程 潛,官 梅,張振乾,常 濤,譚 敏,官春云
(湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,湖南 長沙 410128)
隨著人們生活質(zhì)量的提高和對食品營養(yǎng)保健功能認(rèn)識的加強(qiáng),我國食用植物油的需求不斷增加[1],油菜是我國重要的油料和經(jīng)濟(jì)作物之一,菜籽油不僅富含人體所必需的氨基酸和脂肪酸,而且能較長時間地儲存[2],為了更好地滿足廣大人民對優(yōu)質(zhì)食用植物油的需求,菜籽油品質(zhì)改良已成為當(dāng)前油菜育種領(lǐng)域的熱點(diǎn)。
菜籽油的主要成分是脂肪酸,油脂的優(yōu)劣由脂肪酸決定,而油脂脂肪酸的好壞則主要取決于其碳?xì)滏滐柡统潭?。脂肪酸根?jù)碳?xì)滏滐柡团c不飽和分為3類:飽和脂肪酸(主要有棕櫚酸、硬脂酸等)、單不飽和脂肪酸(油酸、芥酸等)和多不飽和脂肪酸(亞油酸、亞麻酸等)[1],有研究表明,預(yù)防冠心病的指導(dǎo)方針集中在將飲食中的飽和脂肪和反式脂肪轉(zhuǎn)變?yōu)椴伙柡椭綶3],飽和脂肪酸熔點(diǎn)較高,易凝固在血管壁上,從而導(dǎo)致高血壓和動脈粥樣硬化,且飽和脂肪酸還導(dǎo)致血膽固醇濃度上升[4],不飽和脂肪酸熔點(diǎn)較低,容易被人體吸收。
本研究以湖南省水稻油菜抗病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室前期對高亞麻酸甘藍(lán)型油菜(Brassicanapus)近等基因系進(jìn)行的miRNA測序結(jié)果為基礎(chǔ),篩選到的與脂肪酸代謝相關(guān)的bna-miR396及其靶基因乙酰轉(zhuǎn)移酶基因(Acetyltransferase gene,AT)[5]。研究表明,AT通過催化乙?;鶊F(tuán)從乙酰輔酶A(乙酰CoA,Acetyl-CoA)轉(zhuǎn)移到其作用底物芳香胺及雜環(huán)胺類物質(zhì)上,參與脂肪酸轉(zhuǎn)化與降解,AT缺失會推遲植物開花時間并降低育性[6-7]。利用同源基因克隆,得到AT基因的2個拷貝,分別構(gòu)建過表達(dá)載體與干擾載體,轉(zhuǎn)化擬南芥,分析轉(zhuǎn)基因擬南芥后代種子脂肪酸組成,探究該基因在脂肪酸合成過程的功能,以期促進(jìn)甘藍(lán)型油菜脂肪酸合成分子機(jī)理研究。
高亞麻酸甘藍(lán)型油菜近等基因系(低亞麻酸株系575,亞麻酸含量為5.1%;高亞麻酸株系574,亞麻酸含量9.8%),野生型擬南芥(WT)由湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)國家油料改良中心提供。大腸桿菌感受態(tài)DH5α,限制性內(nèi)切酶、dNTP、T4DNA Ligation Kit購自北京擎科生物科技有限公司;pMD18-T載體由本實(shí)驗(yàn)室保存;pCambia1300-35s-N1、pCambia1300-RNAi載體購于上??殿伾锟萍加邢薰?;本試驗(yàn)中所用到的引物均由北京擎科合成。
利用TAIR(https://www.arabidopsis.org)和Brassica Database(http://brassicadb.org/brad/)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,發(fā)現(xiàn)AT基因有2個拷貝,分別在A基因組和C基因組,并以此序列(GSBRNA2T00114025001、GSBRNA2T00148464001)進(jìn)行后續(xù)引物設(shè)計(jì)(表1),其中5′端酶切位點(diǎn)前的序列用于重組連接。
采用TransZol UP植物總RNA提取試劑盒(北京全式金)提取低亞麻酸甘藍(lán)型油菜株系575自交授粉后20~35 d混合種子總RNA,并用TransScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix反轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京全式金)合成cDNA第一鏈,以此為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增體系包含KOD-FX聚合酶 1 μL,2×PCR Buffer 25 μL,dNTP(2.5 μmol/L) 10 μL,正反向引物各0.2 μmol/L,cDNA小于500 ng,用ddH2O補(bǔ)足至50 μL。反應(yīng)條件為98 ℃ 2 min預(yù)變性;98 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,68 ℃ 2 min,35個循環(huán);68 ℃ 7 min延伸。
經(jīng)PCR純化回收后,與pMD18-T載體相連,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌中,由北京擎科公司進(jìn)行測序。
表1 與脂肪酸代謝相關(guān)的miRNA及其靶基因Tab.1 miRNA and its target genes related to fatty acid metabolism
用SnapGene 3.2.1將克隆到的靶基因序列翻譯成氨基酸,經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫BlastP進(jìn)行鑒定后,登錄ExPASy-ProtParam tool網(wǎng)站,預(yù)測對應(yīng)蛋白的一級結(jié)構(gòu),包括氨基酸組成、理化性質(zhì)等;分別登錄PredictProtein、SOPMA、TMHMM網(wǎng)站進(jìn)行蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測、結(jié)構(gòu)預(yù)測、跨膜螺旋區(qū)分析;通過SWISS-MODEL構(gòu)建蛋白三級結(jié)構(gòu)模型。
根據(jù)甘藍(lán)型油菜數(shù)據(jù)庫獲得AT基因全長序列,選擇長度為300 bp特異序列設(shè)計(jì)引物(表2),以合成的cDNA為模板進(jìn)行高保真擴(kuò)增,反應(yīng)體系與1.2克隆體系相同,反應(yīng)條件為98 ℃ 2 min預(yù)變性;98 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,68 ℃ 30 s,35個循環(huán);68 ℃ 7 min延伸。經(jīng)PCR純化回收后,與pMD18-T載體相連,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌中,由北京擎科公司進(jìn)行測序。
表2 RNAi干擾引物Tab.2 RNAi interference primers
用BamHⅠ和SalⅠ雙酶切pCambia1300-35s-N1載體,膠回收,產(chǎn)物進(jìn)行體外同源重組反應(yīng),獲得重組質(zhì)粒。
用XbaⅠ及BamHⅠ雙酶切pCambia1300-RNAi載體以及各個基因的RNAi片段的PCR產(chǎn)物,具體方法參考劉芳等[8],并進(jìn)行改進(jìn),膠回收后進(jìn)行連接,獲得重組質(zhì)粒。測序檢驗(yàn)正確后,用PstⅠ和SalⅠ雙酶切重組質(zhì)粒及各個基因的RNAi片段的PCR產(chǎn)物,再次進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化,獲得最終的RNAi載體。
將構(gòu)建好的過表達(dá)載體與RNAi干擾載體轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,以野生型擬南芥為受體,進(jìn)行基因轉(zhuǎn)化,獲得T0種子;用潮霉素篩選T0擬南芥陽性苗并種植,之后,用PCR鑒定轉(zhuǎn)基因苗,收取得到T1種子。
采用SP-6890型氣相色譜儀、FID檢測器、N3000色譜工作站、毛細(xì)管色譜柱DB-23對轉(zhuǎn)基因擬南芥T1種子進(jìn)行脂肪酸成分測定[9],對7個主要的脂肪酸成分進(jìn)行分析,測定時取5個轉(zhuǎn)基因后代株系,每個材料檢測約30粒種子。
以低亞麻酸甘藍(lán)型油菜20~35 d自交種cDNA為模板,高保真擴(kuò)增了乙酰轉(zhuǎn)移酶基因的2個拷貝,大小均為1 350 bp。分別對2個靶基因特異片段進(jìn)行PCR高保真擴(kuò)增,得到了目的片段長度大小的DNA片段。
2.2.1 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)預(yù)測與分析 以SnapGene 3.2.1分別對AT基因翻譯出來的氨基酸序列,通過ExPASy-ProtParam tool進(jìn)行理化性質(zhì)分析表明(表3),AT基因的2個拷貝114與148氨基酸均為449個,分子量約50.5 ku,114編碼的氨基酸偏中性而148編碼的蛋白偏堿性。不穩(wěn)定系數(shù)顯示114與148均為穩(wěn)定蛋白,且親水性較差,屬于脂溶性蛋白。
表3 AT基因編碼蛋白一級結(jié)構(gòu)理化性質(zhì)分析Tab.3 Analysis of the physical and chemical properties of the primary structure of the protein encoded by the AT gene
2.2.2 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測與分析 通過在線PredictProtein軟件對AT基因不同拷貝編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行亞細(xì)胞定位發(fā)現(xiàn)2個蛋白均定位在細(xì)胞質(zhì);TMHMM跨膜螺旋區(qū)分析表明,2個蛋白均為膜外蛋白,無跨膜結(jié)構(gòu)。SOPMA結(jié)構(gòu)預(yù)測表明,AT蛋白中,無規(guī)則卷曲占比最高,均在43%左右,其次為α-螺旋,約占35%,延伸鏈約占18%,β-轉(zhuǎn)角約占4%,兩蛋白有一定差異(表4)。
2.2.3 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測與分析 經(jīng)SWISS-MODEL同源建模發(fā)現(xiàn),114、148均適應(yīng)酰基轉(zhuǎn)移酶模型,但其構(gòu)象略不同(圖1,2)。
表4 AT蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
Tab.4 Prediction of secondary structure of AT proteins
%
AT基因的2個拷貝114與148過表達(dá)重組質(zhì)粒見圖3-A。AT基因的2個拷貝114與148RNAi重組質(zhì)粒見圖3-B。
經(jīng)潮霉素篩選T0轉(zhuǎn)基因擬南芥種子后(圖4),對T1進(jìn)行pCambia1300-35s-114、pCambia1300-RNAi-114、pCambia1300-35s-148及pCambia1300-RNAi-148載體潮霉素鑒定,結(jié)果表明(圖5),目的質(zhì)粒T-DNA均已插入擬南芥基因組,表明擬南芥轉(zhuǎn)基因成功。
2.5.1 轉(zhuǎn)114基因T1種子脂肪酸成分分析 分別收集野生型擬南芥(對照)、114基因過表達(dá)(35s-114)與RNAi干擾(114R)轉(zhuǎn)基因T1種子,烘干后用氣相色譜儀測定各脂肪酸含量,用Excel 2019單因素方差分析法分析各個脂肪酸成分,結(jié)果見表5。
表5 轉(zhuǎn)114基因T1種子脂肪酸成分分析Tab.5 Fatty acid composition analysis of T1 seeds of trans 114 genes
由表5可知,與野生型擬南芥種子脂肪酸各成分相比,干擾114基因(114R)表達(dá)會導(dǎo)致硬脂酸和油酸含量極顯著的增加,增加幅度分別為10.25%,38.33%,而軟脂酸和亞麻酸是極顯著的減少,減少幅度分別為10.57%,17.90%,顯著減少亞油酸的含量,花生烯酸的含量也有減少,但是差異不顯著;過表達(dá)114基因(35s-114)會導(dǎo)致軟脂酸、油酸和亞油酸含量的顯著增加,增加幅度分別達(dá)到15.52%,37.88%,12.33%,而硬脂酸、亞麻酸和花生烯酸含量達(dá)到極顯著的減少,幅度分別為50.22%,10.86%,29.93%。
在對飽和脂肪酸與不飽和脂肪酸分析中,干擾114基因會使飽和脂肪酸含量下降,對不飽和脂肪酸無顯著影響;過表達(dá)114基因會增加不飽和脂肪酸的含量,而對飽和脂肪酸無顯著影響。
2.5.2 轉(zhuǎn)148基因T1種子脂肪酸成分分析 分別收集野生型擬南芥(對照)、148基因過表達(dá)(35s-148)與RNAi干擾(148R)轉(zhuǎn)基因T1種子,烘干后用氣相色譜儀測定各脂肪酸含量,用Excel 2019單因素方差分析法分析各個脂肪酸成分,結(jié)果見表6。
由表6可知,與野生型擬南芥種子脂肪酸各成分相比,干擾148基因(148R)會導(dǎo)致油酸含量增加,幅度為31.19%,而軟脂酸、亞麻酸會極顯著減少,而花生烯酸含量顯著減少,減少幅度分別為5.46%,18.68%,13.16%,并使硬脂酸增加,亞油酸和芥酸減少,但是增減幅度沒有達(dá)到顯著水平,干擾148基因還會導(dǎo)致芥酸含量增加;過表達(dá)148基因(35s-148)會導(dǎo)致軟脂酸、油酸、亞油酸含量的極顯著增加,其增加幅度分別為23.50%,45.12%,14.03%,而硬脂酸、亞麻酸和花生烯酸的含量與野生型擬南芥相比,都有極顯著的下降。
在對飽和脂肪酸與不飽和脂肪酸分析中,干擾148基因會使飽和脂肪酸含量下降,對不飽和脂肪酸無顯著影響;過表達(dá)148基因會顯著增加不飽和脂肪酸的含量,而對飽和脂肪酸無顯著影響。
2.5.3 對具有相同變化趨勢的脂肪酸成分進(jìn)行分析 結(jié)合表5,6,選取在2個拷貝基因的過表達(dá)與干擾體系中,脂肪酸成分具有相同變化趨勢的油酸、亞麻酸、花生烯酸和芥酸,并進(jìn)行方差分析,結(jié)果見表7。
表7 過表達(dá)與干擾體系間方差分析Tab.7 Analysis of variance between overexpression and interference systems
結(jié)果顯示,過表達(dá)114基因會導(dǎo)致花生烯酸極顯著的下降,而對其他脂肪酸含量無顯著影響;干擾148基因會導(dǎo)致芥酸含量的極顯著增加,而對其他脂肪酸成分無顯著影響。
棕櫚酸是游離脂肪酸中最主要的飽和脂肪酸,能夠誘導(dǎo)肝細(xì)胞、骨骼肌和心肌細(xì)胞等發(fā)生胰島素抵抗[10-12],硬脂酸是自然界廣泛存在的一種脂肪酸,在動物脂肪中的含量較高,植物油中含量較少,主要應(yīng)用于橡膠和化妝品工業(yè),人若長期微量攝入可能會刺激眼睛、呼吸系統(tǒng)。油酸是人體最易消化吸收的脂肪酸,高油酸具有降低人體血液中有害的低密度脂,同時可減少血漿中脂蛋白膽固醇含量[13],有效的預(yù)防及治療動脈的硬化[14]。亞油酸是一種人體必需脂肪酸,在機(jī)體內(nèi)含量極為豐富,具有降血脂、降血壓、防止動脈硬化,還參與了人體物質(zhì)循環(huán)和免疫調(diào)節(jié)[15]。α-亞麻酸是二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)的前體物質(zhì),EPA和DHA在視網(wǎng)膜和大腦的結(jié)構(gòu)膜中也起重要作用[16-17],亞麻酸還具有抗動脈粥樣硬化、預(yù)防心腦血管疾病及減肥、降血脂等生理功能[16,18]?;ㄉ南┧峋哂性黾友軓椥?、酯化膽固醇,調(diào)節(jié)血細(xì)胞功能等一系列生理活性,對預(yù)防心血管疾病、糖尿病和腫瘤等具有重要功效[19]。花生四烯酸及其代謝產(chǎn)物還參與了人體造血和免疫調(diào)節(jié)[20],花生四烯酸降低血液中膽固醇的效果是亞油酸和亞麻酸的4倍,其降低血液中血脂和血壓的能力也要強(qiáng)于亞油酸和亞麻酸[21-22]。芥酸在人體內(nèi)不易被消化吸收,而且芥酸凝固點(diǎn)高,不適于食品加工[23]。高芥酸的油菜籽餅粕需經(jīng)過脫毒處理才能用作動物飼料,因此,降低芥酸含量是油菜食用目的脂肪酸改良的首要任務(wù)[24]。
在西方飲食中,棕櫚酸(C16∶0)和硬脂酸(C18∶0)是最常食用得飽和脂肪酸[25]。一般認(rèn)為棕櫚酸比硬脂酸更能提高膽固醇[26-28],世界衛(wèi)生組織(WHO)與聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)曾建議食用油中飽和脂肪酸∶單不飽和脂肪酸∶多不飽和脂肪酸=1∶1∶1[29]。熊秋芳等[1]分析認(rèn)為,在亞麻酸質(zhì)量分?jǐn)?shù)不低于5%的前提下,飽和脂肪酸含量越低、油酸含量越高、且ω-6與ω-3比例為1~4∶1的天然食用植物油品最具營養(yǎng)價(jià)值。
擬南芥作為模式植物,并與甘藍(lán)型油菜同屬于蕓薹屬十字花科且有著共同的原始祖先,開展擬南芥研究可為甘藍(lán)型油菜研究提供重要參考與借鑒[30-31]。
本研究對克隆得到的AT基因的2個拷貝進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)114與148同屬于?;D(zhuǎn)移酶模型,但其構(gòu)象略有不同,推測其在甘藍(lán)型油菜中發(fā)生了序列變異,將進(jìn)一步研究;脂肪酸組成分析表明,乙酰轉(zhuǎn)移酶基因的這2個拷貝在飽和脂肪酸的代謝過程中具有相同的功能,過表達(dá)114基因與148基因均會導(dǎo)致軟脂酸含量的增加,硬脂酸含量的減少,干擾114基因與148基因均會導(dǎo)致軟脂酸含量的減少,硬脂酸含量增加,表明在軟脂酸向硬脂酸合成過程中發(fā)揮抑制作用,抑制這2個拷貝表達(dá),可以促進(jìn)軟脂酸向硬脂酸轉(zhuǎn)化;這2個拷貝在不飽和脂肪酸代謝過程中存在差異,過表達(dá)114基因和148基因均會引起亞油酸含量的增加,而通過分析其他幾個具有相同變化趨勢的脂肪酸成分后,發(fā)現(xiàn)可以通過過表達(dá)114基因,可以使花生烯酸含量顯著下降,干擾148基因的表達(dá)會導(dǎo)致芥酸含量的增加。這2個拷貝可以促進(jìn)菜籽油品質(zhì)改良。
本研究以前期對高亞麻酸油菜近等基因系材料miRNA測序結(jié)果為基礎(chǔ),同源克隆獲得了AT基因的2個拷貝114與148(均為1 350 bp),分別構(gòu)建了這2個基因的過表達(dá)載體和RNAi干擾載體并成功轉(zhuǎn)化擬南芥。生物信息學(xué)分析表明,114編碼的蛋白偏中性而148編碼的蛋白偏堿性,114與148均為穩(wěn)定蛋白,親水性差,屬于脂溶性蛋白,且定位在細(xì)胞質(zhì),無跨膜結(jié)構(gòu)。114基因與148基因在脂肪酸代謝途徑中,抑制軟脂酸向硬脂酸轉(zhuǎn)化。過表達(dá)114基因和與148基因可以提高不飽和脂肪酸含量,抑制這2個拷貝基因會導(dǎo)致飽和脂肪酸含量的增加;過表達(dá)114基因可以顯著增加軟脂酸、油酸和亞油酸的含量,并減少硬脂酸、亞麻酸和花生烯酸的含量,干擾114基因的表達(dá)可以增加硬脂酸和油酸的含量,減少軟脂酸、亞油酸和亞麻酸的含量;過表達(dá)148基因可以增加軟脂酸、油酸和亞油酸的含量,減少硬脂酸、亞麻酸和花生烯酸的含量,而干擾148基因會導(dǎo)致油酸、花生烯酸以及芥酸含量的增加,軟脂酸、亞油酸和亞麻酸含量的減少;可以通過過表達(dá)114基因,促使花生烯酸含量的下降,干擾148基因的表達(dá)會導(dǎo)致芥酸含量的增加。因此,乙酰轉(zhuǎn)移酶基因這2個拷貝對改良甘藍(lán)型油菜脂肪酸成分作用明顯。