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        利用流式細(xì)胞術(shù)檢測甜菜染色體倍性和DNAC-值

        2021-06-07 06:06:46董心久高衛(wèi)時(shí)瑪依拉玉素音楊洪澤
        新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年5期
        關(guān)鍵詞:四倍體二倍體細(xì)胞核

        沙 紅,高 燕,董心久,高衛(wèi)時(shí),瑪依拉·玉素音,楊洪澤

        (新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所,烏魯木齊 830091)

        0 引 言

        【研究意義】甜菜(Beta.vulgarisL.)屬于藜科(Chenopodiaceae)甜菜屬(BetaL.),2年生經(jīng)濟(jì)作物,是我國北方重要的產(chǎn)糖原料[1]。我國甜菜種質(zhì)多樣,主要有糖用、飼用、直接食用。糖用甜菜栽培品種多為在二倍體或四倍體,在育種過程中也會(huì)出現(xiàn)單倍體、三倍體,但是甜菜多倍體品種較二倍體品種具有更強(qiáng)的雜種優(yōu)勢。目前,我國糖用甜菜已進(jìn)入廣泛應(yīng)用多倍體雜種優(yōu)勢階段,生產(chǎn)上廣泛應(yīng)用的品種以三倍體雜交種為主[2]。在利用手中資源選育品種時(shí),及時(shí)、準(zhǔn)確了解掌握材料的倍性,有利于加快選育進(jìn)程、提高選育目標(biāo)性。流式細(xì)胞術(shù)(flow, cytometry, FCM)是一種能夠?qū)θ后w細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞水平的多個(gè)參數(shù)同時(shí)快速定量分析和分選的技術(shù),其在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用還有較大的發(fā)展空間[3]。流式細(xì)胞技術(shù)可以精準(zhǔn)地對(duì)鞘液中的熒光微粒進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),快速、準(zhǔn)確、簡便地檢測待測植物的倍性與細(xì)胞核DNA含量,并且非常適用于大樣本的檢測分析,是近年用來檢測染色體倍性的常用方法[4-6]。倍性水平的分析、鑒定對(duì)于植物分類及育種具有重要意義[5]。研究流式細(xì)胞術(shù)檢測甜菜染色體倍性和DNAC-值,對(duì)甜菜染色體倍性、分子生物學(xué)領(lǐng)域相關(guān)研究有實(shí)際意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】傳統(tǒng)的倍性鑒定多采用根尖、莖尖或花粉粒直接進(jìn)行染色體計(jì)數(shù)來判斷倍性,傳統(tǒng)染色體倍性鑒定技術(shù)需要專業(yè)技術(shù)人員具有相當(dāng)熟練的操作技能,過程復(fù)雜,耗時(shí)多[7,8]。李盛賢[9]在1988年報(bào)道過以掃描顯微光密度測定法對(duì)甜菜植株和種子有生殖力的多倍性進(jìn)行測定。董立[10]研究了甜菜染色體鏡檢的具體方法。魯文英[11]、魏良民[12]等利用甜菜葉片保衛(wèi)細(xì)胞中葉綠體個(gè)數(shù)或觀察氣孔性狀來判斷甜菜的倍性。但用甜菜葉片保衛(wèi)細(xì)胞中葉綠體個(gè)數(shù)或觀察氣孔性狀鑒定在糖用甜菜、飼用甜菜表現(xiàn)不一樣,判斷二倍體、四倍體的標(biāo)準(zhǔn)也不同,在材料選擇時(shí)容易混亂。同時(shí)測試材料取樣條件會(huì)受環(huán)境、植株自身狀態(tài)的影響。這些間接辦法過程復(fù)雜,耗時(shí)長,準(zhǔn)確性低。目前隨著科學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,流式細(xì)胞儀的使用越來越普及,采用流式細(xì)胞儀有效克服上述缺點(diǎn),能快速、簡單、準(zhǔn)確的測定甜菜種質(zhì)的倍性,尤其是在早期快速高效地鑒定、篩選出目標(biāo)倍性水平植株材料已用于相關(guān)育種應(yīng)用[13]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前國內(nèi)尚無關(guān)于利用流式細(xì)胞術(shù)鑒定甜菜染色體倍性和DNAC-值的檢測方法的研究報(bào)道。研究利用流式細(xì)胞儀測定分析不同倍性甜菜的染色體?!緮M解決的關(guān)鍵問題】以二倍體M39-8-4嫩葉為材料,以已知基因組的新疆野杏洛浦洪待克為外標(biāo),建立適合于甜菜染色體倍性和基因組的流式細(xì)胞術(shù)測定方法,為甜菜的基因組學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和種質(zhì)資源研究提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        甜菜品種: M39-8-4超原 (二倍體),02343劉福齊(二倍體),7208 伊抗褐(四倍體),需鑒定材料LSR88-5-1(二倍體或四倍體)均由新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所甜菜育種研究室提供。

        1.2 方 法

        1.2.1 解離液及 DNA 熒光染料的配制

        配制細(xì)胞核解離液,所有解離液均需用真空泵抽濾(0.22 μm 濾膜),去除大的顆粒、細(xì)菌等。預(yù)先配好的解離液均于4℃保存。核酸熒光染料是能插入雙鏈的碘化丙啶(propidium iodide, PI),用于裝備488 nm激光 。在解離液中PI染液的終濃度50 μg/mL。并在PI 染液中加入適量 RNA 酶,排除RNA 的干擾。PI染液配制方法參照田新民[14]。表1

        表1 常用細(xì)胞核解離液配方[5,7]

        1.2.2 細(xì)胞核懸浮液的制備

        避開主葉脈的選取葉片1.5~2 cm2,用蒸餾水沖洗2~3遍,再用去離子水沖洗2~3遍,濾紙吸干后放在清洗好的預(yù)冷培養(yǎng)皿中,加入解離液1.5 mL。將培養(yǎng)皿放在平整的冰袋上用刀片垂直、快速切碎后用200目濾膜過濾到1.5 mL離心管中, 4℃下孵育5~10 min,4℃1 000 r/min離心5 min,吸取上清棄之,在管中保留100 μL,再加入100 μL預(yù)冷的解離液。加入150 μL預(yù)冷的PI染料,輕輕混勻,在4℃下孵育10 min,上機(jī)待測。每個(gè)樣本獲得約250 μL細(xì)胞懸浮液。

        1.2.3 上機(jī)檢測

        流式細(xì)胞儀型號(hào)為 AccuriC6 (BD, 美國), 藍(lán)色激光488 nm激發(fā),接受通道為波長范圍在585/40 nm的FL2的熒光。每個(gè)樣本做3次平行試驗(yàn),每次至少收集1×104個(gè)顆粒。變異系數(shù)控制在5%以內(nèi)。

        1.3 數(shù)據(jù)處理

        FCM通過記錄樣品的 G1/G0 和G2/M 期細(xì)胞的熒光強(qiáng)度,反應(yīng)基于對(duì)照和樣品的G1/G0峰的熒光強(qiáng)度值來計(jì)算 2C DNA 含量。所有植物的單倍體 DNA含量,也以質(zhì)量值pg和Mb (1 pg=978 Mb)計(jì)算。未知樣品的倍性水平和 DNA 含量計(jì)算如下:待測樣本DNA含量(pg/Mb)=對(duì)照樣本 DNA 含量×(待測樣品 G0/G1 峰熒光均值)/(對(duì)照樣品G0/G1峰熒光均值)[7]。使用Cytometer software workspace 軟件直接讀取變異系數(shù)的、進(jìn)行DNA 含量和倍性數(shù)據(jù)進(jìn)行相應(yīng)分析。用Excel 2016 對(duì)數(shù)據(jù)做相關(guān)分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 細(xì)胞核解離液的篩選

        研究表明,用WPB解離液所制備的懸浮液上樣后不能形成峰值 ,其無法將甜菜嫩葉中細(xì)胞核完整釋放出來,收集細(xì)胞數(shù)少。Galbraith's、GP、LB01 、HEPES、MgSO4解離液有完整的峰,但峰幅較寬,在峰左右兩側(cè)出現(xiàn)背景碎片,有干擾峰出現(xiàn)。Marie's解離液制備甜菜嫩葉的細(xì)胞核解離液上樣后能形成左右對(duì)稱主峰,峰幅窄,CV值都在5%以下,上樣速率超過 200 events/μL,可重復(fù)性好,結(jié)果清晰、可靠。圖1

        圖1 檢測甜菜倍性及 DNA 含量

        2.2 檢測甜菜倍性

        A、B分別是已確定倍性的M39-8-4超原(二倍體)和7208伊抗褐(四倍體)2份材料。二倍體材料M39-8-4超原,CV值為1.94%小于5% ,G0/G1峰值的均值為295 175.98,數(shù)據(jù)可靠;已知四倍體7208伊抗褐,CV值為 1.69%,G0/G1 峰值的均值為631 946.40,數(shù)據(jù)可靠。7208伊抗褐的熒光通導(dǎo)值約為M39-8-4超原的2倍,且CV值均小于5%,可以認(rèn)為用Marie's作為流式細(xì)胞術(shù)的解離液檢測甜菜樣本倍體是可行的。待測材料 LSR88-5-1的G0/G1 峰值的均值為295 390.29,CV值為 1.52%,與二倍體材料M39-8-4超原的值很接近,熒光通導(dǎo)值約為四倍體7208伊抗褐的一半,LSR88-5-1材料為二倍體材料。表2,圖2

        注:A:M39-8-4超原; B:7208 伊抗褐; C:LSR88-5-1;D:洛浦洪待克

        2.3 檢測甜菜DNA值

        以新疆野杏洛浦洪待克為外標(biāo),分別測定二倍體甜菜懸浮液和新疆野杏洛浦洪待克懸浮液的熒光強(qiáng)度為300 000左右,新疆野杏洛浦洪待克熒光強(qiáng)度為110 000。研究表明,二倍體M39-8-4超原、02343劉福齊和LSR88-5-1的均值分別是295 175、320 335和295 390,DNA含量分別是821.88 Mb、 891.94 Mb和822.48 Mb。四倍體7208伊抗褐均值631 946, DNA含量1 759.59 Mb,是二倍體材料的約2倍。表2

        表2 利用流式細(xì)胞儀檢測甜菜倍性及DNA含量

        3 討 論

        FCM是通過流式細(xì)胞分析儀對(duì)大量處于分裂間期的細(xì)胞核內(nèi)DNA含量進(jìn)行檢測,經(jīng)儀器附設(shè)的計(jì)算機(jī)軟件統(tǒng)計(jì)分析,最后繪制出含量倍性的分布曲線圖,進(jìn)而推斷細(xì)胞的倍性[4-6]。具體是用G1期的DNA含量間接反映染色體倍性水平。用FCM一般可同時(shí)獲得植物細(xì)胞核DNA含量和倍性的數(shù)據(jù)。自1983年Galbraith運(yùn)用FCM測定了17種植物的細(xì)胞核DNA含量,流式細(xì)胞術(shù)越來越多利用在測定植物DNA含量和倍性上,如新疆野杏[7]、苜蓿[8]、梨樹[15]、棗和酸棗[16、17]、櫻屬[18]、鼠尾草[19]、草莓[20]等多種作物上開展。

        流失細(xì)胞術(shù)測定的細(xì)胞必須處于單細(xì)胞懸浮液狀態(tài),該技術(shù)關(guān)鍵在制備細(xì)胞核懸浮液和核酸熒光染色。如果細(xì)胞懸浮液制作不成功,會(huì)與未染色的陰性對(duì)照沒有顯著差別。不同植物的組織結(jié)構(gòu)和化學(xué)成分存在較大差異,不同細(xì)胞核提取緩沖液及酶解液對(duì)植物的提取效果也不相同,大量研究報(bào)道表明,目前還沒有一種通用的植物細(xì)胞核解離液[5]。如報(bào)道中WPB解離液更多用在木本植物上,但新疆野杏并不適用[7]。在不同物種應(yīng)用FCM時(shí),需要適當(dāng)改變緩沖液成分,從而獲得較高分辨率、提高結(jié)果的可靠性、穩(wěn)定性和可重復(fù)性。如果想要FCM檢測甜菜倍性和DNA含量,篩選適合甜菜幼嫩葉片的細(xì)胞核解離液十分必要。常用于木本植物解離液WPB完全不適合,沒有峰形成。使用 Galbraith's、GP、LB01 、HEPES、MgSO4核解離液時(shí),可以形成峰,但峰幅較寬,碎片較多,會(huì)形成干擾;Marie's細(xì)胞核解離液相對(duì)效果最好。與已發(fā)表其他植物相比,甜菜幼嫩葉片為材料時(shí)會(huì)多出一個(gè)較明顯的峰,其原因還需進(jìn)一步探討。試驗(yàn)中PI是一種目前相關(guān)DNA流式細(xì)胞術(shù)中普遍的熒光染料,用于裝備488 nm激光,能插入雙鏈DNA中。PI具有較高的分辨率及較低的毒性。這類染料除了能與雙鏈DNA結(jié)合,同樣也能與雙鏈RNA結(jié)合,在使用時(shí)同時(shí)加入了適量的RNAase。試驗(yàn)結(jié)果表明,加適量RNAase的50 μg/mL PI能作為探針。

        在利用FCM時(shí),一般要選著一個(gè)已知倍性或DNA-C值得作為參考,確定待測植物的倍性[21、22]。試驗(yàn)用FCM來檢測甜菜倍性和DNA含量。通過試驗(yàn)確定了FCM的適用性及其具體操作步驟、細(xì)胞核解離液及注意事項(xiàng)方法。因此,在試驗(yàn)時(shí)選擇了已明確倍性的、純度高的甜菜品系材料二倍體M39-8-4超原、02343劉福齊和四倍體7208伊抗褐和未知倍性LSR88-5-1的待測材料,同時(shí)選擇選取二倍體新疆野杏'洛浦洪待克'幼葉為外標(biāo)。試驗(yàn)結(jié)果能很好的區(qū)分甜菜二倍體和四倍體材料,數(shù)據(jù)重復(fù)性好、可靠。因試驗(yàn)材料的限制,沒對(duì)甜菜單倍體、三倍體進(jìn)行檢測。據(jù)耿小麗等[6]報(bào)道,利用FCM鑒定紫花苜?;ㄋ幱鷤M織的變異時(shí),能清晰的檢測出二倍體、三倍體、四倍體以及二倍體加四倍體的嵌合體。利用FCM檢測甜菜倍性對(duì)今后甜菜育種和遺傳學(xué)研究應(yīng)用很有意義。

        4 結(jié) 論

        Marie's是最佳的解離液,測定值變異系數(shù)均小于5.0%。甜菜幼嫩葉片可作為進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)檢測的理想材料,通過FCM檢測供試樣本可區(qū)分甜菜二倍體和四倍體,所測的二倍體DNA含量范圍為821~891 Mb/C,四倍體DNA 含量1 759 Mb/C。

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