可能是預(yù)測各種癌癥結(jié)果的獨立生物標志物,并需要進一步更大樣本量的臨床驗證。
表2 MALAT1 在腫瘤預(yù)后中的應(yīng)用Tab.2 Application of MALAT1 in tumor prognosis
本文一方面探討了MALAT1 在多種腫瘤中的異常表達與腫瘤細胞增殖、轉(zhuǎn)移等過程的密切關(guān)系,另一方面著重闡述了MALAT1 在腫瘤早期診斷、治療及預(yù)后評估中的應(yīng)用價值與前景。另外,通過橫向比較MALAT1 在各種腫瘤中的研究策略,可以看出目前針對MALAT1 的研究路線較為成熟,主要是通過體外培養(yǎng)腫瘤細胞系,在細胞水平上探索MALAT1 對腫瘤細胞生物學進程的調(diào)控及其調(diào)控機制,再建立小鼠模型進一步驗證。但是,MALAT1 的具體作用機制、參與的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等方面仍需深入研究,距離它真正應(yīng)用到實際臨床工作中還有很多的工作需要做。
綜上所述,MALAT1作為一種重要的lncRNAs,其應(yīng)用是多樣化的[37],未來有可能開發(fā)成為腫瘤診斷和預(yù)后的生物標志物以及腫瘤治療新靶點,而且與藥物聯(lián)用也是其臨床轉(zhuǎn)化的重要方向。