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        人參活性成分Rg3通過CASP8誘導(dǎo)膽管癌細(xì)胞凋亡作用研究
        ——基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選及實驗驗證

        2021-06-25 03:43:10吳可人
        浙江中醫(yī)雜志 2021年6期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫

        宋 爽 張 敏 吳可人

        浙江中醫(yī)藥大學(xué)附屬第一醫(yī)院 浙江 杭州 310006

        膽管癌(cholangiocarcinoma)是一種起源于膽管上皮細(xì)胞且具有較高惡性程度的腫瘤[1]。手術(shù)是唯一能夠治愈膽管癌的手段,但早期發(fā)現(xiàn)困難,只有約35%的患者能夠早期發(fā)現(xiàn)并接受根治性手術(shù),而晚期無法行手術(shù)治療的患者,中位生存期僅為3~6個月[2]?;诨煂δ懝馨┗颊叩闹卮笠饬x,逆轉(zhuǎn)MDR是對抗膽管癌的重要任務(wù)和提高患者生活質(zhì)量的有效方式。人參(Panax ginsengC.A.Meyer)是五加科植物人參Panax ginseng C.A.Meyer的干燥根和根莖,屬多年生草本植物,具有大補元氣、補脾益肺、生津養(yǎng)血、安神益智的功效?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn),人參具有抗增殖、抗血管生成、抗炎、抗氧化和抗腫瘤等特性[3]。人參對肝癌[4]、結(jié)腸癌[5]、皮膚癌[6]等多種腫瘤有明確作用。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究人參活性成分Rg3通過CASP8誘導(dǎo)膽囊癌細(xì)胞凋亡作用。

        1 材料與方法

        1.1 收集疾病、藥物靶基因:在GeneCards和Online Mendelian Inheritance in Man在線數(shù)據(jù)庫輸入“cholangiocarcinoma”,檢索并收集膽管癌相關(guān)體內(nèi)基因。本研究中涉及的生物物種均設(shè)計為“homo sapiens(human)”。借助中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSPp)挖掘“人參”的活性成分及靶標(biāo),后經(jīng)UniProt查詢對應(yīng)靶標(biāo)的基因名。

        1.2 蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:在Venn在線工具中分別輸入人參和膽管癌靶基因,可直接獲取Venn圖及兩者交集基因。將交集基因?qū)隨TRING在線數(shù)據(jù)庫,隱藏?zé)o連接的節(jié)點,即可得到PPI網(wǎng)絡(luò)。

        1.3 基因表達(dá)驗證和生存分析:借助Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行交集基因表達(dá)驗證和生存分析。

        1.4 通過CCK-8實驗考察對Hucct-1細(xì)胞增殖作用:細(xì)胞培養(yǎng):Hucct-1細(xì)胞(廣州賽庫生物有限公司)用含10%胎牛血清(美國Gibico公司)及1%P/N雙抗(美國Gibico公司)的RPMI-1640培養(yǎng)基(美國HyClone公司)于 37℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),取對數(shù)生長期細(xì)胞用于實驗。以5×104/孔接種于96孔板。于37℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12h后,分別加25、50、100μg/ml的Rg3(終濃度),設(shè)置空白對照組。分別作用24、48h后更換培養(yǎng)基,每孔加入10μl CCK-8(日本同仁化學(xué)研究所)溶液,孵箱繼續(xù)培養(yǎng)1后測量450nm處的吸光度(OD)值。

        1.5 Rg3誘導(dǎo)CASP8,Bax表達(dá),抑制Bcl-2表達(dá):細(xì)胞接種方法同上接種于6孔板每組3個復(fù)孔,Rg3干預(yù)細(xì)胞24h后,用細(xì)胞裂解液提取總蛋白,BCA法測蛋白濃度。常規(guī)方法進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,脫脂牛奶封閉抗后敷育一抗、二抗(中國親科生物有限公司),ECL法拍攝化學(xué)發(fā)光。檢測灰度值。

        1.6 統(tǒng)計學(xué)方法:應(yīng)用 SPSS 23.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。所獲數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示。組間比較采用單因素方差分析,進(jìn)一步比較行LSD檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 疾病-藥物靶基因預(yù)測:本文借助兩個數(shù)據(jù)庫以盡量全面獲取膽管癌相關(guān)體內(nèi)基因,共1733個。TCMSP數(shù)據(jù)庫包含了499味草藥(中國藥典2010版)以及每位草藥的化合物成分(共計29000余個),本研究設(shè)置OB≥30%且DL≥0.18,共獲得人參活性物質(zhì)14個。

        2.2 人參治療膽管癌的可能靶點:經(jīng)Venn工具共獲得人參-膽管癌交集基因24個,此即為人參治療膽管癌的可能靶點,詳見表1和圖1。

        表1 人參活性成分調(diào)控體內(nèi)基因與膽管癌靶基因交集基因名稱

        圖1 膽管癌和人參交集基因

        2.3 獲取PPI網(wǎng)絡(luò):PPI網(wǎng)絡(luò)如圖2,圖中節(jié)點代表基因,連線代表相互作用,不同顏色的線條代表不同的相互作用類型。

        2.4 表達(dá)驗證和生存分析:利用GEPIA-Boxplots對20個STRING篩選出的核心基因進(jìn)行表達(dá)驗證發(fā)現(xiàn),與正常組織相比,在膽管癌樣品中有8個基因(ALOX5、BCL2、CASP8、GSTP1、ICAM1、PLAU、PRKCA、PTGS1)高表達(dá),3個基因(CYP1A1、NR1I3、PON1)低表達(dá),詳見圖3。GEPIASurvival Analysis對表達(dá)有差異的11個基因的總體生存率(overall survival,OS)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),ALOX5和CASP8的OS顯著改變(P<0.05),其余基因則沒有顯著性差異,結(jié)果見圖4。

        圖3 膽管癌組織和正常組織中表達(dá)具有顯著性變化的核心基因

        圖4 存活率顯著改變基因的預(yù)后信息

        2.5 Rg3對Hucct-1細(xì)胞增殖抑制作用:采用CCK-8實驗考察給予Rg3作用24,48h對Hucct-1細(xì)胞增殖活性的影響。結(jié)果顯示,25,50,100μg/ml的Rg3對Hucct-1細(xì)胞增殖具有明顯作用,作用24h(P<0.05)以及作用48h(P<0.05)均有顯著性差異(圖5)。由結(jié)果可知Rg3 50,100μg/ml劑量組作用24h具有良好的劑量依賴性,因此后續(xù)實驗以此為干預(yù)條件。

        圖5 不同濃度Rg3對膽管癌Hucct-1細(xì)胞增殖的影響

        2.6 Rg3誘導(dǎo)CASP8、Bax表達(dá),抑制Bcl-2表達(dá):Rg3 50,100μg/ml作用Hucct-1細(xì)胞24h后,采用Western blot實驗檢測凋亡標(biāo)簽蛋白的變化。結(jié)果顯示,與對照組相比,Rg3組CASP8(P<0.01),Bax(P<0.05)表達(dá)上調(diào),Bcl-2表達(dá)下調(diào)(P<0.05)。見圖6。

        3 討論

        本研究通過TCMSP共獲得人參活性成分14個,通過GeneCards和OMIM獲得膽管癌基因1733個,人參和膽管癌交集基因24個,STRING篩選出核心基因20個,表達(dá)驗證證實,其中11個在膽管癌組織中的表達(dá)與正常組織相比發(fā)生了顯著變化,而11個基因中,ALOX5和CASP8的OS顯著改變。

        花生四烯酸5-脂氧合酶(ALOX5)編碼的人體5-脂氧合酶(5-LOX),相當(dāng)文獻(xiàn)表明5-LOX產(chǎn)物具有致癌潛力[7],并認(rèn)為5-LOX能為膽管癌治療提供新的方法。凋亡相關(guān)的半胱氨酸蛋白酶(caspases)對免疫細(xì)胞的存亡至關(guān)重要[8],其中,CASP8與多種腫瘤發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。唐泓波等[9]研究發(fā)現(xiàn),人參皂苷Rg3可以降低小鼠乳腺癌發(fā)生率、促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡、提高小鼠CASP8表達(dá)量。雖然目前還沒有人參作用于ALOX5/5-LOX、CASP8治療膽管癌的直接證據(jù),但網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究結(jié)果提示,人參的活性成分kaempferol和beta-sitosterol可以分別作用于ALOX5和CASP8,發(fā)揮治療膽管癌的作用。

        通過實驗對篩選的CASP8進(jìn)行驗證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Rg3可通過上調(diào)CASP8誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,有效抑制Hucct-1增殖,進(jìn)一步驗證CASP8可能是Rg3誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,抑制膽管癌細(xì)胞增殖的靶點。

        膽管癌病因病機(jī)未明、治療過程中副作用多見且患者預(yù)后不佳,研發(fā)新的治療靶點和藥物刻不容緩。中藥具有多靶點、多途徑的作用特點,針對臨床復(fù)雜疾病的治療有其優(yōu)勢,已然成為抗腫瘤藥物研發(fā)的熱點。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、生物信息學(xué)等為中藥在研發(fā)、疾病治療方面提出了新方法。該方法基于整體,在各數(shù)據(jù)庫中收集藥物和疾病的信息,結(jié)合當(dāng)前計算機(jī)技術(shù),將成分多樣的藥物和因素復(fù)雜的疾病形成網(wǎng)絡(luò)以分析,為系統(tǒng)篩選人參中具有治療膽管癌成分及其可能的作用機(jī)制提供了思路,為后續(xù)研究奠定理論基礎(chǔ)。

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