張波,任龍飛,胡進(jìn)靜,白仲添,周文策,
胰腺癌(pancreatic cancer,PC)是一種常見(jiàn)的消化系統(tǒng)惡性腫瘤,發(fā)病率逐年上升,5年生存率僅9%[1-2],其高死亡率與早期癥狀不典型且易轉(zhuǎn)移有關(guān),大多數(shù)患者確診時(shí)即在晚期,缺乏有效的治療手段。因此,尋找PC早診的生物標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)是近年研究的熱點(diǎn)。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸,最初被認(rèn)為是“垃圾序列”,沒(méi)有特定的生物學(xué)功能,但越來(lái)越多的研究證實(shí)lncRNA與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[3]。LINC00857是新近研究中發(fā)現(xiàn)的與多種腫瘤的增殖、轉(zhuǎn)移、凋亡和預(yù)后相關(guān)的lncRNA[4-10],但在PC中鮮有研究。我們通過(guò)GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn),LINC00857在PC組織中高表達(dá),其表達(dá)水平越高,PC患者預(yù)后越差[11]。然而LINC00857影響PC進(jìn)展的機(jī)制尚不清楚。本研究擬檢測(cè)LINC00857在胰腺細(xì)胞系中的表達(dá)水平,并通過(guò)慢病毒轉(zhuǎn)染下調(diào)LINC00857的表達(dá),探討LINC00857對(duì)胰腺癌PANC-1細(xì)胞增殖、遷移和凋亡的影響及其可能的機(jī)制。
胰腺癌細(xì)胞株AsPC-1、PANC-1和胰腺正常上皮細(xì)胞HPNE購(gòu)自上海中科院,胰腺癌細(xì)胞株CFPAC-1由甘肅省生物治療與再生醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室提供。胰蛋白酶和DMEM培養(yǎng)基(Gibco,美國(guó));胎牛血清和RPMI 1640培養(yǎng)基(BioInd,以色列);TRIzol(Invitrogen,美國(guó));引物GAPDH和LINC00857(寶日生物,中國(guó));反轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增試劑盒(TaKaRa,日本);PVDF膜、ECL發(fā)光液(Millipore,美國(guó));LV-LINC00857-RNAi慢病毒(上海吉?jiǎng)P生物,中國(guó));E-cadherin和N-cadherin抗體(Abcam,美國(guó));Vimentin(賽維爾,中國(guó));鼠抗人GAPDH(Proteintech,美國(guó));羊抗兔、鼠二抗(SAB,美國(guó));細(xì)胞周期試劑盒(索萊寶,中國(guó));細(xì)胞凋亡試劑盒(江蘇碧云天,中國(guó));CCK-8試劑(日本同仁,日本);Transwell小室(Corning,美國(guó))。
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) AsPC-1細(xì)胞使用含10%胎牛血清的RPMI1640培養(yǎng)基,PANC-1、CFPAC-1和HPNE細(xì)胞使用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,置于恒溫培養(yǎng)箱(37℃、5%CO2)中培養(yǎng)。
1.2.2 慢病毒的設(shè)計(jì)和細(xì)胞轉(zhuǎn)染 本實(shí)驗(yàn)中使用的LINC00857 shRNA慢病毒由上海吉?jiǎng)P基因公司構(gòu)建,載體為GV112,元件順序?yàn)閔U6-MCSCMV-puromycin,其中LINC00857-sh1序列為5'-CCGGCTCCTAGAATACCACGTTTATCTCGA GATAAACGTGGTATTCTAGGAGTTTTTG-3',LINC00857-sh2序列為5'-CCGGAAGGTGGAGAA GAGTACCCAACTCGAGTTGGGTACTCTTCTCC ACCTTTTTTTG-3',空載體序列為5'-TTCTCCGA ACGTGTCACGT-3'。根據(jù)慢病毒轉(zhuǎn)染指南,六孔板中細(xì)胞匯合度在30%~40%時(shí)進(jìn)行感染,MOI值為10。共計(jì)分為4組:Normal control組為未處理的正常對(duì)照組,Negative control組為轉(zhuǎn)染空白載體的陰性對(duì)照組,LINC00857-sh1和LINC00857-sh2為實(shí)驗(yàn)組。轉(zhuǎn)染16 h后換液,3天后用嘌呤霉素(2 μg/ml)篩選,隔天換液,篩選9天獲得穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞株。
1.2.3 RNA提取和qPCR法實(shí)驗(yàn) 待細(xì)胞融合度達(dá)80%~90%時(shí),TRIzol提取細(xì)胞的RNA,檢測(cè)濃度和純度,隨即將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,將cDNA原液5倍稀釋后按10 μl反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物序列如下,LINC00857:F:5'-CCCCTGCTTCATTGTTTCCC-3',R:5'-AGCTTGTCCTTCTTGGGTACT-3';GAPDH:F:5'-GTCTCCTCTGACTTCAACAGCG-3',R:5'-ACCACCCTGTTGCTGTAGCCAA-3'。擴(kuò)增參數(shù):95℃ 30 s,1個(gè)循環(huán);95℃ 5 s,60℃ 34 s,40個(gè)循環(huán);95℃ 15 s,60℃ 1 min,95℃ 15 s,1個(gè)循環(huán)。運(yùn)用2-ΔΔCt計(jì)算檢測(cè)結(jié)果。
1.2.4 CCK-8法檢測(cè)轉(zhuǎn)染后PANC-1細(xì)胞增殖 消化處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,取每孔100 μl細(xì)胞懸液(含2 000個(gè)細(xì)胞)接種于96孔板,每組重復(fù)5次,細(xì)胞貼壁后棄掉原液,CCK-8溶液和無(wú)血清的DMEM按1:10配置,每孔加100 μl配置液,恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2 h,酶標(biāo)儀測(cè)450 nm波長(zhǎng)處的吸光度(OD)值,每天檢測(cè)1次,隔天換液,連續(xù)測(cè)5天。采用GraphPad軟件繪制增殖曲線。
1.2.5 Transwell和劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后PANC-1細(xì)胞的遷移能力 將對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞饑餓處理24 h,隨即胰酶消化,取200 μl細(xì)胞無(wú)血清懸液(含6×l04個(gè)細(xì)胞)接種于Transwell上室,600 μl(含30%胎牛血清)完全培養(yǎng)基加入下室,孵箱中培養(yǎng)48 h,隨即用4%多聚甲醛固定、結(jié)晶紫避光染色,放置在浸沒(méi)PBS的24孔板中,倒置顯微鏡(200倍)下多視野拍照。
六孔板中細(xì)胞融合度在90%左右時(shí),在超凈臺(tái)中用10 μl槍頭垂直劃痕。輕柔洗去漂浮細(xì)胞,加入2 ml DMEM(不含血清),0 h和24 h于倒置顯微鏡(100倍)下拍照。利用Image J軟件測(cè)細(xì)胞遷移前后的面積。劃痕愈合率=(0 h劃痕面積-24 h劃痕面積)/0 h劃痕面積×100%。
1.2.6 流式細(xì)胞儀檢測(cè)轉(zhuǎn)染后PANC-1細(xì)胞的細(xì)胞周期和凋亡 待細(xì)胞匯合度達(dá)70%~80%時(shí),收集消化的各組細(xì)胞,取1 ml含1×106個(gè)細(xì)胞的細(xì)胞懸液,離心后預(yù)冷PBS洗兩遍,逐滴加入70%預(yù)冷的無(wú)水乙醇重懸細(xì)胞,隨后置于4℃冰箱過(guò)夜,清洗后重懸于100 μl RNase A溶液,加400 μl碘化丙啶(PI)固定,上流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞DNA含量。取胰酶(不含EDTA)消化的5~10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞重懸于195 μl Annexin V-FITC結(jié)合液中,加入5 μl Annexin V-FITC、10 μl PI,4℃避光靜置20 min,加入300 μl結(jié)合液,上流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡情況。使用ModFit軟件分析細(xì)胞周期,F(xiàn)lowJo軟件分析細(xì)胞凋亡情況。
1.2.7 Western blot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后PANC-1細(xì)胞EMT相關(guān)蛋白的表達(dá) 提取細(xì)胞總蛋白,BCA法測(cè)蛋白濃度,加入適量5×SDS蛋白上樣緩沖液和強(qiáng)RIPA將待測(cè)蛋白樣品定量至合適濃度,的100℃沸水中煮10 min使蛋白質(zhì)變性。每孔加50 μg蛋白進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳(80 V 30 min,120 V 1.5 h,恒壓)、濕轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)膜(200 mA,2~3 h,恒流),5%BSA封閉1 h,TBST洗PVDF膜3次,每次10 min,按分子量拆剪條帶,放置于一抗(稀釋比Vimentin 1:500,GAPDH、E-cadherin和N-cadherin均為1:1 000)中,4℃冰箱保存過(guò)夜;TBST清洗后在二抗(稀釋比1:2000)中孵育1 h,ECL化學(xué)發(fā)光A、B液按1:1配置,曝光儀下顯影并拍照。采用Image J軟件核算蛋白條帶灰度值。
采用SPSS22.0和GraphPad Prism 7.00統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,定量資料用(x±s)表示,數(shù)據(jù)均進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn),每個(gè)實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)3次,兩組間比較采用t檢驗(yàn),多組間比較采用單因素方差分析。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
LINC00857 在三種胰腺癌細(xì)胞系中的表達(dá)顯著高于胰腺正常上皮細(xì)胞HPNE,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01),其中以PANC-1細(xì)胞本底表達(dá)最高,故選擇PANC-1細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn),見(jiàn)圖1A。對(duì)照組間LINC00857表達(dá)水平未見(jiàn)明顯差異(P=0.5946),與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組中LINC00857的表達(dá)水平均顯著下調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.0001),見(jiàn)圖1B。
圖1 LINC00857在胰腺細(xì)胞系中的表達(dá)情況(A)及其敲低效率的驗(yàn)證(B)Figure 1 Expression levels of LINC00857 in pancreatic cell lines(A) and verification of its knockdown efficiency(B)
與Normal control組相比,Negative control組細(xì)胞OD值減?。?4 hP=0.115,余P<0.05);與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞OD值均明顯減?。ň鵓<0.0001);實(shí)驗(yàn)組間OD值僅在48 h差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);表明下調(diào)LINC00857可抑制PANC-1細(xì)胞的增殖能力,見(jiàn)圖2。
圖2 LINC00857敲低對(duì)PANC-1細(xì)胞增殖能力的影響Figure 2 Effect of LINC00857 knockdown on proliferation of PANC-1 cells
與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組穿過(guò)的細(xì)胞數(shù)目均明顯減少(P<0.0001),實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組間各自組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.7835和P=0.7279),見(jiàn)圖3A、3C。劃痕實(shí)驗(yàn)也同樣證實(shí)了敲低LINC00857可以顯著抑制PANC-1細(xì)胞的遷移能力,見(jiàn)圖3B、3D。與Normal control組(78.54±40.25)%和Negative control組(78.06±1.263)%的劃痕愈合率相比,LINC00857-sh1組(44.92±2.14)%和LINC00857-sh2組(42.75±1.425)%的劃痕愈合率均顯著下降(P<0.0001),實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組間各自組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.9990和P=0.9226)。
細(xì)胞周期結(jié)果顯示,與Negative control組G0/G1期細(xì)胞的百分比(55.4±1.045)%相比,LINC00857-sh1組(64.91±1.185)%和LINC00857-sh2組(69.77±0.775)%顯著上升(P=0.0058和P=0.0012),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組各自組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.9743和P=0.0599)。與Negative control組S期細(xì)胞的百分比(22.15±1.51)%相比,LINC00857-sh1組(14.24±0.02)%和LINC00857-sh2組(9.9±0.38)%明顯減少(P=0.0493和P=0.0109),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組各自組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.6489和P=0.254),見(jiàn)圖4A、4C。說(shuō)明敲低LINC00857后PANC-1細(xì)胞被阻滯在G1期。
細(xì)胞凋亡結(jié)果所示,與Negative control組凋亡(早期凋亡+晚期凋亡)比例(26.84±0.97)%相比,LINC00857-sh1組(41.45±0.55)%和LINC00857-sh2組(50.3±2.6)%明顯增加(P=0.0178和P=0.0031),實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組各自組間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.8005和P=0.0914),見(jiàn)圖4B、4D。說(shuō)明敲低LINC00857后PANC-1細(xì)胞凋亡增加。
圖3 Transwell(A、C)和劃痕實(shí)驗(yàn)(B、D)檢測(cè)LINC00857敲低對(duì)PANC-1細(xì)胞遷移能力的影響Figure 3 Effect of LINC00857 knockdown on migration of PANC-1 cells detected by Transwell(A,B) and wound-healing assay(B,D)
圖4 LINC00857敲低對(duì)PANC-1細(xì)胞周期(A、C)和凋亡(B、D)的影響Figure 4 Effect of LINC00857 knockdown on cell cycle(A,C) and apoptosis of PANC-1 cells(B,D)
對(duì)照組間EMT相關(guān)蛋白表達(dá)未見(jiàn)明顯異常(均P>0.05);與Negative control組相比,實(shí)驗(yàn)組EMT相關(guān)的蛋白E-cadherin表達(dá)顯著升高(P=0.0152和P=0.0196),N-cadherin表達(dá)顯著下調(diào)(P=0.0001和P=0.0016),Vimentin表達(dá)顯著降低(P=0.0208和P=0.0170),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,見(jiàn)圖5。
圖5 LINC00857敲低對(duì)PANC-1細(xì)胞EMT相關(guān)蛋白表達(dá)的影響Figure 5 Effect of LINC00857 knockdown on expression of EMT-related proteins in PANC-1 cells
近些年研究發(fā)現(xiàn)LncRNA與PC的惡性行為及治療密切相關(guān)。如LncRNA DGCR5可誘導(dǎo)胰腺癌細(xì)胞凋亡,抑制細(xì)胞增殖[12];Wang等[13]研究發(fā)現(xiàn)lncRNA H19不僅參與維持胰腺癌細(xì)胞干性,還與胰腺癌細(xì)胞的侵襲、遷移、EMT和化療耐藥性密切相關(guān)。納米顆粒介導(dǎo)的致癌LncRNA DANCR已被證明有助于三陰性乳腺癌的治療[14]。LINC00857是一種新發(fā)現(xiàn)的LncRNA,位于人類染色體10q22.3的正鏈上,不能編碼蛋白質(zhì)[4]。LINC00857在肺癌[4-5]、胃癌[6-7]、膀胱癌[8]、肝癌[9]、食管癌[10]等癌組織或細(xì)胞中高表達(dá),通過(guò)不同機(jī)制促進(jìn)腫瘤的惡性進(jìn)展。已有研究[15]通過(guò)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)LINC00857在PC組織中高表達(dá),與PC預(yù)后呈負(fù)相關(guān),提示LINC00857可能作為促癌基因參與PC的惡性進(jìn)展。然而,LINC00857在胰腺癌細(xì)胞中的表達(dá)和作用機(jī)制尚無(wú)報(bào)道。
本研究發(fā)現(xiàn),LINC00857在胰腺癌細(xì)胞系中高表達(dá)。下調(diào)LINC00857后,細(xì)胞增殖能力明顯減弱,說(shuō)明LINC00857在PC中是一種促癌因素。細(xì)胞周期和凋亡實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)組較對(duì)照組細(xì)胞凋亡率明顯增加,G0/G1期比例增加,S期比例下降,細(xì)胞被阻滯在G1期。Wang等[4]和Pang等[7]研究發(fā)現(xiàn),LINC00857下調(diào)后,細(xì)胞周期信號(hào)通路失活,細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶2(CDK2)、細(xì)胞周期蛋白D1(cyclin D1)、細(xì)胞周期蛋白E1(cyclin E1)表達(dá)減少,細(xì)胞被阻滯在G1期,細(xì)胞增殖受到抑制;LINC00857表達(dá)缺失后肺癌和食管癌細(xì)胞凋亡比例增加,細(xì)胞增殖被抑制[5,10]。由此可見(jiàn),G1期阻滯或誘導(dǎo)凋亡可能是LINC00857下調(diào)抑制腫瘤生長(zhǎng)的機(jī)制。本研究Transwell和劃痕實(shí)驗(yàn)同時(shí)證實(shí),下調(diào)LINC00857可抑制PANC-1細(xì)胞的遷移能力;為了探究其原由,我們檢測(cè)了EMT相關(guān)蛋白的表達(dá),與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組的E-cadherin表達(dá)明顯上升,N-cadherin和Vimentin表達(dá)顯著下降,EMT過(guò)程被抑制。這與Xia等[9]在肝癌中的研究一致。腫瘤早期轉(zhuǎn)移與細(xì)胞的EMT過(guò)程緊密相關(guān),EMT可加速腫瘤的侵襲和遷移[16],這種癌細(xì)胞的表型轉(zhuǎn)換是胰腺癌細(xì)胞惡性生長(zhǎng)所必需的[17]。LncRNA SNHG12可通過(guò)EMT增加胰腺癌細(xì)胞的惡性行為[18]。因此,EMT可能是實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組遷移能力差異的原因。
綜上所述,LINC00857在胰腺癌細(xì)胞系中高表達(dá),下調(diào)LINC00857可抑制胰腺癌細(xì)胞的增殖和遷移能力,促進(jìn)細(xì)胞的凋亡,其機(jī)制可能與G1期阻滯和EMT信號(hào)通路有關(guān)。LINC00857對(duì)PC的發(fā)生發(fā)展起促進(jìn)作用,可能成為PC治療的新靶點(diǎn),但 LINC00857在PC中的具體作用機(jī)制仍需進(jìn)一步探究。