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        輪狀病毒NSP5克隆、鑒定、表達及其條件優(yōu)化

        2021-08-31 08:24:00林家鋒陶曉莉陸恒章于美玲李婷婷李藤菲程美慧李永剛
        中國人獸共患病學報 2021年8期
        關鍵詞:檢測

        林家鋒,陶曉莉,陸恒章,于美玲,李婷婷,李藤菲,程美慧,李永剛

        輪狀病毒(Rotavirus, RV)是能夠使人類和動物引起一系列消化系統(tǒng)癥狀的常見病毒,可侵及小腸黏膜并且附著定居,給宿主細胞造成極大的危害[1]。與其他RNA病毒相比,它參與編碼6種結構蛋白(VP1、VP2、VP3、VP4、VP6、VP7)及6種非結構蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5、NSP6),對病毒的增殖及致病有著重要的生物學意義[2-4]。RV大多通過糞-口途徑傳播,秋冬季節(jié)活躍,在一般環(huán)境中能穩(wěn)定生存。它在世界范圍內(nèi)廣泛存在,分型眾多,A~C組能夠?qū)е氯祟惡蛣游锔篂a,D~G組只能導致動物腹瀉,給當?shù)丶倚髽I(yè)及衛(wèi)生健康構成極大的威脅[5-6]。一經(jīng)感染,便可誘發(fā)蛋花湯樣便、眩暈、發(fā)熱等具體表現(xiàn),嚴重者會因機體內(nèi)環(huán)境失衡而脫水、休克死亡[7]。然而,目前尚無治療該病毒公認有效的藥品或疫苗,此外該病毒與宿主間的互作機制和致病機理還有待進一步研究。

        作為一種重要的非結構蛋白,NSP5具有高度磷酸化的功能,能在細胞質(zhì)內(nèi)表達且穩(wěn)定調(diào)控病毒的復制和感染周期。研究表明,具有多個骨架蛋白修飾位點的NSP5可與NSP2、VP2以及VP6蛋白共同構成病毒質(zhì)體,而病毒質(zhì)體又是病毒復制的主要場所[8-10]。一些學者通過小干擾RNA7(MicroRNA-7)靶向下調(diào)NSP5的表達,從而影響病毒質(zhì)體的形成并抑制RV復制[11]。由此可見,NSP5在病毒的增殖表達及生物學活性中發(fā)揮著重要的作用,但具體機制還不清楚,本研究利用分子克隆的方法構建A組RV-NSP5重組表達載體來檢測其在細胞內(nèi)的表達,并對原核表達的條件進行優(yōu)化分析,確定融合蛋白的富集位置,從而進一步探究分離株RV NSP5在病毒增殖中所承擔的作用,同時為后續(xù)多抗及相關制劑的制備提供實驗基礎。

        1 材料與方法

        1.1 主要材料與試劑

        1.1.1 病毒、細胞與質(zhì)粒 本實驗所用的A組RV病毒株分離自遼寧省錦州市婦嬰醫(yī)院一患兒糞便樣品,293T細胞購于北京協(xié)和醫(yī)學院細胞中心,pGEX-6P-1原核表達載體和pFLAG-CMV-3真核表達載體由錦州醫(yī)科大學病原生物學實驗室保存。

        1.1.2 試劑 KOD-PLus-Neo PCR擴增試劑盒購買于日本TOYOBO公司;限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ酶、XhoⅠ酶、XbaⅠ酶、DNA連接酶和反轉(zhuǎn)錄試劑盒均購買于大連TaKaRa公司;TRIzol Reagent LS購買于Ambion公司;DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒DNA中提試劑盒都購買于美國Axyprep公司;普通DNA產(chǎn)物純化試劑盒購買于北京天根生化科技有限公司;DH5α、BL21(DE3)感受態(tài)細胞、氨芐西林鈉(Ampicilin,Amp)、異丙基硫代半乳糖苷(Isopropyl β-D-Thiogalactoside,IPTG)、酵母提取物、胰蛋白胨都購買于北京索來寶科技有限公司;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清都購買于Gibco公司;BCA蛋白濃度測定試劑盒購買于碧云天生物技術公司;GST瓊脂糖純化樹脂購買于上海生工公司;抗FLAG單克隆抗體購買于Sigma公司;Mouse Anti-β-actin mAb和Mouse Anti-GST mAb購買于北京中杉金橋生物技術有限公司;Alexa Flour 594 goat anti-mouse IgG(H+L)和HRP-goat anti-mouse IgG(H+L)都購買于美國Invitrogen公司等。

        1.2 NSP5原核及真核表達載體的構建

        1.2.1 引物設計與合成 根據(jù)分離所得的病毒株進行引物設計并經(jīng)BLAST檢測特異性、測序檢測準確性。詳見表1。

        表1 輪狀病毒NSP5原核及真核表達引物

        1.2.2 提取RV RNA及PCR擴增NSP5 從RV病毒分離株提取RNA,經(jīng)過反轉(zhuǎn)錄、PCR反應獲得特異NSP5基因。反應體系及成分為:KOD-PLus-Neo酶1 μL,cDNA 1 μL,dNTP 5 μL,MgSO43 μL,10×PCR Buffer 5 μL,上下游引物各1 μL,最后用ddH2O補足至50 μL;條件如下:94 ℃持續(xù)2 min; 98 ℃持續(xù)10 s,58 ℃持續(xù)30 s,68 ℃持續(xù)30 s,共35個循環(huán);最后 68 ℃ 持續(xù)7 min。電泳后,將NSP5目的條帶切膠并且純化回收,測序驗證。

        1.2.3 NSP5-pGEX-6P-1和NSP5-pFLAG-CMV-3的構建和鑒定 對純化的NSP5片段和空載體雙酶切,酶切反應體系分別為pGEX-6P-1或NSP5 2.5 μg,EcoR I 1 μL,XhoⅠ 1 μL,10×H Buffer 5 μL,ddH2O補足至50 μL;pFLAG-CMV-3或NSP5 2.5 μg,EcoR I 1 μL,XbaⅠ 1 μL,10×M Buffer 5 μL,0.1% BSA 5 μL,ddH2O補足至50 μL,條件為37 ℃水浴3 h。DNA液體純化再回收,經(jīng)電泳驗證和理論大小相符時,把載體片段以及目的片段按1∶5比例、總體積10 μL進行連接,連接酶10 μL,16 ℃反應1 h,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,第2 d選細菌培養(yǎng)板上生長狀況良好的單克隆菌落,進行菌落PCR的初步驗證。驗證陽性者,即可中提質(zhì)粒,雙酶切驗證。所得質(zhì)粒送至南京金斯瑞生物科技有限公司測序驗證。

        1.3 NSP5-pFLAG-CMV-3真核細胞轉(zhuǎn)染及相關檢測

        1.3.1 293T細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 293T細胞按照每孔6×105的數(shù)量級加到6孔板中,培養(yǎng)過夜。等長到60%~70%的時候,每個孔240 μL Opti-MEM稀釋10 μL PEI,輕柔混合切勿振蕩,室溫孵育5 min;然后240 μL Opti-MEM稀釋4 μg NSP5-pFLAG-CMV-3重組質(zhì)粒,用同樣的方法稀釋pFLAG-CMV-3空載體。把上述稀釋液分別緩慢混合,室溫孵育20 min。最后,加入對應孔培養(yǎng)細胞48 h,用于Western Blot和間接免疫熒光檢測。

        1.3.2 Western blot檢測 NSP5-pFLAG-CMV-3轉(zhuǎn)染后,吸棄上清液體,每個孔加入250 μL的NP-40,變性、離心、-20 ℃保存。蛋白樣品經(jīng)過10%SDS-PAGE分離,15V半干轉(zhuǎn)12 min,PVDF膜右上角裁角標記,5% 脫脂奶粉封閉2.5 h。然后,用封閉液1∶2 000稀釋鼠抗β-actin抗體、1∶5 000的比例稀釋鼠抗FLAG抗體,浸沒PVDF膜4 ℃過夜。1×PBST洗膜10 min×3次;二抗HRP-goat anti-mouse IgG(H+L)經(jīng)1∶3 000稀釋后將膜均勻孵育,室溫1 h,洗膜10 min×3次。ECL顯影拍照,檢測NSP5-pFLAG-CMV-3蛋白在細胞水平上的表達。

        1.3.3 間接免疫熒光檢測 取出細胞培養(yǎng)板置于室溫下,棄掉原有培養(yǎng)液,4%多聚甲醛靜置1 h,500 μL PBS洗滌3次,加200 μL 0.1% Triton X-100靜置15 min,500 μL PBS洗滌3次。1% BSA靜置1 h,PBS洗后,加1∶200比例稀釋的鼠抗FLAG,37 ℃孵箱中靜置1 h。吸掉一抗,500 μL PBS洗滌3次,避光環(huán)境下加入1∶500比例稀釋的羊抗鼠熒光二抗,37 ℃濕盒避光1 h,吸掉二抗,PBS洗滌后,運用熒光顯微鏡采圖。

        1.4 NSP5-pGEX-6P-1原核表達和條件優(yōu)化

        1.4.1 NSP5-pGEX-6P-1在大腸桿菌中的原核表達 NSP5-pGEX-6P-1轉(zhuǎn)化到E.coliBL21(DE3)中,置在細菌培養(yǎng)箱生長過夜。第二天把重組菌的單菌落接種至150 mL新鮮的LB培養(yǎng)液(1∶1 000的比例加了Amp),在恒溫搖床培養(yǎng),直至重組菌菌體OD值達到0.6~0.8時,設置不同變量對最適蛋白誘導表達條件進行摸索:IPTG濃度(0、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2 mmol/L)、誘導溫度(28 ℃和37 ℃)以及誘導時間(2、4、6、8、10、12 h)。

        1.4.2 NSP5-pGEX-6P-1可溶性表達、純化及鑒定 取出保存的最佳誘導條件下菌體蛋白,冰浴超聲破碎:每次工作5 s、間歇10 s,總共超聲99次。然后,離心,保存上清,冰浴條件下用400 μL PBS將沉淀吹打均勻。各吸50 μL上清及沉淀,變性、離心后制成樣品,進行后續(xù)SDS-PAGE分析。經(jīng)大量誘導表達后,沉淀蛋白用含鹽酸胍的變性緩沖液充分溶解,4 ℃搖晃過夜。次日,不斷用不含鹽酸胍的復性緩沖液超濾置換,直至液體清透。根據(jù)GST瓊脂糖純化樹脂說明書,控制流速上柱洗脫,并測定純化所得目的蛋白的濃度。隨后,將純化的重組蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜,Mouse Anti-GST mAb為一抗、HRP-goat anti-mouse IgG(H+L)為二抗,分別以1∶2 000和1∶3 000稀釋,進行Western Blot檢測。

        2 結 果

        2.1 RV-NSP5基因擴增 RV cDNA經(jīng)針對NSP5的特異引物進行體外擴增,電泳結果表明,605 bp左右出現(xiàn)一明亮條帶,與預期片段大小一致(圖1)。測序結果進一步表明,RV-NSP5基因擴增成功。

        1為RV-NSP5目的片段

        2.2 重組載體的構建及鑒定 擴增反應產(chǎn)物經(jīng)過DNA膠回收純化、酶切、再純化及片段連接,轉(zhuǎn)化到DH5α中,提取質(zhì)粒后分別使用EcoRI/XhoI和EcoRI/XbaⅠ進行雙酶切驗證,得到的條帶與理論大小相符(圖2、3)。經(jīng)測序結果證明,所得序列與NSP5基因序列相一致,表明NSP5-pGEX-6P-1和NSP5-pFLAG-CMV-3重組質(zhì)粒構建成功(圖4、5)。

        1為NSP5-pGEX-6P-1質(zhì)粒

        1為NSP5-pFLAG-CMV-3質(zhì)粒

        圖4 NSP5-pGEX-6P-1的測序鑒定圖(部分截圖)

        圖5 NSP5-pFLAG-CMV-3的測序鑒定圖(部分截圖)

        2.3 Western blot 驗證NSP5-pFLAG-CMV-3在細胞中的表達 NSP5-pFLAG-CMV-3轉(zhuǎn)染至293T細胞,分析NSP5在細胞水平上的表達情況。由圖所示,NSP5-pFLAG-CMV-3轉(zhuǎn)染后在約25 kD呈現(xiàn)特異條帶,符合理論大小,而pFLAG-CMV-3空載體轉(zhuǎn)染并沒有出現(xiàn)條帶(圖6)。

        1為轉(zhuǎn)染pFLAG-CMV-3質(zhì)粒;2為轉(zhuǎn)染NSP5-pFLAG-CMV-3質(zhì)粒

        2.4 間接免疫熒光檢測NSP5-pFLAG-CMV-3在細胞內(nèi)分布 NSP5-pFLAG-CMV-3轉(zhuǎn)染至293T細胞之后在37 ℃細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48 h,IFA結果表明,轉(zhuǎn)染NSP5-pFLAG-CMV-3的細胞能夠觀察到熒光主要匯集在細胞質(zhì)中,細胞核并沒有熒光;轉(zhuǎn)染pFLAG-CMV-3空載體沒有呈現(xiàn)出特異性熒光(圖7)。

        A為轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒NSP5-pFLAG-CMV-3;B為轉(zhuǎn)染空載體pFLAG-CMV-3質(zhì)粒

        2.5 NSP5-pGEX-6P-1優(yōu)化表達、純化及鑒定 經(jīng)誘導條件摸索,確定NSP5-pGEX-6P-1最適誘導條件為37 ℃、8 h、IPTG 0.4 mmol/L,超聲破碎獲得上清液和沉淀懸液,用于電泳及進一步的染色分析。結果表明,在最適蛋白誘導條件下,NSP5-pGEX-6P-1大部分是以包涵體形式富集于沉淀中表達,而在上清的可溶性表達微乎其微(圖8A)。包涵體蛋白在變性、復性之后,經(jīng)GST瓊脂糖樹脂親和層析洗脫,純化所得的蛋白濃度為0.92 mg/mL(圖8B)。經(jīng)Western Blot檢測,純化的融合蛋白能被抗GST單抗特異性識別,且在48 kD左右處有一條特異性條帶,符合預期大小(圖8C)。

        A:NSP5-pGEX-6P-1菌體總蛋白裂解后分析:1為裂解后的上清液;2為裂解后的沉淀懸液;B:NSP5-pGEX-6P-1純化蛋白SDS-PAGE分析:1和2為純化所得的重組蛋白;C:NSP5-pGEX-6P-1純化蛋白的Western Blot檢測:1為純化所得的重組蛋白

        3 討 論

        輪狀病毒是全球高發(fā)的人獸共患病原體之一,約95%的嬰幼兒在5歲前受過感染,此外也給畜牧業(yè)和世界經(jīng)濟造成了一定的損失[12]。由于該種病毒包裝機制復雜,復制增殖功能會大大加強病毒的致病力,給衛(wèi)生防控帶來了很大的難度[13]。至今除了預防性減毒活疫苗外,尚無有效的藥物及制劑可治療輪狀病毒,故從輪狀病毒的基因成分入手,對病毒的致病機制、表達方式及與宿主間互作機理進行深入研究,從而為腸道類病毒的檢測和治療提供理論基礎。

        NSP5是病毒基因組11片段編碼的蛋白質(zhì),含有大量絲氨酸、蘇氨酸等多種氨基酸的修飾位點,參與RV翻譯后修飾及加工處理,對病毒的復制周期和蛋白表達調(diào)控有著舉足輕重的作用[14]?;诜聪蜻z傳學技術的興起,科學家嘗試產(chǎn)生NSP5的穩(wěn)定反向互補系統(tǒng)以鑒定NSP5突變對RV病毒株的影響,結果發(fā)現(xiàn)NSP5過度磷酸化是裝配圓形病毒質(zhì)體的關鍵步驟,并且突出了NSP5的C末端尾巴在具有復制能力的病毒工廠形成過程中的關鍵作用[15-18]。隨后,Buttafuoco等[19]發(fā)現(xiàn)NSP5高表達是一個初始步驟,能夠觸發(fā)與NSP2、VP2結合形成胞質(zhì)包涵體,可在病毒顆粒蛋白募集過程中起到“橋梁”作用,這便為蛋白互作影響病毒功能提供了有力的依據(jù)。由此表明,NSP5非結構蛋白在病毒的復制和表達過程中起到非常重要作用,所以NSP5是如何加快病毒感染宿主并且協(xié)助逃避免疫監(jiān)視將會是人類未來深入探討的一大課題。

        本次研究通過構建輪狀病毒NSP5真核及原核表達系統(tǒng),一方面通過轉(zhuǎn)染真核細胞來研究重組質(zhì)粒在細胞水平上的表達情況,為深入探究NSP5的功能與致病機理提供了新思路;另一方面,基于重組蛋白獨特的屬性,利用基因工程等方面的技術,摸索出最優(yōu)化的表達條件,確定了重組蛋白富集在沉淀中,恰恰也驗證了Buttafuoco等研究者的觀點,并且順利純化NSP5蛋白,這為研制多抗提供了一定的前期基礎。

        利益沖突:無

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