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        卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和近紅外光譜的土壤pH值預(yù)測(cè)

        2021-03-09 10:37:14唐永生陳爭(zhēng)光
        光譜學(xué)與光譜分析 2021年3期
        關(guān)鍵詞:光譜卷積建模

        唐永生,陳爭(zhēng)光

        黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)電氣與信息學(xué)院,黑龍江 大慶 163319

        引 言

        土壤酸堿度不僅影響著土壤的理化性質(zhì)和微生物的活性,還與土壤養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化以及農(nóng)作物的生長(zhǎng)發(fā)育息息相關(guān)[1]。為了能夠合理有效地開發(fā)利用耕地資源,因地制宜地對(duì)耕地進(jìn)行精準(zhǔn)施肥,需要對(duì)土壤的酸堿度變化進(jìn)行一定的監(jiān)測(cè)把控。目前對(duì)土壤酸堿度的檢測(cè)常采用比色法和電位法[2],雖然測(cè)量結(jié)果精確,但效率低,耗時(shí)長(zhǎng),不適用于在線檢測(cè)以及野外大面積土壤檢測(cè)。

        近紅外光譜在土壤成分分析與參數(shù)測(cè)定方面取得了很多研究成果。沈掌泉等[3利用近紅外光譜與偏最小二乘回歸法(partial least squares regression,PLSR)對(duì)土壤中的有機(jī)碳含量進(jìn)行預(yù)測(cè),其訓(xùn)練集和測(cè)試集的均方根誤差分別為0.192和0.200; 盛夢(mèng)鴿[4]等以國(guó)內(nèi)7個(gè)省份共計(jì)313個(gè)茶園土壤樣本為材料,采用近紅外光譜分析與多元線性回歸(multiple linear regression,MLR)方法對(duì)茶園土壤的pH值進(jìn)行預(yù)測(cè),其模型的預(yù)測(cè)相關(guān)系數(shù)為0.928; 王凱龍[5]等以野外實(shí)測(cè)土壤光譜數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),分別采用主成分回歸(principal component analysis,PCA)、PLSR及BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立土壤pH預(yù)測(cè)模型,結(jié)果表明土壤光譜數(shù)據(jù)與土壤pH值之間存在良好的相關(guān)性且呈顯著水平。高小紅[6]等利用可見(jiàn)光-近紅外光譜與BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相結(jié)合的方式對(duì)土壤全氮含量進(jìn)行估算,模型對(duì)預(yù)測(cè)集的決定系數(shù)為0.81; 方向[7]等利用可見(jiàn)光-近紅外光譜和最小二乘支持向量機(jī)(least squares support vector machine,LSSVM)對(duì)土壤中的速效磷進(jìn)行預(yù)測(cè),模型對(duì)驗(yàn)證集的決定系數(shù)為0.78。以上研究結(jié)果表明,采用這些方法能夠有效地對(duì)小樣本土壤數(shù)據(jù)養(yǎng)分含量進(jìn)行預(yù)測(cè),但是隨著研究的深入,數(shù)據(jù)量的增加,這些方法的弊端也慢慢暴露出來(lái),其中,PLS不能有效的處理非線性問(wèn)題,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)容易出現(xiàn)局部最優(yōu)解和“過(guò)擬合”現(xiàn)象,而SVM則無(wú)法對(duì)大規(guī)模的訓(xùn)練數(shù)據(jù)實(shí)施訓(xùn)練。

        近年來(lái)由于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolution neural network,CNN)具備局部感知,權(quán)值共享及自動(dòng)提取數(shù)據(jù)特征的特點(diǎn),模型的運(yùn)行效率較高,從而被廣泛應(yīng)用在計(jì)算機(jī)視覺(jué)[8],自然語(yǔ)言處理[9],語(yǔ)音識(shí)別[10]等領(lǐng)域。故將CNN應(yīng)用于基于近紅外光譜數(shù)據(jù)的土壤pH值預(yù)測(cè)建模中,首先對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行一階求導(dǎo)和Savitzky-Golay平滑預(yù)處理,消除基線漂移或其他背景干擾,提高信噪比。然后根據(jù)近紅外光譜數(shù)據(jù)的特點(diǎn)對(duì)經(jīng)典CNN模型進(jìn)行改進(jìn),建立土壤pH值的CNN預(yù)測(cè)模型,并與傳統(tǒng)的PLSR和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法模型進(jìn)行對(duì)比,旨在探究一種高效準(zhǔn)確的土壤pH值獲取方法。

        1 實(shí)驗(yàn)部分

        1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源

        以歐洲統(tǒng)計(jì)局在2008年—2012年對(duì)歐盟23個(gè)成員開展的土地利用及覆蓋面積統(tǒng)計(jì)調(diào)查研究(European Commission Land Use/Cover Area frame Statistical Survey,LUCAS)所采集的土壤養(yǎng)分及可見(jiàn)光近紅外光譜樣本為研究對(duì)象,共計(jì)19 936個(gè)樣本點(diǎn)。土壤樣本分為礦物質(zhì)和腐殖質(zhì)兩類,主要包括耕地,林地,草地等多種土壤類型,樣本的取樣深度為土壤剖面的0~20 cm范圍,采用十字交叉法在采樣點(diǎn)2米范圍內(nèi)取5份土樣約500 g進(jìn)行混合[11]。土壤pH值依照ISO 10390—1994標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行檢測(cè),使用FOSS XDS近紅外光譜分析儀進(jìn)行光譜采集,光譜儀測(cè)量波長(zhǎng)范圍為400~2 500 nm,分辨率為0.5 nm。光譜預(yù)處理采用CAMO公司的The Unscrambler X10.3。使用Python語(yǔ)言調(diào)用Tensorflow工具包搭建基于CNN的回歸預(yù)測(cè)模型。

        選取了LUCAS土壤數(shù)據(jù)集中的礦物質(zhì)土壤樣本共計(jì)17 272個(gè)。其中隨機(jī)選取15 000個(gè)樣本作為建模集,剩余的2 272個(gè)樣本作為測(cè)試集。土壤樣本pH值統(tǒng)計(jì)信息如表1所示,其中建模集的pH值范圍為3.430~10.080,測(cè)試集的pH值范圍為3.510~8.770,建模集能夠完整覆蓋測(cè)試集中土壤樣本的pH值范圍。

        表1 LUCAS土壤數(shù)據(jù)集pH值基本信息Table 1 Basic information of pH value in LUCAS soil dataset

        1.2 光譜數(shù)據(jù)處理

        pH值作為衡量土壤養(yǎng)分轉(zhuǎn)化及土壤肥力的一個(gè)重要指標(biāo),是土壤養(yǎng)分管理項(xiàng)目中必測(cè)的內(nèi)容之一,土壤的酸堿度主要與土壤有機(jī)質(zhì)和微生物中的氫氧基團(tuán)及土壤膠體中的Al+和H+濃度有關(guān)。LUCAS光譜的平均曲線及變異系數(shù)曲線如圖1所示,由于受到土壤中氫氧基,羥基鋁及甲基團(tuán)的影響,光譜曲線在1 400,1 900,2 200和2 350 nm處出現(xiàn)明顯的波峰。光譜儀在采集土壤樣本時(shí),會(huì)受到周圍環(huán)境的影響,光譜中往往會(huì)摻雜各種噪聲,因此光譜曲線出現(xiàn)中等變異,變異平均系數(shù)為0.217。為消除光譜中的基線偏移,提高信噪比,采用一階求導(dǎo)和Savitzky-Golay平滑(多項(xiàng)式階數(shù)為2,平滑點(diǎn)數(shù)為11)對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,處理后的光譜圖像如圖2所示,后續(xù)的建模及預(yù)測(cè)都是基于圖2數(shù)據(jù)進(jìn)行。

        圖1 LUCAS土壤樣本平均光譜曲線圖Fig.1 Mean spectra of LUCAS soil samples

        圖2 經(jīng)過(guò)預(yù)處理的土壤近紅外光譜圖Fig.2 Pretreated near infrared spectra of soil

        1.3 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

        卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是一種端到端的有監(jiān)督式神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),基本架構(gòu)由輸入層,卷積層,非線性激活層,池化層和全連接層五部分組成。其中卷積層是卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中最重要的一層,即通過(guò)“局部連接,權(quán)值共享”的方式對(duì)輸入光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行特征提取。卷積之后,通常會(huì)加入偏置,并引入非線性激活函數(shù),經(jīng)過(guò)激活函數(shù)后,得到結(jié)果

        (1)

        池化是一種非線性的降采樣方法,主要是對(duì)卷積層輸出的特征值進(jìn)行降維,減少運(yùn)算規(guī)模。目前,池化主要分為最大值池化和平均值池化兩種方式,本工作則采用最大池化法來(lái)對(duì)模型進(jìn)行降采樣處理。

        1.4 建立模型

        整個(gè)模型的參數(shù)設(shè)置如表2所示,為避免在特征學(xué)習(xí)過(guò)程中出現(xiàn)梯度消失,神經(jīng)元飽和的狀況,將所有的激活函數(shù)均設(shè)置為線性整流函數(shù)(rectified linear units,ReLU)。經(jīng)過(guò)四層卷積池化操作后得到128個(gè)寬度為260的光譜信號(hào),然后將128個(gè)光譜信號(hào)進(jìn)行扁平化處理,將得到的一維數(shù)據(jù)輸入到全連接層,全連接層含有兩個(gè)隱含層,為使計(jì)算機(jī)充分利用資源,全連接層兩個(gè)隱含層神經(jīng)元的個(gè)數(shù)分別為1 024和128,輸出層含有一個(gè)神經(jīng)元,用于實(shí)值回歸。整個(gè)網(wǎng)絡(luò)層的基本架構(gòu)如圖3所示。

        表2 CNNR模型參數(shù)設(shè)置Table 2 Parameters of CNNR model

        圖3 CNNR模型基本結(jié)構(gòu)Fig.3 Basic structure of CNNR model

        網(wǎng)絡(luò)模型采用信號(hào)前向傳遞,誤差反向傳播的方式進(jìn)行訓(xùn)練,前向傳遞中初始化網(wǎng)絡(luò)權(quán)重和偏置值分別為截?cái)嗾龖B(tài)分布的隨機(jī)值和固定值0.1,反向傳播中采用的損失函數(shù)為均方誤差函數(shù),如式(2)所示

        (2)

        2 結(jié)果與討論

        2.1 訓(xùn)練次數(shù)及卷積層數(shù)對(duì)模型的影響

        在使用建模集樣本對(duì)模型內(nèi)部參數(shù)進(jìn)行調(diào)節(jié)中,為探究訓(xùn)練次數(shù)對(duì)CNNR模型的影響,將測(cè)試集樣本每隔100次迭代輸入到訓(xùn)練模型中,用于檢驗(yàn)?zāi)P偷挠?xùn)練效果。如圖4所示,隨著訓(xùn)練次數(shù)的不斷增加,模型的均方誤差逐漸減小,模型的精度不斷提高,模型在2 400次訓(xùn)練后達(dá)到最佳狀態(tài)。由于訓(xùn)練集樣本數(shù)據(jù)量大,數(shù)據(jù)復(fù)雜性高,因此在前期迭代訓(xùn)練中,模型特征學(xué)習(xí)不足,模型的測(cè)試損失小于訓(xùn)練損失。當(dāng)訓(xùn)練次數(shù)大于2 500次時(shí),模型的測(cè)試損失與訓(xùn)練損失之間的距離不斷變大,模型開始出現(xiàn)過(guò)擬合現(xiàn)象,因此為防止出現(xiàn)過(guò)擬合現(xiàn)象,模型可以在第2 500次訓(xùn)練之后停止訓(xùn)練。

        為了探究卷積層數(shù)對(duì)模型預(yù)測(cè)性能的影響,在使用同一種土壤近紅外光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行建模的情況下,分別采用三層、四層、五層卷積層對(duì)模型進(jìn)行訓(xùn)練,模型的預(yù)測(cè)性能隨卷積層的變化曲線如圖5所示,由曲線對(duì)比可知,三種模型的預(yù)測(cè)結(jié)果大致相同; 在特征學(xué)習(xí)速度方面,3層卷積層的模型特征學(xué)習(xí)速度最慢,模型需訓(xùn)練1 500次后才能達(dá)到穩(wěn)定預(yù)測(cè)狀態(tài),五層卷積層的模型特征學(xué)習(xí)速度最快,模型在1 000次訓(xùn)練后就達(dá)到了穩(wěn)定,而四層卷積層的特征學(xué)習(xí)速度與五層類似,模型在訓(xùn)練1 000次左右達(dá)到穩(wěn)定的預(yù)測(cè)狀態(tài)。因此,本文選用具有四個(gè)卷積層的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)樣本進(jìn)行訓(xùn)練學(xué)習(xí)。

        圖4 CNNR模型訓(xùn)練損失和測(cè)試損失Fig.4 Training loss and test loss of CNNR model

        圖5 CNNR模型不同卷積層測(cè)試損失Fig.5 Test loss of different convolutions of CNNR model

        2.2 不同模型性能比較

        為了了解CNN網(wǎng)絡(luò)模型的優(yōu)劣性,選用了目前較為常用的PLSR和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)兩個(gè)模型作為對(duì)比。BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)設(shè)置隱含層為75個(gè)神經(jīng)元的單隱層結(jié)構(gòu)模型。由于LUCAS土壤樣本數(shù)據(jù)量比較大,不適用于PLSR建模,因此將數(shù)據(jù)集分成7組進(jìn)行計(jì)算,每組從LUCAS數(shù)據(jù)集中隨機(jī)選取2 100個(gè)樣本用于PLSR建模,隨機(jī)選取367個(gè)樣本用于預(yù)測(cè),各組數(shù)據(jù)之間獨(dú)立不交叉。設(shè)置PLSR模型的最大成分?jǐn)?shù)為7,得到7個(gè)PLSR模型,選擇最優(yōu)模型為最終的PLSR建模結(jié)果。三種模型預(yù)測(cè)結(jié)果如表3所示,在使用同一種土壤近紅外光譜數(shù)據(jù)訓(xùn)練模型的情況下,CNN模型的效果要優(yōu)于傳統(tǒng)的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和PLSR模型。

        表3 三種模型的預(yù)測(cè)效果對(duì)比Table 3 Comparison of the predictive effects of three models

        圖6、圖7和圖8分別為三個(gè)模型測(cè)試集的預(yù)測(cè)值與真實(shí)值的散點(diǎn)擬合圖。由圖對(duì)比可以看出,三種模型中CNN模型的預(yù)測(cè)效果最好,數(shù)據(jù)點(diǎn)密集地集中在擬合直線的兩側(cè),而BP模型和PLSR模型的數(shù)據(jù)點(diǎn)分布較分散。因此,利用深度學(xué)習(xí)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)土壤pH值進(jìn)行預(yù)測(cè)的方案要優(yōu)于傳統(tǒng)的PLSR和BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型。

        圖6 BP模型對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè)結(jié)果Fig.6 Prediction of soil pH value by BP model

        Yang[13]等利用LS-SVM,ELM等機(jī)器學(xué)習(xí)方法對(duì)可見(jiàn)-近紅外光譜原譜數(shù)據(jù)進(jìn)行建模,對(duì)土壤pH值進(jìn)行預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)模型的決定系數(shù)皆為0.740; 而本文使用BP和CNN模型實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè),其結(jié)果分別為0.792和0.909,本文所使用的方法預(yù)測(cè)精度有所提高??梢?jiàn),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型較SVM和PLSR等傳統(tǒng)模型在非線性建模方面具有一定的優(yōu)勢(shì)。而基于CNN的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型能夠利用其獨(dú)特的內(nèi)部結(jié)構(gòu)實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤近紅外光譜的特征提取與學(xué)習(xí),通過(guò)多次的卷積與池化操作,不斷降低光譜中無(wú)關(guān)數(shù)據(jù)的干擾,從而獲得更加細(xì)致的光譜特征,利用這些特征實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤pH值的高效預(yù)測(cè),比傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法具有較高的擬合水準(zhǔn)。

        圖7 PLSR模型對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè)結(jié)果Fig.7 Prediction of soil pH value by PLSR model

        圖8 CNNR模型對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè)結(jié)果Fig.8 Prediction of soil pH values by CNNR model

        王璨等利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)土壤近紅外光譜進(jìn)行建模,實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤含水率的預(yù)測(cè),并與傳統(tǒng)的BP,PLSR,LS-SVM方法得到的模型進(jìn)行對(duì)比,所得結(jié)論與本文基本一致,從而充分證明了CNN模型的特征學(xué)習(xí)能力。Padarian[14]等利用二維卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)LUCAS土壤數(shù)據(jù)進(jìn)行建模,實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè),測(cè)試集的決定系數(shù)為0.870,而本文采用一維CNN模型實(shí)現(xiàn)對(duì)土壤pH值的預(yù)測(cè),結(jié)果為0.909,可見(jiàn)使用一維卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)土壤近紅外光譜進(jìn)行建模相比于二維卷積不僅能夠有效簡(jiǎn)化光譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理過(guò)程而且還能夠使模型具有較高的泛化學(xué)習(xí)能力。

        綜上所述,卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠用于土壤近紅外光譜的回歸分析建模中,并在土壤pH值預(yù)測(cè)方面相比于傳統(tǒng)模型具有更高的擬合和預(yù)測(cè)能力。研究表明卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型能夠直接對(duì)一維光譜信號(hào)進(jìn)行高效的特征抽取,并能利用這些特征不斷的調(diào)節(jié)修正模型內(nèi)部參數(shù),從而使土壤pH值回歸具有較高的性能。此外,在卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中運(yùn)用池化層對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行降維,不僅能夠有效減少模型的內(nèi)部參數(shù),提高運(yùn)算速度,還增強(qiáng)了模型提取特征的魯棒性和泛化能力,使模型具有更穩(wěn)定的光譜預(yù)測(cè)效果。由于本工作是對(duì)歐洲土壤的近紅外光譜進(jìn)行pH值預(yù)測(cè)研究,因此數(shù)據(jù)具有一定的區(qū)域局限性,下一步工作將進(jìn)一步研究如何獲取更多地區(qū)特別是國(guó)內(nèi)的土壤近紅外光譜數(shù)據(jù),從而充分挖掘模型潛力,提高模型檢測(cè)精度和適用范圍。

        3 結(jié) 論

        利用近紅外光譜結(jié)合卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型對(duì)土壤的pH值進(jìn)行預(yù)測(cè),LUCAS土壤樣本作為研究對(duì)象,建立能夠檢測(cè)土壤pH值的CNN模型,分析結(jié)果表明: (1)利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)近紅外光譜進(jìn)行建??蓪?shí)現(xiàn)對(duì)土壤pH值的高效準(zhǔn)確檢測(cè); 使用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型能夠直接對(duì)一維光譜信號(hào)進(jìn)行特征提取。(2)利用測(cè)試集對(duì)搭建好的模型進(jìn)行性能評(píng)估,評(píng)估結(jié)果表明,本模型能夠準(zhǔn)確地對(duì)土壤pH值進(jìn)行預(yù)測(cè),模型的擬合優(yōu)度比傳統(tǒng)的PLSR模型高。利用本模型可以對(duì)不同地區(qū)的耕地pH值進(jìn)行檢測(cè),對(duì)耕地的資源管理及農(nóng)作物的精準(zhǔn)栽種具有指導(dǎo)意義。(3)本模型方法可應(yīng)用到其他土壤養(yǎng)分信息建模研究。

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