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        8-溴-6-甲基-2-(1-吡咯烷基羰基)咪唑并[1,2-a]吡啶 的合成及晶體結(jié)構(gòu)

        2021-07-05 02:48:30毛順?biāo)?/span>駱榮雙劉春江柴慧芳趙春深
        廣州化學(xué) 2021年3期

        毛順?biāo)?,?婷,駱榮雙,劉春江,柴慧芳*,趙春深*

        (1. 貴州大學(xué) 藥學(xué)院,貴州 貴陽(yáng) 550025;2. 貴州省合成藥物工程實(shí)驗(yàn)室,貴州 貴陽(yáng) 550025; 3.貴州中醫(yī)藥大學(xué) 藥學(xué)院,貴州 貴陽(yáng) 550025)

        咪唑并[1,2-a]吡啶類化合物是一類重要的含氮稠雜環(huán)化合物[1],因其特殊的生物活性并與吲哚、氮雜吲哚等結(jié)構(gòu)上的類似性,已成為當(dāng)前藥物及材料研究的熱點(diǎn)[2]。含咪唑并[1,2-a]吡啶結(jié)構(gòu)的藥物在抗病毒、抗炎、鎮(zhèn)靜催眠、抗?jié)円约捌渌矫娑季哂辛己玫淖饔肹3-4]。如特異性磷酸二酯酶Ⅲ抑制劑Olprinone[5],抗焦慮及安眠藥物Alpidem[6]、Saripidem[7],抗?jié)僑oraprazan[8]、Zolimidine[9],治療骨質(zhì)疏松Minodronic acid[10]以及治療艾滋病毒(HIV)感染的光學(xué)活性藥物GSK812397[11]等。咪唑并[1,2-a]吡啶類化合物還顯示出激發(fā)態(tài)的分子內(nèi)質(zhì)子轉(zhuǎn)移性質(zhì),這使其易于用于熒光傳感器、激光染料和分子開關(guān)[12]。

        本文設(shè)計(jì)了一條目標(biāo)化合物的合成路線,見圖1,以2-氨基-5-甲基吡啶為起始原料經(jīng)溴代反應(yīng)得到2-氨基-3-溴-5-甲基吡啶(1),化合物1經(jīng)環(huán)合反應(yīng)得到8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸乙酯(2),化合物2經(jīng)水解反應(yīng)得到8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸(3),化合物3經(jīng)酰胺化反應(yīng)得到標(biāo)題化合物8-溴-6-甲基-2-(1-吡咯烷基羰基)咪唑并[1,2-a]吡啶(4),總收率為32.82%,其結(jié)構(gòu)經(jīng)1H-NMR、MS和X-射線單晶衍射確證。

        圖1 目標(biāo)化合物的合成路線

        1 實(shí)驗(yàn)

        1.1 試劑和儀器

        試劑:N,N-二甲基甲酰胺,分析純,上?;瘜W(xué)試劑總廠;甲基叔丁基醚,分析純,貴陽(yáng)益大化學(xué)試劑公司;氫氧化鈉,分析純,上海博景化工有限公司;碳酸鉀,分析純,廊坊鵬彩精細(xì)化工有限公司;四氫吡咯,分析純,貴陽(yáng)天利和化工有限公司;濃鹽酸,分析純,勞爾吉實(shí)業(yè)有限公司;石油醚,貴陽(yáng)天利和化工有限公司;乙酸乙酯,貴陽(yáng)天利和化工有限公司;3-溴丙酮酸乙酯,分析純,上海相輝醫(yī)藥科技有限公司;三乙胺,分析純,貴陽(yáng)益大化學(xué)試劑公司;PyBOP,分析純,上海麥克林生化科技有限公司;無(wú)水乙醇,分析純,貴陽(yáng)益大化學(xué)試劑公司。

        儀器:DF-101S型集熱式恒溫加熱磁力攪拌器;DB30型電子天平(上海臺(tái)衡儀器儀表有限公司);Bruker Advance DMX 400 MHz型核磁共振儀(TMS為內(nèi)標(biāo));N1200型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(東京理化器械株式會(huì)社);1100 LC/MS型質(zhì)譜儀(美國(guó)Agilent公司);Bruker APEX-II CCD 型 X-射線衍射儀。

        1.2 標(biāo)題化合物合成

        1.2.1 2-氨基-3-溴-5-甲基吡啶(1)的合成

        在500 mL單口瓶中,將2-氨基-5-甲基吡啶20 g(184.9 mmol)溶于150 mL DMF,冰浴下加入NBS 32.92 g(185.0 mmol),0℃攪拌反應(yīng)3 h,反應(yīng)完畢。將反應(yīng)混合物倒入150 mL冰水中,用甲基叔丁基醚(100 mL×4)萃取,合并有機(jī)相,用無(wú)水硫酸鈉干燥,濃縮后得到棕黃色固體30.98 g,收率89.56%;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ 8.15(d,J=1.1 Hz,1H),7.61(d,J=1.1 Hz,1H),6.42(s,2H),2.22(s,3H)。

        1.2.2 8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸乙酯(2)的合成

        在100 mL單口瓶中,將2-氨基-3-溴-5-甲基吡啶7 g(37.42 mmol)溶于50 mL無(wú)水乙醇中,加入3-溴丙酮酸乙酯9.12 g(47.77 mmol),82℃攪拌反應(yīng)4 h,反應(yīng)完畢,冷卻,將反應(yīng)液減壓濃縮后得到棕紅色固體,用少量丙酮打漿得到淺黃色固體6.62 g,收率66.74%;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ 8.46(d,J=1.5 Hz,1H),7.98(d,J=1.5 Hz,1H),7.72(s,1H),4.19(q,J=8.0 Hz,2H),2.50(s,3H),1.31 (t,J=8.1 Hz,3H);ESI-MS,m/z:281.3 [M+H]+。

        1.2.3 8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸(3)的合成

        在100 mL單口瓶中,將8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸乙酯10 g(37.16 mmol)溶于50 mL無(wú)水乙醇中,向反應(yīng)液中加入1 mol/L的NaOH溶液15 mL,使反應(yīng)液pH≈11,并將反應(yīng)移至82℃下攪拌反應(yīng)3 h,反應(yīng)完畢,冷卻,將反應(yīng)液減壓濃縮除去溶劑,用1 mol/L的稀鹽酸5 mL調(diào)節(jié)pH≈3,析出固體,過(guò)濾,濾餅干燥得淺黃色固體7.03 g,收率74.23%;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ 8.56(s,1H),8.44 (s,1H),7.68(s,1H),2.31(s,3H);ESI-MS,m/z:253.7[M+H]+。 1.2.4 8-溴-6-甲基-2-(1-吡咯烷基羰基)咪唑并[1,2-a]吡啶(4)的合成

        在100 mL單口瓶中,將8-溴-6-甲基咪唑并[1,2-a]吡啶-2-羧酸7 g(27.44 mmol),在室溫下加入50 mL DMF,使其充分溶解后,依次加入四氫吡咯4.30 g(60.46 mmol),三乙胺5.56 g(54.95 mmol)和PyBOP 17.14 g(32.94 mmol)。反應(yīng)液室溫?cái)嚢? h。反應(yīng)完畢,析出固體,過(guò)濾,濾餅干燥得到白色固體6.25 g,產(chǎn)率73.97%;1H-NMR(400 MHz,DMSO-d6)δ 8.42(s,1H),8.41(s,1H),7.61(s,1H),4.04(t,J=6.6 Hz,2H),3.53(t,J=6.8 Hz,2H),2.31(s,3H),1.97~1.92(m,2H),1.88~1.82(m,2H);ESI-MS,m/z:306.9[M+H]+。

        1.3 單晶培養(yǎng)

        稱取干燥的化合物(4)0.5 g,加入適量丙酮,充分溶解,濾除不溶物,置于干凈試管中,自然揮發(fā)三天得無(wú)色透明的塊狀晶體a。

        1.4 晶體結(jié)構(gòu)測(cè)定

        將單晶a(0.15 mm×0.08 mm×0.05 mm)置于衍射儀上,用經(jīng)石墨單色化的Mo-Kα射線(λ=0.710 73 ?),于150.0 K以ω/2θ掃描方式收集,掃描范圍為4.738o≤2θ≤52.886o,-7≤h≤7,-10≤k≤10,-14≤l≤14,共收集衍射點(diǎn)7095個(gè),其中獨(dú)立衍射點(diǎn)2512個(gè)(Rint=0.030 1)。使用Olex2[13]和本征相的ShelXT[14]結(jié)構(gòu)解決方案程序?qū)Y(jié)構(gòu)進(jìn)行求解,并使用ShelXL改進(jìn)包對(duì)其進(jìn)行精修。a的CCDC號(hào)為2039002。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 標(biāo)題化合物的合成

        如圖1,化合物3與四氫吡咯酰胺化得到標(biāo)題化合物8-溴-6-甲基-2-(1-吡咯烷基羰基)咪唑并[1,2-a]吡啶(4),目前該化合物的合成尚未有文獻(xiàn)報(bào)道,為提高產(chǎn)率,分別對(duì)縮合劑和縛酸劑的投料比進(jìn)行單因素考察。

        2.2.1 縮合劑PyBOP的摩爾量對(duì)化合物4產(chǎn)率的影響

        保持反應(yīng)溫度、反應(yīng)時(shí)間、反應(yīng)溶劑和縛酸劑投料比不變,對(duì)縮合劑PyBOP投料量進(jìn)行單一變量考察對(duì)反應(yīng)收率的影響。結(jié)果如表1。

        表1 縮合劑PyBOP摩爾比對(duì)化合物4產(chǎn)率的影響

        由表可見,隨著化合物3與縮合劑PyBOP的配比增加時(shí),產(chǎn)品收率逐漸增加,當(dāng)化合物3與縮合劑PyBOP的配比增加到1.0∶1.2時(shí),產(chǎn)品收率達(dá)到最高接近73.97%,繼續(xù)增加投料量,產(chǎn)率變化不大,從節(jié)約成本的情況考慮,選擇化合物3與縮合劑PyBOP的摩爾比為1.0∶1.2時(shí)反應(yīng)效果最好,為最佳的工藝條件。

        2.1.2 縛酸劑的摩爾量對(duì)化合物4產(chǎn)率的影響

        保持反應(yīng)溫度、反應(yīng)時(shí)間、反應(yīng)溶劑和縮合劑投料比不變,對(duì)縛酸劑三乙胺投料量進(jìn)行單一變量考察對(duì)化合物4產(chǎn)率的影響,結(jié)果如表2。

        表2 縛酸劑三乙胺的摩爾比對(duì)化合物4產(chǎn)率的影響

        由表可見,隨著化合物3與縛酸劑三乙胺的配比增加,產(chǎn)品收率逐漸增高,當(dāng)化合物3與縛酸劑三乙胺的配比增加到1.0∶2.0時(shí),產(chǎn)品收率達(dá)到最高接近73.8%,繼續(xù)增加投料量,產(chǎn)率變化不大,從節(jié)約成本的情況考慮,選擇化合物3與縛酸劑三乙胺的配比達(dá)1.0∶2.0時(shí)反應(yīng)結(jié)果最好,確定其為最佳工藝。

        2.2 晶體結(jié)構(gòu)

        a的晶體結(jié)構(gòu)見圖2,a的晶體學(xué)數(shù)據(jù)見表3,a的部分鍵長(zhǎng)和鍵角數(shù)據(jù)見表4,a的晶體分?jǐn)?shù)原子坐標(biāo)和各向同性或等效的各向同性位移參數(shù)見表5。a通過(guò)光譜法和X-射線衍射闡明了標(biāo)題化合物的結(jié)構(gòu)。該結(jié)構(gòu)由一個(gè)甲基、一個(gè)溴原子和咪唑并[1,2-a]吡啶經(jīng)一個(gè)羰基連接到四氫吡咯環(huán)組成。晶體結(jié)構(gòu)中所有鍵的長(zhǎng)度和角度均在正常范圍內(nèi),且晶體結(jié)構(gòu)表明分子間的堆積通過(guò)范德華力得以穩(wěn)定。

        表 4 a的主要鍵長(zhǎng)和鍵角

        表5 分?jǐn)?shù)原子坐標(biāo)和各向同性位移參數(shù)

        圖2 a的分子結(jié)構(gòu)

        表3 a的晶體學(xué)參數(shù)

        (續(xù)表5)

        3 結(jié)論

        本研究以2-氨基-5-甲基吡啶為原料,經(jīng)溴代、環(huán)合、水解及酰胺化反應(yīng)合成了目標(biāo)化合物,通過(guò)光譜法和X射線衍射闡明了標(biāo)題化合物的結(jié)構(gòu)并研究了其晶體結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明,a 屬三斜晶系,空間群P-1,晶胞參數(shù)a=6.344 7(2) ?,b=8.625 1(3) ?,c=11.455 3(4) ?,β=88.230 0(10)o,V=624.47(4) ?3,Z=2,Rgt(F)=0.026 1,ωRref(F2)=0.063 7,F(000)=314,μ=3.283 mm-1。晶體結(jié)構(gòu)中所有鍵的長(zhǎng)度和角度均在正常范圍內(nèi),其晶體結(jié)構(gòu)表明分子間的堆積通過(guò)范德華力得以穩(wěn)定。此化合物目前并無(wú)文獻(xiàn)報(bào)道,且合成該化合物的路線具有反應(yīng)條件溫和、后處理簡(jiǎn)便及收率較高等優(yōu)點(diǎn),適合工業(yè)化生產(chǎn)。

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