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        ACCaseTrp 1999 Leu突變對菵草種子萌發(fā)的影響

        2021-03-01 14:55:53尹夢婕劉國平李怡慧姜波白霜李凌緒
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年12期
        關(guān)鍵詞:禾草條帶抗性

        尹夢婕 劉國平 李怡慧 姜波 白霜 李凌緒

        摘要:為了確定菵(Beckmanniasyzigachne)乙酰輔酶A羧化酶(acetyl-coenzymeAcarboxylase,ACCase)Trp-1999-Leu突變對種子萌發(fā)的影響,采用衍生酶切擴增序列多態(tài)性法(derivedcleavedamplifiedpolymorphismsequences,dCAPS)從JS-26種群中分離出基因背景一致的1999位突變純合子(1999Trp/Trp,RR)和野生型(1999Leu/Leu,SS),并在室內(nèi)測定其種子萌發(fā)的動態(tài)差異,及在pH、水分、鹽等脅迫下的萌發(fā)差異。結(jié)果表明,Trp-1999-Leu突變能夠提高菵種子的萌發(fā)率,使菵種子在偏酸性或偏堿性條件下的萌發(fā)率降低;但能顯著提高菵種子萌發(fā)對水分和鹽脅迫的耐受力,水勢為-0.4MPa時,RR萌發(fā)率比SS高23個百分點,NaCl濃度為80mmol/L時,RR的萌發(fā)率為SS的4.4倍。

        關(guān)鍵詞:菵;乙酰輔酶A羧化酶;Trp-1999-Leu突變;種子萌發(fā)

        中圖分類號:S451 文獻標(biāo)識號:A 文章編號:1001-4942(2021)12-0044-06

        菵(Beckmanniasyzigachne)為禾本科菵屬一年生或越年生雜草,喜濕,是我國稻茬麥田主要雜草之一[1]。精唑禾草靈是乙酰輔酶A羧化酶(acetyl-coenzymeAcarboxylase,ACCase)抑制劑類除草劑,化學(xué)結(jié)構(gòu)上屬于芳氧苯氧丙酸酯類(Aryloxyphenoxypropionates,APP),通過抑制禾本科雜草脂肪酸合成起到除草作用,是我國小麥田苗后選擇性防治菵的主要藥劑之一[2]。目前我國稻茬麥田菵已對精唑禾草靈產(chǎn)生了明顯抗性,靶標(biāo)酶ACCase特定氨基酸的突變是其重要的抗性機理之一,其中Trp-1999-Leu是菵中最新發(fā)現(xiàn)的抗性突變[3-5]。在除草劑存在的情況下,抗性基因可為雜草帶來收益,但在沒有除草劑存在時,可能帶來適合度代價[6]。萌發(fā)是雜草重要的生理過程,對植物生長發(fā)育有重要影響。本試驗以基因背景一致的ACCasee1999位突變純合體菵(RR)和1999位野生型菵(SS)為材料,研究Trp-1999-Leu突變對菵種子萌發(fā)的影響,以期為菵抗性進化、抗性菵治理等提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        供試菵(JS-26)種子于2012年6月采集于江蘇省丹陽市,在田間隨機采集50株以上菵種子,置紙袋內(nèi),室內(nèi)晾干,于4℃保存。敏感種群(SD-12)2013年6月采自山東省泰安市,采集、保存等方法同上。

        1.2 種子萌發(fā)與幼苗培養(yǎng)

        取成熟飽滿、大小一致的菵種子置于鋪有濾紙的9cm培養(yǎng)皿內(nèi),加入5mL清水,潤濕種子,于光照培養(yǎng)箱中催芽,L∶D=12h∶12h,光照12000Lux,白晝20℃、夜晚10℃,每日換水。胚芽生長至1cm左右時移栽于裝有疏松壤土的花盆中(直徑15cm,高9cm),壤土采自青島農(nóng)業(yè)大學(xué)校園,未施用過除草劑。菵置于15~28℃溫室內(nèi),自然光照,每兩日澆水一次。用于抗性水平測定的菵每盆移入7株,生長至三葉期間苗,每盆保留5株長勢一致的幼苗;用于衍生酶切擴增序列多態(tài)性(derivedcleavedamplifiedpolymorphismsequences,dCAPS)分析的菵每盆移入一株。

        1.3 JS-26種群對精唑禾草靈的抗性水平

        采用整株法測定JS-26種群對精唑禾草靈的抗性水平,以SD-12種群為對照。將精唑禾草靈(69g/L水乳劑,拜耳)配制成如表1所示的系列濃度,使用移動噴霧塔(3WP-2000,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部南京農(nóng)業(yè)機械化研究所)以Teejet-9503EVS型扇形噴嘴在0.28MPa下噴霧處理,噴液量450L/hm2。每盆作為一個處理,每處理重復(fù)3次,以噴施清水為對照。處理21d后,剪取地上部植株稱量鮮重,使用SigmaPlot12.5(Systat)的雙邏輯非線性回歸模型(公式1)計算鮮重抑制中濃度(GR50)。

        式中,Y為該除草劑用量下雜草地上部鮮重抑制率;C為劑量反應(yīng)下限;D為劑量反應(yīng)上限;X為除草劑用量;GR50為鮮重抑制中濃度;b為斜率。

        根據(jù)公式2計算抗性水平(RI)。

        1.4 ACCase基因克隆與測序

        在菵3~4葉期采集葉片約50mg,采用CTAB法提取總DNA[7]。根據(jù)Li等[8]的方法擴增菵質(zhì)體ACCase基因CT區(qū)域序列,引物為FP:5′TTTCCCAGCGGCAGACAGAT3′,RP:5′TCCCTGGAGTCTTGCTTTCA3′。PCR 反應(yīng)體系(25μL):FP(20μmol/L)1μL、RP(20μmol/L)1μL、dNTPs(0.25mmol/L)2μL、反應(yīng)緩沖液2.5μL、EasyTaqDNA聚合酶(500U)0.2μL、DNA1μL、雙蒸水17.25μL。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性3min;95℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸100s,共35個循環(huán);72℃延伸10min,4℃保溫。反應(yīng)結(jié)束后取PCR產(chǎn)物5μL,在1%瓊脂糖凝膠上140V電泳30min,溴化乙錠(EB)染色后,檢測目的條帶。隨后將擴增產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進行DNA測序,測序結(jié)果用DNAMAN9.0(LynnonLLC,SanRamon,CA)進行序列比對分析。JS-26種群共采集25株進行測序比對,取樣后的植株噴施精唑禾草靈觀察表型,劑量為62.1ga.i./hm2。

        1.5 dCAPS分析試驗

        參考Xu等[9]的方法進行,通過錯配引物引入HindⅢ的酶切位點(A^AGCTT),分析JS-26菵質(zhì)體ACCase第5996位的SNP(G/T)。使用引物為W1999LF:5′TGATTCCCACGAGCGGTCTGTTCCTCGTGCTGGGCAAAGCT3′(下劃線為錯配的堿基),W1999LR:5′TTGAGTTCCTCTGACCTGA3′。PCR反應(yīng)體系(25μL):DNA1μL、W1999LF(10μmol/L)1μL、W1999LR(10μmol/L)1μL、dNTPs(0.25mmol/L)2μL、反應(yīng)緩沖液2.5μL、EasyTaqDNA聚合酶(500U)0.25μL、雙蒸水17.25μL。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性3min;95℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸25s,共34個循環(huán);72℃延伸10min,4℃保溫。經(jīng)3%瓊脂糖凝膠電泳、EB染色確認目的條帶后,取PCR反應(yīng)產(chǎn)物5μL經(jīng)HindⅢ37℃酶切2h,酶切產(chǎn)物經(jīng)3%瓊脂糖凝膠電泳、EB染色后進行分析。經(jīng)內(nèi)切酶消化后,野生型(SS)應(yīng)該有一條390bp的條帶,純合突變型(RR)應(yīng)該有一條可見的349bp條帶和一條不可見的41bp條帶,雜合突變型(RS)應(yīng)該同時存在349bp和390bp兩種帶型。根據(jù)dCAPS分析結(jié)果,將SS和RR分別置于不同溫室培養(yǎng),收取種子,室內(nèi)晾干,置4℃待用。

        1.6 最適條件下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        分別在種子采集當(dāng)天與室溫儲存4個月后進行試驗,萌發(fā)條件同1.2。每皿放入25粒種子,重復(fù)4次。胚根或胚芽長度超過種子一半時視為萌發(fā),每天記錄萌發(fā)種子數(shù)量,并將其移出皿外,連續(xù)觀察20d。

        1.7 不同pH值環(huán)境下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        分別配制pH為4、6、8、10的緩沖液[10,11],按1.2的方法使菵種子在不同pH值緩沖液中萌發(fā),以去離子水(pH=6.5)為對照,每處理重復(fù)4次,20d后記錄種子萌發(fā)數(shù)。

        1.8 水分脅迫下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        配制不同濃度聚乙二醇-6000(PEG-6000)溶液,使水勢分別為0、-0.1、-0.2、-0.3、-0.4、-0.5、-0.6MPa[12],按1.2的方法萌發(fā)種子,每處理重復(fù)4次,20d后記錄種子萌發(fā)數(shù)。

        1.9 鹽脅迫下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        配制濃度分別為0、10、20、40、80、160、320mmol/L的NaCl溶液,以蒸餾水作對照,萌發(fā)條件同1.2,每處理重復(fù)4次,20d后記錄種子萌發(fā)數(shù)。

        1.10 數(shù)據(jù)處理

        試驗整體重復(fù)3次,使用SPSS20.0(IBM)對3次試驗數(shù)據(jù)進行方差齊性檢驗,若3組數(shù)據(jù)無顯著性差異(P>0.05),將數(shù)據(jù)合并。使用Sigmaplot軟件(Systat)對種子萌發(fā)過程進行非線性擬合。鹽脅迫、水分脅迫和不同pH值條件下萌發(fā)率的差異顯著性利用獨立樣本t檢驗(α=0.05)分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 JS-26種群對精唑禾草靈的抗性水平

        整株法測定結(jié)果表明(圖1),JS-26種群對精唑禾草靈的GR50值為(3554.08±110.22)ga.i./hm2;SD-12種群對精唑禾草靈的GR50值為(6.29±0.13)ga.i./hm2??梢奐S-26種群已對精唑禾草靈產(chǎn)生高水平抗性(RI=565)。

        2.2 ACCase基因克隆與測序

        擴增產(chǎn)物經(jīng)電泳分析,發(fā)現(xiàn)在約1437bp處獲得目的條帶(圖2)。測序比對后發(fā)現(xiàn),在25株供試植株中,3株ACCase1999位氨基酸密碼子為TTG,編碼色氨酸(Trp),對精唑禾草靈敏感;16株1999位密碼子為TGG,編碼亮氨酸(Leu),6株1999位密碼子為TTG/TGG,編碼色氨酸/亮氨酸(Trp/Leu),均對精唑禾草靈表現(xiàn)出耐受性。Trp-1999-Leu突變已在日本看麥娘等雜草中得到鑒定,可使ACCase對精唑禾草靈等藥劑的敏感性降低,是導(dǎo)致禾本科雜草對芳氧苯氧丙酸酯類除草劑產(chǎn)生抗性的突變位點之一[9]。

        2.3 dCAPS分析

        反應(yīng)完成后對擴增產(chǎn)物進行凝膠電泳檢測,可見在390bp處有明顯且唯一的條帶,與預(yù)期目標(biāo)符合,可用于后續(xù)試驗。擴增產(chǎn)物經(jīng)HindⅢ酶切后電泳檢測,結(jié)果如圖3所示。泳道3在349bp處有單一條帶,為突變純合子(RR);2、4、5、6在390bp處有單一條帶,為野生型(SS);1在349bp和390bp處均有條帶,為突變型雜合子(RS)。應(yīng)用此方法對JS-26種群96株菵進行檢測,得到RR型(1999Leu/Leu)79株,RS型(1999Leu/Trp)1株,SS型(1999Trp/Trp)16株。

        2.4 最適條件下RR、SS型菵種子萌發(fā)動態(tài)差異

        由圖4可知,在種子采集當(dāng)天進行試驗,RR型菵種子的tG50(萌發(fā)率達到50%所用時間)為14.7~16.8d,SS型菵種子的tG50為14.8~15.6d,二者無顯著差異;RR型菵種子最終萌發(fā)率(73%)略高于SS型(65%),但差異不顯著。室溫儲存明顯縮短了菵種子萌發(fā)所需時間,RR型和SS型菵種子的tG50分別縮短至7.5~8.4d和7.6~9.7d,且無顯著差異;儲存后RR型菵種子萌發(fā)率(99%)顯著高于SS型? 草種子(87%)??梢娛覝貎Υ?個月可顯著縮短菵種子萌發(fā)時間,且Trp-1999-Leu突變顯著提高了菵種子萌發(fā)率。

        2.5 不同pH值下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        如表2所示,菵種子的萌發(fā)對pH值變化不敏感,在pH為4~10范圍內(nèi),兩基因型菵種子萌發(fā)率均在70%以上。對比兩基因型菵種子萌發(fā)率發(fā)現(xiàn),除pH=6.0時,RR型的萌發(fā)率均顯著低于SS型。

        2.6 水分脅迫下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        菵種子萌發(fā)對滲透壓比較敏感,當(dāng)滲透壓為-0.1MPa時萌發(fā)率開始大幅降低,滲透壓低于-0.4MPa時種子的萌發(fā)率低于50%,在-0.6MPa時萌發(fā)率低于10% (表3)。在滲透壓為-0.1、-0.2、-0.6MPa時,RR型菵種子萌發(fā)率與SS型無顯著差異;在滲透壓為-0.3、-0.4、-0.5MPa時,RR型菵種子的萌發(fā)率顯著高于SS型,分別高18、23、17個百分點。

        2.7 鹽脅迫下RR、SS型菵種子萌發(fā)差異

        菵種子萌發(fā)對NaCl敏感,當(dāng)NaCl濃度達到20mmol/L時萌發(fā)率明顯降低,濃度達到160mmol/L時SS型菵種子不能萌發(fā)。RR型菵種子萌發(fā)對NaCl的耐受性更強,在NaCl濃度為20、40、80mmol/L時萌發(fā)率均顯著高于SS型(表4)。

        3 討論與結(jié)論

        菵是長江中下游地區(qū)稻茬麥田的主要雜草之一,已對精唑禾草靈、炔草酯等ACCase抑制劑普遍產(chǎn)生了抗性[13]。質(zhì)體ACCase特定氨基酸的突變是菵對精唑禾草靈產(chǎn)生抗性的重要機理,已從菵中鑒定出了Ile-1781-Leu、Ile-1781-Val、Trp-2027-Cys、Ile-2041-Asn、Asp-2078-Gly、Gly-2096-Ala等抗性突變[3,4]。質(zhì)體ACCase1999位氨基酸Trp突變也可能導(dǎo)致對ACCase抑制劑產(chǎn)生抗性,Trp-1999-Cys是1999位最先發(fā)現(xiàn)的抗性突變形式,Liu[14]、Jang[15]等將該突變導(dǎo)入酵母,重組酵母對精唑禾草靈和精喹禾靈產(chǎn)生了抗性。Liu等[5]證實菵Trp-1999-Leu突變對精唑禾草靈、精喹禾靈、唑酰草胺等具有雙環(huán)芳香基的APP類品種具有中等至高水平的抗性,對炔草酯等僅具單環(huán)芳香基的APP類品種無抗性。

        為了應(yīng)對不同生境的選擇壓力,雜草在不同空間中經(jīng)常發(fā)生生態(tài)型分化,使不同地理種群在許多與適合度代價相關(guān)的位點上表現(xiàn)出遺傳變異[16,17]。因此,控制遺傳背景是適合度代價研究的重要前提。從單個群體中鑒定、分離抗性和敏感個體是常用的控制遺傳背景的方法之一[18,19]。本研究采用dCAPS法從JS-26種群鑒定分離出1999位抗性純合子(1999Leu/Leu,RR)和敏感野生型(1999Trp/Trp,SS),獲得了遺傳背景一致的材料,消除了其他位點的干擾。

        抗性雜草種子的萌發(fā)動態(tài)會影響其在田間的發(fā)生發(fā)展[20]。本研究發(fā)現(xiàn),在最適條件下,儲存可使菵種子萌發(fā)時間縮短,且RR型萌發(fā)率顯著高于SS型。Du等[21]研究了不同突變對菵種子萌發(fā)的影響,發(fā)現(xiàn)Ile-1781-Leu、Trp-2027-Cys、Ile-2041-Asn、Asp-2078-Gly、Gly-2096-Ala等突變對儲存后菵種子萌發(fā)的tG50沒有顯著影響。Vila-Aiub等[22]發(fā)現(xiàn)ACCaseIle-1781-Leu突變使大穗看麥娘(Alopecurusmyosuroides)種子萌發(fā)的tG50升高,Ile-2041-Asn突變則對種子萌發(fā)沒有影響。可見同一突變形式對種子萌發(fā)的影響在種間呈現(xiàn)一定程度差異。

        菵種子萌發(fā)對酸堿度不敏感,pH值4~10范圍內(nèi)均適宜其萌發(fā),在偏酸性(pH=4)或偏堿性(pH為8~10)條件下,RR種子萌發(fā)率顯著低于SS。干旱脅迫和鹽脅迫對菵種子萌發(fā)影響顯著。滲透壓達到-0.1MPa時菵種子萌發(fā)率迅速下降,與Du等[21]的結(jié)果一致。在本研究中,ACCaseTrp-1999-Leu突變增強了菵種子對干旱脅迫的耐受力,在滲透壓為-0.3、-0.4、-0.5MPa時,RR型萌發(fā)率顯著高于SS型。NaCl濃度對菵種子萌發(fā)也有一定影響,濃度達到20mmol/L時,菵種子萌發(fā)率出現(xiàn)明顯下降。與SS型相比,RR型對鹽脅迫的耐受性更高,說明ACCaseTrp-1999-Leu突變提高了菵種子萌發(fā)對鹽的耐受力。Du等[21]研究了ACCase不同突變在干旱脅迫和鹽脅迫下對菵種子萌發(fā)的影響,發(fā)現(xiàn)Ile-1781-Leu突變可提高干旱脅迫下菵種子的萌發(fā)率,在野燕麥(Avenaludoviciana)上的研究則表明Asn-2041-Ile突變不會影響種子萌發(fā)對鹽脅迫和干旱脅迫的耐受性[23]。

        本試驗表明菵ACCaseTrp-1999-Leu突變降低了菵種子對酸堿的耐受性,但增強了對干旱脅迫和鹽脅迫的耐受性,對抗性菵的分布可能會產(chǎn)生一定影響。

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