近年來，稻漁綜合種養(yǎng)模式發(fā)展迅速，特別是稻田-克氏原螯蝦共作模式的推廣面積逐年增加，成為了一類重要的漁業(yè)水域生境類型。近日，淡水漁業(yè)研究中心漁業(yè)環(huán)境保護研究室在漁業(yè)水域微生態(tài)環(huán)境研究領(lǐng)域取得新進展。淡水漁業(yè)研究中心漁業(yè)環(huán)境保護研究室在江蘇省自然科學(xué)金面上項目“克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)中主要微生物群落特征及形成機制研究”(BK20181136)支持下，進行了克氏原螯蝦養(yǎng)殖池塘系統(tǒng)和克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)抗生素抗性基因組成、分布及在各自系統(tǒng)中的遷移研究。相關(guān)成果“Metagenomics analysis reveals the distribution and communication of antibiotic resistance genes within two different red swamp crayfishProcambarusclarkiicultivation ecosystems”在線發(fā)表在環(huán)境類Top期刊Environmentalpollution(實時影響因子6.792)上，第一作者為范立民副研究員，通信作者為陳家長研究員。

該研究分別從水稻田、克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)和克氏原螯蝦養(yǎng)殖池塘進行樣品采集，研究其中的抗性基因及抗生素組成特征。結(jié)果表明，MacB和BcrA基因是所有水、沉積物和腸道樣品的優(yōu)勢抗性基因，大環(huán)內(nèi)酯(macrolide)類抗生素是所有樣品的主要抗生素。表明，抗生素抗性基因的來源可能來自于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中使用的有機肥。通過富集分析分別研究克氏原螯蝦養(yǎng)殖池塘水和克氏原螯蝦-水稻共作塘水中抗性基因?qū)Φ咎锼锌箵艋虻纳险{(diào)和下調(diào)狀況，結(jié)果表明，主要的抗性基因在系統(tǒng)間沒有明顯變化，上調(diào)和下調(diào)的是少部分低豐度抗性基因，可以推斷，該地區(qū)2種克氏原螯蝦養(yǎng)殖模式養(yǎng)殖本身并未造成抗生素抗性基因的增加。通過溯源分析了克氏原螯蝦池塘養(yǎng)殖系統(tǒng)和克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)中抗性基因在水、沉積物、克氏原螯蝦腸道間的遷移狀況，結(jié)果表明，養(yǎng)殖池塘中沉積物主要表現(xiàn)為抗性基因的“匯”，克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)中水主要表現(xiàn)為抗性基因的“源”。

綜合以上結(jié)果，無論是克氏原螯蝦池塘單養(yǎng)模式還是克氏原螯蝦-水稻共作模式，系統(tǒng)中的抗性基因不是來源于養(yǎng)殖過程，而是來源于外部環(huán)境。提示應(yīng)該注意農(nóng)業(yè)生產(chǎn)對系統(tǒng)抗性基因的可能影響，特別是克氏原螯蝦-水稻共作系統(tǒng)應(yīng)該盡量不要使用有機肥。