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        線(xiàn)粒體4977-bp缺失對(duì)鼻咽癌的影響

        2021-07-19 10:04:32袁妮娜樓響瑜冷建杭
        浙江醫(yī)學(xué) 2021年12期
        關(guān)鍵詞:拷貝數(shù)變性線(xiàn)粒體

        袁妮娜 樓響瑜 冷建杭

        鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是指發(fā)生于鼻咽腔頂部和側(cè)壁的惡性腫瘤,是我國(guó)高發(fā)惡性腫瘤之一,發(fā)病率為耳鼻咽喉惡性腫瘤之首。在中國(guó),NPC的高發(fā)區(qū)主要集中在廣東、廣西、湖南、福建和江西5省,其中以廣東省為高發(fā),發(fā)病率在25/100 000~30/100 000[1]。迄今為止,NPC的發(fā)病機(jī)制仍未完全闡明,有研究表明NPC可能由環(huán)境因素、遺傳因素以及EB病毒感染引起,遵循多基因-環(huán)境交互作用的模式[2-4]。然而,大部分遺傳因素方面的研究均集中于核基因,NPC和線(xiàn)粒體基因組的關(guān)系目前尚不清楚。線(xiàn)粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)是一種細(xì)胞核外唯一的遺傳物質(zhì),全長(zhǎng)為16,569-bp[5]。由于mtDNA缺乏組蛋白保護(hù),因此對(duì)輻射等氧化損傷較為敏感。此外,mtDNA損傷修復(fù)能力低,可造成核酸片段缺失,其中線(xiàn)粒體4977-bp缺失最為常見(jiàn)[6-7]。線(xiàn)粒體4977-bp缺失位于線(xiàn)粒體序列13-bp的正向重復(fù)序列(5'-ACCTCCCTCACC-3'),即 8470~8482 和 13447~13459 之間[8]。本研究旨在分析線(xiàn)粒體4977-bp缺失對(duì)NPC的影響,并對(duì)攜帶該缺失的患者進(jìn)行線(xiàn)粒體功能分析,探討NPC發(fā)病的可能分子機(jī)制。

        1 對(duì)象和方法

        1.1 對(duì)象 收集2019年1至12月在杭州市第一人民醫(yī)院耳鼻喉科手術(shù)的NPC患者66例,采集鼻咽纖維鏡活檢的腫瘤組織約50 mg,均經(jīng)病理確診。其中男44例,女22例;年齡22~61歲,中位年齡40歲。本研究經(jīng)本院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn),所有受試者均簽署知情同意書(shū)。

        1.2 全基因組DNA提取 采用改進(jìn)的酚、氯仿、異戊醇提取法提取腫瘤組織中的DNA。首先將腫瘤組織放在1.5 ml離心管中,分別用75%和50%的乙醇和純水梯度脫乙醇,將組織放入研缽中,加入DNA裂解液;隨后將研磨好的組織液加入離心管,并加入10 μl的蛋白酶K,加入等體積的酚后離心,分為3層,吸取上層液,加入飽和酚、氯仿和異戊醇(比例為25:24:1)混合液后搖勻繼續(xù)離心,吸取上清液后加入等體積的氯仿和異戊醇混合液400 μl,離心后加入2.5倍體積的100%乙醇,冷凍過(guò)夜后將樣品取出12 000 r/min離心,白色沉淀物即為DNA。將所得的DNA溶于雙蒸水,-20℃冰箱保存?zhèn)溆?,并用紫外分光密度儀檢測(cè)所提取的DNA濃度。

        1.3 線(xiàn)粒體4977-bp缺失檢測(cè) 采用巢式PCR檢測(cè)腫瘤組織中線(xiàn)粒體4977-bp缺失情況,利用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)兩對(duì)引物,引物序列見(jiàn)表1。其中外F和外R用于擴(kuò)增4977-bp缺失區(qū)域兩端較長(zhǎng)區(qū)域序列,內(nèi)F與內(nèi)R用于擴(kuò)增4977-bp缺失區(qū)域兩端較短區(qū)域序列。在PCR管中,加入Takara Taq酶0.1 μl,10×Buffer 2 μl,dNTP 2 μl,Mg2+1.5 μl,正反向引物各0.4 μl,模板 DNA 1.2 μl,加入去離子水至 25 μl。反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性5 min,95℃變性20 s,55℃退火20 s,72℃延伸40 s,共35個(gè)循環(huán),72℃延伸5 min。第1次使用外引物進(jìn)行擴(kuò)增,第2次使用內(nèi)引物,模板為第1次PCR的產(chǎn)物。反應(yīng)結(jié)束后取5 μl的PCR產(chǎn)物于加有溴化乙錠的1.5%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。

        表1 線(xiàn)粒體4977-bp缺失檢測(cè)的PCR引物序列

        1.4 攜帶線(xiàn)粒體4977-bp缺失患者線(xiàn)粒體功能分析

        1.4.1 mtDNA拷貝數(shù)分析 分別抽取2例攜帶線(xiàn)粒體4977-bp缺失患者(NPC-1和NPC-2)和2例性別、年齡相仿的健康體檢者外周靜脈血3 ml,提取基因組DNA。使用線(xiàn)粒體ND1基因來(lái)確定mtDNA的拷貝數(shù),選用β-actin作為看家基因。其中,擴(kuò)增線(xiàn)粒體ND1基因和β-actin的引物序列見(jiàn)表2。使用熒光定量PCR法檢測(cè)mtDNA的拷貝數(shù),95℃10 min預(yù)變性后,95℃變性15 s,60℃退火1 min(熒光檢測(cè))共40個(gè)循環(huán)進(jìn)行擴(kuò)增,隨后95℃變性15 s,60℃退火1 min,95℃變性15 s,60℃退火15 s進(jìn)行熔解曲線(xiàn)分析,使用2-ΔΔCt法計(jì)算出拷貝數(shù)[9]。

        表2 mtDNA拷貝數(shù)檢測(cè)所需的引物序列

        1.4.2 線(xiàn)粒體ATP水平分析 采用Ficoll密度梯度離心法[10]分離NPC-1和NPC-2患者和2例健康體檢者的外周血單核細(xì)胞。ATP定量分析使用CellTiter-Glo發(fā)光法細(xì)胞活力檢測(cè)試劑盒,方法如下:將CellTiter-Glo試劑直接加入攜帶4977-bp缺失患者和健康體檢者的單核細(xì)胞中,10 min后檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度,細(xì)胞裂解產(chǎn)生的發(fā)光信號(hào)與ATP含量成正比[11]。

        1.4.3 活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平分析由于ROS是線(xiàn)粒體產(chǎn)生的氧自由基,對(duì)細(xì)胞、組織和蛋白有一定的損傷作用,ROS的過(guò)量表達(dá)是線(xiàn)粒體功能損傷的指標(biāo)[12]。ROS的檢測(cè)基于一種熒光染料2',7'-二氯二氫熒光素二乙酸酯(2',7'-Dichlorodi-hydrofluorescein diacetate,DCFH-DA)的強(qiáng)度,DCFH-DA 本身沒(méi)有熒光,進(jìn)入細(xì)胞后,被細(xì)胞內(nèi)的酯酶水解成2',7'-二氯二氫熒光素(2',7'-Dichlorodi-hydrofluorescein,DCFH),和探針特異性結(jié)合,細(xì)胞內(nèi)的ROS可以氧化無(wú)熒光的DCFH變成有熒光的2',7'-二氯熒光素(2',7'-Dichlorofluorescein,DCF),熒光強(qiáng)度與ROS水平成正比,使用流式細(xì)胞儀計(jì)算熒光強(qiáng)度,計(jì)算ROS水平[13]。

        2 結(jié)果

        2.1 線(xiàn)粒體4977-bp缺失情況 巢式PCR法可以擴(kuò)增出358-bp的片段,而不含4977-bp缺失的個(gè)體,無(wú)法擴(kuò)增出358-bp的片段,見(jiàn)圖1。66例NPC患者中有2例攜帶線(xiàn)粒體4977-bp缺失(NPC-1和NPC-2),檢出率為3.03%。

        圖1 線(xiàn)粒體4977-bp缺失的巢式PCR電泳圖[孔道1為空白對(duì)照,孔道2和3表示攜帶線(xiàn)粒體4977-bp缺失的樣本(NPC-1和NPC-2)]

        2.2 mtDNA拷貝數(shù)分析 mtDNA拷貝數(shù)分析發(fā)現(xiàn),NPC-1和NPC-2的mtDNA拷貝數(shù)分別為161.5和167.0,遠(yuǎn)高于健康體檢者的70.6。

        2.3 線(xiàn)粒體ATP水平分析 ATP水平檢測(cè)發(fā)現(xiàn),NPC-1和NPC-2的ATP含量分別為57.0和63.0,明顯低于健康體檢者的140.66。

        2.4 ROS定量分析 ROS定量分析發(fā)現(xiàn),NPC-1和NPC-2患者的ROS水平分別為99.0、107.5 U/ml,明顯高于健康體檢者的45.6 U/ml。

        3 討論

        早在1956年,生物學(xué)家Warburg[14]在癌細(xì)胞中首次發(fā)現(xiàn)了一種稱(chēng)為“有氧糖酵解”現(xiàn)象,就是大多數(shù)癌細(xì)胞即使在有充分氧供應(yīng)的條件下仍主要通過(guò)糖酵解途徑而不是氧化磷酸化途徑來(lái)獲得ATP用于維持自身代謝及分裂增殖,同時(shí)產(chǎn)生大量乳酸代謝產(chǎn)物,該效應(yīng)也稱(chēng)為Warburg現(xiàn)象,為癌細(xì)胞線(xiàn)粒體功能障礙的研究奠定了基礎(chǔ)。

        由于線(xiàn)粒體基因組缺乏保護(hù)性組蛋白,修復(fù)能力非常有限,本身又是產(chǎn)生ROS的主要場(chǎng)所,因此mtDNA的突變率遠(yuǎn)高于核DNA[15]。有研究發(fā)現(xiàn),mtDNA的4977-bp缺失是一種較為常見(jiàn)的突變,在癌癥中尤為常見(jiàn)[16-17]。Guo等[18]對(duì)105例肝癌患者進(jìn)行了線(xiàn)粒體4977-bp缺失的篩查,發(fā)現(xiàn)有10個(gè)患者攜帶該大片段的缺失。Tan等[19]應(yīng)用PCR技術(shù)分析乳腺癌腫瘤組織中常見(jiàn)的4977-bp缺失,19例腫瘤標(biāo)本均未檢測(cè)到該缺失。沈慧等[20]對(duì)52例新鮮胃癌標(biāo)本的研究表明4977-bp缺失陽(yáng)性率為73.1%。從分子結(jié)構(gòu)上看,線(xiàn)粒體4977-bp的缺失位于核苷酸位點(diǎn)的8470~13446之間的區(qū)域,缺失區(qū)編碼 5 個(gè)線(xiàn)粒體 tRNA、A8、A6、CO3、ND3、ND4L、ND4和ND5。因此,4977-bp的大片段缺失會(huì)影響線(xiàn)粒體的結(jié)構(gòu)和功能,引起線(xiàn)粒體功能損傷,但是具體的分子機(jī)制尚不清楚。

        本研究中,筆者首先利用巢式PCR法對(duì)NPC患者進(jìn)行了線(xiàn)粒體4977-bp缺失的檢測(cè),共發(fā)現(xiàn)2例NPC患者攜帶這個(gè)大片段的缺失,檢出率為3.03%;并對(duì)2例攜帶線(xiàn)粒體4977-bp缺失的NPC患者和2例健康體檢者進(jìn)行了線(xiàn)粒體功能研究,包括mtDNA拷貝數(shù)、ATP和ROS水平。本研究發(fā)現(xiàn),攜帶4977-bp缺失NPC患者的mtDNA拷貝數(shù)和ROS明顯高于健康體檢者,而ATP水平明顯低于健康體檢者。筆者認(rèn)為mtDNA對(duì)很多致癌因素敏感,是ROS攻擊的主要目標(biāo),當(dāng)細(xì)胞受到外源性物質(zhì)的攻擊時(shí),使得線(xiàn)粒體總呼吸的代償,導(dǎo)致mtDNA的拷貝數(shù)增高。在癌細(xì)胞缺氧的情況下,線(xiàn)粒體氧化磷酸化功能受到抑制,ROS水平急劇上升,但是超氧化物歧化酶由于酶的活性改變,清除能力下降,引起線(xiàn)粒體大片段的缺失[21]。此外,由于線(xiàn)粒體功能損傷,呼吸鏈合成受阻,導(dǎo)致ATP水平下降,進(jìn)而參與了NPC的發(fā)病進(jìn)程。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)線(xiàn)粒體4977-bp缺失和NPC有關(guān),很有可能是通過(guò)影響線(xiàn)粒體氧化磷酸化功能而參與了NPC的發(fā)病進(jìn)程,本研究為NPC的發(fā)病機(jī)制提供了新思路。本研究不足之處是標(biāo)本量較少,需要繼續(xù)擴(kuò)大樣本量來(lái)開(kāi)展后續(xù)的工作。

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