郝甜,趙新偉,孫然,才滿,杜克久
(1 河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 林學(xué)院,河北 保定 071000;2 河北林木種質(zhì)資源與森林保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 保定 071000)
多溴聯(lián)苯醚(polybrominated diphenyl ethers,PBDEs)作為常見(jiàn)的環(huán)境有機(jī)污染物[1-2],可沿食物鏈逐級(jí)富集至生物體內(nèi)[3-5]。環(huán)境中PBDEs同系物因還原反應(yīng)脫溴,生成低溴聯(lián)苯醚[6],其中4-溴帶聯(lián)苯醚(4-bromodiphenyl ether,BDE-3)作為 PBDEs 脫溴反應(yīng)的終產(chǎn)物之一[7],在 PBDEs 生物修復(fù)研究中備受關(guān)注[8-10]。
ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白參與生物對(duì)逆境的適應(yīng)過(guò)程[11-12],目前多數(shù)研究集中于其對(duì)金屬或農(nóng)藥抗性等方面[13-15],并且將酵母 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在植物體內(nèi)超表達(dá),發(fā)現(xiàn)可提高植物對(duì)于重金屬的抗性[16-17],而對(duì)于其是否參與包括 PBDEs 在內(nèi)環(huán)境持久性有機(jī)污染物(POPs)的轉(zhuǎn)運(yùn)和解毒過(guò)程研究尚無(wú)報(bào)道。
毛白楊葉際異常維克漢姆酵母、煙草組培苗由河北農(nóng)業(yè)大學(xué)植物修復(fù)實(shí)驗(yàn)室保存
1.2.1 目的基因的克隆及序列分析 以異常維克漢姆酵母菌體 DNA 為模板,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果(未公開(kāi)),由上海生工合成如下2條引物分別為正向引物 5′-GGGACTCTTGACCATGTCA
TCAGATATCAGA和反向引物5′-AGTCAGATCTACCATGTCACTTCTTGGGTTTTTC。PCR反應(yīng)體系(50 μL)包括: 正向引物與反向引物各 1 μL;普通 Taq 酶 Mix:25 μL;DNA:1 μL;ddH2O:22 μL。PCR 擴(kuò)增反應(yīng)程序:(1)預(yù)變性:94 ℃,2 min。(2)變性:94 ℃,30 s,退火:56 ℃,30 s,延伸:72 ℃,5 min,30個(gè)循環(huán)。(3)最終延伸,72 ℃ 10 min。1%瓊脂糖凝膠電泳回收擴(kuò)增片段,連接pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌,菌落 PCR 鑒定陽(yáng)性菌落,重組質(zhì)粒送生工生物工程(上海)有限公司測(cè)序。
采用 GSDS 在線軟件分析基因結(jié)構(gòu);利用 SMART 進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析,由 DNAMAN 軟件與其他物種進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)。
1.2.2 植物過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建 首先根據(jù)對(duì)基因全長(zhǎng)和載體進(jìn)行酶切位點(diǎn)分析,選擇目的基因內(nèi)部沒(méi)有相應(yīng)酶切位點(diǎn)的酶SalI和SpeI,再將 pCambia1 302-35s、pT-Wapdr15 質(zhì)粒酶切后,電泳檢測(cè),回收目的片段。利用北京全式金生物技術(shù)有限公司出品的 T4DNA Ligase 試劑,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌 DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,過(guò)夜培養(yǎng),挑取菌落進(jìn)行菌落 PCR,陽(yáng)性克隆提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定目的基因過(guò)表達(dá)載體是否構(gòu)建成功。將制備成功的重組載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,獲得攜帶目的基因的陽(yáng)性農(nóng)桿菌菌株。
1.2.3 葉盤法轉(zhuǎn)化煙草及轉(zhuǎn)基因煙草的鑒定 采用葉盤法轉(zhuǎn)化煙草,轉(zhuǎn)化方法參考郭曉蓉[18]。利用 PCR 技術(shù)鑒定目的基因是否轉(zhuǎn)入煙草。
同時(shí),對(duì)于上市問(wèn)題,宗慶后此前一直堅(jiān)持娃哈哈不差錢、不上市。而今年3月,也有媒體報(bào)道稱,娃哈哈開(kāi)始為上市而瘦身——清退員工股份。宗慶后也改口表示,未來(lái)如果有大的產(chǎn)業(yè)要投資,娃哈哈也要上市募集資金。
1.2.4Wapdr15基因功能初步分析 從生長(zhǎng)一致的未轉(zhuǎn)基因和轉(zhuǎn)入Wapdr15基因的煙草組培苗相同部位,剪取葉片,平鋪到煙草分化培養(yǎng)基上,并吸取 10 μL 5 mg/mL BDE-3 滴到不同煙草葉片上,觀察記錄不同煙草葉片的受害情況。
目的基因克隆結(jié)果見(jiàn)圖1。
以酵母 DNA 為模板,PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)結(jié)果如圖1 a所示。引物設(shè)計(jì)時(shí)預(yù)計(jì)Wapdr15基因 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物的片段長(zhǎng)度為 4 536 bp,由圖1 a可知,各基因的 PCR 產(chǎn)物片段大小與預(yù)計(jì)片段長(zhǎng)度一致?;厥占兓哪康幕?DNA 片段與 pUCm-T 載體進(jìn)行連接,菌落 PCR 檢測(cè)電泳結(jié)果如圖1 b所示。由圖1 b 可知,泳道 1-4 號(hào)出現(xiàn)目的條帶,與泳道 5 陽(yáng)性對(duì)照中條帶位置相同,而陰性對(duì)對(duì)照(泳道 6)中則無(wú)條帶。提取陽(yáng)性轉(zhuǎn)化菌質(zhì)粒送往生工(上海)生物有限公司測(cè)序。
Wapdr15測(cè)序結(jié)果及編碼氨基酸序列見(jiàn)圖2。
如圖2所示,經(jīng) NCBI 序列比對(duì),與異常維克漢姆酵母目的基因的相似度為 98%,說(shuō)明目的基因Wapdr15克隆成功,將序列正確的質(zhì)粒命名為pT-Wapdr15。毛白楊葉際異常維克漢姆酵母(W.anomalus)Wapdr15基因長(zhǎng)度為4 536 bp,編碼1 511個(gè)氨基酸。
Wapdr15基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果如圖3所示。
由圖 3 可知,Wapdr15基因中無(wú)內(nèi)含子結(jié)構(gòu)。
Wapdr15基因編碼氨基酸序列結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果如圖4所示。
圖4 WaPDR15蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域Figure 4 Domain structure of WaPDR15 protein
由圖 4 可知 WaPDR 15轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白含有 ABC 蛋白的結(jié)構(gòu)域PDR-CDR(710~802),符合 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 G 家族的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),所以WaPDR 15轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白屬于 ABCG 家族。WaPDR15 共包含 2 個(gè) NBD (173~383,870~1 061)和 TMD (489~699,1 158~1 378),形成了 NBD1~TMD1~NBD2~TMD2結(jié)構(gòu),為典型的全分子蛋白。
WaPDR15 與其他物種 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白氨基酸序列比對(duì)結(jié)果如圖5所示。
圖5 WaPDR15與其他物種氨基酸比對(duì)Figure 5 The amino acids of WaPDR15 comparison with other species
由圖 5 可知 WaPDR15 N 端的 NBD 結(jié)構(gòu)域中包含 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白序列中高度保守的 Walker-A、Walker-B 基序。
pT-Wapdr15、pCam1 302-35s 質(zhì)粒酶切結(jié)果見(jiàn)圖6。
由圖6 a中可知,1~3泳道中片段長(zhǎng)度為5 000 bp,與目的基因長(zhǎng)度相符。由圖6 b中可知,1~5泳道片段長(zhǎng)度為11 000 bp,與待連接質(zhì)粒長(zhǎng)度相符。
圖6 質(zhì)粒酶切電泳檢測(cè)結(jié)果Figure 6 Detection results of plasmid enzyme cutting electrophoresis
重組質(zhì)粒菌落PCR及酶切電泳檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖 7。
圖7 重組質(zhì)粒菌落PCR及酶切電泳檢測(cè)結(jié)果Figure 7 Detection results of recombinant plasmid colony PCR and enzyme digestion electrophoresis
由圖 7a可知,酶切回收產(chǎn)物與表達(dá)載體 pCam1 302~35 s連接,菌落PCR鑒定結(jié)果中泳道1、2號(hào)出現(xiàn)目的條帶,與泳道3陽(yáng)性對(duì)照中條帶位置相同,而陰性對(duì)照中則無(wú)條帶,表明pCam-Wapdr15初步構(gòu)建成功。為進(jìn)一步確保載體構(gòu)建正確,挑選目的條帶明亮的 2 號(hào)菌落,提取質(zhì)粒,進(jìn)行質(zhì)粒 PCR 和酶切鑒定。由圖7 b可知,酶切產(chǎn)物電泳檢測(cè)出現(xiàn)兩條帶,大片段11 000 bp和小片段5 000 bp,結(jié)果與預(yù)期相符,經(jīng)鑒定獲得植物表達(dá)載體pCam-Wapdr15重組質(zhì)粒。
農(nóng)桿菌菌落PCR結(jié)果如圖8所示。
圖8 農(nóng)桿菌菌落PCR凝膠電泳圖Figure 8 PCR gel release results of agrobacterium colonies
采用熱激法將pCam-Wapdr15轉(zhuǎn)入Agl 1農(nóng)桿菌,菌落PCR鑒定結(jié)果如圖8,所擴(kuò)增的片段與陽(yáng)性對(duì)照一致,說(shuō)明基因成功轉(zhuǎn)入 Agl 1 農(nóng)桿菌中。
轉(zhuǎn)化煙草過(guò)程如圖9所示。
圖9 Wapdr15基因轉(zhuǎn)化煙草Figure 9 Tobacco transformed with the Wapdr15 gene
由圖9可知,將含有目的基因pCam-Wapdr15的農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)入煙草,培養(yǎng)1個(gè)月后,進(jìn)行篩選生根,得到疑似含 pCam-Wapdr15基因的抗性植株。選取生長(zhǎng)狀況良好的煙草組培苗葉片(圖9a),剪成1 cm2方塊,培養(yǎng)基中加入抗生素后篩選轉(zhuǎn)染成功的煙草葉片(圖9b),葉片上開(kāi)始出現(xiàn)不定芽(圖9c),1個(gè)月后逐漸長(zhǎng)出不定根(圖9d)。
轉(zhuǎn)基因煙草組培苗驗(yàn)證結(jié)果如圖10所示。
圖10 轉(zhuǎn)基因植物的PCR擴(kuò)增1%瓊脂糖凝膠電泳圖Figure 101% agarose gel electrophoresis of PCR product of transgenic plants
由圖10可知,以轉(zhuǎn)基因植株的 DNA 為模板,以含有目的基因片段pCam-Wapdr15的質(zhì)粒為陽(yáng)性對(duì)照,以野生型煙草植株作陰性對(duì)照,對(duì) 5 個(gè)煙草株系進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增鑒定。轉(zhuǎn)基因煙草株系和陽(yáng)性對(duì)照擴(kuò)增結(jié)果一致,且陰性對(duì)照植株沒(méi)有擴(kuò)增出特異性條帶,說(shuō)明成功獲得了Wapdr15的轉(zhuǎn)基因植株,可用于后續(xù)試驗(yàn)。
轉(zhuǎn)基因煙草和野生煙草對(duì) BDE-3的耐受情況如圖11所示。
圖11 轉(zhuǎn)基因煙草對(duì)BDE-3的耐受情況Figure 11 Tolerance of transgenic tobacco to BDE-3
如圖11所示,為探究Wapdr15轉(zhuǎn)基因煙草植物對(duì) BDE-3 耐受情況,分別在葉齡一致的煙草葉片下表面的固定位置滴加10 μL 5 mg/mL的BDE-3,每24 h觀察葉片滴加部位的壞死情況。野生型對(duì)照組煙草葉片在滴加BDE-3第4天出現(xiàn)褐化壞死斑(圖11白色箭頭所指),而轉(zhuǎn)毛白楊葉際異常維克漢姆Wapdr15轉(zhuǎn)基因的煙草葉片未出現(xiàn)褐化壞死斑,表現(xiàn)出一定抗性。
ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白參與生物抗逆過(guò)程,真菌中 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在植物中的超表達(dá)可以提到轉(zhuǎn)基因植物的抗性;釀酒酵母 YCF1 可以明顯提高印度芥菜(Brassicajuncea)對(duì)Cd和Pb的耐性;粟酒裂殖酵母中的ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白Sp HMT1可以提高擬南芥種子的Cd耐性[16-17]。
Wapdr15基因編碼蛋白質(zhì)中包含保守度極高的 Walker-A、Walker-B 基序[12],與葡萄中 ABCG 亞族中蛋白結(jié)構(gòu)相似[19],這些結(jié)構(gòu)和保守基序都有助于NBD 與 ATP 結(jié)合并水解[20],為物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸提供能量,提高生物抗逆能力。Wolfge 等[21]的研究結(jié)果顯示,釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae) ABCG 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白pdr15由轉(zhuǎn)錄因子pdr1和pdr3控制,pdr1和pdr3通過(guò)與順式作用位點(diǎn) PDREs(PDR響應(yīng)元件)結(jié)合,調(diào)控 ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白藥物外排泵的表達(dá),從而產(chǎn)生抗藥性。為研究Wapdr15基因?qū)?BDE-3 的作用,對(duì)Wapdr15基因進(jìn)行克隆、構(gòu)建Wapdr15基因過(guò)表達(dá)載體并轉(zhuǎn)化煙草,分析轉(zhuǎn)入Wapdr15基因煙草對(duì) BDE-3 的耐受情況,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因的煙草對(duì) BDE-3 的耐受顯著好于野生型對(duì)照煙草,毛白楊葉際異常維克漢姆 WaPDR15 ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白可以增強(qiáng)煙草對(duì)于PBDEs的耐受性。
綜上所述,Wapdr15基因編碼序列長(zhǎng)4 536 bp,為全分子跨膜蛋白。毛白楊異常維克漢姆 WaPDR15ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對(duì) BDE-3 有解毒作用。這些發(fā)現(xiàn)都將有助于進(jìn)一步揭示毛白楊葉際異常維克漢姆酵母對(duì) BDE-3 耐受解毒分子機(jī)制,并可以為包括林木在內(nèi)的植物對(duì)有機(jī)污染物修復(fù)機(jī)制研究提供借鑒。毛白楊葉際異常維克漢姆酵母 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因Wapdr15有望成為包括毛白楊在內(nèi)的楊樹(shù)以及其他木本植物遺傳轉(zhuǎn)化的抗有機(jī)污染物基因資源,為獲得可修復(fù) BDE-3及其他 PBDEs 以及 POPs 的木本植物新種質(zhì)奠定理論基礎(chǔ)。