王晶瑩,劉 洋,劉啟迪
(1.吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院 a.檢驗(yàn)科;b.呼吸內(nèi)科,吉林 長春130033;2.吉林大學(xué)第二臨床醫(yī)院 放射線科)
人組織谷氨酰胺轉(zhuǎn)胺酶(TGM2)是一種具有轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶交聯(lián)(TGase)、G蛋白信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和激酶活性的多功能酶,被認(rèn)為在多種疾病中起作用。TGM2的mRNA通過選擇性剪接進(jìn)行調(diào)控,產(chǎn)生C端截短形式的TGM2,被預(yù)測具有獨(dú)特的生化特性和生物學(xué)功能。本研究將生物信息學(xué)手段聯(lián)合臨床分析,基于Western blot方法及免疫組化法驗(yàn)證并觀察蛋白TGM2在肺癌中的表達(dá)及診斷意義。
收集就診于吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院同時臨床確診為肺癌患者的腫瘤組織及癌旁組織(男性22例,女性28例),取少量新鮮組織標(biāo)本,快速、低溫條件下,PBS洗滌組織標(biāo)本,以手術(shù)消毒剪刀將組織分為較小塊狀,置于凍存管中。液氮保存,備用。
1.2.1蛋白提取 取組織,在液氮中研磨,加入組織蛋白裂解液,低溫震蕩,冰敷,此步驟重復(fù)三次。低溫超速離心機(jī)離心(Tempreture:4℃,speed:12 000 rpm/min,time:1 h),將上清取少量用于蛋白濃度測定,其余大部分上清轉(zhuǎn)移至新的EP管中,-80℃保存,備用。
1.2.2Western blot 微量加樣器取經(jīng)預(yù)處理的蛋白樣品,注入凝膠內(nèi),電壓110 V。將凝膠電泳分離的蛋白進(jìn)行切割,留取目的蛋白所在凝膠片段,置于已經(jīng)完成活化的膜上,電流 90 mA,1 h,5%脫脂奶粉封閉。稀釋TGM2抗體,4℃,孵育過夜。PBS-吐溫洗膜。脫脂奶粉稀釋二抗,室溫孵育2 h;洗膜?;瘜W(xué)發(fā)光法曝光。
1.2.3生物信息數(shù)據(jù)庫分析 登錄TCGA數(shù)據(jù)庫,檢索肺癌組織中差異表達(dá)的基因,并根據(jù)表達(dá)的差異水平,對差異基因進(jìn)行篩選。
1.2.4免疫組化 將肺癌的病理切片進(jìn)行脫蠟,再經(jīng)酶滅活、抗原修復(fù)、冷卻、PBS沖洗等一系列的預(yù)處理,將稀釋的一抗滴加至組織切片上,低溫孵育過夜;常溫孵育二抗,4小時。顯色,復(fù)染,分化,返藍(lán),封片。
1.2.5統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 13.0分析,組間差異采用卡方檢驗(yàn),P<0.05具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。
TGM2在肺癌中的基因表達(dá)水平,通過檢索TCGA數(shù)據(jù)庫,結(jié)果如圖1所示,肺癌組織中的TGM2基因顯著低于癌旁組織。
圖1 差異表達(dá)基因TGM2在TCGA數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果
Western blot分析肺癌組織及癌旁組織中蛋白TGM2的表達(dá),結(jié)果如圖2所示,發(fā)現(xiàn)TGM2在肺癌組織中的表達(dá)顯著低于癌旁組織。
圖2 TGM2在肺癌及癌旁組織中的表達(dá)
免疫組化實(shí)驗(yàn)中,對組織切片進(jìn)行染色,結(jié)果如圖3。經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析,如表1,發(fā)現(xiàn)TGM2蛋白在肺癌組織中有更顯著的低表達(dá),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05)。
圖3 TGM2在肺癌及癌旁正常組織中的表達(dá)(×200)
表1 肺癌與癌旁組織中TGM2蛋白表達(dá)情況對比
TGM2是谷氨酰胺轉(zhuǎn)胺酶家族中最復(fù)雜和最普遍的成員,它通過引入高度穩(wěn)定的ε-(γ-谷氨酰胺基)賴氨酸異肽鍵或在Ca2+存在下在選定的肽結(jié)合谷氨酰胺殘基上結(jié)合多胺來催化蛋白質(zhì)的翻譯后修飾[1]。此外,TGM2還可以水解核苷酸三磷酸鳥嘌呤(GTP),并作為蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶、激酶[1-2]。在生理學(xué)上,TGM2被認(rèn)為是細(xì)胞或組織防御機(jī)制的一個組成部分;它的表達(dá)經(jīng)常被上調(diào),以應(yīng)對細(xì)胞損傷或其他應(yīng)激源,以保護(hù)細(xì)胞免受內(nèi)源性和環(huán)境壓力的影響,并在以后修復(fù)組織以實(shí)現(xiàn)持續(xù)的體內(nèi)平衡。
最近的一些研究認(rèn)為TGM2在多種癌癥中的表達(dá)異常[3-7]。重要的是,TGM2表達(dá)的增加通常與耐藥性有關(guān)[4-7]。對區(qū)域特異性DNA甲基化的詳細(xì)分析表明,TGM2是參與的基因之一,其表達(dá)水平因耐藥癌細(xì)胞的甲基化的狀態(tài)而改變[8]。在后來的一項(xiàng)研究中,科研人員[9]觀察到TGM2基因是耐藥癌細(xì)胞表觀遺傳沉默的一個有希望的靶點(diǎn),其甲基化狀態(tài)可以作為化療敏感性腫瘤的標(biāo)記物。同樣,TGM2在腫瘤標(biāo)本中的表達(dá)與患者的轉(zhuǎn)移擴(kuò)散和不良的疾病預(yù)后相關(guān)[5,7]。利用功能喪失和獲得的方法,一些研究者報(bào)告了TGM2的異常表達(dá)促進(jìn)了對化療藥物的抵抗和癌細(xì)胞的侵襲性[4-9]。TGM2也與表皮生長因子受體介導(dǎo)的腫瘤發(fā)生有關(guān)[10]。核轉(zhuǎn)錄因子-κB(NF-κB)、缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)-1α、Akt和黏著斑激酶(FAK)的激活以及腫瘤抑制因子PTEN(第10號染色體上缺失的磷酸酶和張力素同源物)的下調(diào)是TGM2表達(dá)的常見反應(yīng)途徑。最近,TGM2在絲氨酸216處的磷酸化被認(rèn)為是誘導(dǎo)NF-κB和Akt激活和PTEN下調(diào)的關(guān)鍵[11]。本研究通過對TGM2在肺癌中的表達(dá)水平的研究,認(rèn)為TGM2可作為肺癌潛在的腫瘤標(biāo)志物。