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        基于微滴式數(shù)字PCR技術(shù)的HER2基因擴增用于乳腺癌TNM分期的研究

        2021-08-18 00:42:40張藝超林建山
        局解手術(shù)學(xué)雜志 2021年9期
        關(guān)鍵詞:微滴拷貝數(shù)倍數(shù)

        黃 波,張藝超,林建山

        (深圳市寶安人民醫(yī)院普外二區(qū),廣東 深圳 518101)

        乳腺癌是威脅女性健康的惡性腫瘤之一,每年乳腺癌新發(fā)100多萬例,死亡40多萬例[1]。乳腺癌類型較多,因而明確乳腺癌類型,制定合適的治療方案,準確評估預(yù)后,才能取得最佳的治療效果[2]。有研究顯示,人類表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)作為多變量分析中的一個獨立預(yù)后指標(biāo),可判斷乳腺癌的惡性程度[3]。HER2的標(biāo)準化檢測、乳腺癌患者HER2基因表達的規(guī)律及TNM分期等在臨床實踐中對于預(yù)測患者的預(yù)后、提高乳腺癌診治水平有著積極的意義[4]。目前,可通過免疫組織化學(xué)(immunohistochemistry,IHC)檢測HER2蛋白的表達,通過熒光原位雜交方法(fluorescence in situ hybridization,FISH)檢測HER2基因擴增的水平[5]。然而現(xiàn)有的HER2檢測方法,結(jié)果判讀具有主觀性,也易受到取樣及處理方法的影響,且HER2存在基因融合、斷裂等現(xiàn)象,F(xiàn)ISH檢測結(jié)果存在假陰性的可能[6]。微滴式數(shù)字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技術(shù)是一種新型的絕對定量PCR方法,與實時熒光定量PCR技術(shù)相比,其具有靈敏度高、定量準確、檢測的線性范圍寬、特異度高、成本低等優(yōu)點,極具發(fā)展?jié)摿7],但其結(jié)果的可靠性有待進一步證實。因此,本研究選擇我院收治的乳腺癌患者的標(biāo)本進行研究,分析ddPCR技術(shù)用于HER2基因擴增的價值及在評估乳腺癌TNM分期中的應(yīng)用。

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料

        從我科乳腺癌標(biāo)本庫中選擇2015~2017年行手術(shù)治療的100例乳腺癌患者的標(biāo)本作為觀察組,其中TNMⅠ~Ⅱ期71例,Ⅲ~Ⅳ期29例。納入標(biāo)準:經(jīng)病理學(xué)檢查確診為乳腺癌;IHC 3+或FISH法檢測HER2陽性;年齡≥18歲。排除標(biāo)準:肝腎功能不全;合并其他腫瘤;嚴重精神病史;存在其他重大器官疾??;臨床資料缺失。同期選擇80例乳腺增生患者的組織標(biāo)本作為對照組。2組患者的年齡、絕經(jīng)比例比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表1。本研究經(jīng)我院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準。

        表1 患者臨床資料比較

        1.2 方法

        構(gòu)建HER2基因擴增ddPCR方法:采用QX200 ddPCR系統(tǒng)檢測HER2基因擴增,將MixDNA樣品按16∶4的比例混合,制備反應(yīng)混合物。取20 μL反應(yīng)體系置于微滴發(fā)生器的樣品孔中,每孔加入70 μL微滴生成油,合上微滴生成儀,覆蓋墊圈墨盒,啟動生成儀,形成20 000個納米級的油包水微滴。每孔取40 μL油包水微滴加入96孔板。鋁箔熱封膜密封,置于Bio-Rad C1000熱封膜儀上,95 ℃ 5 s,60 ℃ 30 s進行40個常規(guī)的PCR擴增反應(yīng)循環(huán)。將96孔板放入QX200微滴檢測儀中,利用檢測儀自帶的控制分析軟件設(shè)置樣本孔條件,啟動檢測儀,根據(jù)泊松分布原理獲得標(biāo)本起始分子的絕對拷貝數(shù),將結(jié)果導(dǎo)出并保存。檢測HER2基因相對擴增倍數(shù),相對擴增倍數(shù)(n)=目標(biāo)基因拷貝數(shù)/內(nèi)參基因拷貝數(shù),當(dāng)n≤1.2時為陰性,當(dāng)n>1.2時為陽性。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法

        2 結(jié)果

        2.1 HER2基因相對擴增倍數(shù)檢測

        觀察組患者HER2基因相對擴增倍數(shù)高于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);觀察組中TNM Ⅲ~Ⅳ期乳腺癌患者HER2基因相對擴增倍數(shù)高于TNM Ⅰ~Ⅱ期乳腺癌患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見圖1。Spearman相關(guān)性分析結(jié)果顯示,HER2基因相對擴增倍數(shù)與TNM分期呈正相關(guān)(r=0.632,P<0.05)。

        圖1 HER2基因相對擴增倍數(shù)檢測結(jié)果

        2.2 ddPCR檢測分析乳腺癌患者TNM分期的價值

        使用ddPCR技術(shù)檢測乳腺癌患者HER2基因分析TNM分期的敏感度和特異度均大于90%,且曲線下面積(areaundercurve,AUC)>0.95(圖2),相關(guān)性分析有統(tǒng)計學(xué)意義,說明基于ddPCR技術(shù)的HER2基因相對擴增倍數(shù)可作為評估乳腺癌患者TNM分期的參考依據(jù)。

        圖2 ROC曲線圖

        3 討論

        2018年2月,國家癌癥中心發(fā)布了最新的全國癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù),乳腺癌發(fā)病率居女性惡性腫瘤的首位,約占16.51%,乳腺癌的防控形勢非常嚴峻[8]。根據(jù)基因不同,可將乳腺癌分為Luminal A型、Luminal B型(其中Luminal B型又細分為Luminal B HER2陰性型和Luminal B HER2陽性型)、HER2過表達型、三陰型[9]。不同類型乳腺癌治療方法也不同,Luminal A型乳腺癌以內(nèi)分泌治療為主;Luminal B型乳腺癌要考慮多種輔助治療相結(jié)合;三陰型乳腺癌尚無針對性治療方法,以化療為主;20%~30%的乳腺癌患者為Luminal B HER2陽性型,是各種分型中較為兇險的一個亞型,相比其他類型乳腺癌其惡性程度更高,疾病進展更快,更容易復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,嚴重威脅患者的生命[10]。

        HER2/neu基因是乳腺癌細胞中重要的表皮生長因子受體家族成員,也是目前乳腺癌治療的藥物靶點之一。有研究顯示,若乳腺癌患者HER2過表達,則其生存期極易縮短,導(dǎo)致不良結(jié)局[11]?,F(xiàn)階段臨床應(yīng)用過程中參考《乳腺癌HER2檢測指南》,而該指南中推薦使用IHC與FISH和/或顯色原位雜交結(jié)合方案檢測HER2的表達,但均存在分析結(jié)果主觀性、檢測耗時長、操作繁瑣等缺點,導(dǎo)致其臨床應(yīng)用存在一定的局限性[12-13]。

        ddPCR技術(shù)是近年來臨床逐漸推廣應(yīng)用的新型檢測技術(shù),可有效分析HER2基因拷貝數(shù),定量分析HER2的DNA以及RNA水平[14]。ddPCR技術(shù)在使用過程中通過將反應(yīng)體系均分到大量反應(yīng)單元中,獨立進行PCR擴增,檢測每個反應(yīng)單元的熒光信號(熒光信號產(chǎn)生過程參考qPCR),根據(jù)泊松分布和陽性比例計算核酸數(shù)量[15]。本研究采用ddPCR技術(shù)檢測乳腺癌患者的標(biāo)本,結(jié)果顯示,TNM Ⅲ~Ⅳ期的患者HER2基因相對擴增倍數(shù)高于TNM Ⅰ~Ⅱ期的患者;相關(guān)性分析結(jié)果顯示,ddPCR技術(shù)檢測的HER2基因相對擴增倍數(shù)與TNM分期呈正相關(guān);進一步分析發(fā)現(xiàn),ddPCR技術(shù)檢測乳腺癌患者HER2基因分析TNM分期的敏感度和特異度均大于90%,且AUC>0.95,具有較高的應(yīng)用價值。ddPCR技術(shù)可對基因序列進行高靈敏度的檢測,在檢測過程中無需采用標(biāo)準品即可實現(xiàn)DNA的絕對定量;此外,ddPCR技術(shù)檢測HER2基因時,不依賴擴增效率和Ct值,可有效避免PCR抑制劑的影響,對樣本容忍度較高。結(jié)合本研究進一步分析認為,ddPCR技術(shù)可有效分析HER2表達水平和拷貝數(shù),通過精準定量分析為乳腺癌分子分型提供數(shù)據(jù)支持,ddPCR計數(shù)可有效篩選出低豐度的基因表達并開展鑒定分析,對于乳腺癌患者病情的評估具有重要作用。

        綜上所述,使用ddPCR技術(shù)檢測乳腺癌患者HER2基因相對擴增倍數(shù)與乳腺癌TNM分期呈正相關(guān),該方法預(yù)測TNM分期的敏感度和特異度均較高。但本研究并未詳細分析ddPCR技術(shù)檢測HER2基因相對擴增倍數(shù)與乳腺癌患者預(yù)后質(zhì)量的關(guān)系,有待后續(xù)進一步研究。

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