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        生物合成天然2-苯乙醇細菌的篩選及合成途徑分析

        2021-08-31 02:34:30榮紹豐管世敏蔡寶國李茜茜
        食品科學 2021年16期
        關(guān)鍵詞:途徑檢測

        榮紹豐,伍 進,管世敏,蔡寶國,張 碩,李茜茜

        (上海應用技術(shù)大學香料香精技術(shù)與工程學院,上海 201418)

        2-苯乙醇因具有令人愉悅的香甜味,不僅可以作為食品添加劑對發(fā)酵食品中的其他風味物質(zhì)起到協(xié)調(diào)及增效的作用[1],而且在藥品、化妝品等領(lǐng)域的應用也十分廣泛。目前, 2-苯乙醇主要通過化學合成法制備,但此法原料具有致癌風險,而且產(chǎn)物中常含有一些難以去除的副產(chǎn)物,嚴重影響了產(chǎn)品質(zhì)量,極大限制了產(chǎn)品的使用范圍[2]。物理提取法可從植物中提取天然2-苯乙醇,但由于植物資源有限、提取效率低等原因不能滿足市場的大規(guī)模需求[3-4]。微生物轉(zhuǎn)化法[5]生產(chǎn)天然2-苯乙醇不僅可以滿足市場需求,而且得到的產(chǎn)品安全天然[6],是合成天然2-苯乙醇工業(yè)化新趨勢。

        微生物轉(zhuǎn)化法生產(chǎn)天然2-苯乙醇的菌種主要有酵母菌、真菌和細菌[7-8]。合成2-苯乙醇代謝途徑主要有3 條,即艾氏途徑、苯乙胺途徑和從頭合成途徑(圖1)[9]。目前,研究和應用最廣泛的是酵母菌,如釀酒酵母、馬克斯克魯維酵母、乳酸克魯維酵母、異常威克漢姆酵母等[10-13]。酵母菌通常以L-苯丙氨酸為底物,通過艾氏途徑合成2-苯乙醇。此外,真菌如米曲霉等可通過艾氏途徑和苯乙胺途徑合成2-苯乙醇[14]。細菌合成2-苯乙醇的報道較少,有研究顯示腸桿菌屬(Enterobactersp.)細菌能通過從頭合成途徑合成2-苯乙醇[15]。由于細菌具有生長速率快、無需以L-苯丙氨酸為底物合成2-苯乙醇等優(yōu)點,可降低生產(chǎn)成本,因此具有應用潛力[16]。

        圖1 微生物合成2-苯乙醇的代謝途徑Fig. 1 Metabolic pathway for biosynthesis of 2-phenylethanol in microorganisms

        本研究從土樣中分離篩選出1 株腸桿菌,該菌株不僅對2-苯乙醇有一定耐受,且可合成2-苯乙醇。從基因序列分析和生物轉(zhuǎn)化實驗兩個層面對該菌株合成2-苯乙醇的代謝途徑進行研究??蔀樘烊?-苯乙醇的工業(yè)化生產(chǎn)提供優(yōu)良的出發(fā)菌株。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        土壤樣品采集自上海海灣森林公園不同種類花的根部。

        細菌基因組DNA快速抽提試劑盒 生工生物工程(上海)股份有限公司;HBI腸桿菌科細菌生化鑒定試劑盒 青島海博生物技術(shù)有限公司;L-苯丙氨酸、2-苯乙醇、苯乙醛、苯丙酮酸 美國Sigma公司;其余試劑均為分析純,購自國藥集團化學試劑有限公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        GC6890-5973MS氣相色譜-質(zhì)譜(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)聯(lián)用儀、4890氣相色譜儀、1260液相色譜儀 美國Agilent公司;Nicolet 670傅里葉紅外光譜分析儀 美國Thermo Fisher Scientific公司;UNIC7200紫外-可見分光光度計 上海旦鼎國際貿(mào)易有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 菌株的篩選與鑒定

        1.3.1.1 菌株的篩選

        在超凈工作臺上稱取采集的土樣各5 g,分別加入含有100 mL無菌水的三角瓶中,在30 ℃、250 r/min條件下富集培養(yǎng)48 h。用無菌生理鹽水將富集菌液稀分別釋至10-4、10-5、10-6、10-7、10-8五個梯度,每個稀釋度取500 μL涂布于肉膏蛋白胨(Luria-Bertani,LB)固體培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)至長出菌落。挑單菌落反復劃線培養(yǎng)至菌落形態(tài)單一。將各單菌落轉(zhuǎn)接LB液體培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)24 h,取500 μL分別涂布于含6.0、5.0、4.0、3.0、2.0、1.0 g/L 2-苯乙醇的LB固體培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)3~5 d。挑取能在含2-苯乙醇LB固體培養(yǎng)基上生長的單菌落,按1.3.3節(jié)方法發(fā)酵培養(yǎng)并按1.3.4所述方法提取發(fā)酵產(chǎn)物。通過GC-MS檢測樣品中2-苯乙醇含量,方法見1.3.5節(jié)。所有實驗重復3 次。

        1.3.1.2 16S rDNA鑒定

        篩選獲得的菌株接種至LB培養(yǎng)基,37 ℃、250 r/min條件下培養(yǎng)24 h。用細菌基因組DNA快速抽提試劑盒提取基因組,用細菌16S rDNA通用引物27F(5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’)和1492R(5’-TACGGYTACCTTGTTACGACTT-3’)進行PCR擴增[17]。擴增產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司完成16S rDNA測序。測序結(jié)果上傳至美國國立生物技術(shù)信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)進行BLAST比對,并用MEGA 5.1軟件通過鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.3.1.3 革蘭氏染色和生理生化鑒定

        篩選獲得的菌株進行革蘭氏染色并鏡檢觀察菌體形態(tài)。按HBI腸桿菌科細菌生化[18]鑒定試劑盒使用手冊檢測,并根據(jù)《伯杰氏細菌鑒定手冊》[19]進行生理生化鑒定。

        1.3.2 基因組測序及序列分析

        按1.3.1.2節(jié)步驟提取篩選獲得的菌株基因組并送至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進行基因組測序[20]。利用美吉生物云(https://www.i-sanger.com/)進行序列組裝與注釋。利用KEGG數(shù)據(jù)庫(https://www.genome.jp/kegg/pathway.html)分析2-苯乙醇合成途徑。

        1.3.3 菌株發(fā)酵培養(yǎng)

        挑取斜面保藏菌株接種于50 mL LB培養(yǎng)基中,在30 ℃、250 r/min條件下培養(yǎng)24 h。按5%接種量轉(zhuǎn)接至發(fā)酵培養(yǎng)基[21](L-苯丙氨酸3.0 g/L,氯化鈉5.0 g/L,磷酸氫二鉀3.0 g/L,硫酸鎂1.0 g/L,pH 7.0),相同培養(yǎng)條件下發(fā)酵48 h。

        1.3.4 2-苯乙醇的提取

        發(fā)酵液于8 000 r/min離心10 min。上清液加入二氯甲烷進行萃取,體積比為1∶1。萃取30 min后取有機相,用0.22 μm有機相濾膜過濾并收集濾液。

        1.3.5 2-苯乙醇檢測

        GC檢測2-苯乙醇條件:色譜柱:Agilent色譜柱19091S-963(60 m×250 μm,0.25 μm);進樣口溫度250 ℃;升溫程序:初始柱溫50 ℃,以3 ℃/min升溫至140 ℃,140 ℃保持5 min。載氣(He)流速1.0 mL/min,分流比20∶1,進樣量1 μL。

        GC-MS檢測2-苯乙醇方法:GC條件:色譜柱及進樣溫度與上述方法相同;升溫程序:50 ℃保持1 min,以5 ℃/min升溫至230 ℃,230 ℃保持10 min;載氣(He)流速1.0 mL/min;進樣量1 μL;分流比20∶1。MS條件:電子電離源;電子能量70 eV;離子源溫度230 ℃;母離子m/z122;激活電壓0.8 V;傳輸線溫度250 ℃;電子倍增電壓1.3 kV;掃描范圍m/z20~500。

        2-苯乙醇采用外標法定量。配制不同質(zhì)量濃度的2-苯乙醇(0.8、0.6、0.4、0.2、0.1 g/L)標準品,在上述GC條件下作2-苯乙醇標準曲線。

        1.3.6 紅外光譜檢測

        將純化的2-苯乙醇樣品置于紅外光譜儀上,在800~2 500 nm紅外光譜范圍內(nèi)進行掃描,掃描次數(shù)32,分辨率為8 cm-1,探測器為InGaAs。使用空氣作為參考,透射光程1.0 mm,對每個樣品收集3 次光譜,取其平均光譜進一步分析。檢測時環(huán)境溫度20 ℃,相對濕度60%。

        1.3.7 不同碳源、底物發(fā)酵產(chǎn)2-苯乙醇

        將菌株接種于50 mL LB培養(yǎng)基,30 ℃、250 r/min培養(yǎng)24 h。無菌條件下將菌液于8 000 r/min離心10 min,并收集菌體。菌體用pH 7.4磷酸鹽緩沖液洗滌3 次后以10%接種量轉(zhuǎn)接于1.3.3節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基,其中L-苯丙氨酸質(zhì)量濃度分別為3.0、6.0、9.0 g/L。將發(fā)酵培養(yǎng)基中的L-苯丙氨酸依次替換為葡萄糖(10.0、20.0、30.0 g/L)或苯丙酮酸(3.0、6.0、9.0 g/L)或苯乙醛(3.0、6.0、9.0 g/L),按1.3.3節(jié)方法發(fā)酵后,按1.3.4節(jié)方法提取2-苯乙醇,并按1.3.5節(jié)方法定量檢測2-苯乙醇。實驗重復3 次,取平均值。

        1.3.8L-苯丙氨酸檢測

        高效液相色譜法檢測L-苯丙氨酸濃度。流動相為甲醇-水7∶3,檢測條件為:TC-C18色譜柱(250 mm×4.5 mm),流速1 mL/min,進樣量10 μL,檢測時間15 min,檢測波長254 nm。

        L-苯丙氨酸的標準曲線用外標法進行測定:配制不同質(zhì)量濃度2.0、4.0、6.0、8.0、10.0 g/L的L-苯丙氨酸標準品,分別通過高效液相色譜檢測獲得相應檢測峰面積。以L-苯丙氨酸峰面積為縱坐標、L-苯丙氨酸標準品質(zhì)量濃度為橫坐標繪制L-苯丙氨酸標準曲線。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 腸桿菌的分離鑒定

        從上海海灣森林公園采集的10 份土樣中初篩獲得44 株具2-苯乙醇耐受性菌株。各菌株2-苯乙醇耐受性結(jié)果見表1。其中,編號為1~35的單菌落2-苯乙醇耐受質(zhì)量濃度為1.0 g/L,編號為36~44的單菌落2-苯乙醇耐受質(zhì)量濃度為2.0 g/L。

        表144 株菌株對2-苯乙醇耐受結(jié)果Table 1 Tolerance to 2-phenylethanol in 44 strains isolated in this study

        進一步通過將初篩獲得的44 株菌置于發(fā)酵培養(yǎng)基中進行復篩實驗。在30 ℃、250 r/min條件下培養(yǎng)48 h后。取樣通過GC分別檢測L-苯丙氨酸和2-苯乙醇含量,以此評估44 株菌株產(chǎn)2-苯乙醇能力。其中40號菌2-苯乙醇質(zhì)量濃度最高,達到0.52 g/L(表2)。

        經(jīng)過比較分析各菌株產(chǎn)2-苯乙醇能力,最終選擇篩選獲得的40號菌株產(chǎn)2-苯乙醇0.52 g/L且對2-苯乙醇耐受質(zhì)量濃度達到2.0 g/L的細菌菌株。顯微鏡鏡檢結(jié)果表明,該菌細胞呈直短桿狀,大小0.6~1.0 μm×1.5~3.0 μm,革蘭氏染色陰性(圖2A)??寺≡摼?6S rDNA(GenBank No. MG554655),并對測序結(jié)果進行BLAST分析和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(圖2B),結(jié)果表明該菌株與腸桿菌屬相似性達到99.0%[22],初步確定該菌株屬于腸桿菌屬。

        圖2 腸桿菌革蘭氏染色顯微圖(A)及其系統(tǒng)發(fā)生樹(B)Fig. 2 Gram staining (A) and phylogenetic analysis (B) of Enterobacter sp. MF024

        進一步根據(jù)《伯杰氏細菌鑒定手冊》[19]進行生理生化鑒定,包括碳源同化、氮源同化和其他特征等實驗。以大腸桿菌DH5α為對照,結(jié)果顯示該菌具有典型的腸桿菌屬細菌生理生化特征(表3),因此確定該菌屬于腸桿菌屬,命名為Enterobactersp. MF024。

        表3 生理生化實驗結(jié)果Table 3 Physiological and biochemical experiment results

        2.2 Enterobacter sp. MF024菌株合成2-苯乙醇產(chǎn)物的鑒定

        對篩選獲得的Enterobactersp.MF024以3.0 g/LL-苯丙氨酸為唯一氮源生物轉(zhuǎn)化48 h后,提取發(fā)酵液中2-苯乙醇進行GC-MS分析。如圖3所示,在相同檢測條件下,Enterobactersp.MF024發(fā)酵液中提取的2-苯乙醇出峰時間為29.705 min(圖3A),與2-苯乙醇標準品(圖3C)的出峰時間一致。由MS結(jié)果可知,Enterobactersp.MF024發(fā)酵液中提取的樣品在m/z122出現(xiàn)吸收峰,為2-苯乙醇的碎片峰;在m/z91出現(xiàn)強吸收峰,為苯甲基的碎片峰(圖3B)[4]。該結(jié)果與2-苯乙醇標準品(圖3D)的各個峰一致。該發(fā)酵條件下2-苯乙醇產(chǎn)量為1.15 g/L。

        圖3 發(fā)酵液GC-MS鑒定結(jié)果Fig. 3 GC chromatograms and mass spectra of 2-phenylethanol standard and 2-phenylethanol in fermentation broth

        進一步利用紅外光譜法分析Enterobactersp. MF024發(fā)酵液中提取的2-苯乙醇樣品(圖4)。醇C—O鍵在1 260~1 000 cm-1有強吸收峰;在1 650~2 000 cm-1出現(xiàn)C—H和C=C鍵的面內(nèi)振動的泛頻峰強度都很弱,可以判斷是苯環(huán)的一取代物。在3 650~3 200 cm-1處為2-苯乙醇中O—H鍵的低頻峰;2 940~2 970 cm-1處為—CH2—的吸收峰。該結(jié)果都與2-苯乙醇標準品特征峰一致。

        圖42 -苯乙醇紅外光譜檢測結(jié)果Fig. 4 Infrared spectra of 2-phenylethanol standard and 2-phenylethanol in fermentation broth

        2.3 Enterobacter sp. MF024菌株基因組中參與2-苯乙醇合成途徑關(guān)鍵基因分析

        對Enterobactersp. MF024菌株基因組進行測序,該菌基因組大小為4 278 063 bp,共編碼4 512 個基因,基因平均長度是948.15 bp,N50值為577 909 bp (GenBank No. VCBB00000000)。通過KEGG數(shù)據(jù)庫比對,在Enterobactersp. MF024菌株基因組中發(fā)現(xiàn)了參與艾氏途徑以L-苯丙氨酸為底物合成2-苯乙醇的轉(zhuǎn)氨酶(基因aspC、hisC、tyrB)、苯丙酮酸脫羧酶(基因pdc)和乙醇脫氫酶(基因adhP、adhE)[23]。此外,發(fā)現(xiàn)了該菌的aroF、aroB、aroQ、aroE、quiA、aroK、aroA、aroC、pheA和tryA等10 個基因編碼的酶參與了2-苯乙醇從頭合成途徑[24]。

        2.4 Enterobacter sp. MF024菌株中2-苯乙醇合成途徑的確定

        由于微生物可通過從頭合成途徑、艾氏途徑和苯乙胺途徑3 個途徑合成2-苯乙醇(圖1),本研究對Enterobactersp.MF024菌株的2-苯乙醇合成途徑進行分析。生理生化檢測結(jié)果(表3)發(fā)現(xiàn),該菌L-苯丙氨酸脫羧酶為陰性,此酶為L-苯丙氨酸催化生成苯乙胺的關(guān)鍵酶。該酶的缺失表明Enterobactersp.MF024菌株無法通過苯乙胺途徑合成2-苯乙醇。

        在艾氏途徑中,以L-苯丙氨酸為唯一氮源,依次生成苯丙酮酸和苯乙醛兩種中間產(chǎn)物,最終生成2-苯乙醇[7]。從頭合成途徑則無需添加L-苯丙氨酸,以葡萄糖為唯一碳源,通過一系列代謝途徑后,依次合成苯丙酮酸和苯乙醛,最終生成2-苯乙醇。因此,在前期以L-苯丙氨酸為底物的發(fā)酵實驗基礎(chǔ)上,分別以苯丙酮酸、苯乙醛為底物,對Enterobactersp.MF024菌株進行發(fā)酵培養(yǎng),進一步驗證艾氏途徑。此外,不添加底物而以葡萄糖為唯一碳源進行發(fā)酵培養(yǎng),以驗證從頭合成途徑。由圖5 GC分析結(jié)果可知,無論是以苯丙酮酸、苯乙醛為底物發(fā)酵,還是以葡萄糖為碳源進行發(fā)酵,其產(chǎn)物均在29.704 min處有2-苯乙醇峰出現(xiàn)。MS結(jié)果進一步表明發(fā)酵產(chǎn)物都有2-苯乙醇的特征離子峰(m/z122、91)。因此,Enterobactersp.MF024菌株既能通過艾氏途徑,又能通過從頭合成途徑合成2-苯乙醇。

        圖5 各底物發(fā)酵液的GC-MS鑒定結(jié)果Fig. 5 GC-MS identification of 2-phenylethanol in fermentation broths with various substrates

        對Enterobactersp.MF024菌株兩條2-苯乙醇合成途徑的合成效率進行分析。當分別以10.0、20.0 g/L和30.0 g/L的葡萄糖為唯一碳源發(fā)酵48 h后(圖6A),得到2-苯乙醇質(zhì)量濃度分別為0.45、0.49 g/L和0.56 g/L。因此,在一定范圍內(nèi),隨著葡萄糖初始質(zhì)量濃度的提高,2-苯乙醇產(chǎn)率相應提高。當分別以3.0、6.0 g/L或9.0 g/L的L-苯丙氨酸為唯一氮源發(fā)酵48 h后(圖6B),2-苯乙醇質(zhì)量濃度分別為1.02、1.07 g/L和1.15 g/L。因此,在一定范圍內(nèi),隨著L-苯丙氨酸初始質(zhì)量濃度的提高,2-苯乙醇的產(chǎn)率相應提高。當分別以3.0、6.0 g/L或9.0 g/L的苯丙酮酸為底物發(fā)酵48 h后(圖6C),2-苯乙醇質(zhì)量濃度分別達到0.35、0.39 g/L和0.41 g/L。當分別以3.0、6.0 g/L或9.0 g/L的苯乙醛為底物發(fā)酵48 h后(圖6D),2-苯乙醇質(zhì)量濃度分別達到1.63、1.68 g/L和1.75 g/L。由于苯丙酮酸與苯乙醛為從頭合成途徑和艾氏途徑的中間產(chǎn)物,分別以兩者為底物發(fā)酵時Enterobactersp. MF024菌株均能合成2-苯乙醇,且隨著底物濃度的提高,2-苯乙醇產(chǎn)量相應提高,進一步表明該菌具備兩種合成途徑產(chǎn)2-苯乙醇的能力。

        圖6 2-苯乙醇合成效率結(jié)果Fig. 6 Synthetic efficiency of 2-phenylethanol with glucose as carbon source, L-phenylalanine as nitrogen source and different substrates

        自20世紀80年代艾式途徑報道以來,微生物轉(zhuǎn)化法生產(chǎn)2-苯乙醇的研究取得了很大發(fā)展。2-苯乙醇微生物合成途徑主要有3 條。其中,報道最多的是酵母菌以L-苯丙氨酸為唯一氮源,通過艾氏途徑生產(chǎn)2-苯乙醇[25]。為提高酵母菌產(chǎn)2-苯乙醇產(chǎn)量,Etschmann等[6]用馬克斯克魯維酵母(Kluyveromyces marxianus)CBS 600發(fā)酵41 h后獲得2-苯乙醇0.89 g/L。徐崢等[26]用紫外誘變法選育釀酒酵母2-苯乙醇高產(chǎn)菌株,其2-苯乙醇產(chǎn)量達到3.55 g/L。汪琨等[27]優(yōu)化釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)CWY 132的培養(yǎng)條件后,其生產(chǎn)2-苯乙醇產(chǎn)量提高至4.1 g/L。田勛[20]經(jīng)過對釀酒酵母細胞輔因子(NADH/NAD+)調(diào)控的研究,利用連續(xù)發(fā)酵85 h后積累獲得2-苯乙醇15.1 g/L。黃筱萍等[28]利用S. cerevisiaeH003雙罐連續(xù)補料發(fā)酵144 h后,通過原位產(chǎn)物分離技術(shù)獲得2-苯乙醇產(chǎn)量達29.86 g/L。綜上,增加2-苯乙醇產(chǎn)率的改進方式主要集中在合成途徑、遺傳修飾和代謝工程方面[29]。雖然酵母菌可通過艾氏途徑從L-苯丙氨酸高效合成2-苯乙醇,但L-苯丙氨酸的添加提高了生產(chǎn)成本,因此限制了其工業(yè)生產(chǎn)規(guī)模。

        從頭合成途徑產(chǎn)2-苯乙醇是以葡萄糖為唯一碳源,通過苯丙酮酸途徑(即莽草酸途徑)生成苯丙酮酸,苯丙酮酸再代謝為2-苯乙醇。苯丙酮酸途徑可聯(lián)系碳水化合物的代謝與芳香族化合物代謝,可直接由碳水化合物(例如葡萄糖)為底物代謝生產(chǎn)2-苯乙醇,無需添加L-苯丙氨酸,降低了生產(chǎn)成本[30]。目前報道通過該途徑合成2-苯乙醇的菌種較少,僅有Zhang Haibo等[15]篩選到Enterobactersp. CGMCC5087可通過從頭合成途徑發(fā)酵24 h后,生成0.1 g/L 2-苯乙醇。本研究分離篩選獲得了1 株具備從頭合成途徑和艾氏途徑生產(chǎn)2-苯乙醇的菌株,且從頭合成途徑產(chǎn)2-苯乙醇產(chǎn)量是目前已報道的菌株的5 倍。通過菌種誘變篩選和基因工程改造方法可進一步提高Enterobactersp. MF024菌株從頭合成途徑的2-苯乙醇產(chǎn)量,降低成本,為天然2-苯乙醇的工業(yè)化生產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。

        3 結(jié) 論

        本研究在環(huán)境土壤樣品中分離篩選到1 株可生產(chǎn)2-苯乙醇且對2-苯乙醇有一定耐受能力的新菌株Enterobactersp. MF024?;蚪M序列分析表明該菌存在從頭合成途徑和艾氏途徑的所有關(guān)鍵酶編碼基因。2-苯乙醇生物轉(zhuǎn)化實驗進一步驗證了Enterobactersp. MF024具備這兩種2-苯乙醇合成途徑,且2-苯乙醇產(chǎn)量分別達到0.56 g/L和1.15 g/L。研究為天然2-苯乙醇的工業(yè)生產(chǎn)提供了優(yōu)良的出發(fā)菌株。

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