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        馬來穿山甲源嗜水氣單胞菌亞種的分離鑒定及生物學特性分析

        2021-04-07 09:47:30杜雪晴古河祥薩家祺吳亞江侯方暉肖嘉杰翟俊瓊鄒潔建
        中國動物檢疫 2021年4期
        關(guān)鍵詞:耐藥小鼠

        杜雪晴,古河祥,薩家祺,吳亞江,侯方暉,肖嘉杰,翟俊瓊,陳 武,鄒潔建

        (1.廣州動物園,廣州市野生動物研究中心,廣東廣州 510070;2.廣東省野生動物救護中心,廣東廣州 510520)

        嗜水氣單胞菌屬于弧菌科氣單胞菌屬,可從自然水體、土壤中被分離檢測到,是目前普遍存在的一種人、畜、水生動物共患病原菌[1]。在一定條件下,該菌還能感染魚類、鳥類、爬行類和兩棲類動物,致使感染動物出現(xiàn)不同程度的腹瀉、敗血癥、肝臟大、皮膚潰爛等癥狀[2-4],因此做好該病的診斷,了解感染菌株的致病性及耐藥情況并及時治療,是防治的重要途徑。

        2019 年3 月,救護轉(zhuǎn)移至廣東省野生動物救護中心的1 只馬來穿山甲腿部肌肉出現(xiàn)感染潰爛,通過無菌操作取腿部潰爛組織進行細菌分離培養(yǎng),得到1 株優(yōu)勢菌。經(jīng)形態(tài)特性、革蘭氏染色及16S rRNA 和gyrB基因序列進化樹分析鑒定,證實其為嗜水氣單胞菌亞種Aeromonas hydrophilasubsp.Dhakensis(縮寫Aeromonas dhakensis)。本研究對該病原菌的生物學特性、遺傳進化特征、毒力因子及耐藥情況進行研究,以期為嗜水氣單胞菌的流行病學調(diào)查及其感染的防治提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        血瓊脂培養(yǎng)基、MH 培養(yǎng)基、LB 液體培養(yǎng)基、PCA 平板技術(shù)瓊脂、革蘭氏染色試劑盒、細菌基因組DNA 提取試劑盒、2×TaqPCR Master Mix,均購自廣州維寧生物科技有限公司;18 種標準藥敏紙片,由溫州市康泰生物科技有限公司生產(chǎn);細菌16S rRNA、gyrB基因、耐藥基因、毒力基因的引物合成和測序,均由廣州睿博興科生物技術(shù)公司完成;42 只SPF 昆明小鼠(6 周齡),購自廣東省醫(yī)學實驗動物中心,體質(zhì)量(30±5)g。

        1.2 細菌分離培養(yǎng)及形態(tài)學觀察

        無菌條件下采集穿山甲腿部潰爛組織樣品,浸液接種于血瓊脂平板上,37 ℃恒溫培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h 后,觀察菌落形態(tài)特征,純化至單個菌落;用接種環(huán)挑取平板上單個菌落,接種于LB 液體培養(yǎng)基;將純化的菌液接種在血瓊脂平板上,37 ℃恒溫培養(yǎng)24 h,觀察菌落形態(tài),并進行革蘭氏染色,在顯微鏡下觀察菌體染色特性及形態(tài)。

        1.3 藥敏試驗

        采用紙片擴散法(K-B 法),將純培養(yǎng)的細菌培養(yǎng)液用LB 液體培養(yǎng)基稀釋至0.5 麥氏比濁管濃度(此時菌液濃度為1.5×108CFU/mL)并均勻涂布于MH 培養(yǎng)基表面;待表面菌液干燥后使用無菌鑷子夾取18 種標準藥敏紙片緊貼于MH 培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)24 h;測量各抑菌環(huán)直徑,依據(jù)說明書判斷標準判定分離菌株對所用藥物的敏感程度。藥敏紙片包括:青霉素、阿莫西林、頭孢氨芐、頭孢克洛、頭孢曲松、頭孢克肟、頭孢吡肟、頭孢哌酮舒巴坦、丁胺卡那、鏈霉素、慶大霉素、阿奇霉素、氯霉素、利福平、諾氟沙星、恩諾沙星、氧氟沙星及左氧氟沙星。

        1.4 16S rRNA 和gyrB 基因擴增及遺傳進化分析

        取培養(yǎng)24 h 的菌液2 mL,采用細菌基因組DNA 提取試劑盒提取分離菌DNA,作為PCR 反應(yīng)模板。參照文獻[2]合成細菌16S rRNA 基因通用引物,參照文獻[5]合成gyrB基因擴增引物,引物序列見表1。PCR 擴增體系:F、R 引物各1.0 μL(1.0 μmol/L),2×TaqPCR Master Mix 12.5 μL,Nuclease-free Water 8.5 μL,DNA 模板2.0 μL,合計總體積25.0 μL。PCR 反應(yīng)程序:95 ℃ 4 min;95 ℃ 30 s,Tm(退火溫度)30 s,72 ℃ 1 min,35 個循環(huán);72 ℃,7 min。PCR 產(chǎn)物采用1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。擴增陽性產(chǎn)物送廣州睿博興科生物技術(shù)公司測序,采用Lasergene 7.0軟件進行序列拼接。

        將菌株的16S rRNA 和gyrB基因序列與GenBank 中已報道的核酸序列進行在線BLAST分析,調(diào)出與其同源性較高的核酸序列,并參照LPSN(the list of prokaryotic names with standing in nomenclature)下載氣單胞菌屬相關(guān)模式菌株的16S rRNA 基因序列及同種不同株系的16S rRNA和gyrB基因序列。使用Mega7.0 軟件對上述序列進行比對,以Escherichia coli和Vibrio cholerae為外群,采用臨接近法構(gòu)建NJ 系統(tǒng)發(fā)育樹,通過自舉分析進行置信度檢測,自舉次數(shù)1 000 次,以估算其內(nèi)分支的支持率。

        1.5 毒力試驗

        利用平板計數(shù)法測定24 h肉湯培養(yǎng)菌液濃度,根據(jù)預(yù)試驗結(jié)果,將菌液配制成6 種濃度梯度;分別將6 種濃度的菌液各腹腔接種SPF 小鼠6只(0.2 mL/只),另設(shè)陰性對照組小鼠6 只,分別腹腔接種生理鹽水0.2 mL;攻菌組和對照組小鼠飼養(yǎng)條件相同,隔離飼養(yǎng);感染細菌后連續(xù)觀察7 d,并對小鼠死亡情況進行記錄;根據(jù)小鼠死亡情況,采用Reed-Muench 法計算菌株對SPF 昆明小鼠的半數(shù)致死量(LD50)。對死亡小鼠立即解剖,無菌采集臟器,分離培養(yǎng)并鑒定。

        1.6 耐藥基因及毒力基因檢測

        采用PCR 方法對分離菌株6 種毒力基因、19 種耐藥基因進行檢測[6-8],各引物序列見表1。PCR 擴增體系:F、R 引物各1.0 μL(1.0 μmol/L),2×TaqPCR Master Mix 12.5 μL,Nuclease-free Water 8.5 μL,DNA 模板2.0 μL,合計總體積25.0 μL。PCR 反應(yīng)程序:95 ℃ 4 min;95 ℃30 s,Tm 30 s,72 ℃ 1 min,35 個循環(huán);72 ℃,7 min。PCR 擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。陽性擴增樣品送測序公司測序后,登陸GenBank進行BLAST 分析。

        表1 PCR 擴增相關(guān)基因引物信息

        2 結(jié)果

        2.1 細菌分離培養(yǎng)及形態(tài)學觀察

        該菌在血瓊脂平板上形成直徑1~2 mm、表面光滑、圓形凸起、灰白色的菌落(圖1)。挑取單個純培養(yǎng)菌落進行涂片,經(jīng)革蘭氏染色后鏡檢。結(jié)果(圖2)顯示,該菌為革蘭氏陰性短桿菌,兩端鈍圓,單個或成對排列。

        圖1 分離菌血平板菌落

        圖2 分離菌革蘭氏染色鏡檢結(jié)果(10×100)

        2.2 藥敏試驗

        由表2 可知,該菌株對青霉素、阿莫西林、頭孢氨芐、頭孢克洛、氯霉素、磺胺甲惡唑、甲氧芐啶、林可霉素耐藥;對鏈霉素、紅霉素以及利福平等中度敏感,對頭孢曲松、頭孢克肟、慶大霉素和氧氟沙星等敏感。

        表2 分離菌藥敏試驗結(jié)果

        2.3 16S rRNA 及gyrB 基因擴增及遺傳進化分析

        分離菌株(命名MJA12)16S rRNA 和gyrB基因PCR 擴增結(jié)果見圖3。經(jīng)測序、校正后分別獲得1 385 bp 和1 003 bp 的序列。登錄NCBI 進行BLAST 比對分析,MJA12 菌株16S rRNA 序列與GenBank 中已報道的多株氣單胞菌序列高度同源,與登錄號為MK958566.1、LC420123.1、MG818965.1、MF776531.1 和MT368027.1 等序列相似性達100%;MJA12 菌株gyrB基因與GenBank 中已報道的多株嗜水氣單胞菌序列高度同源,與登錄號為LC003063.1 序列相似性達100%,與登錄號為MT372057.1、JN711807.1、MT371989.1和MK572686.1 等序列相似性達到99%。

        圖3 菌株MJA12 的16S rRNA 和gyrB 基因PCR 電泳結(jié)果

        采用NJ 法,分別基于16S rRNA 和gyrB基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。本試驗分離的MJA12 菌株16S rRNA 與豚鼠氣單胞菌(Aeromonas caviae)、嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)、嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)及腸棕氣單胞菌(Aeromonas enteropelogenes)聚為同一分支(圖4)。gyrB基因主要與嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)聚為同一分支(圖5)。依據(jù)16S rRNA 和gyrB基因序列及系統(tǒng)發(fā)育樹綜合分析,MJA12 菌株與嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)親緣關(guān)系最近,因此鑒定為嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)。

        2.4 分離菌株對小鼠致病性

        接種MJA12 菌株的小鼠在接種后出現(xiàn)精神沉郁、飲食欲降低、站立不穩(wěn)等癥狀。接種108CFU/mL 濃度菌液組小鼠在12 h 內(nèi)相繼死亡,接種107CFU/mL 濃度菌液組小鼠在24 h 內(nèi)相繼死亡,其余各組小鼠感染劑量與7 d 連續(xù)觀察情況見表3。死亡小鼠主要表現(xiàn)為腹膜出血、肝臟大、出血性腸炎(圖6)。取小鼠肺臟、肝臟組織進行細菌分離鑒定,可重新檢測到接種菌株。試驗期間,未接種分離菌的對照組小鼠健康狀況良好。采用Reed-Muench 法計算得知,菌株MJA12 的LD50為3.75×106CFU/mL。

        圖4 分離菌16S rRNA 序列系統(tǒng)進化樹(NJ 樹)分析結(jié)果

        圖5 分離菌gyrB 基因序列系統(tǒng)進化樹(NJ 樹)分析結(jié)果

        表3 分離菌對小鼠致病性試驗結(jié)果

        圖6 人工感染小鼠試驗結(jié)果

        2.5 分離菌毒力基因檢測

        毒力基因PCR 檢測結(jié)果見圖7。對與目的基因大小一致的PCR 陽性擴增產(chǎn)物測序分析,并將序列登錄NCBI 進行BLAST 分析,共檢測出4種毒力基因aerA(290 bp)、hlyA(584 bp)、alt(482 bp)、act(249 bp);引物擴增片段分別與NCBI 中基因序列登錄號為AF485771.1、JN602736.1、L77573.1 以及JX489371.1 的嗜水氣單胞菌4 種毒力基因高度同源,表明菌株MJA12具有較強的致病性。

        圖7 分離菌毒力基因PCR 擴增電泳圖

        2.6 分離菌耐藥基因檢測

        耐藥基因PCR 擴增結(jié)果見圖8。對與目的基因大小一致的4 種耐藥基因PCR 產(chǎn)物測序分析,共發(fā)現(xiàn)4 種耐藥基因tem(860 bp)、aac(3)-II(237 bp)、flor(1 215 bp)和sul2(191 bp);引物擴增片段分別與NCBI 中登錄號 為LC310937.1、KC958582.1、MT1513801 和CP055262.1 的嗜水氣單胞菌4 種耐藥基因核苷酸序列高度同源,表明分離菌MJA12 攜帶4 種耐藥基因tem、aac(3)-II、flor、sul2。

        圖8 分離菌耐藥基因PCR 擴增電泳結(jié)果

        3 討論

        嗜水氣單胞菌廣泛分布于自然界的水與土壤中,為革蘭氏陰性短桿菌,極端單鞭毛,沒有芽孢和莢膜,是一種條件致病菌。人和動物感染嗜水氣單胞菌后可導致皮膚潰爛、傷口化膿、腹瀉和急性出血性敗血癥等[9-10]。本研究從救護的馬來穿山甲腿部潰爛組織樣品中分離出1 株嗜水氣單胞菌MJA12。該菌在瓊脂平板上形成圓形凸起、表面光滑、灰白色菌落,與以往研究報道[7]一致。16S rRNA 序列分析是細菌分子鑒定的重要依據(jù),但由于其在細菌菌種鑒定上存在局限性,有必要結(jié)合其他保守的管家基因進行補充和驗證[11]。對于眾多管家基因,gyrB基因在氣單胞菌序列分析中能揭示較高的堿基差異,可以很好區(qū)分屬內(nèi)菌種[12]。本研究利用16S rRNA 和gyrB基因序列對穿山甲源嗜水氣單胞菌MJA12 進行了分子鑒定,結(jié)果顯示gyrB基因序列能將16S rRNA 序列一致的不同菌株較好地分開,結(jié)合2 個基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹可較準確地對嗜水氣單胞菌進行分子鑒定,確定菌株MJA12 為嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)。從圖5 建立的菌株進化樹可以看出,分離菌株MJA12 與LC003063.1(泰國,2009)及MT372050.1、MT372057.1、MT372059.1(馬來西亞,2019)關(guān)系最近,根據(jù)此批非法走私馬來穿山甲的溯源情況,推測本次分離的MJA12 菌株可能從馬來西亞傳入我國。相關(guān)研究[13-15]表明,與氣單胞菌屬的其他菌種相比,嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)在人和小鼠細胞系中具有更高的細胞毒性,在臨床上因細菌膿毒性引起的死亡率更高。

        嗜水氣單胞菌之所以能導致人與動物發(fā)生炎癥性疾病,是因為該菌攜帶毒力基因并分泌多種毒力因子,aerA、rtxA、hlyA、alt、act和epa是嗜水氣單胞菌的重要毒力基因[16]。aerA基因表達氣溶素(aerolysin)。氣溶素對宿主細胞具有溶血性、細胞毒性和腸毒性,aerA基因缺失的嗜水氣單胞菌毒力減弱[6]。rtxA基因表達的重復毒素A,其能導致宿主細胞凋亡[17]。hlyA基因表達的溶血素(hemolysin),可對宿主細胞構(gòu)成細胞毒性損害;劉杰等[18]將hly基因作為致病性嗜水氣單胞菌的鑒定標準。alt基因表達的熱不穩(wěn)定細胞興奮性腸毒素,act基因表達的細胞毒性腸毒素,均具有腸毒性[16]。epa基因表達的嗜水氣單胞菌重要的胞外蛋白酶,能直接作用于宿主相關(guān)器官組織,造成靶器官組織溶解或壞死,以利于病原菌入侵宿主和攝取營養(yǎng)物質(zhì)[19]。細菌所攜帶的毒力因子與其致病性緊密相關(guān)。此菌株人工感染小鼠使其出現(xiàn)腹膜出血、出血性腸炎、急性敗血癥死亡,與檢測出的4種毒力基因aerA、hlyA、alt、act致病作用相符。牛志偉等[19]把aerA、hlyA、act基因歸類為可引起宿主死亡的主要毒力基因,陳婷婷等[20]研究也發(fā)現(xiàn)攜帶aerA和hlyA基因的嗜水氣單胞菌致病性顯著增強。這表明從患病馬來穿山甲腿部肌肉組織分離的嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)具有較強的致病性。

        嗜水氣單胞菌耐藥菌株表現(xiàn)出耐藥譜廣、耐藥率高的特點。本試驗結(jié)果顯示,分離菌對β-內(nèi)酰胺類的青霉素、阿莫西林,頭孢類的頭孢氨芐、頭孢克洛,及氯霉素、磺胺甲惡唑、甲氧芐啶、林可霉素等耐藥,對頭孢曲松、頭孢吡肟等藥物敏感,與陳婷婷[20]的調(diào)查結(jié)果較相似。嗜水氣單胞菌的耐藥機制包括獲得性耐藥、主動外排泵作用、細胞膜滲透性改變等[9]。有研究報道,嗜水氣單胞菌的細胞壁最外層由疏水性脂多糖形成,阻止了一些未修飾青霉素的擴散,對青霉素有固有抗性[21],且通過質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子及整合子等介導基因水平轉(zhuǎn)移以及染色體突變使其獲得新的耐藥基因[9,22]。此分離菌中檢測到β-內(nèi)酰胺酶基因tem、乙酰轉(zhuǎn)移酶基因aac(3)-II、氯霉素基因flor和磺胺基因sul2共4種獲得性耐藥基因,綜合藥敏試驗結(jié)果分析,該菌耐藥表型和耐藥基因型相符。該分離菌除對青霉素的固有耐藥性外,還可能通過質(zhì)粒和整合子等可移動原件從環(huán)境中其他耐藥菌獲得了抗性基因tem、aac(3)-II、flor和sul2。

        馬來穿山甲被救護時腿部潰爛,與其他感染嗜水氣單胞菌的動物癥狀一致[2,23],使用藥敏試驗推薦的抗菌藥物治療后能較好控制感染,說明分離菌MJA12 為馬來穿山甲腿部潰爛的病原。對于嗜水氣單胞菌亞種(Aeromonas dhakensis)感染的防治不宜使用青霉素、磺胺類藥物,在實際生產(chǎn)中應(yīng)使用敏感藥物進行治療,且輪換使用,可降低耐藥菌株的發(fā)生概率。

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