陶文學(xué),陳來秀,李正國,席彩霞,曾多,劉雪梅,李博,魏婷
(甘肅省武威腫瘤醫(yī)院呼吸內(nèi)科,甘肅 武威 733000)
呼吸道病原菌主要包括金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、肺炎克累伯菌等,目前,其導(dǎo)致的感染已成為全世界主要致死性因素之一。世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,呼吸道病原菌感染(5.9%)在世界十大病死原因中位列第三,僅次于冠心病與腦卒中,增加家庭和社會的負(fù)擔(dān)[1-3]。呼吸道病原菌感染表現(xiàn)癥狀基本相似,單純依據(jù)癥狀難于有效準(zhǔn)確診斷。目前,臨床鑒定病原菌的方法主要依靠細(xì)菌培養(yǎng)法,但獲得結(jié)果需3~5 d,易錯過控制感染的最佳時期[4-5]。晶芯呼吸道病原菌酸檢測可一步完成對靶基因的擴增和檢測。基于此,本研究選取2019年4月至2020年1月本院收治的84例疑似下呼吸道感染患者作為研究對象,探討晶芯呼吸道病原菌核酸檢測在臨床中的應(yīng)用價值,現(xiàn)報道如下。
1.1 臨床資料 選取2019年4月至2020年1月本院收治的84 例疑似下呼吸道感染的患者。納入標(biāo)準(zhǔn):研究經(jīng)本院倫理委員會批準(zhǔn);患者均對本研知情并自愿簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):咳出、吐出的痰液不合格者;依從性差者。
1.2 方法
1.2.1 儀器與試劑 巧克力瓊漿平板、血瓊脂平板、革蘭染液(青島海博生物科技有限公司)、晶芯呼吸道病原菌核酸檢測試劑盒(上海紀(jì)寧實業(yè)有限公司)、全自動細(xì)菌鑒定儀(蘇州安創(chuàng)儀器有限公司,型號:Phoenix100)、恒溫擴增微流控芯片核酸分析儀(成都博奧晶芯生物科技有限公司,型號:Dhelix 1610)。
1.2.2 檢測方式 使用魚躍吸痰器(北京眾思康科技發(fā)展有限公司),由專業(yè)護士指導(dǎo)患者配合吸取呼吸道深部痰液,采集后送至檢驗科微生物室。晶芯呼吸道病原菌核酸檢測:利用熒光染料摻入法進行實時熒光檢測,在具有鏈置換功能的聚合酶(在65 ℃恒溫條件下可發(fā)生反應(yīng))作用下,擴增靶核酸會呈S形曲線擴增,進而對靶基因進行檢測與擴增。常規(guī)痰培養(yǎng)檢:將痰液標(biāo)本接種于巧克力瓊漿平板或血瓊脂平板,于37 ℃環(huán)境下孵育24 h,選出優(yōu)勝菌群,革蘭染色鏡下形態(tài)鑒定,上機鑒定。
1.3 觀察指標(biāo) 比較兩種檢測方式的樣本檢出陽性率,并分析兩種檢測方式對8 種傳統(tǒng)可培養(yǎng)細(xì)菌的檢出一致性。根據(jù)陽性判斷值結(jié)合Tp值判讀結(jié)果,Tp值為晶芯呼吸道病原菌核酸檢測完成后軟件將輸出S 形擴增曲線快速增長的首個拐點時刻減去原點時刻。
1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)分析,計量資料以“”表示,比較采用t檢驗,計數(shù)資料用[n(%)]表示,比較采用χ2檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 兩種檢測方法結(jié)果比較 兩種檢查方法陽性率比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義,以痰培養(yǎng)鑒定為金標(biāo)準(zhǔn),晶芯呼吸道病原菌核酸檢測的靈敏度為96.01%(65/67),特異性為76.47%(13/17),見表1。
表1 兩種檢測方法結(jié)果比較Table 1 Comparison of results of the two detection methods
2.2 兩種檢測方法檢測結(jié)果一致性分析 8 種傳統(tǒng)可培養(yǎng)細(xì)菌在84例樣本檢測中有64(76.19%)例2種檢測方法結(jié)果一致,分別為肺球鏈球菌20例(23.81%),金黃色葡萄球菌19例(22.62%),大腸埃希菌8 例(9.52%),肺炎克雷伯菌7 例(8.33%),銅綠假單胞菌5 例(5.95%),鮑曼不動桿菌2 例(2.38%),嗜麥芽窄食單胞菌0 例(0.00%),流感嗜血桿菌3例(3.57%)。
據(jù)統(tǒng)計,全球33%的病死是由感染性疾病引發(fā),其中呼吸道感染居各種感染性疾病首位,是威脅人類生命安全的重要疾病之一[6-7]。呼吸道感染的主要病原體為細(xì)菌,其種類繁多,若僅采取經(jīng)驗性抗菌治療,極易造成耐藥菌群增加,而需及時確定感染細(xì)菌種類,并予針對性治療,因此,確定病原體對呼吸道感染臨床治療具有重要意義[8--13]。
常規(guī)痰培養(yǎng)檢查是臨床確診病原體常見操作,但傳統(tǒng)培養(yǎng)檢測周期較長,操作繁瑣,在培養(yǎng)中可能被污染,導(dǎo)致結(jié)果準(zhǔn)確性較低[14]。晶芯呼吸道病原菌核酸檢測技術(shù)是一種新的痰標(biāo)本病原體種類檢測技術(shù),操作簡單、檢測成本低、敏感度高,在63 ℃恒溫裝置中,將試劑與待測標(biāo)本DNA 共同放置1 h左右便可判斷擴增情況,從痰液標(biāo)本處理到報告結(jié)果全過程僅需2 h,顯著縮短了檢驗周期[15-16]。本研究結(jié)果表明,晶芯呼吸道病原菌核酸檢測陽性率略高于痰培養(yǎng)鑒定,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義,表明兩者檢測結(jié)果差異不顯著,但傳統(tǒng)的痰培養(yǎng)則需將痰標(biāo)本在保溫箱中孵育>24 h,因此,在相同檢出率的前提下應(yīng)選擇更簡單、快捷的晶芯呼吸道病原菌核酸檢測[17]。同時,以痰培養(yǎng)鑒定為金標(biāo)準(zhǔn),晶芯呼吸道病原菌核酸檢測的靈敏度為96.01%,特異性為76.47%,表明晶芯呼吸道病原菌核酸檢測具有較高的靈敏度與特異性。本研究結(jié)果顯示,兩種檢測方法一致性較高,其中肺球鏈球菌與金黃色葡萄球菌的陽性率最高,均>22%,Yousaf S等[18]研究顯示,恒溫擴增芯片法檢出病原體56株,培養(yǎng)法檢出僅11例,即恒溫擴增芯片法的靈敏度顯著更高,可有效反映呼吸道感染的真實情況,可能原因是痰培養(yǎng)技術(shù)中痰標(biāo)本的保存與擴增過程受各種條件的限制,從而導(dǎo)致未檢測到真正的病原體[19-20]。
綜上所述,晶芯呼吸道病原菌核酸檢測方法較常規(guī)痰培養(yǎng)檢測法,操作簡單,可快速一次性檢出全部下呼吸道病源菌,且具有較高的特異性、敏感度與檢出率。