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        基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的骨齡輔助評測技術(shù)

        2021-03-06 05:56:16管駿
        關(guān)鍵詞:骨齡計分梯度

        管駿

        (四川大學(xué)視覺合成圖形圖像技術(shù)國防重點學(xué)科實驗室,四川 成都610064)

        1 骨齡評估方法

        1.1 現(xiàn)狀

        目前, 國內(nèi)主流的骨齡預(yù)測方式還是主要依賴于人工對于X 光照片的解讀,根據(jù)骨骼生長的一般規(guī)律進行分析,臨床醫(yī)學(xué)上用于骨齡評價所依據(jù)的方法主要有兩種,分別是圖譜法和計分法。而目前國內(nèi),中華05 計分法相比于其它的骨齡評價方法,具有更高的使用率,計分法分期具有明確的量化概念,相對于其他骨齡評估方法準(zhǔn)確度更高,可重復(fù)性較強。但缺點是需提前掌握相關(guān)知識并需要進行繁瑣的操作。

        1.2 計數(shù)法

        計數(shù)法是人為估計骨齡的一種方法,其通過觀察骨化中心隨時間在一定年齡出現(xiàn)的數(shù)目、測量骨化中心面積以及骨與骨之間的比例,同時觀察骨骺的融合時間來進行骨齡的判斷,但是這種系統(tǒng)誤差較大,又會導(dǎo)致x 射線對人體的照射量大從而導(dǎo)致對人體的損害,現(xiàn)在已很少出現(xiàn)在臨床。

        1.3 圖譜法

        圖譜法是將手骨x 射線照片與醫(yī)學(xué)骨齡標(biāo)準(zhǔn)照片進行逐項比對的方法,由Todd 制定了較為完善的骨骼成熟圖譜后開始進行流傳,主要依據(jù)青少年不同年齡手腕部骨化中心和干骺的出現(xiàn),消失順序,建立男女骨齡標(biāo)準(zhǔn)的圖譜[7],手骨射線圖譜包括男子31 張標(biāo)準(zhǔn)片,年齡范圍0-19 歲;女子27 張標(biāo)準(zhǔn)片,年齡范圍0-18 歲。評價時只需將手骨圖片與圖譜對照,找出其中最相近者,如果結(jié)余兩個相鄰年齡譜之間,取均值進行估算,即可確定未知片的骨齡。G-P 圖譜法簡便明確,在國際上廣泛使用。

        1.4 計分法

        TW 計分法,它通過將左手腕的20 塊手腕骨的發(fā)育過程進行分級,根據(jù)各骨按不同的發(fā)育狀況分為8-9 期,賦予不同的分值,最后將各個評分進行相加得到總分,最后依據(jù)各個年齡的骨成熟度得分中位數(shù)曲線得出評估結(jié)果[4],制定出判定骨齡的計分方法。在1972 年正式制定TW2 標(biāo)準(zhǔn),TW2 與TW1 的不同之處在于各骨齡等級和性別的計分方面,TW2 方法共有20 個感興趣區(qū),每個感興趣區(qū)包括骨骺、干骺端、骨干3 個部分,并根據(jù)成熟程度劃分成不同的等級。此外,男性和女性采用不同的權(quán)重計分。

        2 研究材料與方法

        2.1 研究材料

        該研究采用的是2017 年由RSNA 北美放射學(xué)會舉辦的兒童骨齡挑戰(zhàn)賽比賽的公開集,這來自于斯坦福兒童醫(yī)院和科羅拉多兒童醫(yī)院的無償提供[6],這些手骨圖片是在不同的時間、不同的條件下拍攝到的關(guān)于Kaggle 的數(shù)據(jù)集,為使其更容易實驗和做教育演示,整個RSNA 數(shù)據(jù)集選用6823 例男性、5767 例女性共12590 例手骨圖片數(shù)據(jù)進行訓(xùn)練,而RSNA 數(shù)據(jù)測試集包括男性、女性分別100 例共計200 例額外手骨圖片,不包括在訓(xùn)練集內(nèi),無需從訓(xùn)練集中進行選取。

        2.2 研究方法

        2.2.1 目標(biāo)檢測預(yù)處理

        在使用深度學(xué)習(xí)方法的過程中,數(shù)據(jù)預(yù)處理是所有后續(xù)步驟的重要基石。而該方案的第一步則是對目標(biāo)檢測的部分?jǐn)?shù)據(jù)進行標(biāo)注并訓(xùn)練,目標(biāo)檢測的準(zhǔn)確性關(guān)乎后續(xù)分類訓(xùn)練所需數(shù)據(jù)的完整性,在目標(biāo)檢測網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練開始之前需要耗費一定的時間去標(biāo)注數(shù)據(jù)。

        數(shù)據(jù)處理:

        圖1 數(shù)據(jù)標(biāo)注

        數(shù)據(jù)標(biāo)注主要參考了中華05 法和TW2 法,將兩種方法中重要的關(guān)鍵部位進行標(biāo)注,最終統(tǒng)計有16 個具體框體,并且分為七個類,分別包含手掌數(shù)據(jù),橈骨,尺骨,掌骨,近節(jié)手骨,中節(jié)手骨和遠節(jié)手骨等,其中數(shù)據(jù)標(biāo)定如圖1 所示, 利用YOLOv3-SPP 訓(xùn)練已有的手骨數(shù)據(jù)集檢測手骨的關(guān)鍵區(qū)域并進行截取,將這些關(guān)鍵區(qū)域進行姿態(tài)調(diào)整后進行融合。目標(biāo)檢測的框架為YOLOv3-SPP,整個框架使用的是python 語言。總共進行隨機標(biāo)注了1000 例手骨圖片,訓(xùn)練時按照9:1 的比例進行劃分訓(xùn)練集和驗證集。

        2.2.2 骨齡評價網(wǎng)絡(luò)設(shè)計

        骨齡評價使用的網(wǎng)絡(luò)為改進的reanet18,ResNet 網(wǎng)絡(luò)提出殘差結(jié)構(gòu),并且使用Batch Normalization 加速訓(xùn)練。相比于傳統(tǒng)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),Resnet 可以搭建超深的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),可以突破1000 層,傳統(tǒng)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)都是通過將一系列卷積層與池化層進行堆疊得到的,但是網(wǎng)絡(luò)堆疊到一定深度時,會出現(xiàn)兩個問題:a.梯度消失或者梯度爆炸,也就是當(dāng)每一層的誤差梯度小于1,反向傳播時,網(wǎng)絡(luò)越深,梯度越趨近于0;反之,若每一層的誤差梯度大于1,反向傳播時,網(wǎng)絡(luò)越深,梯度越來越大。b.退化問題,解決了梯度消失、爆炸問題后,仍然存在深層網(wǎng)絡(luò)的效果可能比淺層網(wǎng)絡(luò)差的現(xiàn)象。

        解決梯度消失或者梯度爆炸的方式可以通過數(shù)據(jù)的預(yù)處理以及在網(wǎng)絡(luò)中使用Batch Normalization 層來解決,而殘差結(jié)構(gòu)人為地讓神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)某些層跳過下一層神經(jīng)元的連接,隔層相連,弱化每層之間的強聯(lián)系,可以用于減輕退化問題,所以在進行骨齡評價的網(wǎng)絡(luò)設(shè)計中,選用ResNet 網(wǎng)絡(luò)相較于其它傳統(tǒng)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能得到更好的效果。

        而關(guān)于傳統(tǒng)的ResNet 網(wǎng)絡(luò),本文在訓(xùn)練過程中修改了其中的Relu 激活函數(shù)為隨機糾正線性單元(RReLU),ReLU 是將所有的負(fù)值都設(shè)為零,而RReLU 是給所有負(fù)值賦予一個非零斜率,而且負(fù)值的斜率在訓(xùn)練中是隨機的,在之后的測試中就變成了固定的,RReLU 的亮點在于,在訓(xùn)練環(huán)節(jié)中,aji是從一個均勻的分布U(I,u)中隨機抽取的數(shù)值,RReLU 從數(shù)學(xué)的形式表示為以下公式:

        使用RReLU 后,訓(xùn)練結(jié)果的準(zhǔn)確率提高了3 個百分點。

        2.2.3 評估結(jié)果

        將預(yù)測結(jié)果進行回歸預(yù)測,按性別分別統(tǒng)計測試集所有數(shù)據(jù)誤差在±1 歲以內(nèi)的準(zhǔn)確率,并計算平均絕對誤差(MAE)[2]。公式如下:

        表1 RSNA 不同性別訓(xùn)練結(jié)果

        3 骨齡識別系統(tǒng)設(shè)計

        本文利用opencv 計算機視覺庫和目標(biāo)檢測算法以及深度學(xué)習(xí)框架封裝的接口,且同時利用了QT 編程框架實現(xiàn)了集成本文檢測組合ROI 和骨齡評價方法的端到端的桌面應(yīng)用軟件,相較于國內(nèi)其他同類研究,本軟件環(huán)境更加易搭建、易使用。

        3.1 運行流程

        3.1.1 通過點擊QT 應(yīng)用軟件主界面按鈕選擇并打開手骨X光圖像所在文件夾并顯示手骨X 光圖像在程序主界面中。

        3.1.2 選擇待檢測圖像的性別并點擊檢測按鈕,程序加載運行封裝好的目標(biāo)檢測算法接口和模型,對輸入的手骨X 光圖像進行ROI 檢測,并在軟件界面中顯示檢測出的ROI 框體。

        3.1.3 程序根據(jù)上一步檢測出的ROI,自動提取歸一化并合成三通道的數(shù)據(jù)在本機緩存文件夾中。

        3.1.4 加載封裝好的接口和骨齡識別網(wǎng)絡(luò)模型,將合成數(shù)據(jù)輸入網(wǎng)絡(luò)中得出模型預(yù)測的骨齡并顯示在軟件界面中,程序檢測識別骨齡的流程圖如圖2。

        圖2 程序識別骨齡流程

        3.2 程序展示

        如圖3 所示為集成本研究方法的桌面應(yīng)用軟件UI,該桌面應(yīng)用軟件UI 十分簡潔,在主界面左上角為選擇檢測文件夾按鈕和路徑顯示標(biāo)簽。用戶首先通過點擊該按鈕進行待檢測手骨圖像所在文件夾選擇,程序會將文件夾包含的圖像數(shù)顯示在按鈕緊鄰的右側(cè),同時將文件名列表顯示在主界面左側(cè)。在主視圖中會顯示當(dāng)前文件夾的第一張圖像,在圖片個數(shù)顯示框右側(cè)為兩個性別的選擇按鈕,選擇性別后點擊檢測即可自動檢測全部ROI 并標(biāo)注在圖像上,同時檢測下方的textlabel 將會輸出預(yù)測的骨齡。圖3 所示的骨齡為使用了混合性別訓(xùn)練的MultiBoneNet 回歸模型預(yù)測出的結(jié)果轉(zhuǎn)換為年為單位的年齡。

        圖3 骨齡評價系統(tǒng)

        本算法應(yīng)用中的檢測算法接口和深度學(xué)習(xí)框架接口均有CPU 和GPU 兩種版本,可視具體應(yīng)用場景選擇軟件所需要的接口版本。檢測算法和接口中均包含了加載模型,預(yù)測結(jié)果的功能函數(shù)。經(jīng)測試,本軟件使用的兩種版本接口在配置GPU 為20708G、CPU 為i58300H、內(nèi)存8G、操作系統(tǒng)為WIN10 的PC 上能夠流暢運行。CPU 版每個樣例檢測識別速度平均在0.8 秒左右,而GPU 版每個樣例檢測識別速度平均在500 毫秒左右。

        4 結(jié)論

        本文介紹骨齡評價的現(xiàn)狀,針對骨齡評價方法使用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的方式,在RSNA 公開數(shù)據(jù)集取得較好結(jié)果,表現(xiàn)出較強的魯棒性。在骨齡評價速度和準(zhǔn)確率方面均具有很大優(yōu)勢,減少了骨齡識別的人工成本,并設(shè)計出了全自動的骨齡評價系統(tǒng),在耗時上遠遠低于人工評價所需時間。

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