張凱 ,郭紫微 ,王倩 ,韓雅 ,李貺家,張中帥
1.信陽(yáng)師范學(xué)院地理科學(xué)學(xué)院,河南 信陽(yáng) 464000;2.河南省水土污染協(xié)同防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/信陽(yáng)師范學(xué)院,河南 信陽(yáng) 464000;3.水利部發(fā)展研究中心,北京 100038
抗生素耐藥性導(dǎo)致的環(huán)境問(wèn)題近年來(lái)受到越來(lái)越多的關(guān)注(朱永官等,2018)。環(huán)境中殘留的抗生素促進(jìn)了環(huán)境中微生物抗藥性的發(fā)展,導(dǎo)致環(huán)境中抗性細(xì)菌的大量繁殖(Jiang et al.,2018)。環(huán)境中的抗性細(xì)菌(Antibiotic resistant bacteria,ARB)會(huì)通過(guò)水平轉(zhuǎn)移的方式將抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)傳播到病原菌中,從而對(duì)人體健康產(chǎn)生威脅(Allen et al.,2010;Yang et al.,2018)。目前,針對(duì)各個(gè)環(huán)境介質(zhì)中ARGs及ARB中的研究層出不窮。大量研究結(jié)果表明,空氣、水及土壤等介質(zhì)中均有不同程度的ARGs及ARB污染,環(huán)境中ARGs及ARB污染已不容忽視(Jiang et al.,2018;Yang et al.,2018;García et al.,2020)。
湖庫(kù)型水源地與人體健康密切,其用水安全也是最引人重視的研究之一。Han et al.(2020)的研究結(jié)果表明,即便經(jīng)過(guò)飲用水處理設(shè)施的深度處理,湖庫(kù)型水源地中的菌落結(jié)構(gòu)仍能夠?qū)︼嬘盟械木航M成造成直接影響。這一結(jié)果進(jìn)一步凸顯了研究湖庫(kù)型水源地環(huán)境中耐藥菌的重要性。近年來(lái),大量研究分析了湖庫(kù)環(huán)境中ARGs及ARB污染現(xiàn)狀(Pang et al.,2015;Nnadozie et al.,2019;Chen et al.,2019;Dang et al.,2020)。結(jié)果表明,湖庫(kù)環(huán)境中也受到了一定程度的 ARB污染,且不同地區(qū)ARB的污染狀況不盡相同。
華中地區(qū)為中國(guó)七大地理分區(qū)之一,其包括河南、湖北、湖南三省。該地區(qū)總面積約56×104km2,占全國(guó)國(guó)土總面積的約5.9%。截至2017年底,華中地區(qū)常住人口約2.23億人,生產(chǎn)總值約11.61萬(wàn)億元,人均生產(chǎn)總值約5.20萬(wàn)元。隨著近年來(lái)華中地區(qū)經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展,該地區(qū)社會(huì)經(jīng)濟(jì)地位日益凸顯。然而,經(jīng)濟(jì)及工業(yè)的高速發(fā)展造成了該地區(qū)環(huán)境質(zhì)量的惡化(彭佳雯等,2011;繆羽晨等,2019)。水庫(kù)是華中地區(qū)最重要的飲用水來(lái)源,在促進(jìn)該地區(qū)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和繁榮、保障居民身體健康方面的作用不可替代。然而,目前缺乏對(duì)該地區(qū)供水水庫(kù)ARB賦存狀況綜合性的調(diào)查。因此,亟需研究明確華中地區(qū)水庫(kù)型水源地 ARB的分布特征,為控制該地區(qū)水庫(kù)環(huán)境 ARB及抗生素污染提供理論依據(jù)及數(shù)據(jù)支撐。
基于以上背景,本研究選取了華中地區(qū) 11個(gè)大型水庫(kù)型水源地,分析了水樣和底泥中耐藥菌的分布規(guī)律。本研究的主要目標(biāo)有:(1)明確華中地區(qū)水庫(kù)型水源地中耐藥細(xì)菌的污染特征;(2)分析華中地區(qū)水庫(kù)型水源地不同環(huán)境介質(zhì)中耐藥細(xì)菌的分布差異。
本實(shí)驗(yàn)所用儀器包括:BSD-400恒溫振蕩培養(yǎng)箱(上海博迅實(shí)業(yè)有限公司),T100PCR擴(kuò)增儀(美國(guó)Biorad),SW-CJ-1G無(wú)菌超凈工作臺(tái)(上海滬凈醫(yī)療器械有限公司),YM75Z高壓蒸汽滅菌器(上海三申醫(yī)療器械有限公司)。
本實(shí)驗(yàn)所用主要試劑包括:細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(美國(guó)Axygen),瓊脂糖(北京鼎國(guó)生物有限公司),50×TAE(天津莫克曼生物科技有限公司),PCRmix(南京諾維贊生物科技有限公司),瓊脂粉、酵母粉以及蛋白胨均購(gòu)于北京奧博星生物技術(shù)有限公司),磺胺甲惡唑、氨芐西林、四環(huán)素、諾氟沙星以及鏈霉素均購(gòu)于大連美侖生物技術(shù)有限公司。
本研究從華中地區(qū)選取了 11個(gè)供水水庫(kù)(圖1),其中4個(gè)水庫(kù)選自河南(HN1,HN2,HN3,HN4),3個(gè)水庫(kù)選自湖北(HB1,HB2,HB3),4個(gè)水庫(kù)選自湖南(HU1,HU2,HU3,HU4)。樣品于2019年10—11月進(jìn)行。采集樣品時(shí),每個(gè)水庫(kù)庫(kù)區(qū)分別設(shè)定一個(gè) 10000 m2的正方形區(qū)域,在該區(qū)域的4個(gè)頂點(diǎn)和中心位置各取1 L子水樣和20 g左右的表層沉積物。從每個(gè)子樣各取400 mL水和5 g沉積物樣品,分別于2.5 L采樣瓶中和無(wú)菌自封袋中混合均勻,在4 ℃條件下運(yùn)至實(shí)驗(yàn)室。
圖1 華中地區(qū)水庫(kù)采樣點(diǎn)示意圖Fig.1 Sampling sites of water supply reservoirs in central China
采用 10倍梯度稀釋法對(duì)水樣細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng)以及計(jì)數(shù)。將每個(gè)取樣點(diǎn)所取水樣用無(wú)菌PBS稀釋4個(gè)梯度,每個(gè)梯度設(shè)置3個(gè)平行。每個(gè)樣品分取50 μL于LB固體培養(yǎng)基上涂布,于37 ℃培養(yǎng)48 h,隨后取合適梯度對(duì)細(xì)菌進(jìn)行計(jì)數(shù)。
以5 mL無(wú)菌離心管為容器,在無(wú)菌條件下準(zhǔn)確稱(chēng)取0.2 g沉積物樣品。隨后向離心管加入2 mL無(wú)菌PBS溶液,充分混勻后吸取200 μL至新的5 mL無(wú)菌離心管中進(jìn)行10倍梯度稀釋。每個(gè)采樣點(diǎn)稀釋5個(gè)梯度,此后所有實(shí)驗(yàn)參數(shù)均與水樣10倍梯度法相同。
本研究選取的各類(lèi)抗生素的最終濃度及參考文獻(xiàn)如表1所示。
表1 抗生素濃度信息Table 1 Related information of antibiotic concentration in this study
水樣和沉積物樣品按照10倍梯度稀釋法(0.5 mL+4.5 mL)分別稀釋2個(gè)梯度和3個(gè)梯度,每個(gè)梯度分別設(shè)置3個(gè)平行,分別吸取50 μL樣品均勻涂布于抗性平板上。以未添加抗生素的平板為對(duì)照,平板倒置于37 ℃條件下培養(yǎng)48 h,隨后取合適梯度對(duì)細(xì)菌進(jìn)行計(jì)數(shù)(劉珊珊等,2018)。
從抗性平板上隨機(jī)挑選菌落形態(tài)有明顯差異的細(xì)菌進(jìn)行劃線培養(yǎng)(葉繁等,2019),將純化后的單菌落接種到LB液體培養(yǎng)基中,于37 ℃條件下培養(yǎng)48 h,將菌液用細(xì)菌DNA提取試劑盒提取細(xì)菌DNA。采用Nanodrop 2000核酸蛋白定量?jī)x測(cè)定提取DNA的質(zhì)量以及純度。以細(xì)菌基因組DNA為模板,采用25 μL體系對(duì)細(xì)菌的16S rDNA進(jìn)行擴(kuò)增。體系組成為:12.5 μL 2×Taq PCR MasterMix,上、下游引物各 1 μL,1 μL DNA 模板,9.5 μL 雙蒸水。正向引物序列27F為:5′-AGAGTTTGATCCT GGCTCAG-3′,反向引物1492R為:5′-ACGGTTACC TTGTTACGACTT-3′。PCR產(chǎn)物立即于低溫條件下送往北京六合華大基因科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行同源性比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果確定細(xì)菌種屬。
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用SPSS 20.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。利用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)進(jìn)行差異性分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。熱圖、相關(guān)性熱圖分別用R 3.6.1的 ggplot2及 ggcorrplot包繪制;mantel分析用 R 3.6.1的vegan包進(jìn)行。
華中地區(qū)水庫(kù)型水源地 ARB的分布特征如圖2所示。各省水庫(kù)上覆水和沉積物中ARB分布不存在顯著性差異(t檢驗(yàn),P>0.05),表明華中地區(qū)水庫(kù)型水源地上覆水中ARB分布不存在地域性差異。華中地區(qū)各省的養(yǎng)殖業(yè)均比較發(fā)達(dá)。2016年華中地區(qū)各省豬、牛和羊的總量占全國(guó)總量的比例均比較接近??股卦陴B(yǎng)殖業(yè)的使用是造成環(huán)境中細(xì)菌耐藥性的重要因素。因此,華中地區(qū)相近的養(yǎng)殖業(yè)規(guī)模導(dǎo)致了該地區(qū)水庫(kù)中ARB不存在地域性差異。
圖2 華中地區(qū)水庫(kù)型水源地抗生素抗性細(xì)菌的分布特征Fig.2 ARB distribution pattern in water supply reservoirs of central China
上覆水和沉積物中豐度最高的兩類(lèi) ARB均是磺胺類(lèi) ARB(上覆水中平均相對(duì)豐度為 8.9%,在所有耐藥菌中的占比為45%;沉積物中平均豐度為7.0%,占耐藥菌總量的 54%)和 β-內(nèi)酰胺類(lèi) ARB(上覆水中平均豐度為8.1%,在所有耐藥基因中的占比為38%;沉積物中平均豐度為3.2%,占耐藥菌總量的 27%),這可能與其對(duì)應(yīng)抗生素的使用及特性有關(guān)?;前奉?lèi)抗生素有較長(zhǎng)的使用歷史且仍是目前使用量最大的抗生素之一,每年有將近2000 t磺胺類(lèi)抗生素被釋放到生物圈(Qiu et al.,2006)。此外,其具有較好的水溶性且難以降解,因此可以在環(huán)境中持續(xù)積累并提供選擇性壓力(Zhang et al.,2020)。此外,以氨芐青霉素為代表的β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素近年來(lái)在醫(yī)療和畜牧業(yè)中被廣泛使用,Zhang et al.(2015)的研究結(jié)果表明,中國(guó)β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素使用量為 34100 t,占中國(guó)抗生素總使用量的21%。因此,磺胺類(lèi)和β內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素的大量使用可能是導(dǎo)致水庫(kù)上覆水中 ARB廣泛存在的重要因素。
喹諾酮類(lèi)ARB在本研究選取的5種抗生素中豐度最低,這可能和喹諾酮類(lèi)抗生素本身的性質(zhì)有關(guān)。排放到環(huán)境中的喹諾酮類(lèi)抗生素并不穩(wěn)定,光照、水和生物作用均能促進(jìn)其降解。此外,水體環(huán)境中喹諾酮類(lèi)抗生素能通過(guò)吸附作用蓄積于沉積物中(孟磊等,2015)。以往關(guān)于水庫(kù)環(huán)境中抗生素的研究表明,喹諾酮類(lèi)抗生素平均濃度低于四環(huán)素和大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)抗生素(廖杰等,2020)。因此,水庫(kù)中喹諾酮較低的含量可能是導(dǎo)致相應(yīng) ARB豐度較低的重要因素。與上覆水相比,沉積物四環(huán)素類(lèi)抗生素占比增高,這可能和沉積物對(duì)四環(huán)素有較強(qiáng)的吸附性能有關(guān)。土壤對(duì)四環(huán)素類(lèi)抗生素的吸附能力和吸附容量高于其他類(lèi)別的抗生素(伊麗麗等,2013),導(dǎo)致沉積物中ARB豐度相應(yīng)增加。
由圖2可知,本研究選取的ARB在大部分采樣點(diǎn)均能檢出,且當(dāng)ARB在水庫(kù)上覆水中檢出時(shí),其在沉積物中也往往能被檢出。該結(jié)果表明,上覆水與沉積物 ARB的賦存特征存在較強(qiáng)聯(lián)系。在此基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步采用了mantel分析評(píng)估了沉積物和上覆水中 ARB的豐度關(guān)系。結(jié)果表明,華中地區(qū)水庫(kù)型水源地沉積物和上覆水中 ARB豐度呈顯著性正相關(guān)(r=0.472,P=0.026,permutations=9999),表明水庫(kù)沉積物和上覆水ARB組成相似。沉積物是污染物的“匯”和“源”,包括ARB在內(nèi)的污染物通過(guò)吸附、沉降等作用匯集在沉積物上(姜春霞等,2019)。當(dāng)水體發(fā)生擾動(dòng)時(shí),吸附于沉積物中的污染物又重新釋放到上覆水中(張皓清等,2020)。相對(duì)于河海等環(huán)境介質(zhì),湖庫(kù)環(huán)境水體流動(dòng)相對(duì)緩慢,沉積物和水交換能力也相對(duì)較弱。但湖庫(kù)有增強(qiáng)水和沉積物之間物質(zhì)交換的途徑。本研究樣品采集工作于10月及11月進(jìn)行,晝夜溫差較大,因此易造成“翻湖”現(xiàn)象,該途徑能夠增強(qiáng)水和沉積物之間的物質(zhì)交換(陸桂華等,2009)。
本研究通過(guò) Spearman相關(guān)性分析探索了不同類(lèi)別ARB的共現(xiàn)關(guān)系,結(jié)果如圖3所示。結(jié)果表明,多數(shù)耐藥菌之間都具有一定的正相關(guān)關(guān)系。其中四環(huán)素類(lèi)ARB及氨基糖苷類(lèi)ARB均與三類(lèi)耐藥基因有顯著性正相關(guān)。有研究表明,中國(guó)往往采用數(shù)種抗生素聯(lián)用的方式治療疾?。≦iao et al.,2018)。因此,環(huán)境中不同種類(lèi)抗生素的共選擇作用是不同類(lèi)別ARB豐度具有相關(guān)性的因素之一。
圖3 不同類(lèi)別ARB的共現(xiàn)關(guān)系Fig.3 Co-occurrence patterns among different ARB types
本研究根據(jù)細(xì)菌形態(tài)的不同,選取了 26 個(gè)菌株進(jìn)行菌種鑒定,共鑒定出8種菌屬。其中氣單胞菌屬(Aeromonas,9株,34.6%)及不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter,7株,26.9%)檢出率最高。此外,腸桿菌屬(Enterobacter)、芽孢桿菌屬(bacillus)以及假單胞菌屬(Pseudomonas)均檢出2株;希瓦氏菌屬(Shewanella)、紡錘形賴(lài)氨酸芽孢桿菌(Lysinibacillus fusiformis)以及類(lèi)芽孢桿菌屬(Paenibacillus)均檢出1株。氣單胞菌屬、不動(dòng)桿菌屬以及芽孢桿菌屬均為人體條件致病菌,在人體免疫力下降時(shí)能夠引起人體胃腸道、肺部感染(葉繁等,2019)。本研究篩選的氣單胞菌屬及不動(dòng)桿菌屬均對(duì)3種以上抗生素有抗性,這兩種菌屬的多重抗性可能會(huì)對(duì)人體健康產(chǎn)生威脅。此外,本研究還篩選出了能夠與人體腸道密切相關(guān)的腸桿菌屬細(xì)菌,兩株細(xì)菌均分離自沉積物中,表明水庫(kù)沉積物一定程度上受到糞源污染。兩株細(xì)菌分別對(duì)磺胺類(lèi)抗生素及四環(huán)素類(lèi)抗生素表現(xiàn)出耐藥性,表明陸源輸入也可能是導(dǎo)致水庫(kù) ARB細(xì)菌廣泛分布的原因之一。
本研究同時(shí)對(duì)水樣和沉積物細(xì)菌總數(shù)(Total heterotrophic bacteria count,HPC)進(jìn)行了計(jì)數(shù)(表2)。結(jié)果表明華中地區(qū)供水水庫(kù) HPC低于山東省湖泊環(huán)境(錢(qián)巖等,2013)及華中地區(qū)非供水湖泊(孫增靈等,2011)中HPC數(shù)量。中國(guó)飲用水標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定 HPC 總量不得超過(guò) 1.00×102CFUs·mL?1。以往研究表明,飲用水處理工藝對(duì)細(xì)菌的去除效果極為明顯(Zhang et al.,2020)。因此,雖然華中地區(qū)供水水庫(kù)受陸源輸入細(xì)菌影響,但華中地區(qū)水庫(kù)型水源地較少的細(xì)菌數(shù)量能夠在一定程度上保證飲用水水質(zhì)。
表2 華中地區(qū)水庫(kù)上覆水和沉積物的總異養(yǎng)菌數(shù)Table 2 Total heterotrophic bacteria count of water supply reservoirs in central China
(1)磺胺類(lèi)和四環(huán)素類(lèi) ARB是華中地區(qū)水庫(kù)型水源地豐度最高的兩類(lèi)ARB。
(2)華中地區(qū)水庫(kù)型水源地沉積物和上覆水中的ARB含量沒(méi)有顯著性差異。
(3)華中地區(qū)水庫(kù)型水源地多數(shù)耐藥菌之間具有一定的共現(xiàn)關(guān)系。
(4)水庫(kù)型水源地的一些條件致病菌具有3種以上多重抗性,由此導(dǎo)致的潛在風(fēng)險(xiǎn)值得關(guān)注。
生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào)2021年5期