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        非小細胞肺癌GATA4啟動子甲基化檢測及其對細胞增殖和凋亡的影響

        2021-03-26 09:03:20黨海舟
        關(guān)鍵詞:增殖率細胞系甲基化

        李 源,黨海舟

        (1.漢中市三二0一醫(yī)院呼吸科,陜西 漢中 723000; 2.空軍軍醫(yī)大學(xué)第二附屬醫(yī)院胸腔外科,西安 710000)

        目前,肺癌是最常見的癌癥,也是全球癌癥死亡的主要原因[1]。非小細胞肺癌(NSCLC)是指除小細胞肺癌(SCLC)外的肺癌,約占所有肺癌病例的85%,其5年總生存率僅為15%[2],已成為嚴重危害人類健康和患者生命質(zhì)量的疾病。因此,探索其發(fā)病機制和影響因素,加強預(yù)防和干預(yù)成為目前急待解決的關(guān)鍵問題。NSCLC的發(fā)生、發(fā)展和預(yù)后與DNA修復(fù)突變相關(guān)基因[3]、DNA甲基化[4]等表觀遺傳修飾水平異常有關(guān)。而DNA甲基化會導(dǎo)致DNA、染色質(zhì)以及DNA和蛋白質(zhì)相互作用的變化,從而引起基因表達發(fā)生改變[5]。

        GATA4屬于轉(zhuǎn)錄因子GATA家族,GATA4是調(diào)控一些組織特異性表達的關(guān)鍵因子[6],此外,GATA4可能驅(qū)動內(nèi)胚層特異性分化[7]。研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子GATA4基因功能的喪失與肺癌[8]、漿液性卵巢癌[9]、胃癌[10]、結(jié)直腸細胞系和原發(fā)性結(jié)腸癌[11]等惡性腫瘤密切相關(guān),其可能是肺癌功能喪失的靶點,且GATA4啟動子甲基化參與其中[12]。研究發(fā)現(xiàn)過表達GATA4會抑制結(jié)腸癌細胞的增殖[13],而GATA4的缺失使惡性膠質(zhì)瘤細胞的細胞增殖加速,患者生存率大大降低[14]。本文采用人NSCLC細胞系A(chǔ)549細胞研究其GATA4啟動子的甲基化和GATA4 mRNA的水平,并加入DNA甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,觀察其GATA4的mRNA水平和細胞的增殖及凋亡情況,以期為臨床NSCLC治療提供可能的靶點。

        1 材料與方法

        1.1 試劑

        人正常肺上皮細胞系BEAS-2B和人NSCLC細胞系A(chǔ)549(均購自美國典型培養(yǎng)物保藏中心)。Genomic DNA試劑盒(寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司),DNA重亞硫酸鹽處理試劑盒(天根生化科技有限公司),基因甲基化特異性PCR擴增(MSP)試劑盒(寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司),焦磷酸測序試劑盒(寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司),PCR引物(上海生工生物工程有限公司),總RNA提取試劑盒(北京索萊寶科技有限公司),SYBR Green PCR試劑盒(寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司),CCK-8檢測試劑盒(博士德生物工程有限公司),anti-PCNA抗體(CST公司)、anti-cleaved-caspase 3和anti-caspase 3(abcam公司)、β-actin(abcam公司),ANNEXIN V-FITC/PI凋亡試劑盒(博士德生物工程有限公司)。

        1.2 細胞的分組與處理

        以人正常肺上皮細胞系BEAS-2B為對照組,人NSCLC細胞系A(chǔ)549為NSCLC組進行甲基化檢測。之后在A549細胞中加入2 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,分為NSCLC組和NSCLC+5-Aza-2′deoxycytidine組,繼續(xù)培養(yǎng)48 h之后進行實驗。

        1.3 甲基化特異性PCR(MSP)法檢測NSCLC GATA4啟動子甲基化水平

        選取對數(shù)生長期的BEAS-2B和A549細胞,待其生長匯聚至80%,胰蛋白酶消化細胞,1000 r·min-1離心5 min,收集細胞,按照試劑盒說明提取基因組DNA,采用超微量分光光度計測定提取DNA的濃度和純度。DNA亞硫酸氫鈉修飾,采用25 μL的反應(yīng)體系進行PCR擴增。甲基化GATA4引物序列為:上游5′-GTATAGTTTCGTAGTTTGCGTTTAGC-3′,下游5′-AACTCGCGACTCG-AATCCCCG-3′;非甲基化GATA4引物序列為:上游5′-TTTGTATAGTTTTGTAGTTTGTGTTT-TT-3′,下游5′-CCCAACTCACAACTCAA-ATCCCCA-3′。瓊脂糖凝膠電泳,120 V、5 min進行電泳,溴化乙錠(EB)染色,成像并拍照記錄。

        1.4 Real-time PCR檢測GATA4的mRNA水平

        選取對數(shù)生長期的BEAS-2B和A549細胞,待其生長匯聚至80%,胰蛋白酶消化細胞,1000 r·min-1離心5 min,收集細胞。逆轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,每次反應(yīng)使用5 μg的總RNA。之后進行PCR擴增檢測GATA4 mRNA的表達水平。GATA4引物:上游5′-CTGGCCTGTCATCTCACTACG-3′,下游5′-GGTCCGTGCAGGAATTTGA-GG-3′。PCR擴增采用25 μL反應(yīng)體系,95 ℃、30 s預(yù)變性,95 ℃、5 s變性,60 ℃、30 s退火。最后按2-ΔΔCt檢測GATA4的mRNA表達水平。

        1.5 CCK-8檢測細胞的增殖率

        取對數(shù)期細胞使用細胞計數(shù)板進行細胞計數(shù),用完全培養(yǎng)基將細胞密度調(diào)整為105·mL-1,在96孔板中接種細胞懸液,培養(yǎng)24 h,分別加入0.2、0.5、2.0和5.0 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,繼續(xù)培養(yǎng)24 h,避光加入CCK-8液,孵育2 h后酶標儀檢測吸光度值并計算增殖率。

        1.6 Western blot檢測PCNA、cleaved-caspase 3和caspase 3的蛋白表達

        待細胞匯聚至80%左右時,胰蛋白酶消化細胞,4000 r·min-1、10 min離心,棄上清留細胞沉淀。加入100 μL裂解液和1 μL蛋白酶抑制劑(PMSF),超聲破碎細胞。12 000 r·min-1、15 min離心,取上清,BCA法測蛋白濃度。80 V電泳至marker分開,換120 V電泳。轉(zhuǎn)膜、脫脂奶粉封閉。孵一抗4 ℃過夜、孵二抗2 h,曝光機上曝光并拍照。分析灰度值,以β-actin為內(nèi)參。

        1.7 流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡

        將細胞接種于六孔板內(nèi),待細胞生長至70%,胰蛋白酶消化細胞,加入4 mL PBS,800 r·min-1、5 min離心,棄上清。輕輕吹打細胞使細胞懸液均勻,加入Annexin V-FITC結(jié)合液重懸細胞,再加入Annexin V-FITC液重懸細胞,避光孵育10 min,相繼加入Annexin V-FITC結(jié)合液和碘化丙啶染色液,上機。根據(jù)所得數(shù)據(jù)進行結(jié)果分析。

        1.8 統(tǒng)計學(xué)方法

        2 結(jié)果

        2.1 A549細胞GATA4啟動子甲基化頻率的變化

        用甲基化特異性PCR(MSP)法對BEAS-2B細胞和人NSCLC細胞系A(chǔ)549的GATA4啟動子DNA甲基化水平進行檢測發(fā)現(xiàn),與BEAS-2B相比,A549細胞的GATA4啟動子的DNA甲基化水平顯著升高[(3.383±0.614)%比(35.53±1.89)%,t=16.14,P<0.01],見圖1。提示GATA4啟動子的甲基化可能與NSCLC的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。

        **P<0.01與BEAS-2B比較,n=6。圖1 A549細胞中GATA4啟動子甲基化頻率顯著升高

        2.2 A549細胞中GATA4 mRNA水平的變化

        用Real-time PCR檢測BEAS-2B細胞和A549細胞的mRNA表達水平,結(jié)果顯示,與對照組相比,NSCLC組細胞的GATA4 mRNA水平顯著降低(1.000±0.000比0.358±0.027,t=23.98,P<0.01),見圖2。提示NSCLC細胞GATA4啟動子甲基化水平的升高會導(dǎo)致GATA4 mRNA表達水平的降低。

        **P<0.01與BEAS-2B比較,n=6。圖2 A549細胞中GATA4 mRNA水平明顯降低

        2.3 抑制GATA4啟動子甲基化對NSCLC細胞的GATA4 mRNA水平的影響

        在A549細胞中加入2 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,用Real-time PCR檢測A549細胞的mRNA表達水平,結(jié)果顯示,與NSCLC組相比,NSCLC+5-Aza-2′deoxycytidine組細胞的GATA4 mRNA水平顯著升高(1.000±0.000比3.100±0.188,t=11.17,P<0.01),見圖3。提示加入2 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine后,NSCLCGATA4啟動子甲基化水平受到抑制,導(dǎo)致GATA4的mRNA水平升高。

        **P<0.01與NSCLC比較,n=6。圖3 抑制GATA4啟動子甲基化對NSCLC細胞GATA4 mRNA水平的影響

        2.4 抑制GATA4啟動子甲基化對NSCLC細胞增殖的影響

        除Control組外,其余分別加入0.2、0.5、2.0和5.0 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,CCK-8結(jié)果顯示,隨著抑制劑濃度的升高,NSCLC細胞的增殖率逐漸降低(F=18.95,P<0.01),見圖4A;用Western blot檢測細胞中增殖相關(guān)指標PCNA的蛋白表達,發(fā)現(xiàn)與NSCLC組相比,NSCLC+5-Aza-2′deoxycytidine組PCNA的蛋白表達水平降低(0.998±0.003比0.721±0.020,t=13.74,P<0.01),見圖4B。提示GATA4啟動子甲基化能增加NSCLC細胞的增殖。

        A:CCK-8檢測細胞的存活率,**P<0.01與Control比較,n=5;B:Western blot檢測PCNA的表達,**P<0.01與NSCLC比較,n=6。

        2.5 抑制GATA4啟動子甲基化對NSCLC細胞凋亡的影響

        Western blot結(jié)果顯示,與NSCLC組細胞相比,NSCLC+5-Aza-2′deoxycytidine組凋亡指標cleaved-caspase 3/caspase 3的比值增高(0.998±0.003比1.682±0.051,t=13.50,P<0.01),見圖5A;流式細胞術(shù)檢測細胞的凋亡情況,發(fā)現(xiàn)與NSCLC組細胞相比,NSCLC+5-Aza-2′deoxycytidine組的凋亡率增高[(6.222±0.399)%比(14.990±0.690)%,t=11.00,P<0.01],見圖5B。提示GATA4啟動子甲基化能降低NSCLC細胞的凋亡。

        A:Western blot檢測cleaved-caspase 3和caspase 3的表達,**P<0.01與NSCLC比較,n=6;B:流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡,**P<0.01與NSCLC比較,n=6。

        3 討論

        肺癌是全球癌癥死亡的主要原因[1],其中絕大多數(shù)的肺癌屬于NSCLC[2]。有研究[3]發(fā)現(xiàn),癌基因突變和DNA甲基化異常與NSCLC密切相關(guān)。作為機體內(nèi)的抑癌基因,轉(zhuǎn)錄因子GATA4可能是NSCLC功能喪失的靶點,且GATA4啟動子甲基化在其中起著關(guān)鍵的作用[12]。

        本研究采用MSP法檢測對照細胞與NSCLC細胞中的GATA4啟動子DNA甲基化水平,發(fā)現(xiàn)NSCLC細胞中GATA4啟動子甲基化率顯著升高;采用焦磷酸測序進一步檢測GATA4啟動子區(qū)CPG島的甲基化水平,NSCLC組細胞的GATA4啟動子各位點的DNA甲基化水平同樣顯著升高;采用Real-time PCR檢測發(fā)現(xiàn)NSCLC細胞中GATA4 mRNA水平明顯降低,說明NSCLC細胞中GATA4啟動子的甲基化可能導(dǎo)致GATA4 mRNA表達降低。由此,推測GATA4啟動子的甲基化可能與NSCLC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。

        抑制腫瘤細胞的增殖是NSCLC控制和治療的方式之一。HELLEBREKERS等[13]發(fā)現(xiàn),GATA4的過表達可以抑制一些腫瘤細胞的增殖。同樣,AGNIHOTRI等[14]在惡性膠質(zhì)瘤中的研究發(fā)現(xiàn),GATA4的缺失使細胞增殖加速,患者病程加速。那么,GATA4是否可以對NSCLC細胞的增殖產(chǎn)生影響?而GATA4啟動子的DNA甲基化是否參與其中?為此,本研究在NSCLC細胞中加入2 μmol·L-1的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,培養(yǎng)48 h后,檢測NSCLC細胞的GATA4 mRNA水平,發(fā)現(xiàn)細胞在加入甲基化抑制劑后GATA4的mRNA水平顯著升高;分別在NSCLC細胞中加入不同濃度的甲基化抑制劑5-Aza-2′deoxycytidine,培養(yǎng)24 h后,CCK-8檢測細胞增殖率,發(fā)現(xiàn)隨著抑制劑濃度的變化,細胞的增殖率逐漸降低;檢測細胞中增殖相關(guān)指標PCNA的蛋白表達,發(fā)現(xiàn)甲基化抑制后細胞的增殖相關(guān)蛋白PCNA的表達水平降低。提示GATA4啟動子甲基化能增加NSCLC細胞的增殖。這與以往的研究[13-14]認為GATA4具有抑癌作用的結(jié)果一致。

        NSCLC的控制和治療同樣依賴于NSCLC細胞的凋亡增加,推測在NSCLC中,GATA4啟動子甲基化有可能對肺癌細胞的凋亡產(chǎn)生影響。為了驗證這個假設(shè),本研究采用Western blot檢測細胞中凋亡指標cleaved-caspase 3和caspase 3的表達,發(fā)現(xiàn)抑制GATA4啟動子甲基化后cleaved-caspase 3/caspase 3的比值增高;采用流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡,同樣發(fā)現(xiàn)抑制GATA4啟動子甲基化后NSCLC細胞凋亡率增加。提示GATA4啟動子甲基化能降低NSCLC細胞的凋亡。GONG等[15]發(fā)現(xiàn)GATA4可以抑制胰腺導(dǎo)管癌增殖和分化,通過促進抑癌基因P53表達,并通過KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),GATA4調(diào)控基因部分富集在MAPK和JAK-STAT信號通路中。

        綜上所述,在NSCLC中,GATA4啟動子DNA的甲基化水平升高,去甲基化減少,從而可能導(dǎo)致GATA4 mRNA表達降低,有可能誘導(dǎo)肺癌細胞的增殖,抑制肺癌細胞的凋亡,從而誘使NSCLC的發(fā)生并促進其發(fā)展。本研究為NSCLC的干預(yù)和治療提供了新的靶點;然而,本課題僅粗略的探究了NSCLC中GATA4啟動子DNA的甲基化與細胞增殖和凋亡的關(guān)系,并未深入探究其具體的機制,因此,將進一步研究GATA4啟動子DNA的甲基化是依靠哪些途徑來促進細胞增殖并抑制細胞凋亡的,從而為今后NSCLC的治療和干預(yù)提供更進一步的理論基礎(chǔ)。

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