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        蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在婦科疾病研究中的應(yīng)用

        2021-03-19 08:24:40黃原昕賴東梅
        關(guān)鍵詞:組學(xué)卵巢癌卵泡

        黃原昕,賴東梅

        上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬國際和平婦幼保健院上海市胚胎源性疾病重點實驗室,上海200030

        蛋白質(zhì)組學(xué)以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)的組成及其變化規(guī)律,包括蛋白質(zhì)的表達水平、翻譯后的修飾、亞細胞定位或遷移、蛋白與蛋白相互作用等[1],由此獲得蛋白質(zhì)水平上關(guān)于疾病發(fā)生、細胞代謝等過程的認識。蛋白質(zhì)組學(xué)通過比較正常人與患者生物樣本之間蛋白質(zhì)種類、表達量、修飾狀態(tài)的差異,可由此篩選出與疾病診斷治療相關(guān)的蛋白質(zhì)標志物或潛在治療靶點,闡明疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制或發(fā)展新的治療技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在婦科疾病中的研究應(yīng)用逐步展開,本文對此進行綜述。

        1 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)

        1.1 定量蛋白質(zhì)組學(xué)

        蛋白質(zhì)組學(xué)研究目前廣泛應(yīng)用的是“自下而上”的策略。傳統(tǒng)的鳥槍法策略最初基于蛋白質(zhì)分離技術(shù)——雙向凝膠電泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis,2D-PAGE),而液相色譜(liquid chromatography,LC)的引入讓蛋白質(zhì)定量分析變得更為準確。其基本流程為蛋白質(zhì)樣本經(jīng)過蛋白酶消化后由LC 分離,再進行質(zhì)譜分析和數(shù)據(jù)庫檢索。由此開發(fā)出脫離凝膠的定量方法,包括同位素標簽定量法和非標記定量法。同位素標簽定量法中,肽與各種同位素標簽相連,其中離子信號對應(yīng)樣本中的相對肽豐度。最常見的同位素標簽法包括:細胞培養(yǎng)中氨基酸的穩(wěn)定同位素標記(stable isotope labeling by amino acids in cell culture,SILAC)、同位素編碼親和標簽(isotope-coded affinity tag,ICAT)、相對和絕對定量的同位素標簽(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ) 和串聯(lián)質(zhì)譜標簽法(tandem mass tags,TMT)。與之相對,非標記定量法基于前體信號強度或光譜計數(shù),樣本制備更簡便,可檢測范圍更大,技術(shù)進步得益于高分辨率質(zhì)譜儀的發(fā)展[2]。

        1.2 數(shù)據(jù)采集方式

        經(jīng)典的鳥槍法屬于數(shù)據(jù)依賴采集模式(datadependent acquisition,DDA),可以一次性分析大量蛋白質(zhì),但可重復(fù)性較低。靶向質(zhì)譜技術(shù),主要基于選擇/多重/平行反應(yīng)監(jiān)測技術(shù)(selected-/multiple-/parallel reaction monitoring,SRM/MRM/PRM),可以提供目標蛋白精確的絕對定量結(jié)果,是質(zhì)譜絕對定量的金標準,但有低通量的缺點。數(shù)據(jù)非依賴采集模式(data independent analysis,DIA),融合了上述兩者的特點,已成為生物標志物發(fā)現(xiàn)的常規(guī)方法[3]。DIA 代表性的技術(shù)為全碎片離子順序窗口化獲取質(zhì)譜(sequential window acquisition of all theoretical mass spectra,SWATH),能將質(zhì)譜掃描范圍分為若干窗口,高速、循環(huán)地分析每個窗口中的離子。

        1.3 翻譯后修飾

        蛋白質(zhì)組分析的另一項挑戰(zhàn)是翻譯后修飾,如糖基化、泛素化、磷酸化、甲基化等。利用蛋白質(zhì)發(fā)生修飾后的質(zhì)量偏移可以實現(xiàn)翻譯后修飾位點的鑒定;同時,由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在樣本中含量低且動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜檢測前通常需要對發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段進行富集[4]。

        1.4 蛋白質(zhì)和肽組織成像

        血漿是復(fù)雜的生物樣本,所含蛋白質(zhì)的豐度差異極大,使得生物標志物的發(fā)現(xiàn)變得復(fù)雜。人體組織樣本蛋白質(zhì)的種類雖然少,卻富含與疾病相關(guān)的特定分子,因此直接分析組織樣本,尤其是對于腫瘤的研究,是一種很有前景的方法?;|(zhì)輔助激光解吸/電離-飛行時間質(zhì)譜成像技術(shù)(matrix-assisted laser desorption/ionization timeof-flight imaging mass spectrometry, MALDI-TOF-IMS)不僅能直接分析腫瘤組織中的蛋白質(zhì)組,更能提供有關(guān)脂質(zhì)和代謝物等相關(guān)物質(zhì)的空間分布信息[5]。

        2 蛋白質(zhì)組學(xué)在婦科疾病研究中的應(yīng)用

        2.1 多囊卵巢綜合征

        多囊卵巢綜合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)是以稀發(fā)排卵或無排卵、高雄激素或胰島素抵抗、多囊卵巢為特征的內(nèi)分泌紊亂的癥候群[6]。PCOS病理生理機制尚不明確,可能涉及的機制有下丘腦-垂體-腎上腺軸(hypothalamus-pituitary-ovarian axis,HPA axis) 功 能 異常、胰島素抵抗和高胰島素血癥以及腎上腺內(nèi)分泌異常。近年來,蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展為研究PCOS發(fā)病內(nèi)在機制提供了進一步探索的方向,其中一些代表性研究發(fā)現(xiàn)的生物標志物見表1。

        2.1.1 卵泡 卵泡液構(gòu)成卵母細胞發(fā)育的微環(huán)境,卵巢病理過程常常涉及卵泡液的變化。Ambekar 等[7]的研究中,對接受輔助生殖技術(shù)的健康女性和PCOS患者的卵泡液取樣后用液相色譜-質(zhì)譜法(liquid chromatography/mass spectrometry,LC/MS)進行分析,鑒定出186 種表達上調(diào)或下調(diào)的蛋白質(zhì),這些蛋白表達水平變化引起了酶活性、氧化應(yīng)激、基底膜成分、血卵屏障、卵泡血管生成、卵丘復(fù)合體的異常,在一定程度上解釋了PCOS患者卵泡發(fā)育停滯或異常的原因。Patil 等[8]的研究則利用3種凝集素對卵泡液中的糖蛋白富集后進行對比分析,發(fā)現(xiàn)10 種差異表達蛋白,經(jīng)過驗證,α1-抗胰蛋白酶(alpha-1-antitrypsin,SERPINA1)上調(diào)和α-胰蛋白酶抑制劑 重 鏈4 (inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 4,ITIH4)下調(diào),這些蛋白質(zhì)在血管生成和維持細胞外基質(zhì)穩(wěn)定方面發(fā)揮作用,對卵泡成熟至關(guān)重要。

        卵巢顆粒細胞是卵泡發(fā)育過程中的重要參與者。Lan等[9]研究比較了PCOS患者與正常對照組的卵巢顆粒細胞基因表達譜的差異,其中差異表達的基因涉及氨基酸代謝、細胞增殖、生殖系統(tǒng)發(fā)育等過程,并發(fā)現(xiàn)參與構(gòu)成促分裂原活化的蛋白激酶/細胞外信號調(diào)節(jié)激酶(mitogenactivated protein kinase/extracellular signal-regulated kinase,MAPK/ERK)信號通路的促分裂原活化的蛋白激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase 4,MAPKK4)和磷酸細胞外信號調(diào)節(jié)激酶1/2(phospho-ERK1/2)可能是影響PCOS 患者卵巢顆粒細胞功能的關(guān)鍵蛋白。關(guān)于PCOS 患者不易受孕的原因,除了卵巢功能異常之外,Amjadi 等[10]的研究發(fā)現(xiàn)其可能還與PCOS 患者子宮內(nèi)膜組織中凋亡、氧化應(yīng)激、炎癥相關(guān)蛋白表達異常有關(guān)。

        2.1.2 血漿 血液樣本的檢測雖然干擾因素較多,但能對全身疾病狀態(tài)有宏觀了解。分析患有胰島素抵抗(insulin resistance,IR)和無胰島素抵抗(NIR)的PCOS患者血清樣本,可以發(fā)現(xiàn)IR 組血清中總膽固醇(total cholesterol,TC)、三酰甘油(triacylglycerol,TAG)、低密度脂蛋白(low density lipoprotein,LDL)、空腹血糖(fasting blood glucose,F(xiàn)BG)、尿酸(uric acid,UA)水平高于NIR 組,發(fā)現(xiàn)4 種蛋白表達升高——α-白蛋白(alpha albumin/Afamin, AFM)、 血 清 轉(zhuǎn) 鐵 蛋 白(serotransferrin)、補體C3 和載脂蛋白C3(apolipoprotein C3,APOC3)。其中APOC3 的升高經(jīng)過酶聯(lián)免疫吸附測定 (enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA) 證實[11]。另 外,F(xiàn)azilat 等[12]發(fā) 現(xiàn) 在 排 卵 型PCOS 患 者(ovulatory PCOS,OPCOS)的血清中促分裂原活化的蛋白 激 酶4 (mitogen-activated protein kinase 4,MAPK4)表達下降,可能增高了患高脂血癥、高雄激素血癥和代謝綜合征的風(fēng)險。Arffman 等[13]比較了是否患有PCOS的晚期妊娠孕婦的血漿,預(yù)測PCOS與妊娠期不良事件發(fā)生風(fēng)險的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)35 種差異表達的蛋白質(zhì),涉及免疫應(yīng)答、心血管疾病發(fā)生和細胞增殖等過程,其中P 因子(properdin)和胰島素樣生長因子Ⅱ(insulin-like growth factor-Ⅱ,IGF-Ⅱ)增高幅度最大。

        表1 PCOS相關(guān)生物標志物Tab 1 Biomarkers of PCOS

        3 早發(fā)性卵巢功能不全

        早發(fā)性卵巢功能不全 (premature ovarian insufficiency,POI),是指在40 歲之前出現(xiàn)超過4 個月以上閉經(jīng),并且連續(xù)2 次間隔4 周以上的血清促性腺激素(follicle stimulating hormone,F(xiàn)SH)水平>25 IU/L。卵巢功能早衰可導(dǎo)致女性不孕,并提前出現(xiàn)衰老,且長時間的低雌激素水平將增加女性罹患骨質(zhì)疏松、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、認知功能障礙等疾病的風(fēng)險。90%以上的POI 為特發(fā)性,無明確病因,可能與遺傳因素、免疫因素、酶或受體缺陷、物理化學(xué)因素等有關(guān)[14],主要包括3 種發(fā)生機制,即卵母細胞池減少、卵泡發(fā)育障礙、卵泡閉鎖加速。

        3.1 卵泡

        最近,超重被認為是卵母細胞發(fā)育停滯的影響因素。對正常體質(zhì)量和超重女性的卵泡液進行基于iTRAQ 技術(shù)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)22 種蛋白表達上調(diào)和21 種蛋白表達下調(diào), 經(jīng)ELISA 驗證人附睪蛋白4 (human epididymis protein 4,HE4/WFDC2)可能提示超重女性卵母細胞異常發(fā)育的情況[15]。Xu 等[16]發(fā)現(xiàn)始基卵泡形成與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣結(jié)合蛋白1 (reticulocalbin-1/-3,RCN1/RCN3)、核內(nèi)不均一核糖核蛋白K (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, HNRNPK)、 肌 動 蛋 白(actin) 等有關(guān),而向初級卵泡過渡與穹窿體主蛋白(major vault protein,MVP)等有關(guān)。

        3.2 血漿

        目前,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用于POI 診斷及治療的研究并不多。Lee 等[17]利用LC-MS/MS 鑒定了POI 患者血清中差異表達的11 種蛋白質(zhì),其中5 種與生殖系統(tǒng)相關(guān),包 括 血 漿 銅 藍 蛋 白 (ceruloplasmin)、 補 體 C3(complement C3)、纖維素原α 和β(fibrinogen α/β)、性激 素 結(jié) 合 球 蛋 白 (sex hormone-binding globulin,SHBG),均是潛在的蛋白質(zhì)生物標志物,見表2。

        研究影響卵泡發(fā)育的因素,引起卵泡凋亡加速的機制,對早期發(fā)現(xiàn)POI、延緩卵巢功能衰退、預(yù)防POI遠期并發(fā)癥,都具有重要的臨床價值。

        4 上皮性卵巢癌

        上皮性卵巢癌是常見的女性生殖器官惡性腫瘤之一,發(fā)病率次于宮頸癌(cervical cancer,CC)和子宮內(nèi)膜癌(endometrial cancer,EC),病死率卻位于生殖器官惡性腫瘤之首。上皮性卵巢癌患者的預(yù)后差,目前仍缺乏有效的治療手段。將蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用于卵巢癌發(fā)病機制、生物學(xué)特性的研究,并尋找高靈敏度和高特異度的生物標志物,有望幫助早期診斷、早期治療和個性化治療,從而改善患者預(yù)后。

        對卵巢腫瘤蛋白質(zhì)組進行全面檢測,并結(jié)合基因組數(shù)據(jù)進行分析,可以發(fā)現(xiàn)其中的關(guān)聯(lián)?;蚱慰截悢?shù)的變化將同時引起蛋白質(zhì)組的變化;反之蛋白質(zhì)參與的信號通路也影響基因的表達,尤其是與短期整體生存最相關(guān)的信號通路集合,可用來預(yù)測疾病的臨床轉(zhuǎn)歸[18]。

        表2 POI相關(guān)生物標志物Tab 2 Biomarkers of POI

        4.1 血漿

        血漿所含蛋白質(zhì)的豐度差異極大,蛋白質(zhì)生物標志物的發(fā)現(xiàn)比較復(fù)雜,近年來SRM/MRM為代表的靶向質(zhì)譜技術(shù)能較好地克服定量檢測中遇到的障礙。Hüttenhain等[19]提出基于SRM 的用于尋找血漿中蛋白質(zhì)生物標志物的策略,先通過比較蛋白質(zhì)組學(xué)方法篩選出候選標志物,再通過SRM對樣本中的候選標志物進行定量檢測,其中5種聯(lián)合糖類抗原125(carbohydrate antigen 125,CA125)檢測能提高卵巢癌的診斷率。不同類型上皮性卵巢癌的蛋白質(zhì)組有所差異,這些差異蛋白可輔助進行分型。Dieters-Castator等[20]應(yīng)用非標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)8種蛋白質(zhì),組合后能鑒別子宮內(nèi)膜樣卵巢癌和高級別漿液性卵巢癌,將鑒別診斷準確率提高至99.2%。

        4.2 腫瘤組織與腫瘤細胞

        4.2.1 腫瘤轉(zhuǎn)移 腫瘤的發(fā)生發(fā)展和轉(zhuǎn)移需要腫瘤細胞和腫瘤基質(zhì)的相互作用。Curtis 等[21]使用SILAC 以及無標簽定量磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究腫瘤細胞和腫瘤相關(guān)成纖維細胞(cancer-associated fibroblast,CAF)之間的雙向信號通路,發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞中糖原動員依賴于后者中的p38α MAPK 活化,通過減少p38α 及抑制糖原磷酸化酶1(phosphoglucomutase 1, PGM1) 能 減 少 腫 瘤 轉(zhuǎn) 移。Eckert 等[22]改進了一套非標記定量的蛋白質(zhì)組學(xué)研究流程,并對卵巢癌細胞及腫瘤基質(zhì)進行分析,發(fā)現(xiàn)腫瘤蛋白質(zhì)組從原位癌到轉(zhuǎn)移的過程是穩(wěn)定的,而腫瘤基質(zhì)內(nèi)煙酰胺-N-甲基轉(zhuǎn)移酶(nicotinamide N-methyltransferase,NNMT)以及其調(diào)節(jié)的幾個蛋白質(zhì)的表達量異常,NNMT的增加使組蛋白甲基化減少,促進CAF表達腫瘤增殖、轉(zhuǎn)移相關(guān)蛋白。許多研究已表明腫瘤的發(fā)生發(fā)展伴隨糖基化的異常。Everest-Dass 等[23]在福爾馬林固定石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,F(xiàn)FPE)切片上特定的組織區(qū)域使用N-酶苷酶F 預(yù)處理,再用多孔石墨化碳液相色譜-電噴霧電離-串聯(lián)質(zhì)譜(porous graphitized carbon liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry,PGLC-ESI-MS/MS)和MALDI-MSI 可以分別得到經(jīng)過N-糖基化加工的蛋白質(zhì)的豐度和空間分布信息,結(jié)果表明腫瘤細胞表面和分泌蛋白中含有復(fù)雜的多聚甘露糖結(jié)構(gòu),同時許多患者血清中也發(fā)現(xiàn)了抗多聚甘露糖結(jié)構(gòu)的抗體。

        4.2.2 耐藥性 上皮性卵巢癌對化學(xué)治療(化療)比較敏感,多采用鉑類為基礎(chǔ)的聯(lián)合化療方法,但大多數(shù)高級別漿液性卵巢癌患者對鉑類會產(chǎn)生抗藥性并出現(xiàn)復(fù)發(fā),僅約15%的患者能保持10 年以上不出現(xiàn)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移。Coscia 等[24]采用質(zhì)譜定量分析了對鉑敏感及對鉑耐藥患者的腫瘤組織蛋白質(zhì),并通過對蛋白質(zhì)磷酸化和相互作用的研究,發(fā)現(xiàn)腫瘤-睪丸抗原45(cancer/testis antigen 45,CT45)能調(diào)節(jié)磷酸化酶4的活性,增加DNA損傷和對鉑的敏感性,CT45 衍生的人類白細胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)肽段還能使腫瘤細胞被T 細胞識別并殺滅。Zhang 等[25]發(fā)現(xiàn)含硫氧還原蛋白結(jié)構(gòu)域蛋白 17 (thioredoxin domain-containing protein 17,TXNDC17)的高表達與紫杉醇耐藥性有關(guān),可以增加卵巢癌細胞自噬體形成從而使紫杉醇的殺傷力降低。上述腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)的生物標志物見表3。

        表3 卵巢癌相關(guān)生物標志物Tab 3 Biomarkers of ovarian cancer

        5 EC

        全世界每年約7.6 萬女性因EC 而死亡,病死率及新增病例的不斷增加使其成為影響女性健康的重要疾病。子宮體腫瘤絕大部分是EC,起源于子宮內(nèi)膜腺上皮。EC的發(fā)生發(fā)展過程主要為:正?;蛭s的子宮內(nèi)膜腺上皮在雌激素作用下過度增生,隨著異性細胞不斷積累而出現(xiàn)不典型增生,最后發(fā)展為低級別或高級別EC。后期如發(fā)生上皮-間質(zhì)細胞轉(zhuǎn)化(epithelial-to-mesenchymal transition,EMT),會進一步發(fā)生轉(zhuǎn)移。早期EC 的存活率較高,因此早期診斷和早期治療可以極大改善EC 患者的預(yù)后。

        5.1 血漿

        近年來,針對外周血中循環(huán)腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)、循 環(huán) 腫 瘤DNA (circulating tumor DNA,ctDNA)、蛋白質(zhì)及細胞外泌體等腫瘤相關(guān)標志物的研究較多。因樣本容易獲得,外周血中的生物標志物檢測在EC 早期診斷中被寄予厚望。目前發(fā)現(xiàn)的潛在血清蛋白質(zhì)標志物包括:①內(nèi)分泌激素:催乳素(prolactin,PRL)、 促 卵 泡 生 成 素(follicle-stimulating hormone,F(xiàn)SH)。②補體:補體C3、補體C4A。③癌相關(guān)抗原:CA125。④血漿脂蛋白:載脂蛋白A(apolipoprotein A,ApoA)。 ⑤酶 類: 基 質(zhì) 金 屬 蛋 白 酶 (matrix metalloproteinases, MMP)。 ⑥酶 抑 制 劑: HE4、SERPINA1等。需要注意其中有些蛋白,如脂蛋白,可能與EC 風(fēng)險因素之一的肥胖相關(guān),但用于診斷還需進一步驗證[26]。HE4 和CA125 已經(jīng)多次被驗證在EC 患者血清中含量增加,其中HE4 對EC 檢測的靈敏度為31.5%~78.8%,特異度為65.5%~100%,兩者組合并不顯著提高HE4 的靈敏度[27]。在未來研究中,采取多種預(yù)測潛力較大的蛋白組合建立診斷模型,能進一步提高癌癥高風(fēng)險人群中篩查效率及準確性。一項以前列腺癌、肺癌、卵巢癌、結(jié)直腸癌篩查試驗為基礎(chǔ)設(shè)計的巢式病例對照研究,從納入篩查試驗的人群中篩選出112 例患EC 的絕經(jīng)后女性作為病例組并匹配出112例對照組,通過定量蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析診斷前的血清樣本,初步篩選出病例組及對照組有差異的蛋白質(zhì),通過回歸分析找到6種有潛在高預(yù)測能力的蛋白質(zhì),并根據(jù)抽血與確診EC的時間來綜合評價其預(yù)測能力[28]。

        5.2 尿液

        尿液標本以其非侵入性、價格低廉、易獲取的優(yōu)點,很適合作為檢測樣本。尿液中含量異常的蛋白質(zhì),如鈣黏 著 蛋 白-1 (cadherin-1, CDH1)、 玻 連 蛋 白(vitronectin, VTN) 和硫酸乙酰肝素蛋白多糖2(heparan sulphate proteoglycan 2,HSPG2)有希望成為潛在的生物標志物[29]。Mu 等[30]通過表面增強激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)(surface-enhanced laser desorption ionization time of flight,SELDI-TOF)檢測到質(zhì)荷比為1 201和1 449的肽段,其鑒別EC、卵巢癌、CC的靈敏度和特異度均為100%。但尿液中的蛋白質(zhì)濃度變化大,依賴腎臟代謝,且存在易被陰道分泌物污染等因素,作為生物標志物仍有局限性。

        5.3 內(nèi)膜組織

        90%的EC 患者有異常子宮出血(abnormal uterine bleeding,AUB)的癥狀,有AUB癥狀的患者僅5%~10%患有EC,這表明大量患有良性疾病的女性需要排除EC。目前較常規(guī)的方法是陰道超聲和診斷性刮宮術(shù)。宮腔吸片通過塑料管吸取宮腔內(nèi)的脫落細胞來篩查EC,與診斷性刮宮術(shù)相比,患者痛苦小且易于接受,但取材不夠全面,活檢結(jié)果與最終子宮切除標本病理結(jié)果差異較大。Martinez-Garcia 等[31]通過對宮腔吸片中的液體進行蛋白質(zhì)組研究,在患者中找到連環(huán)素β1 (catenin beta 1,CTNB1)等3種蛋白質(zhì)的表達增高,并證明這3種蛋白組合可以提高宮腔吸片對EC 組織類型和等級的診斷,以及術(shù)前評估的準確性。

        子宮內(nèi)膜組織樣本的蛋白質(zhì)組檢測能有助于研究EC的發(fā)生發(fā)展過程并找到潛在的治療靶點。一項研究[32]對正常子宮內(nèi)膜、復(fù)雜性子宮內(nèi)膜增生、非典型性子宮內(nèi)膜增生以及EC 的組織進行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)碳酸酐酶1(carbonic anhydrase 1,CAH1)和肽基脯氨酰異構(gòu)酶B(peptidylprolyl isomerase B,PPIB)在疾病進展中的含量遞增,說明這些蛋白可能與子宮內(nèi)膜病變進展有關(guān)。通過多反應(yīng)監(jiān)測技術(shù),發(fā)現(xiàn)在高復(fù)發(fā)風(fēng)險EC 患者中,循環(huán)中細胞外囊泡(extracellular vesicle,EV)與微環(huán)境作用形成轉(zhuǎn)移灶的過程中,可溶性半乳糖凝素3 結(jié)合蛋白(lectin galactoside-binding soluble 3 binding protein,LGALS3BP)含量明顯增高。

        隨著質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展,有臨床應(yīng)用潛力的EC 生物標志物逐漸被發(fā)現(xiàn),EC的生物標志物如表4所示。

        6 CC

        CC 是婦科最常見的惡性腫瘤,由宮頸上皮內(nèi)瘤變(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)進展而來。大多數(shù)CC 與 人 乳 頭 瘤 病 毒HPV (human papilloma virus,HPV)感染有關(guān),其中70%由HPV16 和HPV18 引起。CIN 分為3 級,反映CIN 發(fā)生發(fā)展的連續(xù)病理過程。在細胞學(xué)篩查分類中,CINⅠ對應(yīng)低級別鱗狀上皮內(nèi)病變(low-grade squamous intraepithelial lesions,LSIL),高級別鱗狀上皮內(nèi)病變(high-grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)包括CINⅡ、CINⅢ和原位癌。

        表4 EC相關(guān)生物標志物Tab 4 Biomarkers of EC

        20 世紀50 年代以來,子宮頸細胞學(xué)篩查和HPV DNA檢測的普遍應(yīng)用,使CC和CIN患者得到早期發(fā)現(xiàn)和治療,CC 的發(fā)病率及病死率有了明顯下降;并且隨著HPV 疫苗的逐步推廣,CC 可望成為一種可以預(yù)防的腫瘤。但是,CIN 發(fā)病率的降低,會導(dǎo)致LSIL、HSIL 及惡性病變細胞學(xué)篩查的敏感度、特異度、陽性預(yù)測值下降,未來可能不適合早期CC 的篩查[33]。在發(fā)展中國家和地區(qū),宮頸細胞學(xué)篩查存在普及率低、費用高、病理診斷主觀因素大等問題。

        6.1 宮頸陰道液

        宮頸陰道液(cervical vaginal fluid,CVF)與癌組織或癌前組織直接接觸,許多重要的CC 生物標志物濃度在CVF 中會很高,且CVF 不接觸其他組織,是較為理想的樣本來源。通過棉簽、刷子等工具自行采集CVF,再進行后續(xù)的DNA 基因分型、免疫組化等檢測,能更方便女性參與CC 篩查。Arbyn 等[34]進行的meta 分析驗證了基于聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)的HPV 自檢測的可行性。但由于HPV 檢測需要專業(yè)技術(shù)和設(shè)備,因此推廣受限。在對健康女性和高危型、低危型HPV 感染者的CVF 樣本檢測中,其中α-輔肌動蛋白4(actinin alpha 4,ACTN4)是最有希望的CC 癌前狀態(tài)的潛在標志物。ACTN4 被發(fā)現(xiàn)在多種腫瘤中過度表達,主要起到促進細胞遷移的作用,還參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、染色質(zhì)重構(gòu)和轉(zhuǎn)錄。有研究以基于LC-MS/MS 的非標記定量法對CC 不同階段患者的蛋白質(zhì)組進行檢測,來反映CIN 的疾病進展程度,并建立相應(yīng)的統(tǒng)計模型,分別將HSIL 患者和CC 患者,正常對照及LSIL 患者進行鑒別診斷,靈敏度為77%~100%,特異度為94%~100%[35]。

        6.2 血漿

        有研究[36]將CC 發(fā)生過程中各個病變階段的血漿蛋白質(zhì)組進行比較尋找表達差異的蛋白質(zhì)。同時對健康對照、LSIL、HSIL、CC 患者治療前后的血漿樣本進行分析,包含類黏蛋白2(orosomucoid 2,ORM2)在內(nèi)的5種蛋白質(zhì)標志物在LSIL 和HSIL 組表現(xiàn)出明顯的差異表達,可作為CC 進展的潛在生物標志物。與治療前相比,治療后患者的補體因子I(complement factor I,CFI)蛋白水平明顯下降,表明其對療效具有預(yù)測價值。所有這些不同表達的蛋白質(zhì)都與補體系統(tǒng)和凝血級聯(lián)系統(tǒng)相關(guān)。另一項研究[37]通過比較健康對照、LSIL、HSIL、CC 患者血液中絲氨酸殘基的磷酸化修飾特征,發(fā)現(xiàn)磷酸化修飾蛋白隨著疾病進展而呈現(xiàn)遞增趨勢,提示異常磷酸化可能參與CC的病變過程。CC生物標志物見表5。

        表5 CC相關(guān)生物標志物Tab 5 Biomarkers of CC

        7 展望

        隨著技術(shù)的不斷進步,蛋白質(zhì)組學(xué)被應(yīng)用到生物醫(yī)學(xué)研究的各個領(lǐng)域,成為尋找疾病分子標志物和藥物靶標最有效的方法之一。然而,盡管已發(fā)現(xiàn)許多在疾病發(fā)展過程中可能產(chǎn)生作用的分子,但是其確切的功能及應(yīng)用價值仍然需要進一步研究。此外,由于蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法不同、樣本差異等原因往往導(dǎo)致研究可重復(fù)性較低。

        蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法眾多,各有優(yōu)勢和局限,需重視各種方法間的整合和互補,以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的特征[2],其與基因組學(xué)、生物信息學(xué)交叉的研究模式成為未來發(fā)展的方向。

        綜上所述,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,讓許多婦科疾病的研究取得新的進展,并找到許多潛在生物標志物。這些生物標志物的發(fā)現(xiàn),有望實現(xiàn)腫瘤篩查的自檢,也有可能發(fā)展出基于人體蛋白質(zhì)組信息的精準醫(yī)療模式。

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