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        雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)腹瀉中病毒的價(jià)值

        2021-04-03 16:20:17樊永慧
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        樊永慧

        近年來研究表明[1],引起人類非細(xì)菌性胃腸炎的重要病原是諾如病毒,其引起嚴(yán)重的食品安全、公共衛(wèi)生問題,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)[2],≥95%急性病毒性胃腸炎暴發(fā),是由諾如病毒導(dǎo)致的,傳染性較高,傳播方式有:糞便-口途徑傳播、人-人之間直接傳播,嚴(yán)重影響世界公共衛(wèi)生。經(jīng)調(diào)查研究顯示[3],腹瀉是臨床常見的消化內(nèi)科疾病,是指:與平日習(xí)慣頻率比較,排便次數(shù)增加、糞質(zhì)稀薄及水分增加等,排便量≥200 g/d,或者含有未消化食物、黏液及膿血等,患病后常有排便急迫感、肛門不適及失禁等癥狀表現(xiàn),發(fā)病機(jī)制較復(fù)雜,可能與病毒、細(xì)菌及寄生蟲引起腸道感染等因素有關(guān),其中引起感染的主要病毒是GⅠ型、GⅡ型諾如病毒,因此探尋經(jīng)濟(jì)、有效及可行的檢測(cè)方法,逐漸成為醫(yī)學(xué)界研究熱點(diǎn)。張濛等[4-5]認(rèn)為,采用雙重實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR,polymerase chain reaction)法能控制疾病進(jìn)展、改善患者預(yù)后,具有操作簡(jiǎn)便、快速及特異性強(qiáng)等優(yōu)勢(shì),臨床應(yīng)用較廣泛,得到患者的青睞、認(rèn)可,基于上述背景,本研究分析腹瀉患者糞便中諾如病毒(GⅠ+GⅡ)行雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)的價(jià)值,報(bào)道如下。

        1 資料和方法

        1.1 基線資料

        研究2019年1月—2020年3月我市人民醫(yī)院送檢的腹瀉患者的糞便標(biāo)本共400份,其中男性有210例,女性有190例,年齡41~68歲,均值(52.39±6.42)歲;體質(zhì)量19~26 kg/m2,均值是(23.29±5.47)kg/m2。(1)采集糞便的標(biāo)準(zhǔn):腹瀉病程≥2周;排便次數(shù)≥3次/日,糞便呈稀便、水樣便、膿血便及黏液便等;患者表現(xiàn)為不同程度排便次數(shù)增加、腹痛等不適癥狀[6];體征平穩(wěn)、意識(shí)清晰;患者知情并簽署“知情同意書”;醫(yī)院倫理委員會(huì)審核同意。(2)排除標(biāo)準(zhǔn):心肝腎功能障礙者;細(xì)菌性感染后的腹瀉糞便標(biāo)本;伴惡性腫瘤者;認(rèn)知、精神障礙者;臨床資料不完整者。

        1.2 方法

        1.2.1 糞便采集 采集患者糞便標(biāo)本5~10 g,未加入任何培養(yǎng)基、試劑,等待30 min后凍存于零下20℃的冰箱,盡量≤1個(gè)月內(nèi)完成檢測(cè)。采用0℃冰壺運(yùn)送標(biāo)本,陽性糞便標(biāo)本:經(jīng)江蘇省句容市疾病預(yù)防控制中心復(fù)核后,確認(rèn)為諾如病毒GⅠ和GⅡ陽性的糞便樣本,采用PBS稀釋為10%病毒懸濁液,冷存于零下80℃等待檢測(cè)[7]。

        1.2.2 儀器及試劑 涉及儀器有:高速臺(tái)式冷凍離心機(jī)(德國(guó)Sigma,2~16K)、熒光定量AB7500 PCR儀(美國(guó)ThermoFisher分析儀器股份公司)、病毒核酸提取試劑盒及PCR檢測(cè)試劑盒。

        1.2.3 提取RNA病毒 利用病毒核酸提取試劑盒+快速柱式提取法,提取糞便標(biāo)本的病毒核酸,嚴(yán)格按照試劑盒說明書操作。

        1.2.4 雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法 涉及試劑有:諾如病毒(GⅠ+GⅡ))雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)試劑盒(上海之江公司),PCR反應(yīng)按照試劑盒說明書操作,總體積是20 μl,劃分為 18 μl熒光反應(yīng)液、1 μl酶混合物和 1 μl內(nèi)部對(duì)照,將樣品RNA處理后,熒光反應(yīng)利用熒光定量PCR儀進(jìn)行。(1)條件:溫度45℃、持續(xù)10 min、反轉(zhuǎn)錄,進(jìn)行1個(gè)循環(huán);(2)預(yù)變性:溫度為94℃、持續(xù)2 min、進(jìn)行1個(gè)循環(huán);(3)PCR擴(kuò)增:溫度為94℃、持續(xù)15 s、進(jìn)行40個(gè)循環(huán),60℃延伸時(shí),對(duì)熒光信號(hào)進(jìn)行收集;(4)報(bào)告基團(tuán):具體設(shè)置成FAM、VIC,其中GⅠ型諾如病毒采用FAM基團(tuán)監(jiān)測(cè),GⅡ型諾如病毒采用VIC基團(tuán)監(jiān)測(cè)[8-9]。

        1.3 觀察指標(biāo)

        (1)試驗(yàn)有效性:①試驗(yàn)有效:陰性對(duì)照的FAM、VIC通道均為陰性;②陽性對(duì)照的FAM、VIC通道均呈擴(kuò)增。

        (2)FAM通道:Ct值<38,GⅠ型諾如病毒核酸呈陽性,Ct值若顯示為無,則表示樣本呈陰性,說明GⅠ型諾如病毒核酸呈陰性,Ct值處于38~40時(shí),表示再次進(jìn)行試驗(yàn),重復(fù)擴(kuò)增曲線呈擴(kuò)增,表示GⅠ型諾如病毒呈陽性,反之呈陰性。

        (3)VIC通道:Ct值<38,GⅡ型諾如病毒核酸呈陽性,Ct值若顯示為無,則表示樣本呈陰性,說明GⅡ型諾如病毒核酸呈陰性,Ct值處于38~40時(shí),表示再次進(jìn)行試驗(yàn),重復(fù)擴(kuò)增曲線呈擴(kuò)增,表示GⅡ型諾如病毒呈陽性,反之表示樣本呈陰性[10]。

        2 結(jié)果

        本研究選擇400份腹瀉患者的糞便標(biāo)本,實(shí)行雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)發(fā)現(xiàn),GⅠ型諾如病毒感染有15例,檢出率是3.75%;GⅡ型諾如病毒感染有59例,檢出率是14.75%;GⅠ型、GⅡ型諾如病毒混合感染有6例,檢出率是1.50%,諾如病毒的總檢出率是20.00%。

        3 討論

        腹瀉是臨床常見癥狀,俗稱為“拉肚子”,常因細(xì)菌性痢疾、敗潰瘍性結(jié)腸炎、血吸蟲病、病毒性腸炎及麥角性腸病等疾病引起的,具有起病急、遷延難愈及反復(fù)發(fā)作等特點(diǎn),發(fā)病時(shí)常有排便急迫感、肛門失禁及肛門不適等癥狀表現(xiàn),未及時(shí)治療影響患者預(yù)后效果、甚至危及生命,因此早期合理的檢測(cè)方法,受到臨床高度重視。近年來研究表明[11-12],諾如病毒是引起腹瀉的重要原因,傳播途徑有:食物、水源及人群接觸等,是誘導(dǎo)急性病毒性胃腸炎、食源性疾病暴發(fā)的重要原因,具體分析如下:(1)急性病毒性胃腸炎其屬于自限性疾病,患病后患者常有惡心嘔吐、腹瀉等癥狀表現(xiàn),一般情況下呈膿血、水樣便等,一年四季均可能發(fā)病,其中秋冬季較多見,發(fā)病率較高,極易被誤診,若患者多次、大量腹瀉,引起嚴(yán)重脫水、電解質(zhì)紊亂,部分群體產(chǎn)生休克、昏迷及心跳停止等,甚至危及生命;(2)食源性疾病常見疾病類型是食物中毒,是指:食用生物性、化學(xué)性有害物質(zhì)污染的視頻,出現(xiàn)急性、亞急性食源性疾病,在氣溫較高的夏秋季發(fā)病率就較高,具體劃分成:細(xì)菌性食物中毒、非細(xì)菌性食物中毒,具有發(fā)病率高、遷延難愈等特點(diǎn),患病后患者常表現(xiàn)為惡心嘔吐、腹瀉及腹痛等胃腸炎癥狀,未及時(shí)治療引起脫水、酸中毒及休克等,甚至危及生命,因此王強(qiáng)等[13]認(rèn)為,選擇操作簡(jiǎn)便、特異性較強(qiáng)、重復(fù)性良好及時(shí)效性強(qiáng)等優(yōu)勢(shì)的檢測(cè)方法迫在眉睫。

        有研究報(bào)道[14],雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)GⅠ型、GⅡ型諾如病毒具有較高的時(shí)效性,其中GⅠ型諾如病毒特異性采用Taqman探針的5’端標(biāo)記為FAM,GⅡ型諾如病毒特異性采用Taqman探針的5’端標(biāo)記為VIC,將相關(guān)標(biāo)本放置于同一反應(yīng)管,同期開展標(biāo)本檢測(cè)、分型,確保數(shù)小時(shí)內(nèi)獲得諾如病毒的病原體型別、縮短檢測(cè)時(shí)間,將錯(cuò)綜復(fù)雜的檢測(cè)步驟簡(jiǎn)化,提高諾如病毒檢測(cè)效率,具備較高的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        經(jīng)調(diào)查研究顯示,檢測(cè)諾如病毒是疾病監(jiān)測(cè)體系的重要組成部分,回顧分析患者既往飲食調(diào)查史,結(jié)合病毒病原體檢測(cè)數(shù)據(jù)、網(wǎng)絡(luò)上報(bào)體系,實(shí)施追溯疾病誘因、傳染源,及時(shí)發(fā)現(xiàn)并控制病毒引起的疾病暴發(fā),有效治療、預(yù)防并控制諾如病毒引起的疾病,改善患者預(yù)后效果、穩(wěn)定病情。

        本研究示:選擇400份腹瀉患者的糞便標(biāo)本,實(shí)行雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)發(fā)現(xiàn),GⅠ型諾如病毒感染有15例,檢出率是3.75%;GⅡ型諾如病毒感染有59例,檢出率是14.75%;GⅠ型、GⅡ型諾如病毒混合感染有6例,檢出率是1.50%,諾如病毒總檢出率是20.00%,與陸蕓等[15-16]文獻(xiàn)結(jié)果接近。

        綜上所述,腹瀉患者的糞便采用雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)具有較高的臨床應(yīng)用價(jià)值,為后期治療提供可靠性保障、改善預(yù)后效果。

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