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        miR-100-5p用于肝癌患者預(yù)后判斷的臨床意義分析

        2021-01-22 04:14:32何興楨潘翔鄭培奮
        浙江醫(yī)學(xué) 2021年1期
        關(guān)鍵詞:亞組標(biāo)志物引物

        何興楨 潘翔 鄭培奮

        肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是常見的惡性腫瘤之一,其預(yù)后較差,嚴(yán)重威脅我國(guó)人口的健康[1-2]。HCC早期癥狀不典型,起病隱匿,且具有高惡性程度、高復(fù)發(fā)、高轉(zhuǎn)移率等特點(diǎn),因此盡管目前對(duì)于HCC的治療方法逐漸增多,包括手術(shù)治療、介入治療、放化療及靶向治療等[3],但HCC患者預(yù)后仍不理想。因此,如果能夠發(fā)現(xiàn)HCC早期診斷、治療以及預(yù)后相關(guān)的生物標(biāo)志物,將對(duì)臨床診療有重要的意義。

        隨著大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái),目前生物信息學(xué)在腫瘤中的應(yīng)用越來(lái)越廣,通過(guò)生物信息學(xué)分析尋找HCC中異常表達(dá)的基因,可為尋找HCC的生物標(biāo)志物提供依據(jù)。miRNA是一類長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的非編碼RNA,由于miRNA在組織、血漿中可穩(wěn)定存在,并在腫瘤組織中存在異常表達(dá),且可調(diào)控腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移、凋亡等細(xì)胞學(xué)進(jìn)程,是可選的生物標(biāo)志物之一[4-5]。miR-100-5p作為miRNA家族的一員,在膀胱癌、神經(jīng)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤等腫瘤中均存在異常表達(dá),并和疾病分期及預(yù)后相關(guān)[6-7]。而在HCC中,有學(xué)者發(fā)現(xiàn)miR-100-5p表達(dá)水平低于正常肝臟組織,與患者預(yù)后相關(guān),且過(guò)表達(dá)miR-100-5p可抑制HCC進(jìn)展[8-9]。為進(jìn)一步明確miR-100-5p在HCC患者預(yù)后中的臨床意義,本研究通過(guò)生物信息學(xué)分析及組織標(biāo)本表達(dá)檢測(cè),評(píng)估m(xù)iR-100-5p用于不同臨床特征HCC患者預(yù)后監(jiān)測(cè)的臨床意義。

        1 對(duì)象和方法

        1.1 對(duì)象 選取2004年1月至2013年12月于浙江醫(yī)院就診的HCC患者118例,其中男77例,女41例,年齡 21~79(50.29±14.00)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)年齡≥18歲;(2)患者需經(jīng)病理確診為HCC(診斷依據(jù)為2010版AJCC癌癥分期手冊(cè)),有完整的臨床數(shù)據(jù)及隨訪信息;(3)患者不存在其他原發(fā)腫瘤相關(guān)疾病。末次隨訪時(shí)間為2018年12月,所有患者均知情同意,本研究經(jīng)浙江醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

        1.2 主要試劑 Trizol、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒以及SYBRGreen PCR kit試劑盒均購(gòu)自中國(guó)賽默飛世爾科技有限公司;miR-100-5p前引物購(gòu)自中國(guó)上海吉馬生物技術(shù)有限公司。

        1.3 實(shí)驗(yàn)方法 獲取HCC石蠟組織塊,按說(shuō)明書方法使用Trizol提取標(biāo)本中總RNA,并測(cè)定提取得到的總RNA濃度,以1 μg總RNA為底物,在普通PCR儀上進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。采用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,獲取cDNA。反應(yīng)條件:37℃,60 min;95℃,5 min。以cDNA為模板,使用miScript SYBR-Green PCR kit試劑盒進(jìn)行RT-qPCR檢測(cè)。RT-qPCR所用引物如下:miR-100-5p前引物:5′-ACACTCCAGCTGGGAACCCGTAGATCCGA-3′,后引物:通用引物。內(nèi)參U6前引物:5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′;后引物:5′-ACGCTTCACGAATTTGCGT-3′。反應(yīng)體系:模板cDNA1μl,miR-100-5p上游引物1 μl,10*miScript通用引物 2 μl,2*Quanti TectS YBR Green PCR Master Mix 10 μl,加無(wú)酶水至總反應(yīng)體積20 μl。反應(yīng)條件:95 ℃,15 min;94 ℃,15 s;55 ℃,30 s;70℃,30 s;共計(jì)40個(gè)循環(huán)。

        1.4 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證 TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)(www.cancergenome.nih.gov)中可獲取HCC患者預(yù)后數(shù)據(jù),通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)中患者預(yù)后信息和miR-100-5p表達(dá)水平繪制生存曲線,以miR-100-5p表達(dá)水平中位數(shù)為界,將患者分為miR-100-5p低表達(dá)組和高表達(dá)組。采用log-rank檢驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證miR-100-5p和HCC患者預(yù)后的相關(guān)性。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 23.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料用率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)或Fisher確切概率法;采用Kaplan-Meier分析和log-Rank檢驗(yàn)繪制生存曲線;采用單變量和多變量Cox回歸分析miR-100-5p和患者預(yù)后的相關(guān)性。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 HCC組織miR-100-5p低表達(dá)、高表達(dá)與臨床特征的關(guān)系 miR-100-5p低表達(dá)、高表達(dá)與臨床分期有關(guān),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05),而與年齡、性別、腫瘤長(zhǎng)徑無(wú)關(guān),差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),見表1。

        2.2 HCC組織miR-100-5p表達(dá)和患者預(yù)后的關(guān)系對(duì)影響HCC預(yù)后的相關(guān)臨床因素進(jìn)行單因素和多因素分析,結(jié)果顯示腫瘤高分期和miR-100-5p低表達(dá)是HCC預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(均P<0.05),其HR值及95%CI分別為 0.269(0.138~0.523)、2.569(1.277~5.169),見表 2。

        miR-100-5p低表達(dá)組預(yù)后生存率明顯低于高表達(dá)組患者(P<0.01,圖1a),這和TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的預(yù)測(cè)的結(jié)果相同(P<0.01,圖1c)。且高分期(Ⅲ+Ⅳ期)HCC患者預(yù)后生存率低于低分期(Ⅰ+Ⅱ期)組(P<0.01,圖1b)。并且在不同亞組中miR-100-5p表達(dá)水平與HCC預(yù)后關(guān)系各不相同,其中在高分期(圖2b)、低齡(≤60歲)(圖 2c)、男性(圖 2e)、小組織(腫瘤長(zhǎng)徑≤5 cm)組(圖2g)中,低表達(dá)miR-100-5p患者的生存時(shí)間更短差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05);而在低分期(圖2a)、高齡(>60歲)(圖2d)、女性(圖 2f)、大組織(腫瘤長(zhǎng)徑>5 cm)組(圖2h)中均未發(fā)現(xiàn)相關(guān)性(均P>0.05)。另外,在大組織、女性亞組中miR-100-5p高表達(dá)和低表達(dá)組可觀察到不同預(yù)后趨勢(shì),雖然差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05),但不能排除樣本量過(guò)少所致偏倚,需擴(kuò)大樣本量后進(jìn)一步驗(yàn)證。

        表1 HCC組織miR-100-5p低表達(dá)、高表達(dá)與臨床特征的關(guān)系(例)

        表2 HCC組織miR-100-5p表達(dá)與患者預(yù)后關(guān)系分析

        圖1 miR-100-5p表達(dá)及腫瘤分期與患者預(yù)后生存的關(guān)系(a:石蠟標(biāo)本miR-100-5p低、高表達(dá)患者預(yù)后分析;b:石蠟標(biāo)本不同分期肝細(xì)胞癌患者預(yù)后分析;c:TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中miR-100-5p低、高表達(dá)患者預(yù)后分析)

        3 討論

        HCC作為常見的惡性腫瘤,其惡性程度高、預(yù)后差,對(duì)國(guó)民的生命健康產(chǎn)生了巨大的威脅。因此,提高HCC的診斷與治療水平有著重要的臨床意義。近年來(lái)HCC相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)了越來(lái)越多新的生物標(biāo)志物,但并無(wú)哪個(gè)標(biāo)志物是完全理想的。目前,miRNA分子在HCC中的作用機(jī)制和臨床意義被許多學(xué)者所關(guān)注,多種miRNA(如miR-217、miR-148a、miR-17等[10-12])被發(fā)現(xiàn)在HCC組織中異常表達(dá),并和HCC發(fā)生、發(fā)展相關(guān)。另外,miRNA分子在體外相對(duì)穩(wěn)定,且易于檢測(cè),有作為生物標(biāo)志物應(yīng)用于HCC診斷、預(yù)后判斷的可能。研究發(fā)現(xiàn),miR-215、miR-150、miR-99a 等[13-15]miRNA 在 HCC組織中表達(dá)降低,miR-96、miR-155、miR-106b-5p等[14,16]在HCC組織中表達(dá)升高,這些在患者血漿或組織中異常表達(dá)的miRNA和患者臨床分期相關(guān),這將可能用于HCC的早期診斷或靶向治療,并對(duì)判斷腫瘤的惡性程度和預(yù)后有著一定的臨床意義。

        近年來(lái),多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)miR-100-5p在腫瘤中存在異常表達(dá),并具有一定臨床意義。如在口腔鱗狀細(xì)胞癌中,低表達(dá)miR-100-5p提示患者預(yù)后較差[17]。在非肌層浸潤(rùn)膀胱癌組織中,miR-100-5p低表達(dá)組的膀胱癌患者無(wú)疾病進(jìn)展時(shí)間和腫瘤特異生存時(shí)間明顯長(zhǎng)于高表達(dá)組,具有臨床意義[6]。在神經(jīng)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,血清miR-100-5p低表達(dá)患者預(yù)后生存時(shí)間明顯低于高表達(dá)患者,這表明miR-100-5p可用于判斷患者的預(yù)后[7]。

        圖2 各個(gè)不同亞組miR-100-5p表達(dá)與患者總體預(yù)后生存的關(guān)系(a:低分期亞組;b:高分期亞組;c:低齡亞組;d:高齡亞組;e:男性亞組;f:女性亞組;g:小組織亞組;h:大組織亞組)

        在HCC中,已有關(guān)于miR-100功能或臨床意義的相關(guān)報(bào)道。Ge等[8]研究發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)miR-100可通過(guò)抑制HCC細(xì)胞自噬誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡以及抑制HCC細(xì)胞的增殖。另一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),miR-100和miR-125b可通過(guò)抑制血管生存從而抑制HCC的轉(zhuǎn)移[18]。以上研究均表明,miR-100可能作為HCC靶向治療的靶點(diǎn)之一。

        前期已有Chen等[9]研究發(fā)現(xiàn),miR-100在HCC組織中表達(dá)降低,且是HCC預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。本研究通過(guò)石蠟標(biāo)本檢測(cè)miR-100-5p在HCC組織中的表達(dá),并分析其表達(dá)水平和患者臨床特征間的相關(guān)性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)低表達(dá)miR-100-5p和HCC較高的臨床分期具有相關(guān)性,且低表達(dá)miR-100-5p患者預(yù)后較差,該結(jié)果與TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果一致。進(jìn)一步的亞組分析結(jié)果顯示,該結(jié)論在高分期、低齡、男性、腫瘤組織≤5 cm患者中依然適用。在低分期、高齡、女性、大組織亞組中,miR-100-5p表達(dá)和患者預(yù)后并無(wú)相關(guān)性。

        綜上所述,本研究通過(guò)樣本檢測(cè)及TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),HCC組織miR-100-5p表達(dá)水平可用于預(yù)測(cè)HCC患者預(yù)后。miR-100-5p低表達(dá)是HCC患者預(yù)后較差的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。在高分期、低齡、男性、腫瘤組織≤5 cm HCC患者,miR-100-5p低表達(dá)提示著較差的預(yù)后,在女性、腫瘤組織>5 cm HCC患者中miR-100-5p的臨床意義有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

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