劉 培,尹會(huì)敏,穆文靜,栗 慧,武二斌,魏 東*
1河北北方學(xué)院河北省農(nóng)產(chǎn)品食品質(zhì)量安全分析檢測(cè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 河北 張家口 075000;2河北北方學(xué)院農(nóng)林科技學(xué)院, 河北 張家口 075000;3河北北方學(xué)院張家口市特色農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 張家口 075000;4張家口市動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所, 河北 張家口 075000
近年來(lái),生物條形碼檢測(cè)(bio-bar codes assay,BCA)技術(shù)在醫(yī)學(xué)、臨床檢測(cè)、分子生物學(xué)、免疫學(xué)、納米技術(shù)等領(lǐng)域都有不斷的發(fā)展和探索。這種超靈敏納米顆粒擴(kuò)增檢測(cè)系統(tǒng)最早于2003年提出,用于檢測(cè)前列腺特異性抗原(Nametal.,2003)。隨著對(duì)蛋白質(zhì)、核酸等大分子和小分子物質(zhì)的檢測(cè)分析要求越來(lái)越高,傳統(tǒng)的免疫分析方法在蛋白質(zhì)超靈敏檢測(cè)方面存在不足,其主要原因是缺乏直接擴(kuò)增技術(shù),如聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)。因此,在一些檢測(cè)方法中,條形碼DNA需要通過(guò)PCR進(jìn)行擴(kuò)增,或者對(duì)擴(kuò)增后的條形碼進(jìn)行電泳或聯(lián)合技術(shù)芯片檢測(cè)。目前,BCA技術(shù)已成為臨床診斷、微量分析等各個(gè)領(lǐng)域的新技術(shù),具有靈敏度高、操作簡(jiǎn)單、成本低等優(yōu)點(diǎn)。該技術(shù)可實(shí)現(xiàn)探針的間接擴(kuò)增,廣泛用于大分子或小分子物質(zhì)的高靈敏、高特異性檢測(cè)(Tangetal.,2018)。
BCA是指將相同序列的寡核苷酸作為探針,經(jīng)化學(xué)、靜電耦合、自組裝等方式將探針固定在金納米顆粒表面,然后把探針當(dāng)作檢測(cè)對(duì)象,形成“AUNP-目標(biāo)物-MMP”的三明治結(jié)構(gòu),從而實(shí)現(xiàn)超高靈敏度檢測(cè)的方法。用于檢測(cè)BCA的生物探針?lè)譃榧{米金顆粒(gold nanoparticle,AUNP)探針和磁性微球(magnetic microparticles,MMP)探針。將該檢測(cè)技術(shù)的操作過(guò)程總結(jié)為以下幾個(gè)步驟:制作和識(shí)別AUNP探針,MMP探針的制作與識(shí)別,夾層結(jié)構(gòu)的形成,獲得條形碼DNA,檢測(cè)條形碼DNA(高璇等,2016)。BCA是基于納米金和核苷酸鏈的信號(hào)放大技術(shù)通過(guò)抗體識(shí)別檢測(cè)高靈敏度目標(biāo)化合物(Tangetal.,2010)。Nametal.(2003)發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)和核酸等大分子物質(zhì)在檢測(cè)過(guò)程中,檢測(cè)探針和識(shí)別探針?lè)謩e與不同的單抗、多抗及DNA結(jié)合,其主要是通過(guò)與目的蛋白對(duì)應(yīng)的單克隆和多克隆抗體來(lái)實(shí)現(xiàn)特異性檢測(cè)。BCA能夠?qū)崿F(xiàn)多重信號(hào)擴(kuò)增,不需要酶擴(kuò)增技術(shù),是目前能夠?qū)崿F(xiàn)和PCR具有相同靈敏度且都不需要酶擴(kuò)增技術(shù)的檢測(cè)方法(杜鵬飛等,2016;劉軍等,2015;Aminietal.,2017; Zhangetal.,2010)。
BCA技術(shù)被應(yīng)用于腫瘤標(biāo)志物、核酸、病毒、食源性病原體、生物毒素和環(huán)境污染物的檢測(cè)。檢測(cè)蛋白質(zhì)、核酸等大分子物質(zhì)時(shí),則是將AUNP表面的條形碼DNA修飾并且與目標(biāo)分子(DNA)相匹配,然后與附在磁性納米顆粒上的互補(bǔ)DNA混合,形成一個(gè)包含DNA-AUNP/目標(biāo)分子/互補(bǔ)DNA-MMP的三明治結(jié)構(gòu),從而測(cè)定目標(biāo)分子的數(shù)量。Narmanietal.(2018)建立了一種基于MMP和AUNP的熒光DNA生物傳感器方法,用于檢測(cè)霍亂弧菌VibriocholeraeO1OmpW基因,其結(jié)果表明,在5~250 ng·mL-1范圍內(nèi)呈良好的線性關(guān)系,檢出限為2.34 ng·mL-1。Lietal.(2018)開(kāi)發(fā)了一種基于酪酰胺信號(hào)擴(kuò)增和AUNP標(biāo)記的免疫測(cè)定方法,用電感耦合等離子質(zhì)譜對(duì)α胎兒蛋白進(jìn)行高靈敏度檢測(cè),檢出限為1.85 pg·mL-1,線性范圍為0.005~2 ng·mL-1,該方法重復(fù)性好,可用于血清中其他大分子的檢測(cè)。雖然BCA技術(shù)提高了檢測(cè)的靈敏度和速度,但其相關(guān)實(shí)驗(yàn)參數(shù)還需進(jìn)一步優(yōu)化。
農(nóng)藥、生物毒素等小分子物質(zhì)的檢測(cè)則是將運(yùn)輸?shù)鞍椎妮d體物質(zhì)和農(nóng)藥小分子半抗原結(jié)合,并在磁性納米粒子表面形成MMP探針。把抗體與DNA鏈在納米金表面連接,相互反應(yīng)后,DNA鏈在AUNP表面又形成納米復(fù)合探針,農(nóng)藥小分子與在磁性納米粒子表面的抗原產(chǎn)生競(jìng)爭(zhēng),并再次結(jié)合成納米金復(fù)合探針,那么表面的抗體就會(huì)形成競(jìng)爭(zhēng)型免疫化學(xué)反應(yīng)體系(Duetal.,2016,2018)。Hongetal.(2018)開(kāi)發(fā)了一種直接競(jìng)爭(zhēng)仿生酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn),用于測(cè)定樣品中的三唑磷。該方法的線性范圍為0.001~10000 μg·L-1,回歸系數(shù)為0.977,其靈敏度和檢出限分別為428和0.001 μg·L-1,結(jié)果表明該方法更靈敏。Yuetal.(2018)建立了一種檢測(cè)黃曲霉毒素B1的BCA技術(shù),其靈敏度約為10-8ng·mL-1,遠(yuǎn)高于ELISA的靈敏度。這也是首次將BCA技術(shù)應(yīng)用于中草藥中黃曲霉毒素B1的分析。該方法可用于花生ArachishypogaeaLinn.、腰果AnacardiumoccidentalieLinn.等堅(jiān)果類食品中黃曲霉毒素B1的微量檢測(cè)。
近些年,由AUNP和巰基改良組裝的寡核苷酸的研究引起了廣泛的關(guān)注。AUNP表面積比較大,故可以單獨(dú)結(jié)合許多寡核苷酸,且?guī)€基也可通過(guò)修改的寡核苷酸使Au-S鍵與納米金緊密相連,形成一個(gè)探測(cè)器,在某些情況下可以與互補(bǔ)的核苷酸序列結(jié)合,從而達(dá)到核酸檢測(cè)目的。此方法與銀染法結(jié)合在檢測(cè)斑點(diǎn)雜交和芯片等區(qū)域,選擇性高且靈敏度高。生物條形碼免疫分析已通過(guò)生物芯片的銀染法確立,如大分子物質(zhì)的檢測(cè)只能在三明治的結(jié)構(gòu)模型中找到,而小分子物質(zhì)由于只有一個(gè)組件綁定抗原結(jié)構(gòu)模型。因此,目前適用于生物條形碼免疫系統(tǒng)分析不適用于小分子物質(zhì),如農(nóng)獸藥、生物毒素等(鄒艷輝等,2014)。杜鵬飛(2017)利用研究小分子競(jìng)爭(zhēng)型免疫化學(xué)反應(yīng)體系,建立了基于生物芯片銀染技術(shù)的高靈敏度可視化BCA技術(shù),使該技術(shù)在小分子檢測(cè)中得到廣泛應(yīng)用。
酶標(biāo)納米金技術(shù)最早應(yīng)用于蛋白的檢測(cè)(Liuetal.,2010b)。Liuetal.(2010a)利用生物素-親和素系統(tǒng)構(gòu)筑了新的多功能金納米復(fù)合探針,并開(kāi)發(fā)出了基于納米金復(fù)合探針的免疫法。三明治免疫反應(yīng)不僅增長(zhǎng)了與每一個(gè)免疫復(fù)合體相關(guān)聯(lián)的HRP分子的數(shù)量,同時(shí)也增強(qiáng)了信號(hào)強(qiáng)度,檢測(cè)限12 pg·mL-1,具有良好的特異性。利用生物素親和素系統(tǒng),可以增強(qiáng)農(nóng)藥殘留與生物條形碼的敏感性和方便性,再把納米金復(fù)合探針上的復(fù)合納米金探針標(biāo)記上HRP分子,同時(shí)在磁探針結(jié)合之前,形成一個(gè)競(jìng)爭(zhēng)系統(tǒng)的檢測(cè)。
生物傳感器技術(shù)是生物活性物質(zhì)或生物本身(如酶、組織、微生物、細(xì)胞、免疫等)作為識(shí)別元件與被檢物質(zhì)發(fā)生物理化學(xué)反應(yīng)(如電、光、熱、質(zhì)量)再通過(guò)換能器轉(zhuǎn)換為可測(cè)的電化學(xué)、壓電、熱學(xué)、光學(xué)等信號(hào),進(jìn)行信號(hào)檢測(cè),從而獲得被檢物的數(shù)量(劉慧等,2021)。Zhengetal.(2018)開(kāi)發(fā)了一種新的生物傳感器方法,用AUNP來(lái)指示不同濃度的大腸桿菌O157∶H7,并使用智能手機(jī)成像APP監(jiān)測(cè)AUNP的顏色變化,來(lái)確定細(xì)菌的數(shù)量。該生物傳感器對(duì)大腸桿菌的特異性和靈敏度很好,且檢出限低于50 CFU·mL-1。王曉飛等(2021)用基于適配體識(shí)別和BCA放大策略的電化學(xué)發(fā)光生物傳感器方法研究粘蛋白和特定細(xì)胞。通過(guò)測(cè)量電化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度和細(xì)胞濃度的對(duì)數(shù)相比,當(dāng)在4~800 pg·mL-1和30~5.0×10-4cells·mL-1范圍時(shí)呈良好的線性關(guān)系,檢出限為0.5 pg·mL-1和9 cells·mL-1。該方法為高靈敏的檢測(cè)蛋白提供了新的方法。
PCR是生物分子擴(kuò)增的最常用手段,也是核酸檢測(cè)最敏感的方法。PCR是指在生物體外放大的一種特定的DNA序列的技術(shù)。自1985年首次提出PCR概念以來(lái),PCR技術(shù)經(jīng)歷了三代技術(shù)革新。第一代PCR技術(shù)是瓊脂凝膠電泳,常用該方法對(duì)目的DNA進(jìn)行定性分析。第二代PCR技術(shù)是實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time quantification PCR, qPCR)。第三代PCR技術(shù)是數(shù)字PCR(digital PCR, dPCR),該概念最初于1999年提出。其中,qPCR已廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、醫(yī)療診斷和環(huán)境監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域。
3.4.1 常規(guī)PCR生物條形碼免疫分析 PCR技術(shù)是當(dāng)前檢測(cè)核酸最常用的方法之一。為增強(qiáng)BCA的敏感性,可采用PCR的檢驗(yàn)方法。在DNA檢測(cè)過(guò)程中,可將條形碼DNA作為模板DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳來(lái)測(cè)量條形碼DNA的數(shù)量。
3.4.2 基于qPCR的生物條形碼免疫分析 qPCR是熒光標(biāo)記或熒光染料結(jié)合PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,在此階段中,直接放大產(chǎn)物的熒光信號(hào)值和數(shù)量呈正相關(guān)的關(guān)系,此值可以實(shí)時(shí)監(jiān)控樣品中核酸的數(shù)量,并且依照樣品的吸光值,可以得到標(biāo)準(zhǔn)曲線,這是可以準(zhǔn)確定量核酸含量的一個(gè)示例(Yangetal.,2015)。此方法先將抗體修飾的AUNP、目標(biāo)物質(zhì)與MMP混合,形成三明治結(jié)構(gòu),然后通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)反應(yīng),將AUNP上的抗體與MMP結(jié)合,經(jīng)加熱釋放AUNP表面的信號(hào)DNA后,再通過(guò)PCR和qPCR來(lái)檢測(cè),該方法的檢出限1 fg·mL-1,變異系數(shù)3.39%~6.84%(Yinetal.,2012)。為了降低產(chǎn)物的增加與空氣環(huán)境的干擾,在PCR擴(kuò)增的過(guò)程中,基本上不能打開(kāi)玻璃管,這樣在很大程度上降低了污染的可能性。Jietal.(2018)為了讓人血病毒抗原的檢測(cè)更靈敏,應(yīng)用了基于qPCR的方法檢測(cè)。先利用基因庫(kù)中的特定植物序列與條形碼DNA對(duì)比無(wú)同源性后,然后獲得特異性條形碼DNA構(gòu)建重組質(zhì)粒,此方法的靈敏度高、重現(xiàn)性好。
3.4.3 免疫PCR生物條形碼檢測(cè)技術(shù) 傳統(tǒng)的PCR、qPCR與BCA的結(jié)合改進(jìn)了BCA的特異性、敏感性及自動(dòng)化水平,但這些方法仍然離不開(kāi)磁珠的磁分離過(guò)程,使檢測(cè)過(guò)程復(fù)雜化,無(wú)法達(dá)到“下一代”測(cè)序樣本的測(cè)定和計(jì)算。在超微量分析檢測(cè)中,過(guò)度的磁分離過(guò)程也會(huì)導(dǎo)致敏感性的降低和人為操作誤差的增加,但是免疫PCR和BCA的結(jié)合可以較好地處理這些問(wèn)題(Caoetal.,2010; Heetal.,2013)。目前,該方法已被應(yīng)用于病毒、病原體和環(huán)境污染物的檢測(cè)。其原理是將包被在酶標(biāo)板或PCR管上的抗原抗體反應(yīng)后,生成夾層復(fù)合物。再把捕獲的抗體以及被條形碼DNA修飾的納米金復(fù)合探針固定在酶標(biāo)板或PCR管上,之后加熱使探針表面的DNA變性釋放出DNA條形碼,最后用PCR擴(kuò)增的方法來(lái)分析和檢測(cè),實(shí)現(xiàn)測(cè)量目標(biāo)分子的目的。Guanetal.(2021)用來(lái)檢測(cè)食品中的草甘膦,草甘膦是世界上應(yīng)用最廣泛的廣譜除草劑。用基于AUNP的生物條形碼免疫PCR方法檢測(cè),草甘膦檢測(cè)的線性范圍為61.1 pg·g-1~31.3 ng·g-1,檢出限為4.5 pg·g-1,比使用同一抗體開(kāi)發(fā)的常規(guī)ELISA(70.0 μg·g-1)低7個(gè)數(shù)量級(jí)且檢測(cè)時(shí)間短,該方法具有良好的敏感性、特異性、回收率和穩(wěn)定性。
3.4.4 基于數(shù)字PCR技術(shù)的生物條形碼檢測(cè)技術(shù) dPCR的基本原理是一個(gè)樣本被無(wú)限的稀釋,從而將樣本分成數(shù)百個(gè)甚至是數(shù)百萬(wàn)個(gè)獨(dú)立的反應(yīng)單元,在每一個(gè)單元里,有一個(gè)、多個(gè)或者沒(méi)有目標(biāo)DNA鏈,再在每個(gè)單元格里進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后再對(duì)每個(gè)單元格內(nèi)的陽(yáng)性和陰性信號(hào)進(jìn)行記錄并用泊松分布的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理和方法來(lái)對(duì)目標(biāo)分子的含量進(jìn)行確定(崔雪妍,2019)。微流控芯片數(shù)字PCR、微滴數(shù)字PCR和水晶數(shù)字PCR,其中微滴數(shù)字PCR是應(yīng)用最廣泛的。肖芳等(2021)用微滴數(shù)字PCR研究轉(zhuǎn)基因玉米MON87427,結(jié)果準(zhǔn)確度、穩(wěn)定性均較好。Liuetal.(2019)用微滴數(shù)字PCR檢測(cè)柑橘黃靜脈清除病毒(Citrusyellowveinclearingvirus, CYVCV),該病毒是影響檸檬CitruslimonBurm.生產(chǎn)最厲害的病原菌,在感染潛伏期和高溫條件下情況下更易被檢測(cè)出來(lái),且在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中未擴(kuò)增出其他相關(guān)的柑橘病毒,說(shuō)明該方法的特異性、準(zhǔn)確度、靈敏度更高。
近年來(lái),關(guān)于把生物素-親和素系統(tǒng)使用于BCA技術(shù)中的方法越來(lái)越普遍,首先將生物素親和素中具有強(qiáng)親和力的功能牢固地定在微孔板中,然后加入銀染增強(qiáng)液,再利用普通酶標(biāo)儀來(lái)測(cè)定放大了信號(hào)的條形碼,最后可以實(shí)現(xiàn)在同一時(shí)間內(nèi)通過(guò)肉眼就可以觀察其檢測(cè)的結(jié)果(Yangetal.,2008)。為進(jìn)一步簡(jiǎn)化BCA檢測(cè)過(guò)程中AUNP探針的制備過(guò)程,在AUNP探針表面上只修飾一種巰基單鏈DNA,如用二硫蘇糖醇技術(shù),而不是熱變性釋放表面的納米金DNA鏈(Hill & Mirkin, 2006)。因此,BCA通過(guò)與生物素-親和素聯(lián)接,就可以構(gòu)建一個(gè)用普通酶標(biāo)儀就能達(dá)到檢驗(yàn)農(nóng)藥殘留的高敏捷的新方法,并且能夠正確地評(píng)價(jià)此方法。
BCA技術(shù)與現(xiàn)代標(biāo)記免疫分析的首選標(biāo)準(zhǔn)ELISA相比,靈敏度高5~6個(gè)數(shù)量級(jí),檢測(cè)時(shí)間至少節(jié)省3 h(Wangetal.2019),這表明BCA測(cè)定技術(shù)取得了很大的進(jìn)步。但這種方法本身有缺點(diǎn),主要出現(xiàn)在條形碼DNA分析中。在芯片測(cè)試中,因?yàn)殂y染料本身的缺陷,假陽(yáng)性反應(yīng)的可能性更高,且會(huì)隨著時(shí)間、環(huán)境等因素變化,與其余的核酸檢測(cè)法相對(duì)比,靈敏度沒(méi)有優(yōu)勢(shì)。綜合優(yōu)化反應(yīng)條件,不僅減少了反應(yīng)的時(shí)間增強(qiáng)檢測(cè)的靈敏度,而且降低試驗(yàn)成本,更有利于實(shí)用和推廣。因此,提高此方法的利用率是近年來(lái)重要的研究方向。李德雪等(2008)用qPCR替代了傳統(tǒng)的PCR和芯片檢測(cè)方法,建立了熒光定量BCA系統(tǒng),改進(jìn)了BCA技術(shù)的不足。
經(jīng)過(guò)十幾年的發(fā)展和探索,BCA技術(shù)已經(jīng)建立了簡(jiǎn)單可靠的高效體系,可用于蛋白質(zhì)等大分子物質(zhì)和小分子物質(zhì)的檢測(cè)。與其他檢測(cè)技術(shù)相比,其優(yōu)勢(shì):一是用于BCA技術(shù)的納米材料安全且不易與目標(biāo)分子結(jié)合變性;二是高特異性和高靈敏度使其具有廣闊的應(yīng)用前景;三是該方法在小分子物質(zhì)檢測(cè)中性價(jià)比高、速度快、操作簡(jiǎn)單。但是BCA技術(shù)尚未完全成熟,方法的每一個(gè)組成部分都可能影響其靈敏度和特異性。因此,探索最佳反應(yīng)條件、降低檢測(cè)成本、進(jìn)一步簡(jiǎn)化操作步驟、提高檢測(cè)靈敏度、縮短制備和檢測(cè)時(shí)間、實(shí)現(xiàn)同一反應(yīng)體系中多種物質(zhì)的檢測(cè)、制備免疫生物條形碼試劑盒是未來(lái)BCA標(biāo)準(zhǔn)化和商業(yè)化的重要研究方向。