林艷麗 覃建兵 伍翔 王巖巖 潘佑找 柳忠玉
(1.長江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,荊州 434025;2.長江大學(xué)園藝園林學(xué)院 荊州 434025)
虎杖(Polygonum cuspidatum Sieb.et Zucc.)是蓼科多年生藥用草本植物,藥用成分包含蒽醌類、二苯乙烯類、黃酮類和多糖類等化合物,藥用價值豐富。藥用植物中發(fā)揮防病治病功能的有效成分是藥用植物區(qū)別于其他作物最主要的特征,有效成分主要是藥用植物生長過程中積累的代謝產(chǎn)物,轉(zhuǎn)錄因子是調(diào)節(jié)藥用植物次生代謝及有效成分積累的重要影響因子。因此,研究轉(zhuǎn)錄因子對次生代謝產(chǎn)物的積累的影響尤為重要。
MYB轉(zhuǎn)錄因子家族是植物基因組中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一[1],參與調(diào)控植物藥效成分合成,目前,已有不少從植物中克隆MYB基因啟動子的報道。如從黃芪中克隆出了AmMYB44的啟動子[2];從銀杏中克隆出了GbMYBF2的啟動子[3];從丹參中克隆出了SmMYB7的啟動子[4]。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)MYB家族基因啟動子序列中除含有啟動子TATA-box、CAAT-box等基本的組成元件外,還含有一些特有的與激素、抗逆境、組織器官發(fā)育等相關(guān)順式作用元件,推測對MYB轉(zhuǎn)錄因子的激活和誘導(dǎo)起到調(diào)控作用。但虎杖MYB基因啟動子的相關(guān)研究尚未見報道。
藥用植物課題組前期從虎杖中分離得到1個新的轉(zhuǎn)錄因子PcMYB1(GenBank登錄號為KY495789)[5],生物信息學(xué)分析PcMYB1序列C端存在一個抑制結(jié)構(gòu)域基序pdLNL[D/E]LXI[G/S],并且利用酵母單雜交試驗、轉(zhuǎn)基因技術(shù)等證明PcMYB1具有轉(zhuǎn)錄抑制活性,對植物木質(zhì)素合成具有負調(diào)控作用[6]。本研究擬用 hiTAIL-PCR[7]方法獲得PcMYB1的啟動子序列,并構(gòu)建啟動子植物表達載體,通過毛狀根遺傳轉(zhuǎn)化以及GUS組織化學(xué)染色分析PcMYB1啟動子活性。旨為后續(xù)研究PcMYB1參與植物次生代謝產(chǎn)物合成的分子機制奠定基礎(chǔ)。
樣品由長江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院柳忠玉副教授鑒定為虎杖植株,植于長江大學(xué)苗圃,發(fā)根農(nóng)桿菌菌株ATCC15834、大腸桿菌菌株DH5α、載體pCAMBIA1300G、pMD18-T等由藥用植物課題組保存??敲顾兀╧anamycin,Kan)、潮霉素(hygromycin,Hyg)、乙酰丁香酮、質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒等購自Tiangen公司;限制性內(nèi)切酶、Taq DNA聚合酶、T4連接酶購自TaKaRa公司;所用引物和測序服務(wù)由上海生物工程有限公司完成。
1.2.1 PcMYB1啟動子的克隆與序列分析 利用hiTAIL-PCR法[7]擴增虎杖PcMYB1的啟動子序列,以藥用植物課題組已經(jīng)獲得的PcMYB1基因(GenBank登錄號為KY495789)序列為基礎(chǔ),設(shè)計3條特異巢式引物SP0-1、SP1-1和SP2-1,結(jié)合4條LAD簡并引物及AC1引物(表1)進行3輪PCR擴增。
以虎杖基因組DNA為預(yù)擴增模板,LAD1-LAD4、SP0-1為引物進行預(yù)擴增;以預(yù)擴增產(chǎn)物稀釋40倍后作為模板,AC1、SP1-1為引物進行第一輪擴增;再以第一輪擴增產(chǎn)物稀釋10倍后作為模板,AC1、SP2-1作為引物進行第二輪擴增。將PCR產(chǎn)物特異性條帶回收并測序。所獲序列經(jīng)過同源比對確定為PcMYB1的5′側(cè)翼序列后,設(shè)計并合成引物P0-F和P0-R(表1),以虎杖葉片基因組DNA為模板進行 PCR 擴增:94℃ 2 min;94℃ 30 s,58℃ 45 s,72℃ 1 min,35個循環(huán);72℃ 10 min。將PCR產(chǎn)物回收,連接到pMD18-T載體后轉(zhuǎn)化大腸桿菌并測序,重組子命名為pMD18-T-P0。獲得虎杖PcMYB1啟動子序列后,利用軟件PlantCARE預(yù)測該啟動子潛在的順式作用元件。
1.2.2 PcMYB1啟動子表達載體的構(gòu)建 根據(jù)啟動子測序和序列分析結(jié)果,在全長啟動子P1(-2 884-+1)的基礎(chǔ)上,設(shè)計3個5′端缺失啟動子(圖1),分別是 P2(-2 259-+1)、P3(-1 807-+1)和P4(-1 362-+1);并根據(jù)其序列設(shè)計對應(yīng)引物(表1)。以質(zhì)粒pMD18-T-P0為模板,引物P1-F、pro-R擴增全長啟動子P1;引物P2-F、pro-R擴增5′端缺失啟動子P2;引物P3-F、pro-R擴增5′端缺失啟動子P3;引物P4-F、pro-R擴增5′端缺失啟動子P4。PCR產(chǎn)物經(jīng)過雙酶切(PstⅠ+BamH I)后回收目的片段;與經(jīng)過同樣的酶切掉35S啟動子的pCAMBIA1301G載體連接。
1.2.3 發(fā)根農(nóng)桿菌介導(dǎo)的虎杖毛狀根遺傳轉(zhuǎn)化 用電轉(zhuǎn)化法將植物表達載體P1∷GUS、P2∷GUS、P3∷GUS和P4∷GUS以及陽性對照35S∷GUS分別轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌ATCC15834菌株。挑取陽性單菌落于5 mL TY液體培養(yǎng)基(含50 μg/mL卡那霉素)中,28℃條件下180 r/min培養(yǎng)48 h。取菌液100 μL涂布到TY固體培養(yǎng)基(含50 μg/mL卡那霉素),28℃培養(yǎng)48 h。將菌落用涂棒刮下,用1/2MS液體培養(yǎng)基(含有100 μmol/L乙酰丁香酮)重懸,振蕩至A600為0.8左右。選取生長健壯的虎杖無菌苗,葉片切成1 cm×1 cm小塊,并置于準備好的菌液中浸泡10 min,用滅菌濾紙吸干葉片表面的菌液,然后將葉片轉(zhuǎn)移至1/2MS固體培養(yǎng)基(含7.5 μg/mL潮霉素),于黑暗中進行篩選培養(yǎng)并觀察毛狀根的生長狀態(tài)。
1.2.4 轉(zhuǎn)基因虎杖毛狀根的PCR檢測 利用CTAB法提取虎杖毛狀根的基因組DNA。以基因組DNA為模板,利用引物Hyg-F和Hyg-R(表1)擴增潮霉素基因Hyg,預(yù)期擴增片段大小為500 bp;利用引物GUS-F和GUS-R(表1)擴增GUS,預(yù)期擴增片段大小為1 080 bp。
圖1 PcMYB1啟動子系列缺失片段表達載體構(gòu)建示意圖Fig.1 Schematic representation of expression vector construction of serial deletion fragments of PcMYB1 promoter
1.2.5 轉(zhuǎn)基因虎杖毛狀根的GUS染色檢測 選取經(jīng)PCR鑒定為陽性的毛狀根進行GUS染色分析。參照Jefferson等[8]方法略加修改,將毛狀根完全浸沒在事先預(yù)冷的90%丙酮溶液中,室溫放置20 min。再用預(yù)冷的去離子水沖洗,將丙酮溶液完全沖洗干凈,再將毛狀根浸沒于GUS染色劑中,37℃過夜。隨后將GUS染色處理的毛狀根置于濃度為70%的乙醇中脫色30 min,最后用95%的乙醇洗脫,并觀察拍照。
在已經(jīng)獲得的PcMYB1(GenBank登錄號為KY495789)序列基礎(chǔ)上,利用hiTAIL-PCR法擴增虎杖PcMYB1的啟動子序列。用1%瓊脂糖對PCR擴增產(chǎn)物進行檢測,預(yù)擴增的PCR產(chǎn)物均無特異條帶(圖2-A)。第一輪hiTAIL-PCR產(chǎn)物出現(xiàn)特異條帶(圖2-B)。第二輪hiTAIL-PCR產(chǎn)物仍然是特異條帶(圖2-C),將該特異條帶回收。測序后與PcMYB1進行同源性比對,確認其為PcMYB1的5′側(cè)翼序列。再以虎杖基因組DNA為模板,通過PCR擴增最終獲得PcMYB1啟動子序列2 884 bp(圖3),命名為proPcMYB1(GenBank登錄號為MT811057)。
利用PlantCARE對克隆獲得的啟動子序列中可能存在的順式作用元件進行預(yù)測,分析PcMYB1啟動子元件的類型、數(shù)量及位置(表2和圖3)。其中,+1為翻譯起始位點,負值表示從翻譯起始密碼子開始的5′端上游序列。PcMYB1啟動子包含多個真核生物啟動子保守元件TATAbox和CAAT-box。此外,還有光響應(yīng)元件GT1-motif、G-box,涉及光反應(yīng)的AE-box、AT1-box、TCT-box、I-box元件,涉及厭氧誘導(dǎo)順式作用的ARE元件,涉及低溫誘導(dǎo)順式作用的LTR元件,還有參與茉莉酸甲酯響應(yīng)的CGTCA-motif和TGACG-motif元件。
圖2 PcMYB1的hiTAIL-PCR擴增產(chǎn)物電泳分析Fig.2 Analysis of PcMYB1 by electrophoresis of hiTAILPCR amplification products
根據(jù)啟動子測序和生物信息學(xué)分析結(jié)果,將全長啟動子P1和3個5′端缺失啟動子(P2、P3、P4)分別與GUS基因融合構(gòu)建植物表達載體(圖1)。對重組質(zhì)粒進行PCR鑒定,結(jié)果與預(yù)期片段大小一致,P1、P2、P3以及P4的片段大小分別為2 692、2 180、1 762和1 281bp。表明4個植物表達載體構(gòu)建成功,分別命名為P1∷GUS、P2∷GUS、P3∷GUS 和 P4∷GUS(圖4)。
將重組質(zhì)粒P1∷GUS、P2∷GUS、P3∷GUS和P4∷GUS以及陽性對照質(zhì)粒35S∷GUS轉(zhuǎn)入發(fā)根農(nóng)桿菌ATCC15834,然后分別侵染虎杖葉片。暗培養(yǎng)1個月后,選取潮霉素抗性平板上生長良好的毛狀根,提取毛狀根基因組DNA并PCR檢測Hyg(圖5-A)和GUS(圖5-B)。野生型毛狀根均無特異基因擴增條帶,陽性對照35S∷GUS毛狀根能檢測出GUS和 Hyg,并 且 P1∷GUS、P2∷GUS、P3∷GUS和P4∷GUS毛狀根也均能檢測出GUS和Hyg,且Hyg實際大小為500 bp,GUS實際大小為1 080 bp,說明成功獲得轉(zhuǎn)基因毛狀根。
圖3 PcMYB1啟動子的分析Fig.3 Analysis of PcMYB1 promoter
表2 PcMYB1啟動子順式作用元件預(yù)測分析Table 2 PcMYB1 promoter cis-acting element prediction analysis
圖4 重組載體的PCR鑒定Fig.4 PCR identification of recombinant vectors
對轉(zhuǎn)基因毛狀根進行GUS染色,野生型毛狀根不能染成藍色,陽性對照35S∷GUS毛狀根呈藍色,P1∷GUS、P2∷GUS、P3∷GUS和 P4∷GUS毛狀根也均能染成藍色,但與陽性對照相比顏色較淺。證明全長啟動子P1(-2 884-+1)和3個5′端缺失啟動子 P2(-2 259-+1)、P3(-1 807-+1)、P4(-1 362-+1)均能驅(qū)動GUS報告基因的表達,但啟動活性都比CaMV35S啟動子的啟動活性弱(圖6)。
圖5 轉(zhuǎn)基因毛狀根的Hyg(A)和GUS(B)檢測Fig.5 Hyg (A) and GUS (B) detection of transgenic hairy roots
啟動子是研究基因功能的重要組成部分,通常包含多種不同的順式作用元件,與基因功能調(diào)節(jié)有關(guān)。目前,從藥用植物中克隆啟動子已有不少報道,如從黃花蒿(Artemisia annua L.)中克隆了乙醛脫氫酶(acetaldehyde dehydrogenase,ALDH)基因啟動子[9],從刺五加(Eleutherococcus senticosus)中克隆法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase,F(xiàn)PS)基因啟動子[10],從陽春砂(Amomum villousm)中克隆萜類合酶基因AvTPS1啟動子[11],從滇龍膽(Gentiana rigescens Franch.ex Hemsl.)中克隆環(huán)烯醚萜氧化酶(iridoid oxidase,CrIDO)基因的啟動子[12]。但是虎杖相關(guān)基因啟動子的克隆鮮有報道。本研究在前期獲得PcMYB1的cDNA序列的基礎(chǔ)上,利用hiTAIL-PCR成功獲得了PcMYB1啟動子序列。
圖6 轉(zhuǎn)基因毛狀根的GUS組織化學(xué)染色Fig.6 GUS histochemical staining of transgenic hairy roots
通過生物信息學(xué)分析,本研究克隆的PcMYB1啟動子具有CAAT-box和TATA-box等豐富的核心調(diào)控元件。并且PcMYB1啟動子在-1 021、-1 147和-1 808 bp處有3個茉莉酸甲酯響應(yīng)元件(CGTCA-motif),在-1 072和-2 713 bp處有2個茉莉酸甲酯響應(yīng)元件(TGACG-motif)。大豆GsMYB15啟動子含有茉莉酸甲酯響應(yīng)元件,該基因通過MeJA信號途徑對蟲害觸發(fā)的植物自身免疫反應(yīng)進行調(diào)控[13]。水稻萜類合成酶基因啟動子PRJA140含有多種茉莉酸甲酯響應(yīng)元件,對其啟動子活性分析表明該基因的表達不僅受茉莉酸甲酯誘導(dǎo),同時受白葉枯菌誘導(dǎo),可以用于水稻的抗性改良[14]。在蕎麥中,F(xiàn)tMYB13、FtMYB14、FtMYB15和 FtMYB16的表達均受茉莉酸甲酯誘導(dǎo),進而抑制蕎麥中的蘆丁生物合成[15]。本研究PcMYB1啟動子含有多個響應(yīng)MeJA的元件,但該基因啟動子是否存在茉莉酸甲酯調(diào)節(jié)機制有待深入研究。很多MYB轉(zhuǎn)錄因子的啟動子中含有光響應(yīng)元件,如荔枝LcMYB1[16]和葡萄VvMYBF1[17]啟動子含有多個光響應(yīng)元件,其啟動子活性受到光的誘導(dǎo),進而調(diào)控原花青素生物合成。PcMYB1啟動子中也存在數(shù)量較多的光反應(yīng)元件,推測該基因的表達可能受光的調(diào)控。前期實驗發(fā)現(xiàn)紫外照射處理可誘導(dǎo)虎杖葉片中PcMYB1的高表達[6],表明PcMYB1可能響應(yīng)紫外脅迫,但是PcMYB1響應(yīng)紫外機制還有待探究。啟動子序列中低溫反應(yīng)元件(LTR)與抗寒相關(guān)。麻風(fēng)樹(Jatropha curcas L.)的JcHKL1和JcHKL2啟動子包含LTR元件,低溫條件下能顯著提高麻風(fēng)樹的抗寒能力[18]。PcMYB1啟動子中也發(fā)現(xiàn)LTR元件,是否參與抗寒仍需試驗證明。
獲得PcMYB1的啟動子序列長為2 884 bp,PcMYB1啟動子包含多個保守元件。通過毛狀根遺傳轉(zhuǎn)化以及GUS組織化學(xué)染色證明PcMYB1啟動子具有啟動活性。