田萬(wàn)年,王妍慧,薛書(shū)江,賈立軍,張守發(fā)
(1. 吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院,吉林 吉林 132101 ; 2. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林 延吉 133002)
牛的卵形巴貝斯蟲(chóng)病(Babesiaovata)是由巴貝斯科巴貝斯屬的卵形巴貝斯蟲(chóng)寄生于牛紅細(xì)胞內(nèi)所引起的寄生蟲(chóng)病[1]。病牛多表現(xiàn)為高熱、貧血、黃疸和血紅蛋白尿,多引起死亡[2-3]。我國(guó)于1986年在河南省盧氏縣牛體內(nèi)發(fā)現(xiàn)本病,隨后1994年,在甘肅張家川回族自治縣牛體內(nèi)分離到卵形巴貝斯蟲(chóng)[4]。目前牛卵形巴貝斯蟲(chóng)的診斷主要通過(guò)血液涂片,顯微鏡檢查為主,隱性感染牛的血液染蟲(chóng)率較低,顯微鏡檢測(cè)易出現(xiàn)漏檢和誤診。因此,急需建立一種敏感性高、特異性強(qiáng),用于該病早期診斷。PCR方法是一種快速、敏感、特異的診斷方法,已廣泛應(yīng)用寄生蟲(chóng)病的診斷[5-6]。二溫式PCR方法比常規(guī)PCR方法特異性更強(qiáng),所需時(shí)間更少[7]。目前尚未見(jiàn)應(yīng)用二溫式PCR診斷牛卵形巴貝斯蟲(chóng)病的文獻(xiàn)報(bào)道。本試驗(yàn)根據(jù)卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA基因序列設(shè)計(jì)1對(duì)引物,建立了二溫式PCR方法,為今后牛卵形巴貝斯蟲(chóng)病的診斷和流行病學(xué)調(diào)查提供科學(xué)理論依據(jù)。
1.1 病料來(lái)源 血液樣本采自吉林省琿春地區(qū)散養(yǎng)的延邊黃牛60份,無(wú)菌采集抗凝血,用PBS洗3次。存于-20 ℃?zhèn)溆谩M瑫r(shí)制作了血液涂片,甲醛固定保存,供染色鏡檢。牛巴貝斯和雙芽巴貝斯蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)基因組DNA由日本帶廣畜產(chǎn)大學(xué)玄學(xué)南教授惠贈(zèng)。瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA由延邊大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2 主要試劑 全血DNA提取試劑盒、TaqDNA聚合酶、dNTP、Agarose Gel DNA Extraction Kit、DL-2 000 DNA Marker等,均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。
1.3 PCR診斷方法的建立
1.3.1 引物的設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank上登錄的牛卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA基因(LC125457),利用Primer Premier 5.0軟件在保守區(qū)設(shè)計(jì)了1對(duì)二溫式PCR引物,引物P1:5′-TAGTTCTTAACCGACTTTC-TCG-3′,P2:5′-TTCTCAAGTAAAAATAGGCCC-3′,擴(kuò)增預(yù)期片段大小為464 bp。引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。
1.3.2 牛卵形巴貝斯蟲(chóng)DNA標(biāo)準(zhǔn)模板的制備 將經(jīng)姬姆薩染色后顯微鏡檢查確診為牛卵形巴貝斯蟲(chóng)感染的抗凝血,按照全血基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)操作提取基因組DNA,抽提的DNA用50 μL TE溶解,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3 PCR擴(kuò)增及退火-延伸溫度的篩選 以提取的卵形巴貝斯蟲(chóng)DNA為模板,PCR反應(yīng)條件如下:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,62 ℃退火-延伸30 s,30個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸7 min。退火-延伸溫度梯度為 58~64 ℃。
1.3.4 PCR產(chǎn)物的鑒定 將回收的PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,送至生工生物工程(上海)股份有限公司序列測(cè)定。
1.3.5 特異性試驗(yàn) 以卵形巴貝斯蟲(chóng)基因組DNA為試驗(yàn)樣本,以牛巴貝斯蟲(chóng)、雙芽巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA為對(duì)照樣本,進(jìn)行二溫式和普通PCR擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析PCR產(chǎn)物。
1.3.6 敏感性試驗(yàn) 用紫外分光光度計(jì)測(cè)定已提取的卵形巴貝斯蟲(chóng)DNA的OD260 nm值,計(jì)算DNA含量。以10倍為梯度進(jìn)行連續(xù)稀釋成7個(gè)不同濃度,按照最適退火-延伸溫度進(jìn)行二溫式和普通PCR擴(kuò)增,對(duì)比其敏感性。
1.4 臨床樣本的檢測(cè)試驗(yàn) 應(yīng)用所建立的二溫式PCR方法對(duì)采自吉林省琿春地區(qū)的60份血液樣品進(jìn)行檢測(cè)。同時(shí),與常規(guī)PCR和血液涂片鏡檢相對(duì)比,比較陽(yáng)性檢出率。
2.1 PCR擴(kuò)增 對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增后經(jīng)10 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),出現(xiàn)464 bp的特異性DNA條帶(見(jiàn)圖1),與預(yù)期的片段大小相一致。
圖1 卵形巴貝斯蟲(chóng)PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig. 1 PCR amplication result of Babesia ovataM:DL-2 000 DNA 標(biāo)準(zhǔn); 1:卵形巴貝斯蟲(chóng)DNA樣本; 2:空白對(duì)照M:DL-2 000 DNA marker; 1:Babesia ovata DNA; 2:Blank control
2.2 測(cè)序與序列比較 將PCR產(chǎn)物純化后送往生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,結(jié)果表明,其核苷酸序列與GenBank上登錄的牛卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA基因序列(LC125457)同源性為 99.9%。
2.3 退火-延伸溫度的篩選 退火-延伸溫度梯度為58~64 ℃。其中,60 ℃時(shí)目的條帶最亮,因此,最佳退火-延伸溫度為60 ℃(見(jiàn)圖2)。
圖2 退火-延伸溫度的篩選試驗(yàn)Fig. 2 Screening test for annealing-extension temperatureM:DL-2 000 DNA標(biāo)準(zhǔn); 1:58 ℃; 2:59 ℃; 3:60 ℃; 4:61 ℃; 5:62 ℃; 6:63 ℃; 7:64 ℃M:DL-2 000 DNA marker; 1:58 ℃; 2:59 ℃; 3:60 ℃; 4:61 ℃; 5:62 ℃; 6:63 ℃; 7:64 ℃
2.4 特異性試驗(yàn) 以牛卵形巴貝斯蟲(chóng)、牛巴貝斯蟲(chóng)、雙芽巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA為模板,分別用二溫式和三步法進(jìn)行擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)10 g/L瓊脂糖凝膠電泳分析。電泳結(jié)果顯示,僅牛卵形巴貝斯蟲(chóng)DNA樣本擴(kuò)增后出現(xiàn)特異性DNA條帶,與預(yù)期片段大小相符,而作為對(duì)照樣本的牛巴貝斯蟲(chóng)、雙芽巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA均無(wú)此擴(kuò)增條帶出現(xiàn)(見(jiàn)圖3)。
圖3 特異性試驗(yàn)結(jié)果Fig. 3 The results of specific testM:DL-2 000 DNA標(biāo)準(zhǔn); 1:卵形巴貝斯蟲(chóng); 2:雙芽巴貝斯蟲(chóng); 3:牛巴貝斯蟲(chóng); 4:瑟氏泰勒蟲(chóng)M:DL-2 000 DNA marker; 1:Babesia ovata; 2:Babesia bigemina; 3:Babesia bovis; 4:Theileria sergenti
2.5 敏感性試驗(yàn) 根據(jù)DNA分光光度法測(cè)定陽(yáng)性模板DNA濃度為1.6×106fg/μL。將所取的DNA依次做10倍梯度稀釋?zhuān)謩e進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)結(jié)果進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(見(jiàn)圖4)。當(dāng)DNA含量為16 fg/μL時(shí),也能擴(kuò)增出特異目的條帶。
圖4 敏感性試驗(yàn)結(jié)果Fig. 4 The results of sensitivity experimentM:DL-2 000 DNA標(biāo)準(zhǔn); 1~8:1.6×106~0.16 fg/μL的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物M:DL-2 000 DNA marker; 1~8:PCR amplification products of 1.6×106~0.16 fg/μL
2.6 臨床樣本檢測(cè) 對(duì)采自吉林省琿春地區(qū)60份血液樣本分別進(jìn)行二溫式PCR方法、普通PCR和血液涂片檢測(cè)。二溫式PCR和普通PCR方法的陽(yáng)性率均為30%(18/60),2個(gè)檢測(cè)方法檢出結(jié)果差異不顯著(P>0.05),而血涂片陽(yáng)性率為11.67%(7/60),且血液涂片鏡檢診斷為陽(yáng)性的樣本經(jīng)二溫式PCR診斷均為陽(yáng)性,表明二溫式PCR方法更為敏感。
卵形巴貝斯蟲(chóng)是牛梨形蟲(chóng)病最為重要的蟲(chóng)種,嚴(yán)重制約養(yǎng)牛業(yè)的健康發(fā)展,急需建立一種快速的檢測(cè)方法。目前卵形巴貝斯蟲(chóng)病PCR診斷方法目的基因?yàn)锳MA-1和CCTη基因[8-9]。據(jù)報(bào)道,18S rRNA基因在梨形蟲(chóng)不同蟲(chóng)種間變異較大,但在同一蟲(chóng)種間具有較好的保守區(qū)域,是PCR診斷首選目的基因[10-11]。因此本試驗(yàn)以卵形巴貝斯蟲(chóng)的18S rRNA為目的基因,設(shè)計(jì)特異性引物,建立了卵形巴貝斯蟲(chóng)二溫式PCR診斷方法,特異性試驗(yàn)表明,該引物只能擴(kuò)增出卵形巴貝斯蟲(chóng)18S rRNA基因片段,而不能擴(kuò)增出瑟氏泰勒蟲(chóng)、巴貝斯蟲(chóng)、雙芽巴貝斯蟲(chóng)基因組DNA,對(duì)該地區(qū)卵形巴貝斯蟲(chóng)病的臨床診斷方面具有一定的應(yīng)用價(jià)值。
本試驗(yàn)對(duì)所建立的二溫式PCR各反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化,比常規(guī)PCR退火溫度要高,提高了檢測(cè)特異性,PCR擴(kuò)增時(shí)間明顯縮短,提高了該病的診斷效率。對(duì)60份血液樣本進(jìn)行PCR檢測(cè),陽(yáng)性率為30%(18/60),而血液涂片染色鏡檢出的陽(yáng)性率為11.67%(7/60),二者檢測(cè)的陽(yáng)性符合率為100%。本試驗(yàn)所建立的二溫式PCR方法為基層獸醫(yī)部門(mén)對(duì)卵形巴貝斯蟲(chóng)病的早期診斷和流行病學(xué)調(diào)查提供了一種有效的檢測(cè)方法。