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        肝硬化患者血漿cfDNA中TERT熱點突變率研究

        2021-04-23 04:38:42薛曉霞何美琳梁國威
        中國實驗診斷學(xué) 2021年4期
        關(guān)鍵詞:檢測研究

        薛曉霞,何美琳,梁國威*

        (1.北京大學(xué)航天臨床醫(yī)學(xué)院 檢驗科,北京100049;2.航天中心醫(yī)院 檢驗科,北京100049)

        端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT)啟動子區(qū)-124bp C/T和-146bp C/T突變是多種自我更新率較低的組織來源的腫瘤突變驅(qū)動基因[1-4],其在肝細胞性肝癌(HCC)中的突變率在60%左右,而在肝硬化中突變率為6%-19%,是肝硬化向HCC轉(zhuǎn)化過程中的最早和唯一的癌變突變驅(qū)動基因[5]。目前,該熱點突變已成為肝硬化患者早期癌變的研究靶點。

        目前,肝硬化患者組織活檢依從性差,難以獲得滿意的組織標本[6]。循環(huán)游離DNA(cfDNA)作為“液體活檢”標本,在肝硬化患者中TERT熱點突變的檢出率為8.6%左右[7],而在肝硬化患者隨訪、監(jiān)測TERT突變的研究中顯示,患者癌變前后TERT熱點突變也由陰性轉(zhuǎn)為陽性[8],提示檢測cfDNA中TERT熱點突變對于監(jiān)測肝硬化患者是否早期發(fā)生癌變具有重要的臨床應(yīng)用價值。

        目前,關(guān)于肝硬化患者cfDNA中測定TERT熱點突變的相關(guān)研究較少[5,7-8],相關(guān)研究有待于進一步完善。本研究在80例肝硬化患者cfDNA中檢測TERT基因-124bp C/T和-146bp C/T熱點突變,旨在進一步明確肝硬化患者TERT熱點突變的發(fā)生率及其突變與肝硬化患者臨床基本資料的相關(guān)性。

        1 材料與方法

        1.1 研究對象

        收集航天中心醫(yī)院2019年10月-2020年11月確診肝硬化患者80例,其中男性40例,女性40例,年齡范圍33-94歲,平均年齡66.4±16.1歲。納入標準:根據(jù)Child-Pugh肝功評分(A、B、C級),結(jié)合患者出現(xiàn)腹水、肝性腦病及門脈高壓引起的食管、胃底靜脈明顯曲張或破裂出血,臨床明確診斷肝硬化患者。排除標準:排除各種疑似或明確診斷原發(fā)性肝癌或肝轉(zhuǎn)移癌患者和除肝癌外疑似或明確診斷的各種腫瘤患者。納入研究者簽署知情同意書,本研究通過航天中心醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會審查(項目批號:20190830-YN-01)。

        1.2 方法

        收集研究對象的基礎(chǔ)資料,包括性別、年齡,有無腹水和臨床肝性腦病診斷。檢測肝功(TBiL、ALB、ALT和AST)、凝血指標(PT、PTA、APTT)、腫瘤標志物(AFP、CEA、CA199)、病毒性肝炎指標(HBV兩對半、HCV抗體)。其中肝功指標采用AU 2700全自動生化分析儀檢測(貝克曼庫爾特,美國)、凝血指標采用top2全自動凝血分析儀(貝克曼庫爾特,美國),由公司提供配套試劑。腫瘤標志物和病毒性肝炎指標采用美國雅培公司 i2000 免疫分析儀進行檢測,由雅培公司提供配套試劑。

        1.3 外周血cfDNA提取

        留取2 h內(nèi)EDTA抗凝外周全血3 mL,4℃、2 000×g離心10 min, 吸出的血漿層再次4℃、16 000×g 離心10 min后,留取500 μL血漿后,采用天根生化科技(北京)有限公司的磁珠法血清/血漿游離DNA提取試劑盒(目錄號:DP709)提取cfDNA,按試劑盒說明操作,洗脫體積35 μL,-80℃保存待測。

        1.4 cfDNA中TERT熱點突變率檢測

        采用2步PCR擴增法檢測TERT熱點突變,首先,采用普通PCR富集cfDNA模板(引物及反應(yīng)條件見表1),擴增產(chǎn)物純化后稀釋1000倍作為模板進行突變率檢測;第二步采用擴增阻滯原理結(jié)合熒光定量PCR(ARMS-qPCR)檢測突變率(引物及反應(yīng)條件見表1),即采用ARMS-qPCR和內(nèi)參-qPCR分別同時檢測待測樣本,根據(jù)5套突變率標準品測得的循環(huán)閾值(Ct值)的平均值,以Lg突變率對應(yīng)ΔΔCt值,分別建立-124(C/T)和-146(C/T)的突變率標準曲線。其中,ΔΔCt值=ΔCt值待測標本-ΔCt值100%M;ΔCt值待測標本=待測標本ARMS-qPCR的Ct值 - 待測標本內(nèi)參-qPCR的Ct值,ΔCt值100%M=100%突變標準品ARMS-qPCR的Ct值-100%突變標準品內(nèi)參-qPCR的Ct值。突變率回歸曲線分別為:-124M%=10(1.979-0.272×ΔΔCt值),-146M%=10(1.993-0.258×ΔΔCt值)。采用所建方法測定30例表觀健康人結(jié)果顯示,-124(C/T)和-146(C/T)突變率檢測下限皆為0.05%(方法學(xué)評價具體數(shù)據(jù)未列出)。

        1.5 統(tǒng)計學(xué)處理

        2 結(jié)果

        2.1 研究對象的基本資料

        80例肝硬化患者中, TBiL、DBiL、TP、AST、PT、PTA、APTT、AFP、CEA、CA199在男、女性之間無顯著性差異(P>0.05),而年齡、ALT水平在男、女性之間有顯著性差異(P<0.05),見表2。

        表1 ARMS-qPCR方法測定TERT熱點突變的引物和探針序列

        表2 80例肝硬化患者基本資料

        2.2 80例肝硬化患者血漿cfDNA標本TERT突變率檢測結(jié)果

        采用所建方法對80例肝硬化患者cfDNA中TERT突變進行檢測,結(jié)果顯示TERT基因突變陽性有6(7.5%)例,其中-124bp位點突變4例(5%),突變率分別為0.13%、0.27%、0.46%和0.52%;-146bp位點2例(2.5%),突變率分別為1.92%和2.77%。

        2.3 TERT陽性病例基礎(chǔ)資料比較

        TERT突變與臨床基本資料統(tǒng)計結(jié)果顯示,與TERT未突變組比較,TERT突變(-124bp和-146bp,6例)陽性組患者的血清ALB水平顯著降低,CA199水平顯著增高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。而與年齡、性別、有無HBV感染、HCV感染、肝功指標(TBiL、TP、ALT和AST)、凝血常規(guī)指標(PT、PTA、APTT)、腫瘤標志物(AFP、CEA)和Child-Pugh分級均沒有統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。

        3 討論

        本研究采用ARMS-qPCR方法,在80例肝硬化患者cfDNA中檢測到-124位點突變4例(5%),-146位點突變2例(2.5%),總計突變率為6例(7.5%)。進一步分析顯示TERT突變陽性組患者的血清ALB水平顯著低于非突變組,CA199水平顯著高于非突變組,而與其他臨床基礎(chǔ)資料和檢測指標無顯著相關(guān)性。

        TERT是肝硬化患者中發(fā)生HCC風(fēng)險的癌前病變的新生生物標志物。研究表明,在肝硬化向肝癌的惡性轉(zhuǎn)變過程中,TERT的突變發(fā)生率逐漸增加。在病理組織標本的研究顯示,低級別分化不良性結(jié)節(jié)、高級別分化不良性結(jié)節(jié)和早期HCC中分別檢測到TERT突變率是6%、19%和61%[5],而在cfDNA中檢測到TERT的突變率為8.6%左右[7]。本研究檢測肝硬化患者cfDNA中TERT基因突變率為7.50%,提示檢測肝硬化患者cfDNA中TERT熱點突變或可監(jiān)測肝硬化患者的早期癌變。

        最新研究顯示,在對肝硬化患者進行跟蹤隨訪時,發(fā)現(xiàn)肝硬化患者在癌變后-124位點突變轉(zhuǎn)呈陽性[8],說明TERT在肝硬化向HCC轉(zhuǎn)變的早期監(jiān)測中具有重要的臨床意義。流調(diào)資料顯示,肝硬化患者年癌變率2%-5%[9],結(jié)合本研究和以往研究[7]在cfDNA中檢測到TERT突變率為7.5%和8.6%,兩者發(fā)生率基本一致,進一步提示在肝硬化患者cfDNA中監(jiān)測TERT基因突變必要性和重要性。

        本研究TERT突變陽性患者中,血清ALB水平顯著降低,CA199水平顯著升高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);而Child-Pugh評分、TBiL、DBiL、TP、ALT、AST、PT、PTA、APTT、AFP、CEA與TERT陰性患者之間雖存在差異,差異未見顯著相關(guān)性(P>0.05),這可能是由于陽性樣本總體偏少所致,有待于進一步深入研究。

        綜上所述,本研究在肝硬化患者cfDNA中檢測到TERT突變率發(fā)生率為7.5%,提示TERT可作為監(jiān)測肝硬化患者發(fā)生HCC的早期生物標志物。由于肝硬化患者進行組織活檢具有患者依從性差、有創(chuàng)性和組織異質(zhì)性的局限性,而cfDNA標本易于反復(fù)取材更適用于臨床常規(guī)檢測,因此,在肝硬化患者cfDNA中檢測TERT位點突變,進而監(jiān)測肝硬化早期癌變具有重要的臨床指導(dǎo)意義。

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