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        糞菌移植對慢加急性肝衰竭小鼠模型腸道菌群的影響

        2021-06-22 05:09:14徐玉靜陸圣威甘建和
        臨床肝膽病雜志 2021年6期
        關(guān)鍵詞:菌群失調(diào)肝細(xì)胞菌群

        高 安,徐玉靜,陸圣威,孫 蔚,甘建和

        蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院 感染科,江蘇 蘇州 215000

        慢加急性肝衰竭(ACLF)為慢性肝病基礎(chǔ)上,短期內(nèi)出現(xiàn)急性肝功能失代償和肝衰竭的表現(xiàn)[1]。ACLF會(huì)導(dǎo)致腸道菌群失調(diào)、腸屏障功能受損、免疫功能下降[2],越來越多的證據(jù)[3]說明慢性肝病與腸道菌群失調(diào)有關(guān)。近年來,腸道菌群在人體健康和疾病中起著至關(guān)重要的作用,并參與腸道內(nèi)外慢性疾病的病理生理學(xué)[4]。基于腸肝軸理論,推測改善菌群失調(diào)對ACLF有保護(hù)意義,本實(shí)驗(yàn)通過建立ACLF小鼠模型,研究ACLF小鼠腸道菌群變化及糞菌移植(fecal microbiota transplantation,F(xiàn)MT)對ACLF小鼠的安全性及保護(hù)作用。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 選用40只SPF級雄性C57BL/6小鼠,3~4周齡,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物生產(chǎn)許可證編號(hào)為SCXK(蘇)2018-0006。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物使用許可證編號(hào)為SYXK(蘇)2017-0042。實(shí)驗(yàn)墊料、飼料經(jīng)過輻照殺菌處理,飲用水經(jīng)高壓滅菌處理,符合SPF級動(dòng)物使用標(biāo)準(zhǔn),溫度(24±2) ℃,濕度55%,小鼠自由攝取飼料和飲用水,光照與黑暗各12 h循環(huán)。

        1.2 主要試劑 CCl4購自江蘇強(qiáng)盛功能化學(xué)股份有限公司,橄欖油購自國藥試劑網(wǎng),D-氨基半乳糖(D-GalN)與脂多糖(LPS) 購自美國Sigma公司。

        1.3 實(shí)驗(yàn)方法

        1.3.1 ACLF小鼠模型建立 將40只小鼠按隨機(jī)數(shù)字表法分為四組,每組10只。本研究采用CCl4聯(lián)合D-GalN和LPS建立ACLF模型[5-6]。正常組(CON組)作為正常對照組進(jìn)行觀察。模型組(MOD組)小鼠按5 ml/kg腹腔注射20% CCl4(橄欖油稀釋) ,2次/周,共12周,10 d后給予一次性腹腔聯(lián)合注射(LPS 0.5 mg/kg、D-Gal 400 mg/kg),建立ACLF模型,48 h后處死。糞菌移植組(FMT組)小鼠造模同MOD組,在第12周予以制備的正常組(CON組)小鼠糞菌液200 μl/只灌胃,持續(xù)3 d。模型小鼠糞菌移植組(ANFMT組)小鼠,在第12周予以制備的模型組(MOD組)小鼠糞菌液200 μl/只灌胃,持續(xù)3 d外。CON組小鼠給予腹腔注射同等劑量的橄欖油、生理鹽水,同等劑量生理鹽水灌胃。MOD組予以同等劑量生理鹽水灌胃。4組小鼠同時(shí)處死。

        1.3.2 標(biāo)本采集與糞菌液制作 糞便標(biāo)本采集采用刺激小鼠肛門的方法收集新鮮排出的小鼠糞便裝于EP管中,裝好的標(biāo)本迅速轉(zhuǎn)移至-80 ℃冰箱凍存。稱重后用無水乙醚麻醉,眼球取血放入采血管(含有肝素鋰),1500 r/min離心5 min,取上清液,-80 ℃冰箱保存。眼球取血后的小鼠頸椎脫臼處死后解剖,取出肝臟,每只小鼠在肝右葉同一位置切取2塊0.5 cm×0.5 cm×0.3 cm大小肝組織,放進(jìn)10%福爾馬林溶液,用于病理檢測。

        參照相關(guān)文獻(xiàn)制備糞菌液[7-8],具體步驟如下:(1)分別選取CON組和MOD組小鼠糞便;(2)稀釋,糞便稱重后放于攪拌器中,加入5倍糞便重量的無菌生理鹽水進(jìn)行攪拌混勻;(3)過濾,將糞便混懸液先后經(jīng)過直徑約1、0.5、0.25 mm的自制滅菌不銹鋼濾網(wǎng)過濾;(4)離心,將懸液用15 ml離心管分裝置于離心機(jī)中(2000 r/min、5 min),棄上清液;(5)洗滌,將菌液加生理鹽水至原懸液的量并搖勻,再次離心(2000 r/min、5 min)重復(fù)3次;(6)凍存。按照50 ml菌液加甘油(100%)5 ml的比例搖勻,分裝于2 ml凍存管中,放入-80 ℃冰箱。

        1.4 各項(xiàng)指標(biāo)檢測 肝功能指標(biāo):采用全自動(dòng)生化儀檢測ALT、AST水平。病理HE染色:肝組織在10%福爾馬林溶液中固定1 d后取出,進(jìn)行梯度濃度乙醇逐級脫水,二甲苯透明,并包埋在石蠟里,行組織切片及HE染色,最后中性樹膠封片,顯微鏡下觀察并拍照、保存。糞便腸道菌群檢測:糞便樣品按照試劑盒說明書提取DNA,將DNA樣品在Illumina NovaSeq平臺(tái)對小鼠糞便腸道菌群進(jìn)行高通量測序,獲得16SrDNA數(shù)據(jù)。構(gòu)建類OTU( Operational Taxonomic Units)表,獲得最終的feature特征表以及特征序列,進(jìn)一步進(jìn)行Venn圖、α多樣性分析、β多樣性分析、觀察在門、屬水平相對豐度較高的物種并進(jìn)行差異分析等。

        1.5 倫理學(xué)審查 本研究方案經(jīng)由蘇州大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物倫理委員會(huì)審批,批號(hào):SUDA20201208A03,符合實(shí)驗(yàn)室動(dòng)物管理與使用準(zhǔn)則。

        2 結(jié)果

        2.1 小鼠體質(zhì)量和肝功能的變化 4組小鼠體質(zhì)量變化如圖1所示,在進(jìn)行糞菌灌胃3 d內(nèi),ANFMT組與FMT組小鼠體質(zhì)量均下降。與CON組相比,MOD組小鼠體質(zhì)量顯著下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。MOD組與FMT組在CCl4腹腔注射及灌糞菌液期間均未出現(xiàn)小鼠死亡,在末次聯(lián)合注射LPS與D-GalN,MOD組死亡4只,F(xiàn)MT組死亡2只,2組病死率差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。與CON組相比,ANFMT組、MOD組、FMT組AST水平均顯著升高(P值均<0.05),MOD組ALT水平顯著升高(P<0.05)。與MOD組相比,F(xiàn)MT組AST、ALT均顯著下降(P<0.05)(表1)。

        表1 4組小鼠體質(zhì)量與肝功能水平比較

        圖1 4組小鼠體質(zhì)量變化

        2.2 小鼠肝組織病理結(jié)果 如圖2所示,CON組小鼠肝小葉形態(tài)結(jié)構(gòu)正常,肝細(xì)胞無變性、壞死,無炎性細(xì)胞浸潤;MOD組小鼠肝小葉結(jié)構(gòu)嚴(yán)重破壞,排列紊亂,肝細(xì)胞大片狀壞死并伴炎性細(xì)胞浸潤;與CON組相比,ANFMT組肝細(xì)胞腫脹,輕微氣球樣變,炎性浸潤增多;FMT組彌漫性肝細(xì)胞腫脹,明顯氣球樣變、壞死輕于MOD組。

        注:a,CON組;b,ANFMT組;c,MOD組;d,F(xiàn)MT組。圖2 各組小鼠肝組織病理(HE染色,×200)

        2.3 測序結(jié)果質(zhì)量分析

        2.3.1 feature分布Venn圖 基于各組樣本的OTU數(shù)量繪制了可直觀顯示差異的Venn圖。CON組有525個(gè)獨(dú)有的OTU,ANFMT組有718個(gè)獨(dú)有的OTU,MOD組有1360個(gè)獨(dú)有的OTU,F(xiàn)MT組有991個(gè)獨(dú)有的OTU(圖3a)。與CON組相比,MOD組有1701個(gè)獨(dú)有的OTU,ANFMT組有992個(gè)獨(dú)有的OTU,F(xiàn)MT組有1331個(gè)獨(dú)有的OTU(圖3b~d)。

        2.3.2 α多樣性分析 各樣本稀釋曲線均趨于平坦(圖4),表明本實(shí)驗(yàn)取樣量合理且物種組成豐富度高,可進(jìn)一步分析。α多樣性分析中observed_OTUs指數(shù)(χ2=1.42,P=0.70)、Shannon指數(shù)(χ2=1.71,P=0.63)、Simpson指數(shù)(χ2=1.25,P=0.74)在各組差異無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2.3.3 β多樣性分析 主成分分析(PCA)表明,與CON組相比,MOD組、FMT組、ANFMT組大鼠腸道菌群組成結(jié)構(gòu)均發(fā)生顯著變化(P<0.01)(圖5)?;赪eighted_UniFrac NMDS分析顯示,4組腸道菌群存在差異(P<0.01)(圖6)。主坐標(biāo)分析(PCoA分析)顯示,4組各樣本間距離較大,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)(圖7)?;赪eighted_Unifrac anosiom相似性分析:R=0.286,P=0.001;基于Weighted_Unifrac adonis多元分析:R2=0.263,P=0.02,表明組間差異大于組內(nèi)差異,4個(gè)不同分組樣品存在差異,可信度高。

        注: a,4組比較;b,CON組 vs ANFMT組;c,CON組 vs MOD組;d,CON組 vs FMT組。

        圖4 各組糞便菌群稀釋曲線圖

        圖5 4組腸道菌群PCA分析

        圖6 4組腸道菌群NMDS分析

        注: a,基于unweighted unifrac分析;b,基于 weighted unifrac分析。圖7 4組腸道菌群PCoA分析

        2.3.4 小鼠腸道菌群物種組成分析

        2.3.4.1 門水平腸道菌群結(jié)構(gòu)分析 基于門水平樣本物種組成結(jié)構(gòu)和差異性聚類分析發(fā)現(xiàn),小鼠糞便菌群組成以擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Fimicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)為主,Bacteroidetes和Fimicutes為主要優(yōu)勢菌群(圖8a)。在柱狀圖的基礎(chǔ)上,還可以根據(jù)樣品物種組成距離對樣品進(jìn)行聚類分析,采用Bray-Curtis距離,ANFMT組各菌門豐度雖與CON組相近,但菌門平均豐度上升或下降與MOD組相似;FMT組菌群較MOD組有一定程度的恢復(fù)(圖8b)。對同一生物學(xué)重復(fù)組內(nèi)取均值進(jìn)行熱圖繪制(圖9),門水平差異檢驗(yàn)顯示,與CON組相比,MOD組小鼠Verrucomicrobia上升,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);與CON組相比,ANFMT組小鼠未分類(unclassified)升高,Patescibacteria、脫鐵桿菌門(Deferribacteres)下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均<0.05);與MOD組相比,F(xiàn)MT組小鼠厚壁菌門(Fimicutes)下降,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。

        注: a,門水平柱狀圖; b,樣品聚類分析圖。圖8 四組菌群門水平分布情況

        注:與CON組相比,*P<0.05;與MOD組相比,#P<0.05;藍(lán)色表示豐度低,紅色表示豐度高。

        2.3.4.2 屬水平腸道菌群結(jié)構(gòu)分析 各組菌群菌屬相對豐度上存在明顯差異,且優(yōu)勢菌群發(fā)生變化。CON組中Muribaculaceae_unclassified、Dubosiella在腸道菌群中占比最高,MOD組中,Muribaculaceae_unclassified、鏈球菌屬(Streptococcus)阿克曼菌屬(Akkermansia)在腸道菌群中占比最高(圖10a)。聚類分析顯示,ANFMT組在菌屬水平豐度雖與CON組相近,各菌屬豐度變化較MOD組菌屬變化相似;FMT組菌群與MOD組比有一定程度的恢復(fù)(圖10b)。對同一生物學(xué)重復(fù)組內(nèi)取均值進(jìn)行熱圖繪制(圖11),屬水平差異檢驗(yàn)顯示,與CON組相比,ANFMT組小鼠unclassified、Faecalibaculum上升,Muribaculum、Candidatus_Saccharimonas、理研菌屬(Rikenella)、Odoribacter、Mucispirillum、Lachnospiraceae_unclassified下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均<0.05)。與CON組相比,MOD組小鼠Akkermansia屬、Erysipelatoclostridium上升,Dubosiella、Duncaniella下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均<0.05)。與MOD組相比,F(xiàn)MT組小鼠Paramuribaculum、嗜膽菌屬(Bilophila)上升,Rikenella、Absiella下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均<0.05)。

        2.3.5 各組菌群差異 LEfSe(LDA Effect Size)差異分析旨在找到不同組間豐度上有顯著性差異的物種。根據(jù)LDA值大小(LDA>4),在門屬水平上,MOD組中Fimicutes占優(yōu)勢;ANFMT組中Dubosiella占優(yōu)勢,CON組中奈瑟菌屬(Neisseria)占優(yōu)勢(圖12)。

        注: a,屬水平柱狀圖;b,樣品聚類分析圖。圖10 四組菌群屬水平分布情況

        注:與CON組相比,*P<0.05;與MOD組相比,#P<0.05。

        3 討論

        腸道微生物群定居于人類腸道,腸道細(xì)菌數(shù)量超過100萬億,其復(fù)雜基因組比人類基因組多150倍[9]。腸肝軸為腸道與肝臟之間形成解剖和功能上的緊密聯(lián)系。一方面細(xì)菌或代謝物進(jìn)入門靜脈血循環(huán),與免疫細(xì)胞相互作用,到達(dá)肝臟微循環(huán),與非實(shí)質(zhì)性和實(shí)質(zhì)性肝細(xì)胞相互作用。另一方面,肝臟還分泌膽汁酸,膽汁酸反過來改變腸道微生物群,同時(shí)也作為肝臟、腸道微生物群和腸道之間的信號(hào)分子[10]。

        目前,ACLF仍有較高的發(fā)病率與病死率。肝硬化患者一旦發(fā)生急性失代償,15%的住院患者將進(jìn)一步發(fā)展為ACLF,其中40%將在90天內(nèi)死亡[11]。Qin等[10]認(rèn)為健康對照者相比,肝硬化患者腸道微生物擬桿菌門與厚壁菌門水平降低,而鏈球菌屬和韋榮球菌屬升高,微生物群的變化是隨著肝硬化的發(fā)展而發(fā)生的。最近Bajaj等[12]的研究證實(shí)了腸道微生物與肝硬化之間的聯(lián)系,該研究表明,在1例嚴(yán)重肝硬化患者肝移植后,腸道微生物的多樣性和共生性顯著提高。在另一篇文獻(xiàn)中,Bajaj等[13]研究認(rèn)為通過飲食獲得的不同腸道微生物與肝硬化的進(jìn)展和住院風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。Chen等[2]發(fā)現(xiàn)腸道微生物組成變化與肝病的嚴(yán)重程度相關(guān),與ACLF患者發(fā)病前相比,ACLF患者擬桿菌門、瘤胃菌科、紫單胞菌科、毛螺旋菌科水平下降,而厚壁菌門水平上升。有足夠的證據(jù)[14-16]表明,微生物群的變化會(huì)影響肝病的進(jìn)展。

        由于人和鼠存在的異源性,本研究選取小鼠糞便作為糞菌群供體,而非人類糞便。結(jié)果顯示,在進(jìn)行糞菌移植時(shí),F(xiàn)MT組與ANFMT組小鼠體質(zhì)量均出現(xiàn)下降,可能與菌群定植反應(yīng)有關(guān);與CON組小鼠相比,MOD組小鼠體質(zhì)量明顯下降,肝細(xì)胞大片壞死,造模成功。FMT組小鼠腸道菌群改善,體質(zhì)量恢復(fù),ALT、AST明顯降低,肝細(xì)胞壞死減輕,從而進(jìn)一步說明了改善腸道菌群對ACLF小鼠具有保護(hù)作用。ANFMT組小鼠AST明顯升高,肝細(xì)胞輕微氣球樣變和炎性細(xì)胞浸潤,說明菌群紊亂導(dǎo)致肝損傷;而同時(shí)MOD組小鼠肝損傷引起菌群改變,可見肝臟與腸道菌群互為因果。

        Zhang等[17]研究發(fā)現(xiàn)因給予大腸桿菌、鼠傷寒上門氏菌和腸球菌出現(xiàn)菌群失調(diào)從而導(dǎo)致肝硬化大鼠細(xì)菌易位和AST水平顯著增高。LPS通過CD14、Toll-樣受體4、核因子κB和TNFα信號(hào)通路以及其他信號(hào)通路誘導(dǎo)肝細(xì)胞凋亡[18]。然而,LPS主要通過Kupffer細(xì)胞在肝臟中清除,因此肝衰竭直接導(dǎo)致的Kupffer細(xì)胞功能障礙可能導(dǎo)致血漿LPS異常。Kupffer細(xì)胞功能狀態(tài)與肝損傷程度之間存在相關(guān)性[19]。 當(dāng)肝功能受損時(shí),持續(xù)的免疫激活、炎癥、Kupffer細(xì)胞功能受損和不受控制的內(nèi)毒素血癥可引起活性氧(ROS)刺激[20-21]。由于內(nèi)毒素血癥、免疫功能紊亂和Toll樣受體4介導(dǎo)的炎癥,導(dǎo)致腸道細(xì)菌過度生長[22]??傊?,腸道菌群失調(diào)可通過以下機(jī)制加速ACLF的進(jìn)展[23-24]:(1)腸道通透性增加和腸道細(xì)菌易位增強(qiáng);(2)菌群失調(diào)的微生物促進(jìn)炎癥反應(yīng),導(dǎo)致了黏膜損傷。雖然腸道微生物在ACLF的發(fā)病機(jī)制和并發(fā)癥中的作用尚不完全清楚,但這些發(fā)現(xiàn)為通過調(diào)節(jié)腸道微生物來治療ACLF提供了希望。

        綜上所述,ACLF小鼠會(huì)出現(xiàn)腸道菌群失調(diào),而FMT可以調(diào)節(jié)腸道菌群,減輕肝損傷,對ACLF小鼠具有保護(hù)作用。干擾正常小鼠的腸道微生態(tài)后,菌群失調(diào)會(huì)進(jìn)一步導(dǎo)致肝損傷。

        利益沖突聲明:本研究不存在研究者、倫理委員會(huì)成員、受試者監(jiān)護(hù)人以及與公開研究成果有關(guān)的利益沖突。

        作者貢獻(xiàn)聲明:高安負(fù)責(zé)課題設(shè)計(jì),實(shí)施研究,資料分析,撰寫論文;徐玉靜、陸圣威參與收集及分析數(shù)據(jù);孫蔚負(fù)責(zé)擬定寫作思路,修改論文;甘建和負(fù)責(zé)指導(dǎo)撰寫文章并最后定稿。

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