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        穿膜肽與抗豬流行性腹瀉病毒膜蛋白單域抗體融合表達和入胞活性分析

        2021-06-24 01:11:20張辛銘尹雙輝張濤濤楊順利薛慧文
        動物醫(yī)學(xué)進展 2021年6期
        關(guān)鍵詞:融合

        李 麗,張辛銘,尹雙輝,張濤濤,楊順利,薛慧文

        (1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,甘肅蘭州 730070;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所/家畜疫病病原生物學(xué)國家重點實驗室,甘肅蘭州 730046;3.石家莊市獸用生物制品供應(yīng)站,河北石家莊 050027)

        豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV) 屬于尼多病毒目(Nidovirales)、冠狀病毒科(Coronaviridae)、冠狀病毒屬(Coronavirus)成員,是引起豬流行性腹瀉(Poreine epidemic diarrhea,PED)的病原。PED是一種急性接觸性傳染病,病豬的主要特征為腹瀉、嘔吐和脫水,對哺乳仔豬具有較高致死率。流行病學(xué)調(diào)查表明,PEDV已經(jīng)遍及全球,給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大損失[1-2]。膜蛋白(M)在PEDV結(jié)構(gòu)蛋白中含量最多,在補體共同作用下能夠誘導(dǎo)機體產(chǎn)生中和抗體。M蛋白編碼基因與其它冠狀病毒的M基因有較低的相似性,但是在不同PEDV毒株間具有較高的相似性。因此,M蛋白是PEDV檢測以及病原成像等研究的理想靶標(biāo)蛋白。

        駝科和軟骨魚等動物體內(nèi)存在著一種天然缺失輕鏈、僅有重鏈的抗體,稱之為重鏈抗體(heavy chain antibodies,HCAbs)[3]。這類抗體僅通過重鏈可變區(qū)形成的結(jié)構(gòu)來特異性識別和結(jié)合抗原,故稱此可變區(qū)結(jié)構(gòu)片段為單域抗體(single domain antibody,sdAb)。sdAb是目前可以得到的具有完整功能的最小抗體分子,分子質(zhì)量僅15 ku,是單克隆抗體分子質(zhì)量的1/3,又稱為納米抗體(nanobody)。sdAb具有結(jié)構(gòu)簡單易于基因工程改造,容易重組表達、高水溶性、耐高溫和極端pH等獨特性質(zhì)[4-5]。此外,sdAb具有較強的組織滲透性,甚至能通過血腦屏障[6-7],在腫瘤成像、腫瘤治療和小分子抗體治療藥物研發(fā)等領(lǐng)域具有廣闊應(yīng)用前景[8-11]。本實驗室前期篩選到了M蛋白特異性sdAb,并證實其具有較好的PEDV結(jié)合活性,在PEDV檢測和分離方面具有較好的應(yīng)用價值。然而,由于sdAb不具有自主進入動物細(xì)胞的特性,限制了其在治療性抗體研發(fā)以及PEDV成像示蹤方面的應(yīng)用。

        細(xì)胞穿膜肽(cell penetrating peptides,CPPs)也稱為蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域,是一類含有約5~30個氨基酸的短肽,自身具有跨膜轉(zhuǎn)運功能,能夠攜帶核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子進入細(xì)胞發(fā)揮功能,且沒有細(xì)胞毒性。TAT短肽(transactivator)是人類免疫缺陷病毒1型(HIV-1)的反式激活因子,是最早被報道的CPPs[12]。目前,TAT短肽已經(jīng)被用作向細(xì)胞內(nèi)遞送包括小分子核酸(DNA、RNA和siRNA)、多肽、蛋白質(zhì)、病毒、成像劑、藥物以及各種納米顆粒等的有效工具。

        本研究將TAT穿膜肽與抗PEDV膜蛋白M的特異性sdAb進行融合表達,獲得帶有TAT短肽的重組sdAb(TAT-sdAb)。用ELISA方法檢測TAT-sdAb與M蛋白的結(jié)合活性,通過免疫熒光技術(shù)分析TAT-sdAb進入Vero細(xì)胞的特性,并對TAT-sdAb與細(xì)胞內(nèi)的PEDV進行共定位。本研究獲得的具有穿膜活性和抗原結(jié)合活性的重組TAT-sdAb,為PEDV感染的活細(xì)胞檢測和示蹤提供了材料基礎(chǔ),為治療性sdAb的研發(fā)提供了參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 主要試劑 限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和XholⅠ,英國NEB公司產(chǎn)品;膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒和大腸埃希氏菌感受態(tài)細(xì)胞,中國全式金生物公司產(chǎn)品;0.45 μm濾膜,美國Millipore公司產(chǎn)品;異丙基-β-d-硫代半乳糖苷(IPTG),上海生工生物工程有限公司產(chǎn)品;His-tag純化樹脂,德國Qiagen公司產(chǎn)品;多聚甲醛固定液,中國索萊寶生物公司產(chǎn)品;HRP和FITC標(biāo)記抗His-tag抗體,TRITC標(biāo)記抗鼠抗體,美國Abcam公司產(chǎn)品;DMEM培養(yǎng)基,美國Hyclone公司產(chǎn)品;胎牛血清,中國四季青公司產(chǎn)品;細(xì)胞培養(yǎng)瓶、激光共聚焦顯微鏡觀察實驗用培養(yǎng)皿(24 mm),美國Corning公司產(chǎn)品;pET-32a表達載體、PEDV核蛋白單克隆抗體、膜蛋白特異性sdAb和重組表達的PEDV M蛋白,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所豬禽消化道感染和黏膜免疫研究創(chuàng)新團隊實驗室保存;其他常規(guī)試劑為國產(chǎn)分析純。

        1.1.2 主要儀器 CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱(HERAcell vios 160i),Thermo Fisher Scientific公司產(chǎn)品;蛋白電泳儀(PowerPac)和酶標(biāo)儀(iMark),Bio-Rad公司產(chǎn)品;超聲波破碎儀(SCIENTZ-950E),寧波新芝生物科技股份有限公司產(chǎn)品;激光共聚焦顯微鏡(TCS SP8X),Leica公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        1.2.1 PEDV特異性單域抗體與穿膜肽的融合表達及與M蛋白結(jié)合活性分析 將TAT穿膜肽基因與實驗室保存的抗PEDV M蛋白的特異性單域抗體sdAb-Mc30(MH550666)[13]基因,通過引物延伸方法融合,并利用BamHⅠ和XholⅠ酶切位點克隆到pET-32a表達載體,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸埃希氏菌(DH5α)感受態(tài)細(xì)胞,挑選陽性克隆并進行測序分析,陽性質(zhì)粒命名為32a-TAT-sdAb,轉(zhuǎn)化到大腸埃希氏菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,過夜培養(yǎng)后,挑取單菌落接種到新鮮Lysogeny broth(LB)培養(yǎng)基(含100 μg/mL ampicillin),37℃振蕩培養(yǎng)過夜,次日按照體積比1%接種量,將菌轉(zhuǎn)接至新鮮LB培養(yǎng)基(含100 μg/mL ampicillin)中,振搖至OD 600 nm值約為0.6~0.8,加入終濃度分別為0.001 moL/L、0.002 moL/L、 0.005 moL/L和0.01 moL/L的IPTG,25℃誘導(dǎo)12 h后,8 000 r/min離心收集菌體。用120 g/L聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分析。

        確定目的蛋白表達以及最佳的IPTG誘導(dǎo)濃度后,大量誘導(dǎo)重組表達菌,收集菌體。用Tris-HCl緩沖液(pH8.0)重懸重組菌,置冰上用超聲儀進行細(xì)胞裂解,然后12 000 r/min、4℃離心10 min,收集上清。上清液用0.45 μm濾膜過濾并加入到裝有His蛋白純化樹脂(Ni-NTA agarose resin)的親和層析柱,按操作說明進行目的蛋白純化。獲得的蛋白樣品進行SDS-PAGE電泳分析,然后用透析袋更換溶解緩沖液為磷酸鹽緩沖液(PBS,pH 8.0),用Nanodrop 2000超微量分光光度計測濃度后,分裝,-80℃保存。

        參照已報道的ELISA方法[13],稀釋重組TAT-sdAb和sdAb至終濃度分別為10 μg/mL、5 μg/mL、2.5 μg/mL、1.25 μg/mL、0.63 μg/mL、0.32 μg/mL、0.16 μg/mL和0 μg/mL,檢測不同濃度TAT-sdAb與M蛋白的結(jié)合活性。

        1.2.2 TAT-sdAb穿膜活性分析 利用間接免疫熒光方法(IFA)分析TAT介導(dǎo)sdAb穿膜進入細(xì)胞的過程。Vero細(xì)胞用DMEM培養(yǎng)基傳代培養(yǎng)(含10%胎牛血清、100 IU/mL青霉素和100 μg/mL鏈霉素),在37℃、5% CO2條件下培養(yǎng)。將細(xì)胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿(24 mm),培養(yǎng)至70%~80%細(xì)胞匯合,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,加入1 mL的DMEM,同時加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,在37℃、5% CO2共孵育3 h;棄掉培養(yǎng)液,PBS洗5次,40 g/L多聚甲醛室溫固定10 min,1 mL/L Triton X100的PBS透膜10 min。固定后的細(xì)胞與FITC標(biāo)記的抗His-tag抗體(1∶3 000稀釋)室溫孵育1 h,DAPI染核5 min,最后用PBS洗5次,激光共聚焦顯微鏡下觀察。

        1.2.3 TAT-sdAb的最適使用劑量分析 將Vero細(xì)胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿培養(yǎng)至70%~80%細(xì)胞匯合,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,然后加入1 mL的DMEM,并分別加入TAT-sdAb至終濃度為0 μg/mL、1 μg/mL、10 μg/mL、50 μg/mL和100 μg/mL,設(shè)置相同濃度的sdAb為試驗對照,在37℃、5% CO2條件下培養(yǎng)3 h。細(xì)胞洗滌并固定,與FITC標(biāo)記的抗His-tag抗體以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。

        1.2.4 TAT-sdAb的最適作用時間分析 將Vero細(xì)胞傳代至共聚焦顯微鏡觀察實驗用培養(yǎng)皿,培養(yǎng)至70%~80%細(xì)胞匯合,分別加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,在37℃、5% CO2,分別培養(yǎng)0 h、0.5 h、1 h、3 h和5 h;設(shè)置不加TAT-sdAb的空白細(xì)胞對照。細(xì)胞洗滌并固定,與FITC標(biāo)記的抗His-tag抗體以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。

        1.2.5 TAT-sdAb與PEDV胞內(nèi)共定位 將Vero細(xì)胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿接種0.5 MOI的PEDV疫苗株(CV777),培養(yǎng)12 h,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,加入1 mL的DMEM,同時加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,繼續(xù)培養(yǎng)3 h。隨后洗滌并固定細(xì)胞,分別與FITC標(biāo)記的抗His-tag抗體、抗PEDV核蛋白單克隆抗體、TRITC標(biāo)記抗鼠二抗以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。

        2 結(jié)果

        2.1 TAT-sdAb的表達、純化及結(jié)合活性分析

        將PEDV特異性sdAb與TAT融合,構(gòu)建表達載體32a-TAT-sdAb,并轉(zhuǎn)化到大腸埃希氏菌感受態(tài)細(xì)胞(DE3)。加入不同終濃度IPTG誘導(dǎo),SDS-PAGE鑒定發(fā)現(xiàn),誘導(dǎo)組均能觀察到大小約為35 ku的特異性條帶,與預(yù)測目標(biāo)蛋白大小相符;利用His-tag蛋白純化樹脂進行純化,可獲得特異性的蛋白條帶(圖1);ELISA試驗證實不同稀釋度的TAT-sdAb與sdAb具有相似的M蛋白結(jié)合活性,表明融合TAT并未影響sdAb的抗原結(jié)合活性(圖2)。

        M.蛋白分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1~4.空白質(zhì)粒對照;5~8.0.001 moL/L、0.002 moL/L、0.005 moL/L和0.01 moL/L IPTG誘導(dǎo)條件下表達菌,白色箭頭所指為目的條帶;9 .目的蛋白純化。

        圖2 ELISA方法分析TAT-sdAb的抗原結(jié)合活性分析

        2.2 TAT-sdAb穿膜活性分析

        為了驗證TAT能否有效介導(dǎo)sdAb進入細(xì)胞,分別向Vero細(xì)胞中加入TAT-sdAb和sdAb共孵育,利用IFA方法通過激光共聚焦顯微鏡觀察細(xì)胞內(nèi)TAT-sdAb和sdAb的分布特征。結(jié)果觀察到在TAT-sdAb共孵育Vero細(xì)胞的胞質(zhì)中有明顯的熒光,而與sdAb共孵育的對照細(xì)胞內(nèi)未觀察到明顯的熒光。結(jié)果表明融合TAT短肽,使TAT-sdAb具備了穿透細(xì)胞膜進入Vero細(xì)胞的活性(圖3)。

        A.白光觀察的細(xì)胞;B.360 nm觀察的細(xì)胞;C.488 nm觀察的細(xì)胞;D.合并觀察的細(xì)胞; T.TAT-sdAb處理組; S.sdAb處理組

        2.3 TAT-sdAb的最適使用劑量分析

        為了確定TAT-sdAb穿膜的最佳使用劑量,將不同量的TAT-sdAb與Vero細(xì)胞共孵育,IFA方法檢測細(xì)胞內(nèi)TAT-sdAb的變化(圖4)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著TAT-sdAb蛋白量的增加,Vero細(xì)胞內(nèi)的熒光分布范圍逐漸變大,熒光強度也隨之增加,在使用濃度為50 μg/mL和100 μg/mL時熒光較為明顯,而sdAb對照組則未見明顯熒光。結(jié)果說明TAT-sdAb穿膜進入Vero細(xì)胞的活性和效率與使用劑量成正相關(guān),要達到理想的穿膜效果,使用濃度應(yīng)大于50 μg/mL。

        A.0 μg TAT-sdAb;B.1 μg TAT-sdAb;C.10 μg TAT-sdAb;

        2.4 TAT-sdAb的最適作用時間分析

        為了確定TAT-sdAb穿膜的最適孵育時間,將其與Vero細(xì)胞共孵育,IFA檢測TAT-sdAb在細(xì)胞內(nèi)的變化(圖5)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著TAT-sdAb與細(xì)胞共孵育時間的延長,細(xì)胞內(nèi)熒光點的分布范圍逐漸變大,熒光強度增加;當(dāng)?shù)? h時,熒光強度尤為明顯。結(jié)果說明TAT-sdAb穿膜進入Vero細(xì)胞的活性和效率與作用時間成正相關(guān),要達到理想的穿膜效果,作用時間應(yīng)大于3 h。

        A.空白對照;B.0 h;C.0.5 h;D.1 h;E.3 h;F.5 h

        2.5 TAT-sdAb與PEDV在細(xì)胞內(nèi)共定位

        為了驗證TAT-sdAb進入細(xì)胞后能否識別和結(jié)合PEDV,將TAT-sdAb與PEDV感染的Vero細(xì)胞孵育,用IFA方法進行共定位分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)TAT-sdAb(綠色熒光)進入細(xì)胞后,與胞內(nèi)的PEDV(紅色熒光)分布基本一致,在細(xì)胞膜和細(xì)胞質(zhì)發(fā)生熒光重疊(圖6)。結(jié)果表明TAT-sdAb進入細(xì)胞后能識別胞內(nèi)的PEDV。

        A.360 nm觀察的細(xì)胞;B.488 nm觀察的細(xì)胞;D.549 nm觀察的細(xì)胞;E.合并觀察的細(xì)胞; T.TAT-sdAb處理組; C.對照組

        3 討論

        PEDV是威脅養(yǎng)豬業(yè)的重大病原,其傳播的廣泛性和對新生仔豬近100%的致死率,給我國養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的損失。本研究小組已經(jīng)利用篩選到的PEDV膜蛋白特異性單域抗體(sdAb-Mcs),建立了PEDV檢測和分離的方法[13]。為了進一步提高sdAb的研究適用性,本研究嘗試構(gòu)建帶有穿膜肽的sdAb,旨在獲得具有自主進入細(xì)胞活性的sdAb,從而拓寬sdAb的潛在應(yīng)用。

        sdAb是具備抗原結(jié)合能力的最小抗體,與傳統(tǒng)抗體相比,sdAb還具有可溶性高、穩(wěn)定性好、親和力高、組織穿透力強以及容易大量生產(chǎn)等優(yōu)點。在生物成像、胞內(nèi)特定抗原示蹤與檢測、藥物投遞以及作為治療性抗體等方面具有巨大應(yīng)用潛力[14-16]。然而,在活細(xì)胞內(nèi)特定抗原示蹤成像、藥物投遞以及胞內(nèi)病原治療性抗體等應(yīng)用中,通常需要sdAb具備較高的組織和細(xì)胞穿透活性。細(xì)胞穿膜肽(CPPs)是能夠自主穿過細(xì)胞膜進入細(xì)胞的一類短肽,有介導(dǎo)sdAb進入細(xì)胞的巨大潛力。已有研究證實CPPs可通過內(nèi)吞和直接穿透等機制運載蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子、成像劑、藥物以及各種納米顆粒進入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮其效應(yīng)功能[17-19]。CPPs具有生物相容性佳、對細(xì)胞造成的毒性小以及能與生物活性蛋白直接融合重組表達等優(yōu)點,因此成為以胞內(nèi)分子為靶標(biāo)的藥物遞送技術(shù)發(fā)展的重要工具。TAT短肽是一類已經(jīng)被廣泛應(yīng)用的富含堿性氨基酸的CPPs,具有強烈的穿透細(xì)胞膜能力[12]。鑒于此,本研究結(jié)合sdAb分子質(zhì)量小、易于基因工程改造特性以及TAT短肽能穿過哺乳動物細(xì)胞膜特性,將sdAb基因與TAT短肽融合表達,成功獲得能在大腸埃希氏菌中(E.coli)可溶性表達的重組TAT-sdAb蛋白。對TAT-sdAb的M蛋白結(jié)合活性分析表明,融合TAT并未影響sdAb的抗原結(jié)合活性。此外,每升LB培養(yǎng)液可獲得超過5 mg的重組TAT-sdAb抗體(結(jié)果未展示),成本低廉,易于制備,能滿足后續(xù)的各種應(yīng)用需求。

        研究發(fā)現(xiàn),將蛋白質(zhì)(如乙二醛酶蛋白和Smar蛋白等)與細(xì)胞穿膜肽TAT融合表達后,TAT能夠以時間和劑量依賴的方式將這些蛋白質(zhì)遞送進入細(xì)胞中[20-21]。也有研究證實,將治療性抗體與TAT融合,成功將治療性抗體遞送到細(xì)胞內(nèi)[22]。本研究將TAT-sdAb與Vero細(xì)胞共孵育后,發(fā)現(xiàn)TAT-sdAb能夠進入到Vero細(xì)胞內(nèi),其入胞效率與使用劑量和作用時間成正相關(guān),這也與以前的研究報道相一致。對細(xì)胞內(nèi)PEDV與TAT-sdAb共定位分析發(fā)現(xiàn),進入細(xì)胞的TAT-sdAb與PEDV呈共定位分布,表明重組TAT-sdAb進入細(xì)胞后能識別胞內(nèi)的PEDV病原。因此,TAT-sdAb有望成為PEDV感染細(xì)胞動態(tài)示蹤研究中的有力工具。同時,TAT穿膜肽成功介導(dǎo)有病原結(jié)合活性的sdAb有效進入細(xì)胞,為具有特定活性小分子蛋白的細(xì)胞內(nèi)傳遞提供更多數(shù)據(jù)參考。

        總之,本研究將TAT穿膜肽與PEDV特異性sdAb進行了融合表達,獲得了具有抗原結(jié)合活性的重組TAT-sdAb;進一步分析證實TAT-sdAb能夠自主進入Vero細(xì)胞,并能識別細(xì)胞內(nèi)的PEDV,為PEDV感染動態(tài)過程可視化研究提供了有力工具,同時也為治療性單域抗體的細(xì)胞內(nèi)遞藥提供更多參考。

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