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        遵義地區(qū)肺結核合并糖尿病患者發(fā)生利福平耐藥的基因突變研究

        2021-05-17 06:57:34徐小溪陳云華龔亞東
        現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生 2021年9期
        關鍵詞:基因突變耐藥檢測

        徐小溪,陳云華,陶 雪,唐 竹,龔亞東,林 牧

        (貴州航天醫(yī)院,貴州 遵義 563000)

        肺結核(TB)與糖尿病(DM)均是常見的慢性疾病,兩者并發(fā)時可相互影響,加重病情[1]。TB使DM患者的糖代謝紊亂加重,血糖水平不易控制;DM的糖代謝紊亂又易引發(fā)蛋白質和脂肪的代謝障礙,增加血液和組織內含糖量、降低血清蛋白、增高血脂水平等,進而降低免疫功能,使TB患者病情惡化[2-3]。加之日益遞增的耐藥結核患者,增大了疾病防控和治療的難度[4]。

        WHO統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,2018年全球48.4萬例利福平(RIF)耐藥結核病患者中,中國占14%,位居全世界第二[5]。而貴州省為我國結核病高發(fā)地區(qū),發(fā)病率居全國第四,耐藥率居全國第一;主要集中在遵義、畢節(jié)、銅仁和黔東南等地區(qū)[6]。RIF作為抗結核治療方案中關鍵的一線藥物,在結核病的治療中一直具有重要作用,這與RIF的作用靶點RNA聚合酶 β 亞單位所編碼的 rpoB 基因突變有關[7-8]。本研究選取遵義市區(qū)的TB患者,應用聚合酶鏈式反應(PCR)檢測結核分枝桿菌(MTB)-DNA和MTB-RNA,以及rpoB 中包含RIF耐藥性決定區(qū)的部分基因[9],探究遵義地區(qū)TB患者和DM合并TB患者結核分枝桿菌 rpoB 基因的突變與RIF耐藥之間的相關性,以明確遵義地區(qū)MTB RIF耐藥的分子生物學特征。

        1 資料與方法

        1.1資料

        1.1.1一般資料 本研究收集2017年12月至2019年7月于本院呼吸與重癥醫(yī)學科就診的763例TB患者的痰液或沖洗液標本,采用MTB-DNA、MTB-RNA和抗酸染色檢測。排除31例重復檢測者,余結果均為陽性者行RIF耐藥基因檢測,比較TB患者(525例)與TB合并DM患者(207例)發(fā)生RIF耐藥的相關性,同時搜集納入患者相關臨床資料。TB及DM分別依據(jù)《WS 288-2017肺結核診斷》及美國糖尿病協(xié)會(ADA)制定的《糖尿病診治指南》標準確診,見表1。

        表1 TB及DM診斷標準

        1.1.2主要儀器和試劑 宏石SLAN-96P熒光定量PCR儀、ABI-2710核酸擴增儀、天隆TL988熒光定量PCR儀等;MTB-DNA檢測試劑盒(PCR-熒光探針法)由成都博奧晶芯生物科技有限公司提供;MTB-RNA檢測試劑盒(RNA恒溫擴增)由上海仁度生物科技有限公司提供;MTB RIF耐藥基因檢測試劑盒(PCR-反向點雜交法)由亞能生物技術(深圳)有限公司提供。

        1.2方法

        1.2.1MTB-DNA和MTB-RNA檢測

        1.2.1.1MTB-DNA和MTB-RNA提取 在患者痰液或支氣管灌洗液標本中加入等體積的氫氧化鈉(濃度為4%),震蕩混勻后靜置15 min以充分液化;12 000 r/min離心10 min后棄上清液,加入1 mL清洗液(主要成分為生理鹽水)混勻后12 000 r/min離心5 min后棄上清液。將沉淀分為兩管,分別加入50 μL核酸提取液(用以提取DNA)和50 μL稀釋液(用以提取RNA),超聲裂解10 min后,DNA提取管置于震蕩金屬浴中,100 ℃伴1 800 r/min震蕩10 min后12 000 r/min離心5 min,RNA提取管直接12 000 r/min離心5 min,棄上清液。

        1.2.1.2MTB-DNA和MTB-RNA檢測方法 MTB-DNA PCR反應體系共20 μL,由探針、Taq酶、引物等共18 μL和模板2 μL構成;擴增程序為37 ℃ 300 s和94 ℃ 180 s一次循環(huán);94 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s 經(jīng)40個循環(huán);50 ℃ 10 s單次循環(huán)。MTB-RNA PCR反應體系共32 μL,由探針、反轉錄酶、引物等共30 μL和模板2 μL構成;擴增程序為42 ℃ 60 s 40個循環(huán)恒溫擴增。結果判讀均為陽性者,留取DNA擴增產(chǎn)物于-20 ℃冰箱保存。

        1.2.2抗酸染色 實驗由本院檢驗科完成。統(tǒng)計MTB-DNA和MTB-RNA陽性者名單,比對抗酸染色結果亦為陽性者,搜集以上患者相關臨床信息。

        1.2.3血糖測定 檢測納入患者任意時間血糖和FPG,依據(jù)表1的診斷標準,分為單純TB組和TB合并DM組。

        1.2.4PCR-反向點雜交

        1.2.4.1PCR擴增 反應體系共25 μL,由dNTP、Taq酶、引物等共21 μL和模板DNA 4 μL構成;擴增程序為50 ℃ 120 s和94 ℃ 600 s一次循環(huán);95 ℃ 45 s,68 ℃ 60 s 經(jīng)30個循環(huán);95 ℃ 30 s,54 ℃ 30 s,68 ℃ 60 s經(jīng)30個循環(huán);68 ℃ 600 s單次循環(huán)。RIF耐藥性檢測基因突變位點見表2。

        表2 rpoB基因突變位點

        1.2.4.2雜交和顯色 將膜條編號并放入含PCR擴增產(chǎn)物緩沖液的15 mL離心管中。100 ℃ 10 min、59 ℃ 90 min后將膜條放入含枸櫞酸鈉緩沖液的50 mL離心管中,59 ℃ 輕搖洗滌15 min。將膜條放入含辣根過氧化物酶的顯色液中10 min,觀察相應顯色點后判讀rpoB基因突變情況。

        2 結 果

        2.1相關因素分析 TB組發(fā)生RIF耐藥患者52例,其中22例伴低蛋白敗血癥,30例血尿酸水平升高;TB合并DM組發(fā)生耐藥患者29例,其中16例伴低蛋白敗血癥,15例血尿酸水平升高。對比耐藥TB、TB合并DM患者的性別、年齡、職業(yè)等因素和血清清蛋白等檢測結果,發(fā)現(xiàn)40~<65歲患者較其他年齡段更易發(fā)生TB合并DM,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),各組其余因素組間比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表3。

        表3 RIF耐藥患者的一般情況[n(%)]

        2.2PCR-反向點雜交檢測結果 rpoB基因檢測 732例TB患者,其中RIF耐藥TB患者52例,RIF耐藥TB合并DM患者29例。

        2.3耐藥基因rpoB突變位點分布 兩組患者發(fā)生突變的位點無明顯差異,TB合并DM組患者中有13例發(fā)生ropB531位點突變(突變率為44.83%),有15例發(fā)生ropBS531L位點突變(突變率為51.72%);TB組中有30例發(fā)生ropB531位點突變(突變率為57.69%),有31例發(fā)生ropBS531L位點突變(突變率為59.62%)。TB合并DM組患者ropBS531L、ropB531位點突變率均低于TB組,但差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。且兩組均存在ropB531和ropBS531L兩位點相伴突變。見圖1。

        圖1 兩組患者耐藥基因rpoB位點突變情況

        3 討 論

        隨著人們生活方式和飲食結構的改變,TB合并DM的發(fā)生率逐年提高,不僅增強機體分解代謝、引起食欲下降、影響胰腺的分泌功能,而且糖代謝異常易引起蛋白質和脂肪的代謝失調,導致營養(yǎng)不良和細胞免疫功能下降,進而加重病情[10-11]。若再發(fā)生RIF耐藥,將嚴重影響患者的治療,不僅增加了治療的難度和費用,而且病情難以控制,導致治愈率降低和病死率升高[12]。故早期確診耐藥結核是提高療效的關鍵。相較培養(yǎng)法,采用分子生物學方法檢測RIF的耐藥位點突變,能很好地解決時效性問題,且RIF耐藥分子機制比較明確,檢測結果準確可靠。

        本研究通過763例TB患者痰液或沖洗液標本的MTB-DNA、MTB-RNA和抗酸染色檢測,結果均為陽性者行RIF耐藥基因檢測,TB患者525例,其中RIF耐藥52例,TB合并DM患者207例,其中RIF耐藥29例?;蛲蛔兾稽c均以ropBS531L和ropB531多見,且兩位點幾乎相伴突變,與國內外的報道相符[13]。本研究中TB組ropB531位點突變率(57.69%)高于福建省(53.3%)、四川省(55.87%),低于廣東省(63.22%)及廣西壯族自治區(qū)(59.26%),印證了rpoB基因突變的發(fā)生頻率有明顯的地域差異[14-15],不同國家和地區(qū)的基因突變頻率呈現(xiàn)出不同差異[16],可能與當?shù)豈TB的進化有關,同時證明了RIF耐藥機制的發(fā)生與ropB基因突變有關。本研究首次統(tǒng)計了遵義地區(qū)TB合并DM患者發(fā)生RIF耐藥的突變位點,主要以ropBS531L(51.72%)和ropB531(44.83%)為主,且相應位點的突變率低于單純TB患者[ropBS531L(59.62%)和ropB531(57.69%)],但差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05),可能與樣本量較少有關。

        本研究還搜集了納入患者相關臨床資料,以分析其與耐多藥MTB感染間的相關性。發(fā)現(xiàn)40~<65歲年齡區(qū)間更易發(fā)生TB合并DM,這可能與DM高發(fā)人群的年齡常分布于此區(qū)間有關[17]。同時發(fā)現(xiàn)與單純TB患者相比,TB合并DM患者的血清清蛋白水平略有下降,這可能與TB合并DM患者不能充分利用葡萄糖,需分解蛋白質和脂肪提供熱量,使機體清蛋白合成減少有關[18]。但因本研究樣本量有限,相關結果無統(tǒng)計學意義,仍需擴大樣本量做進一步研究。

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