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        基于系統(tǒng)藥理學(xué)菊花清熱解毒功效的分子機(jī)制研究

        2021-06-25 08:17:08王春花曲雪嘉孔令鈺孫雪芳
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年10期
        關(guān)鍵詞:抗炎菊花靶點(diǎn)

        王春花,曲雪嘉,孔令鈺,孫雪芳

        (牡丹江師范學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,黑龍江 牡丹江 157000)

        菊花為菊科植物菊(Chrysanthemum morifoliumRa-mat.)的干燥頭狀花序,屬于藥食同源類中藥,其藥用最早記載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,屬上品,歸肺、肝經(jīng),久服輕身耐老延年,具有清熱解毒、平肝明目等功效,在臨床上常被用于治療風(fēng)熱感冒、目赤腫痛、瘡癰腫毒等癥[1,2]。在日常生活中,老百姓也常茶飲菊花或配伍其他中藥達(dá)到清熱解毒、防治疾病的作用?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明,菊花具有抗炎、抑菌、調(diào)節(jié)免疫、鎮(zhèn)痛等作用,其清熱解毒功效與菊花抗炎藥理活性有一定的相關(guān)性[3]。目前,有關(guān)菊花的研究多集中在單一化學(xué)成分及其藥理作用的解析,中醫(yī)理論指導(dǎo)下的清熱解毒功效的物質(zhì)基礎(chǔ)及分子作用機(jī)制方面的研究相對(duì)匱乏[3-5]。系統(tǒng)藥理學(xué)是從多成分-多靶點(diǎn)相互聯(lián)系的角度在整體水平上研究中藥作用機(jī)制的一種新手段,通過識(shí)別藥效物質(zhì)、藥物靶點(diǎn)揭示疾病治療機(jī)制,從系統(tǒng)水平及整體水平研究和解決中藥藥效學(xué)和中醫(yī)藥基礎(chǔ)理論等關(guān)鍵問題,其研究方法符合中藥治療疾病的核心思想。近年來,在探索和預(yù)測中醫(yī)藥治療不同疾病的分子機(jī)制方面做出了顯著貢獻(xiàn)[6-8]。本研究采用系統(tǒng)藥理學(xué)方法,探討了菊花清熱解毒功效的分子機(jī)制,為菊花清熱解毒功效的研究與應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)與科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 菊花活性化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

        借助中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(tái)TCMSP(http://tcmspw.com/index.php)檢索并篩選菊花中符合口服利用度利用TCMSP、Drugbank數(shù)據(jù)庫(https://www.drugbank.ca)搜索化學(xué)成分的靶標(biāo)蛋白質(zhì),合并作為化學(xué)成分的靶點(diǎn)。將化合物-靶點(diǎn)通過Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建菊花化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),分析化合物和靶點(diǎn)間的度(Degree)值,確定菊花關(guān)鍵靶點(diǎn)。

        1.2 菊花靶點(diǎn)GO富集及關(guān)鍵靶點(diǎn)KEGG通路富集分析

        將菊花靶點(diǎn)蛋白質(zhì)基因上傳在線數(shù)據(jù)庫DAVID(https://david.ncifcrf.gov),物種限定為“Homospaiens”,設(shè)定閾值P<0.05,進(jìn)行GO(Gene ontology)生物學(xué)過程富集分析。對(duì)菊花靶點(diǎn)蛋白質(zhì)進(jìn)行KEGG(KEGG pathway analysis)代謝通路富集分析,并通過Cyto?scape 3.7.1軟件構(gòu)建靶點(diǎn)-信號(hào)通路網(wǎng)絡(luò),分析菊花清熱解毒功效的分子機(jī)制。

        1.3 菊花靶點(diǎn)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建

        將菊花相關(guān)靶點(diǎn)帶入在線網(wǎng)站STRING 11.0(https://string-db.org),物種選擇為“Homo spaiens”,打分值設(shè)置>0.9,獲取菊花化合物靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)信息,刪去無關(guān)聯(lián)蛋白質(zhì),通過Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建菊花靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò),分析菊花清熱解毒功效靶點(diǎn)相互作用關(guān)系。

        1.4 菊花靶點(diǎn)器官定位

        通 過BIOGPS數(shù)據(jù)庫(http://biogps.org/#goto=welcome)對(duì)核心靶點(diǎn)進(jìn)行器官定位分析,統(tǒng)計(jì)并整理各靶點(diǎn)組織分布信息,通過Cytoscape 3.7.1軟件繪制菊花核心靶點(diǎn)-組織網(wǎng)絡(luò)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菊花化合物-靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò)

        利用TCMSP平臺(tái)篩選并去除無靶點(diǎn)化合物后共獲得21種符合條件的活性成分。如圖1所示,化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)共包括276個(gè)節(jié)點(diǎn)(21種化合物、255個(gè)靶點(diǎn))和561條邊,菊花化合物由紅色節(jié)點(diǎn)代表,節(jié)點(diǎn)大小與Degree值相關(guān),藍(lán)色節(jié)點(diǎn)代表靶點(diǎn),內(nèi)圈藍(lán)色節(jié)點(diǎn)為連接化合物大于10個(gè)的靶點(diǎn),該網(wǎng)絡(luò)說明菊花清熱解毒功效可能是多成分、多靶點(diǎn)作用的結(jié)果。在菊花化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)中,每個(gè)化合物有平均靶點(diǎn)數(shù)目26.7個(gè),每個(gè)靶點(diǎn)平均與12.1個(gè)化合物相互作用,Degree值排名前5的成分是槲皮素(Quercetin)、山奈酚(Kaempferol)、木犀草素(Luteo?lin)、柚皮素(Naringenin)、β-谷甾醇(Beta-sitoster?ol),靶點(diǎn)≥10的化合物為菊花關(guān)鍵成分(表1)。從靶點(diǎn)的角度來看,連接化合物≥10個(gè)的靶點(diǎn)有6個(gè),分別為前列腺素G/H合酶2(Prostaglandin G/H syn?thase 2)、核受體輔活化子2(Nuclear receptor coacti?vator 2)、前列腺素G/H合酶1(Prostaglandin G/H syn?thase 1)、熱 休 克 蛋 白90(Heat shock protein HSP 90)、二肽基肽酶IV(Dipeptidyl peptidase IV)、cAMP依賴性蛋白激酶催化亞單位α(PKA Catalytic Sub?unit C-alpha),連接化合物≥10個(gè)的靶點(diǎn)為菊花關(guān)鍵靶點(diǎn)(表2)?;衔?關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)如圖2所示,菊花關(guān)鍵靶點(diǎn)主要與壞死(Necrosis)、產(chǎn)前暴露遲發(fā)效應(yīng)(Prenatal exposure delayed effects)、化學(xué)藥物性肝損傷(Chemical and drug induced liver injury)、炎癥(Inflammation)、減重(Weight loss)、細(xì)胞增生(Hyperplasia)、腎臟疾?。↘idney diseases)和水腫(Edema)相關(guān),推測菊花的清熱解毒功效可能與大部分活性成分發(fā)揮調(diào)控炎癥、壞死過程有關(guān)。

        圖1 菊花化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

        表1 菊花度值≥10的活性化合物基本信息

        表2 菊花度值≥10的靶點(diǎn)基本信息

        2.2 靶點(diǎn)通路分析

        圖2 菊花化合物-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)

        通過DAVID數(shù)據(jù)庫中GO功能富集分析得到GO條目146個(gè)(P<0.05),其中生物過程(BP)條目105個(gè),占72%,分子功能(CC)條目17個(gè),占12%,細(xì)胞組成(MF)相關(guān)條目24個(gè),占16%,主要GO條目如圖3所示。KEGG通路注釋分析,按P值排列前15條生物通路結(jié)果如圖4所示。其中包括癌癥信號(hào)通 路(Pathways in cancer、Bladder cancer、Pancreatc cancer、Prostate cancer、Non-small cell lung cancer)、炎癥信號(hào)通路(TNF signaling pathway)、免疫相關(guān)信號(hào) 通 路(Influenza A、Hepatitis B、Toxoplasmosis、Leishmaniasis、HTLV-Iinfection),通路中出現(xiàn)次數(shù)≥10的靶點(diǎn)有12個(gè),包括AKT1、TP53、CCND、TGFB1、CDKN1A、MAPK3、MAPK1、IKBKB、NFKBIA、CHUK、RAF1、BAD,這些靶點(diǎn)蛋白主要參與細(xì)胞增殖和生長、細(xì)胞凋亡、炎癥反應(yīng)、免疫和應(yīng)激應(yīng)答等過程。結(jié)果表明,菊花清熱解毒的功效與調(diào)控這些信號(hào)通路發(fā)揮抗炎、免疫調(diào)節(jié)作用有關(guān)。

        圖3 菊花靶點(diǎn)GO富集

        圖4 菊花靶點(diǎn)KEGG通路

        2.3 菊花靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析

        為了更好地理解菊花清熱解毒功效的作用機(jī)制,利用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建了菊花PPI網(wǎng)絡(luò),結(jié)果表明,PPI網(wǎng)絡(luò)包括244個(gè)節(jié)點(diǎn),946條相互關(guān)系,去掉無相互關(guān)系的35個(gè)節(jié)點(diǎn),其余209個(gè)節(jié)點(diǎn)利用Cytoscape 3.7.1軟件繪制菊花靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)如圖5所示。節(jié)點(diǎn)Degree值≥10的節(jié)點(diǎn)共72個(gè),為菊花的核心靶點(diǎn),其中JUN、TP53、AKT1、MAPK3、MAPK1、RELA、TNF、HSP90AA1、IL6等出現(xiàn)頻率較高,根據(jù)Degree值大小繪制Degree值≥20的核心蛋白質(zhì)節(jié)點(diǎn)的條形圖(圖6)。核心靶點(diǎn)中共包含11個(gè)炎癥相關(guān)靶點(diǎn)(TNF、IL1B、IL6、NOS2、CCL2、CXCL8、IL10、AKT1、VEGFA、MMP9、CXCL2),這些靶點(diǎn)蛋白在菊花清熱解毒功效中起到關(guān)鍵作用。

        圖5 菊花靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)

        2.4 靶點(diǎn)定位分析與歸經(jīng)理論的相關(guān)性分析

        圖6 菊花核心靶點(diǎn)(Degree值≥20)

        利用BIOGPS數(shù)據(jù)庫對(duì)主要靶點(diǎn)(Degree值≥20)定位分析,保留每個(gè)基因表達(dá)量最高的排在前5位的組織,利用Cytoscape軟件繪制靶點(diǎn)-組織網(wǎng)絡(luò)圖(圖7),圖中節(jié)點(diǎn)大小與Degree值一致。結(jié)果表明,這些靶點(diǎn)主要分布在肺(Lung,Degree值=6),平滑肌(Smooth muscle,Degree值=4),肝臟(Liver,De?gree值=3),扁桃體(Amygdala,Degree值=3),甲狀腺(Thyroid,Degree值=3),前列腺(Prostate,Degree值=3),該結(jié)果與菊花歸肺、肝經(jīng)一致,這些組織器官在菊花清熱解毒功效中發(fā)揮重要作用。此外,CD33+髓樣細(xì)胞(CD33+Myeloid,Degree值=9),伯基特淋巴瘤(Lymphoma burkitts,Degree值=6)、心肌細(xì)胞(Cardiacmyocytes,Degree值=5)(CD56+NK Cells,Degree值=4)BDCA4+樹突狀細(xì)胞(BDCA4+Dentrit?ic Cells,Degree值=4),CD14+單 核 細(xì) 胞(CD14+Monocytes,Degree值=4),721 B淋巴母細(xì)胞(721 B lymphoblasts,Degree值=4)等細(xì)胞發(fā)揮重要的作用。

        圖7 菊花靶點(diǎn)-歸經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

        3 討論

        利用系統(tǒng)藥理學(xué)分析了菊花清熱解毒功效的分子機(jī)制,以口服生物利用度(OB)與類藥性(DL)為指標(biāo)通過TCMSP與Drugbank數(shù)據(jù)庫篩選出菊花中符合條件的化合物,建立備選化合物庫。結(jié)果表明,菊花主要通過槲皮素、山奈酚、木犀草素、柚皮素、β-谷甾醇等化合物發(fā)揮清熱解毒作用?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究表明,菊花中作用最強(qiáng)的前5個(gè)化合物在抗炎、抗菌中起到不同程度的作用。槲皮素能明顯抑制大鼠急慢性前列腺炎模型與急性痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎模型炎癥[9,10],具有廣譜抗菌活性,對(duì)金黃色葡萄球菌、膠質(zhì)芽孢桿菌、大腸桿菌、蘇云金芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、銅綠假單胞菌均有明顯的抗菌效果[11]。山奈酚可通過MAPK等信號(hào)通路減輕脂多糖誘導(dǎo)的急性肺炎[12],抑制氣道炎癥[13]。木犀草素能夠降低炎癥因子轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子的活性,抑制IL6等各類促炎因子和炎癥介質(zhì)的產(chǎn)生,改善氣道炎癥[14]。β-谷甾醇可以抑制肺炎鏈球菌溶菌素對(duì)細(xì)胞侵染,通過抑制STAT1的產(chǎn)生及NF-κB的核轉(zhuǎn)移發(fā)揮抗炎作用[15]。柚皮素對(duì)大腸桿菌、金黃色葡萄球菌和枯草芽孢桿菌有較好的抑菌作用[16,17],可通過抑制炎癥細(xì)胞浸潤、炎癥介質(zhì)釋放、iNOS活性等發(fā)揮抗炎作用[18,19]。通過化合物-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)菊花關(guān)鍵靶點(diǎn)主要與炎癥、壞死等疾病相關(guān),如菊花關(guān)鍵靶點(diǎn)前列腺素G/H合酶2為體溫調(diào)節(jié)介質(zhì)前列腺素合成的關(guān)鍵酶,可通過干預(yù)前列腺素E2的合成,參與機(jī)體發(fā)熱與炎癥等的調(diào)節(jié)[20]。以上分析說明,菊花的清熱解毒功效與其成分槲皮素、山奈酚、木犀草素、柚皮素、β-谷甾醇等化合物等干預(yù)炎癥、壞死過程,發(fā)揮抗炎抗菌作用有關(guān)。

        KEGG通路分析結(jié)果顯示,菊花靶點(diǎn)主要作用于炎癥信號(hào)通路(TNF signaling pathway)和免疫相關(guān)信號(hào)通路(Influenza A、Hepatitis B、Toxoplasmosis、Leishmaniasis、HTLV-I infection),其中靶點(diǎn)AKT1、TP53、MAPK3、MAPK1等在通路中出現(xiàn)次數(shù)較高,在PPI網(wǎng)絡(luò)中發(fā)現(xiàn)這些靶點(diǎn)為菊花作用的核心蛋白質(zhì)。AKT1與核心蛋白質(zhì)TNF、IL6、NOS2、MMP9均為炎癥相關(guān)靶點(diǎn),是菊花抗炎發(fā)揮清熱解毒功效的重要靶蛋白。AKT1為致癌基因,是AKT家族的重要一員,在增殖、凋亡等細(xì)胞進(jìn)程及炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用[21,22]。菊花可能是通過抑制AKT磷酸化減少炎性因子IL6、TNFα的釋放,緩解機(jī)體的炎癥反應(yīng)。一氧化氮(NO)為重要的炎癥介質(zhì)[23],菊花可能是通過作用于靶點(diǎn)NOS2,抑制NO的影響,張星海[3]證實(shí)菊花提取液干預(yù)炎癥小鼠后炎癥癥狀明顯改善,血清中NO顯著降低。菊花還可能是通過調(diào)控MMP9的表達(dá),改善炎癥臨床表現(xiàn)發(fā)揮清熱解毒功效的抗炎機(jī)制[24]。通過靶點(diǎn)定位分析發(fā)現(xiàn),菊花主要靶點(diǎn)分布于肺臟與肝臟,與菊花歸經(jīng)一致,這可能是菊花有效治療熱毒引起的目赤、風(fēng)熱證的原因之一。綜上所述,菊花清熱解毒的功效可能與槲皮素、山奈酚、木犀草素、柚皮素、β-谷甾醇等化合物作用AKT1、TNF、IL6、NOS2、MMP9等核心靶點(diǎn),調(diào)控炎癥和免疫相關(guān)信號(hào)通路,抑制炎癥反應(yīng)有關(guān),菊花清熱解毒的物質(zhì)基礎(chǔ)與分子機(jī)制的確定還需通過生物學(xué)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步的研究與驗(yàn)證。

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