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        麥吉爾大學(xué)團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)新型酵母,低溫下可從呼吸作用轉(zhuǎn)為乙醇發(fā)酵適應(yīng)寒冷

        2021-01-21 02:07:21
        海外星云 2021年24期
        關(guān)鍵詞:環(huán)境

        近日,科學(xué)家從南極洲麥克默多干谷15萬年前的永久凍土層中分離出新型嗜極酵母Rhodotorula frigidialcoholis,通過表型和系統(tǒng)發(fā)育分析,將R.frigidialco holis歸類為新物種。

        地球生物圈大部分處在低于5攝氏度的永久低溫環(huán)境中,包括大面積<0攝氏度的低溫環(huán)境,具備地球上最干燥、生物量最低、寒冷和含鹽量最高等特點(diǎn)。盡管條件如此苛刻,仍有很多能夠進(jìn)行代謝活動甚至在原位生長的微生物存在于此,包括細(xì)菌、古細(xì)菌、藻類和真菌。

        這些適應(yīng)寒冷的微生物被稱為嗜冷菌或耐冷菌,能夠在冰川中存活數(shù)千年。生存在這樣的環(huán)境中,微生物必須克服許多生化和生理挑戰(zhàn),包括低水分和養(yǎng)分利用率、高氧化應(yīng)激、高太陽輻射和多次凍融循環(huán),膜流動性、酶活性和蛋白質(zhì)折疊的顯著下降,以及穩(wěn)定的二級抑制性DNA/RNA結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生。

        但微生物也會通過進(jìn)化,獲得適應(yīng)這種環(huán)境的性狀,確保在永久凍土層中生存下來。人們對這種冰凍圈冷適應(yīng)微生物充滿了好奇。

        曾有過一些關(guān)于北極和南極環(huán)境中的細(xì)菌、古細(xì)菌和藻類的研究。最近,人們對存在于在這些環(huán)境中的真菌產(chǎn)生了興趣。真菌在冰凍圈中起著關(guān)鍵作用,因為它們是通過內(nèi)生和地衣關(guān)系產(chǎn)生初級生物質(zhì)的重要促進(jìn)劑并參與養(yǎng)分循環(huán)。

        冰凍圈冷適應(yīng)真菌的一個例子是一種紅酵母屬的單細(xì)胞粉色酵母,在麥吉爾大學(xué)最近的一項研究中,科學(xué)家將其從寒冷的生態(tài)系統(tǒng)中分離出來并進(jìn)行分析、鑒定,發(fā)現(xiàn)它們在地球上最寒冷和最干燥的地方生存,并進(jìn)化出了獨(dú)特的策略來應(yīng)對惡劣的環(huán)境。

        在此之前,科學(xué)家曾在許多寒冷生態(tài)系統(tǒng)中檢測到擔(dān)子菌酵母,但尚未完全了解它們對低溫的適應(yīng)策略。使酵母存活的分子機(jī)制包括產(chǎn)生抗凍劑和冷活性蛋白、相容的溶質(zhì)以及膜流動性的增加。

        新發(fā)現(xiàn)的冷適應(yīng)酵母,是從南極洲麥克默多干谷15萬年前的冰凍永久凍土中分離出來的。為了表征其冷適應(yīng)策略,科學(xué)家們進(jìn)行了mRNA和sRNA(小非編碼RNA)轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析、表型分析,并評估了0攝氏度和23攝氏度下的乙醇產(chǎn)量。

        轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析結(jié)果表明,Rhodotorula frigidialcoholis通過多種機(jī)制適應(yīng)南極干谷永久凍土區(qū)的低溫,包括增加PPP基因(磷酸戊糖途徑中涉及到的基因)的表達(dá),增加類胡蘿卜素、鞘脂、不飽和脂肪酸和胞外多糖的產(chǎn)生,同時減少生長、轉(zhuǎn)錄和翻譯機(jī)制基因的表達(dá)。

        Rhodotorula frigidialcoholis的形態(tài)

        科學(xué)家們還確定了新的寒冷適應(yīng)特征,包括通過下調(diào)檸檬酸循環(huán)基因和ETC基因(電子傳遞鏈),從23攝氏度的呼吸代謝轉(zhuǎn)變?yōu)樵诤錀l件下(0攝氏度)生長時的發(fā)酵代謝。這種轉(zhuǎn)換可能是在低溫環(huán)境(例如南極永久凍土)中節(jié)省能源和延遲細(xì)胞內(nèi)凍結(jié)的一種適應(yīng)。同時,R.frigidialcoholis過表達(dá)參與乙醇和木糖醇發(fā)酵的基因。

        在低溫下,R.frigidialcoholis也過度表達(dá)稱為sRNA的分子,特別是短rRFs/miRNA,并過度表達(dá)了Dicer基因,表明RNAi是極地真菌寒冷適應(yīng)的新機(jī)制。需要進(jìn)一步表征乙醇生產(chǎn)的作用和鑒定RNAi的mRNA靶標(biāo),以確定它們在冰凍圈酵母冷適應(yīng)中所起的作用。

        與23攝氏度相比,0攝氏度冷紅酵母中每個KEGG代謝途徑和細(xì)胞過程顯著差異表達(dá)的基因數(shù)量

        R.frigidialcoholis現(xiàn)在還保持著微生物生產(chǎn)乙醇的最低溫度條件記錄。(綜合整理報道)(編輯/克珂)

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