旋凱昂, 張榮珍*, 饒俊超, 徐 巖
(1. 江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無(wú)錫214122;2. 江南大學(xué) 工業(yè)微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 無(wú)錫214122)
他汀類藥物即3-羥基-3 甲基戊二酰輔酶A(HMG-CoA)還原酶抑制劑是目前最暢銷的降脂類藥物,同時(shí)它也是治療動(dòng)脈粥樣硬化、冠心病、骨質(zhì)疏松癥、抗腫瘤和抗老年癡呆癥等多種疾病的藥物[1-3]。 其中阿托伐他汀鈣(利普妥)因其治療效果好且副作用小,銷量最好[4]。 他汀類藥物的生產(chǎn)可以通過將母體環(huán)部分和側(cè)鏈部分分開合成,然后以適當(dāng)方式鏈接在一起達(dá)到合成的目的,其中側(cè)鏈部分具有相似的結(jié)構(gòu),可由手性中間體進(jìn)行合成[5-6]。 藥物手性中間體的合成可有多種化學(xué)方法,但通常合成步驟多,且反應(yīng)條件苛刻,環(huán)境污染大。 在開拓藥物合成上,如果能實(shí)現(xiàn)縮短反應(yīng)合成步驟,且使反應(yīng)條件更溫和并減少環(huán)境污染,提供綠色可持續(xù)制備策略,這是研究者們努力研究的方向[7]。
近年來(lái),在他汀類藥物側(cè)鏈中間體的合成研究中, 利用2-脫氧-D-核糖-5-磷酸醛縮酶(DERA,EC 4.1.2.4)結(jié)合化學(xué)氧化法合成他汀類側(cè)鏈中間體的方法最為有效,其反應(yīng)過程步驟最少且原子利用率高[8-12]。 DERA 作為惟一的乙醛依賴型醛縮酶,能夠利用簡(jiǎn)單易獲取的乙醛和氯乙醛作為底物,進(jìn)行連續(xù)兩次羥醛加成反應(yīng),且不需要輔底物的添加就可催化生成產(chǎn)物(3R,5S)-6-氯-2,4,6-三脫氧吡喃己糖(CTeHP)。在此基礎(chǔ)上,可進(jìn)一步通過化學(xué)法被區(qū)域選擇性氧化獲得(3R,5S)-6-氯-2,4,6-三脫氧己內(nèi)酯(CTeHL)。 CTeHL 可作為合成阿托伐他汀側(cè)鏈部分的中間體[13],反應(yīng)過程見圖1。
關(guān)于DERA 參與反應(yīng)的研究報(bào)道,最早是發(fā)現(xiàn)來(lái)源于大腸桿菌Escherichia coli 的脫氧核糖醛縮酶能夠催化此反應(yīng)過程[14],但此野生型酶對(duì)醛類底物耐受性差,催化效率低。 近年來(lái),有報(bào)道發(fā)現(xiàn)來(lái)自其他微生物的DERA 催化此反應(yīng)的能力[15],如來(lái)源于Lactobacillus brevis 的DERA[16]。 而涉及立體選擇性氧化中間物CTeHP 形成目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 的反應(yīng)過程中,通常采用溴滴加氧化或次氯酸鈉和乙酸進(jìn)行選擇性氧化等化學(xué)方法[8,17]。然而利用生物酶法選擇性氧化的報(bào)道較少,目前僅有兩篇相關(guān)報(bào)道。 一個(gè)是來(lái)自大腸桿菌作為膜蛋白表達(dá)的吡咯喹啉醌PQQ 依賴型葡萄糖脫氫酶[18],另一個(gè)是來(lái)源于Lodderomyces elongisporus 菌的NADP+依賴型醇脫氫酶LeADH[19]。 但是關(guān)于串聯(lián)兩個(gè)反應(yīng)過程,即DERA 催化合成CTeHP 和醇脫氫酶催化合成CTeHL,利用生物偶聯(lián)的方法整合兩個(gè)催化反應(yīng),實(shí)現(xiàn)一步法催化合成終產(chǎn)物CTeHL 沒有相關(guān)報(bào)道。
圖1 阿托伐他汀側(cè)鏈中間體的合成反應(yīng)過程Fig. 1 Reaction synthesis of atorvastatin side-chain intermediate
通過分別構(gòu)建來(lái)自Streptococcus suis 的脫氧核糖醛縮酶SsDERA 和來(lái)自Lodderomyces elongisporus的醇脫氫酶LeADH 的重組質(zhì)粒, 共轉(zhuǎn)化于一個(gè)大腸桿菌BL21 細(xì)胞中, 生物偶聯(lián)兩個(gè)酶用于催化CTeHL 的合成反應(yīng)。 利用構(gòu)建的重組菌株全細(xì)胞酶串聯(lián)催化反應(yīng)合成路徑,實(shí)現(xiàn)直接從底物到終產(chǎn)物CTeHL 的合成過程,提供了一種綠色無(wú)污染的他汀類側(cè)鏈中間體CTeHL 的“一步”生物合成策略及產(chǎn)物鑒定的方法。
1.1.1 菌株及主要試劑 Escherichia coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞:Novagen 公司;蛋白胨和酵母粉:BD 公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖IPTG:寶生物工程(大連)有限公司(Takara);體積分?jǐn)?shù)40%乙醛與40%氯乙醛水溶液:國(guó)藥集團(tuán);工業(yè)級(jí)輔酶NADP+:貴州科奧德生物技術(shù)有限公司;其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.1.2 主要儀器與設(shè)備 超聲破碎儀VCX750:購(gòu)自美國(guó)Sonic 公司;蛋白質(zhì)電泳儀:購(gòu)自Bio-Rad 公司;TSQ8000 三重四級(jí)桿氣質(zhì)聯(lián)用儀: 購(gòu)自賽默飛世爾科技有限公司; 全數(shù)字化核磁共振波譜儀:購(gòu)自德國(guó)布魯克公司;旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀:購(gòu)自瑞士步琪公司; 超高效液相色譜-四級(jí)桿串聯(lián)飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用儀(型號(hào)X500R):購(gòu)自美國(guó)AB SCIEX 公司。
1.2.1 目標(biāo)基因的選取 目標(biāo)基因的序列是通過在美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)選取, 并分別確認(rèn)來(lái)自Streptococcus suis 菌株的脫氧核糖醛縮酶的序列 (GenBank ID:WP_002935276.1) 和來(lái)自Lodderomyces elongisporus 菌株的醇脫氫酶(GenBank ID:XP_001527075.1)的序列信息。
1.2.2 密碼子優(yōu)化和基因合成 所找尋的兩種酶的蛋白質(zhì)序列由無(wú)錫天霖生物技術(shù)有限公司合成,并對(duì)序列進(jìn)行密碼子優(yōu)化以適宜在E.coli 宿主菌中表達(dá)。SsDERA 的基因合成到質(zhì)粒載體pET28 上,獲得重組質(zhì)粒pET28-SsDERA,從5′-3′基因序列酶切位點(diǎn)分別為Bam H I 和Xho I;LeADH 的基因合成到質(zhì)粒載體pET21 上, 獲得重組質(zhì)粒pET21-LeADH, 從5′-3′基因序列酶切位點(diǎn)為Bam H I 和Xho I, 其中LeADH 目標(biāo)基因序列的終止密碼子TAA 去除。
1.3.1 目的菌株的構(gòu)建 兩重組質(zhì)粒pET28-SsDERA 和pET21-LeADH,分別包含不同的抗性基因,前者是卡那霉素抗性,后者為氨芐霉素抗性。 利用質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化的方法使兩個(gè)重組質(zhì)粒導(dǎo)入同一E.coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,能在含有卡那與氨芐的雙抗性固體培養(yǎng)平板上生長(zhǎng)的克隆為帶有兩個(gè)不同重組質(zhì)粒的目的菌株E. coli BL21/pET28-SsDERA/pET21-LeADH。
1.3.2 菌體的培養(yǎng)及蛋白質(zhì)表達(dá) 將重組菌E. coli BL21/pET28-SsDERA/pET21-LeADH 接種到含50 μg/mL 卡那霉素和100 μg/mL 氨芐霉素的LB 液體培養(yǎng)基中, 于37 ℃、200 r/min 振蕩培養(yǎng)8 h 后,轉(zhuǎn)接到1 L 相同培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至OD600為0.6~0.8,向培養(yǎng)基中加入終濃度為0.1 mmol/L 的IPTG,于25 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)10 h 后,收集菌體。 取收集后的菌體0.5 g 溶于10 mL 的100 mmol/L 磷酸鉀緩沖液中,超聲破碎,開2 s 停3 s,破碎后的菌體在4 ℃條件下,12 000 g 離心10 min,上清液與沉淀分開。 樣品經(jīng)處理后,分別用于9 g/dL 的SDS-PAGE 電泳檢測(cè)分析,確定兩個(gè)目的蛋白質(zhì)脫氧核糖醛縮酶和醇脫氫酶的可溶性表達(dá)情況。
1.4.1 全細(xì)胞催化反應(yīng)及產(chǎn)物前處理 將收集的菌體用生理鹽水洗滌,4 ℃下除去上清液, 重復(fù)3次,離心即獲得濕菌體,稱取0.8 g 的濕菌體用于生物催化反應(yīng)。
反應(yīng)體系:在10 mL 的100 mmol/L 磷酸鉀緩沖液 (pH 8.0) 中, 加入200 mmol/L 氯乙醛和400 mmol/L 乙醛, 然后加入200 mmol/L 的NADP+和0.8 g的E. coli BL21/pET28-SsDERA/pET21-LeADH 濕菌體,于30 ℃、200 r/min 條件下反應(yīng)16 h。
前處理過程: 反應(yīng)液于12 000 g 離心10 min,除去菌體后, 取上清液用10 mL 乙酸乙酯萃取3次,收集萃取液,加入無(wú)水Na2SO4除水靜置。
1.4.2 高分辨LC-MS 檢測(cè) 樣品前處理: 樣品溶于純甲醇溶劑中, 用0.22 μm 有機(jī)微孔濾膜過濾,備用。
液相條件: 色譜柱為Kinetex 2.6 μ C18 100A(100 mm×2.1 mm),流量為0.3 mL/min,柱溫40 ℃。流動(dòng)相A 為乙腈,B 為體積分?jǐn)?shù)0.1%甲酸水, 梯度為:0~1 min,98% B;1~6 min,98% B 到5% B;6~8 min,5% B;進(jìn)樣量為1 μL。
質(zhì)譜條件:離子源溫度為350 ℃,去簇電壓DP為80 V,碰撞能量為10 eV,正離子模式,掃描范圍100~1 500。
1.4.3 反應(yīng)體系pH 的優(yōu)化 反應(yīng)體系的緩沖溶液替換為不同pH 緩沖溶液,梯度設(shè)定為pH 值為6.0、6.5、7.0、7.5、8.0 的100 mmol/L 磷酸鉀緩沖液和pH值為8.5、9.0 的100 mmol/L Tris-HCl 緩沖液。 反應(yīng)體系按比例減小為2 mL, 經(jīng)反應(yīng)完成后按照1.4.1的方法分別進(jìn)行前處理, 通過氣相質(zhì)譜GC-MS 進(jìn)行產(chǎn)物含量對(duì)比分析,確定最適反應(yīng)pH[20]。
氣質(zhì)檢測(cè)條件: 柱子選用HP-5 非極性柱(30 m×250 mm×0.25 mm)。 1 μL 的進(jìn)樣量,分流比為19∶1,氮?dú)庾鳛檩d氣,壓力為100 KPa。 升溫程序設(shè)定為50 ℃保持5 min,以10 ℃/min 升溫至250 ℃(5 min),檢測(cè)器溫度為250 ℃。
在最適反應(yīng)pH 條件下, 重組菌株在2×10 mL催化反應(yīng)體系下按照方法1.4.1 處理, 萃取液樣品進(jìn)行旋蒸,得到的產(chǎn)物經(jīng)過硅膠色譜柱進(jìn)行樣品純化,制備獲得目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL。 其中,硅膠柱純化所用洗脫液為乙酸乙酯(EA)與石油醚(PE),VEA∶VPE=1∶3;硅膠板所用展開劑為VPE∶VEA∶V乙酸=20∶10∶1,顯色劑選用5%的硫酸乙醇溶液。 收集洗脫液,通過薄層色譜(TLC)硅膠板確定洗脫產(chǎn)物位置,并將得到的洗脫產(chǎn)物溶于氘代氯仿中,控制質(zhì)量濃度為40 mg/mL,進(jìn)行核磁共振(1H-NMR)鑒定,并計(jì)算反應(yīng)得到目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 的生成產(chǎn)率。
按照方法1.3.1, 將合成的兩個(gè)重組質(zhì)粒pET28-SsDERA 和pET21-LeADH 共轉(zhuǎn)化入同一感受態(tài)細(xì)胞中, 獲得目標(biāo)重組菌株E. coli BL21/pET28-SsDERA/pET21-LeADH。 按照1.3.2 的方法進(jìn)行重組菌株培養(yǎng), 收集的菌體溶解于緩沖液后,進(jìn)行細(xì)胞破碎。 離心收集破碎后的菌液,上清液與沉淀分開,分別經(jīng)過蛋白質(zhì)變性處理后,用于SDSPAGE 的分析,結(jié)果見圖2。 其中來(lái)自Streptococcus suis 的脫氧核糖醛縮酶理論蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量為22 970,來(lái)自Lodderomyces elongisporus 的醇脫氫酶理論蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量為37 340。 從圖2 蛋白質(zhì)條帶可以看到,電泳圖中兩條明顯的目的條帶與它們的理論相對(duì)分子質(zhì)量加上6×His 標(biāo)簽的蛋白質(zhì)大小一致, 說(shuō)明兩個(gè)蛋白質(zhì)SsDERA 和LeADH 均正確表達(dá),且表達(dá)量較高。 由此說(shuō)明,兩個(gè)酶均在共轉(zhuǎn)化大腸桿菌細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)了高效表達(dá),此重組菌株可進(jìn)一步應(yīng)用于生物催化反應(yīng)。
為了確定構(gòu)建的重組菌株是否具有 “一步”催化反應(yīng)過程的能力, 實(shí)現(xiàn)由底物乙醛與氯乙醛反應(yīng),直接合成得到目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL。 我們利用此重組菌株進(jìn)行全細(xì)胞催化反應(yīng),并對(duì)獲取的反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行分析檢測(cè)。 其中, 催化反應(yīng)體系按照方法1.4.1進(jìn)行操作。 反應(yīng)完成后的樣品經(jīng)過方法1.4.1 前處理過程,用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀除去乙酸乙酯溶劑,最終可以得到黃色油脂狀的產(chǎn)物,并對(duì)產(chǎn)物樣品進(jìn)行分析檢測(cè)。
圖2 重組蛋白質(zhì)SsDERA 和LeADH 表達(dá)SDS-PAGE 分析Fig. 2 SDS-PAGE analysis of recombinant SsDERAand LeADH expression
由于沒有市售的標(biāo)準(zhǔn)品用于比對(duì),需建立確定目標(biāo)產(chǎn)物的檢測(cè)方法。 在獲得黃色油脂狀粗產(chǎn)物后,為確認(rèn)其是否含有CTeHL,稱取部分樣品按照方法1.4.2 前處理后,經(jīng)由LC-MS 分析檢測(cè)。 其中液相質(zhì)譜的檢測(cè)條件設(shè)定按照方法1.4.2 所示,經(jīng)分析處理后, 物質(zhì)檢測(cè)結(jié)果見圖3。 目標(biāo)產(chǎn)物(3R,5S)-6-氯-2,4,6-三脫氧己內(nèi)酯(C6H9ClO3),單一同位素的理論質(zhì)荷比(m/z)為164.024 0,加H+峰的質(zhì)荷比為165.031 3, 實(shí)測(cè)結(jié)果為165.031 4, 結(jié)果一致。 由此可以確認(rèn)粗產(chǎn)物中含有目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL,其物質(zhì)結(jié)構(gòu)還需進(jìn)一步檢測(cè)。
在生物催化反應(yīng)中, 反應(yīng)體系的pH 影響酶的催化反應(yīng)效率。 有研究報(bào)道稱目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 在pH 值大于8.0 的溶液條件下,其穩(wěn)定性不強(qiáng)[19]。 為了進(jìn)一步測(cè)定在全細(xì)胞催化反應(yīng)體系下重組菌株的最適反應(yīng)pH, 選擇在pH 6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0 梯度條件下進(jìn)行測(cè)定。
在不同的pH 緩沖液中, 反應(yīng)樣品按照方法1.4.3 進(jìn)行催化反應(yīng)。由于目標(biāo)產(chǎn)物沒有標(biāo)準(zhǔn)品用來(lái)進(jìn)行定量分析,通過利用萃取產(chǎn)物在氣相質(zhì)譜測(cè)定下產(chǎn)物的碎片離子峰結(jié)果與相關(guān)研究報(bào)道文章[21]中CTeHL 的分析結(jié)果進(jìn)行比對(duì),確定結(jié)果一致,并最終確定目標(biāo)產(chǎn)物出峰時(shí)間和位置。 氣相質(zhì)譜的檢測(cè)條件按照方法1.4.3 設(shè)置,GC-MS 圖譜結(jié)果見圖4。其中18.62 min 的出峰位置為目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 的出峰位置。 在控制樣品處理過程和檢測(cè)進(jìn)樣量相同的條件下, 通過對(duì)不同pH 反應(yīng)液樣品中目標(biāo)產(chǎn)物出峰位置的峰面積比來(lái)進(jìn)行比較,確定全細(xì)胞催化反應(yīng)體系下的最適pH。 通過結(jié)果分析計(jì)算,在不同pH 緩沖液條件下, 得到的重組菌株催化效能相對(duì)百分比見圖5。
圖3 質(zhì)譜分析結(jié)果Fig. 3 Mass spectrometryanalysis
圖4 粗產(chǎn)物氣質(zhì)聯(lián)用圖譜Fig. 4 GC-MS of crude product
在pH 7.5 的緩沖體系下,重組菌株反應(yīng)催化生成目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 的產(chǎn)率是最高的。
圖5 不同pH 緩沖液下重組菌株催化效能相對(duì)百分比Fig. 5 Relative percentage of catalytic efficiency of the recombinant strain under different pH buffers
在利用液相質(zhì)譜聯(lián)用儀確定了合成得到的黃色油脂狀粗產(chǎn)物物質(zhì)中含有目標(biāo)產(chǎn)物相對(duì)分子質(zhì)量后,為了進(jìn)一步確認(rèn)產(chǎn)物結(jié)構(gòu)是否正確,我們利用硅膠柱層析色譜分離的方法對(duì)粗產(chǎn)物進(jìn)行純化,進(jìn)而對(duì)制備純化得到的物質(zhì)用氫譜(1H-NMR)進(jìn)行產(chǎn)物鑒定。 確認(rèn)重組菌株全細(xì)胞催化反應(yīng)條件下最適緩沖體系pH 7.5 后, 在最適反應(yīng)緩沖體系條件下,按照方法1.5 進(jìn)行合成反應(yīng),反應(yīng)液處理后得到的粗產(chǎn)物同樣按照方法1.5 用于硅膠柱純化制備目標(biāo)產(chǎn)物,洗脫樣品薄層色譜(TLC)點(diǎn)板的結(jié)果見圖6。 收集得到的洗脫樣品,旋蒸除去溶劑后,得到目標(biāo)樣品。取部分樣品溶于氘代氯仿中,進(jìn)行1H-NMR鑒定,結(jié)果確定分離得到的目標(biāo)樣品就是(3R,5S)-6-氯-2,4,6-三脫氧己內(nèi)酯。 最終,分離得到的樣品質(zhì)量為162.95 mg, 理論上底物全部轉(zhuǎn)化完全應(yīng)得到662.40 mg, 因此重組菌株在pH 7.5 緩沖液反應(yīng)體系下催化得到目標(biāo)產(chǎn)物CTeHL 的產(chǎn)率為24.6%。CTeHL 氫譜結(jié)果為:1H-NMR(400 MHz)CDCl3δ 為1.98~2.04(m,1H),2.62(d,2H),3.01(d,1H),3.59~3.74(dd,2H),4.39(d,1H),4.90~4.96(m,1H)。
圖6 TLC 產(chǎn)物分析結(jié)果Fig. 6 TLC product analysis
采用生物偶聯(lián)法,把兩個(gè)分別攜帶有不同基因的重組質(zhì)粒pET28-SsDERA 和pET-21-LeADH 導(dǎo)入同一感受態(tài)E.coli BL21 細(xì)胞中, 構(gòu)建重組菌株E. coli BL21/pET28 -SsDERA/pET21 -LeADH。SsDERA 催化的反應(yīng)過程存在反應(yīng)平衡,LeADH 的參與反應(yīng)有助于推動(dòng)反應(yīng)平衡向目標(biāo)終產(chǎn)物合成的方向移動(dòng),提高底物的轉(zhuǎn)化率和產(chǎn)物合成率。 以兩種酶共表達(dá)的重組菌株為生物催化劑,串聯(lián)催化整個(gè)反應(yīng)過程,實(shí)現(xiàn)了重組菌株“一步”催化底物乙醛與氯乙醛,直接生成得到他汀類藥物側(cè)鏈中間體(3R,5S)-6-氯-2,4,6-三脫氧己內(nèi)酯的生物合成方法并鑒定了目標(biāo)產(chǎn)物。 對(duì)利用生物偶聯(lián)法完全合成他汀類藥物側(cè)鏈中間體進(jìn)行了探索性的研究,為進(jìn)一步相關(guān)研究提供了借鑒。