肖芳 ,陸輝 ,劉曉慶 ,劉師文 ,李健雄 ,熊英
(1.江西省疾病預防控制中心,江西 南昌 330029;2.江西省衛(wèi)生健康委疾控處,江西 南昌 330006)
脊髓灰質(zhì)炎又名小兒麻痹癥,是由脊灰病毒引起的一種急性傳染病[1]??诜够覝p毒活疫苗( O-ral poliovirus attenuated live vaccine,OPV) 是我國消滅脊灰的重要策略之一,但由于OPV 在人體內(nèi)復制增殖過程中可發(fā)生基因變異和毒力回復,從而引發(fā)疫苗相關麻痹型脊灰(Vaccine associated paralytic poliomyelitis,VAPP) 病 例[2,3]和 疫 苗 衍 生 脊 灰病毒( Vaccine -derived polio virus,VDPV) 病例[4,5]。我國所屬的西太區(qū)2000 年宣布進入無脊灰狀態(tài)。截至目前,仍有3 個國家(巴基斯坦、阿富汗、尼日利亞)一直有本土脊灰野病毒(Wild PV,WPV)的流行,其中有兩個國家與我國接壤。2011 年,我國新疆維吾爾自治區(qū)發(fā)生源自巴基斯坦的輸入1 型WPV 疫情[6],我國維持無脊灰狀態(tài)形勢非常嚴峻。脊髓灰質(zhì)炎病毒主要通過糞-口途徑傳播,病毒可在外環(huán)境條件中存活,并在人、病毒和環(huán)境間循環(huán),在生活污水監(jiān)測脊灰病毒更能直接反映環(huán)境中脊灰病毒的存在及循環(huán)狀況,為脊灰的防控工作提供更多依據(jù)[7]。
1.1 采樣點的確定 青山湖區(qū)污水處理廠為南昌市日處理污水量最大的污水處理廠,每日處理污水50 萬噸,選擇該廠入水口作為每月固定采樣點。每月月初采集500 毫升/瓶,兩瓶水樣,冷藏運輸至江西省疾病預防控制中心疾病控制檢驗所脊灰實驗室。
1.2 污水處理
1.2.1 前處理 對采集的1 升水樣用陰離子膜吸附水中病毒濃縮技術進行處理。首先3000rpm,4℃離心30min,將上清轉(zhuǎn)移至燒杯中。然后加入2.5M 的MgCl2(終濃度 0.05M),用 0.5N 的 HCl 調(diào)節(jié) pH 值為 3.5~4.0 之間。
1.2.2 過濾 在生物安全柜中將經(jīng)過前處理的污水倒入已高壓的裝有0.45μm 混合硝酸纖維濾膜(ADVANTEC,045A142C,10040014)的過濾器中,為防止抽濾過程中濾膜被堵住, 在0.45μm 的濾膜上方又放置了一張 10μm 的濾膜(ADVANTEC,Y100 A124A,15210012)。過濾器與正壓泵相連,過濾時盡量慢點,5~10min 濾完。在生物安全柜中拆開過濾裝置,將兩張濾膜用無菌的鑷子取出放置于無菌培養(yǎng)皿中。用無菌的剪刀及鑷子將濾膜剪碎,放入50 mL 無菌離心管中[8]。
1.2.3 振蕩及離心 在50ml 無菌離心管加入10 mL 3%的無菌牛肉浸出液,1g 無菌玻璃珠于振蕩器上振蕩20min, 將上清液吸出于15ml 無菌離心管中(第一次洗脫液),再向50ml 無菌離心管加入10 ml 3%的無菌牛肉浸出液,繼續(xù)振蕩20min,將上清液吸出于另一15ml 無菌離心管中 (第二次洗脫液)。將兩次洗脫液于4℃ 3000rpm 離心15min。
1.2.4 無菌過濾及接種 用0.45μm 針式過濾器將兩次離心后的上清分別過濾于5ml 的無菌凍存管中。取 200μl 抽提液接種至 24 孔板細胞上(RD、L20B、Hep-2),第一次洗提液加 5 孔,第二次洗提液加3 孔。
1.2.5 病毒的分離與鑒定 按 《脊灰實驗室操作手冊》(WHO 第四版)[9]及補充資料的規(guī)程對生活污水中脊灰病毒進行分離培養(yǎng),對L20B 陽性分離物進行脊灰病毒型內(nèi)鑒定。
1.2.6 VP1 區(qū)序列測定 用 TAKARA PrimeScript TM One Step RT-PCR Kit Ver.2(AJ21030A) 試劑盒對獲得的23 株PV 株VP1 區(qū)進行擴增, 引物序列為:UG1:5′-TTTGTGTCAGCGTGAATGA-3′;UC11:5′- AAGAGGTCTCTATTCCACAT-3′[10]。擴增片段大小約 1.1kb, 反應條件為:50℃ 30min,95℃ 2min;94℃ 30s,50℃ 30s,72℃ 1min,35 個循環(huán);72℃ 10min[11,12]。獲得的 PCR 產(chǎn)物經(jīng)1.2 % 瓊脂糖凝膠電泳檢測,陽性產(chǎn)物送生工生物工程(上海)股份有限公司進行序列測定。
1.2.7 序列整理及分子生物學信息分析 已測序的序列用DNAStar5.0 的 Seqman 進行序列的拼接,采用Mega 5.0 軟件進行核苷酸和氨基酸同源性分析、 系統(tǒng)進化樹的構建及遺傳距離的分析。PV Sabin 1~3 疫苗株參考序列號為 AY184219~AY1 84221。
2.1 病毒的分離 2018 年1 月-12 月采集了 12 份水樣,除7 月及11 月份未分離出脊灰病毒其余月份均分離出了脊灰病毒,共分離脊灰病毒23 株,分離率為83.33%,見表1。
2.2 病毒的鑒定 分離的23 株脊灰毒株經(jīng)ITD 及VDPV 鑒定均為疫苗相似株,其中PV 1 型2 株(8.7%),PV 2 型 0 株,PV 3 型 21 株(91.3%)。見表 2。
2.3 VP1 區(qū)序列分析及系統(tǒng)進化樹的構建 經(jīng)測序及序列拼接,23 株PV 株均獲得1100bp 左右的核苷酸序列。其中 PV1 與 Sabin 1(AY184219)的同源性為 99.7~100%,PV3 與 Sabin 3 (AY184221)的同源性為99.0~100%。構建系統(tǒng)進化樹如下圖。
表1 2018 年每月分離脊灰病毒情況
表2 每月分離脊灰病毒鑒定情況
圖1 系統(tǒng)進化發(fā)生樹
2.4 突變位點分析 對分離的23 株PV 株VP1 區(qū)進行核苷酸序列比對分析發(fā)現(xiàn),12 株脊灰病毒毒株在VP1 區(qū)發(fā)生了核苷酸變異,其中PV 1 型的核苷酸變異數(shù)在≤3 個,PV 3 的核苷酸變異數(shù)在≤5個。基因序列已上傳至 NCBI,Genebank 為:MT3 60741~MT360743 及 MT349683~MT349703。見表3。
AFP 病例監(jiān)測仍是目前全球消滅脊灰計劃中的金標準,而環(huán)境監(jiān)測可以提供一些補充信息。由于PV 是糞口途徑傳播,因此從生活污水中檢測PV可以用來評估PV 在環(huán)境中的循環(huán),估計環(huán)境人口中感染者的數(shù)量,因而可以將PV 環(huán)境監(jiān)測結果作為某一特定人口地區(qū)無脊灰循環(huán)的指標,為中國維持無脊灰狀態(tài)提供環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)。2015 年WHO證實2 型脊灰病毒導致的脊灰已被消滅,2016 年5 月1 日前全球已停止使用tOPV,我們國家脊髓灰質(zhì)炎疫苗的接種程序調(diào)整為1 劑次的IPV 和2 劑次的bOPV,疫苗中不再含有2 型脊灰減毒成分。脊灰疫苗接種策略調(diào)整后,一旦環(huán)境中存在2 型脊灰病毒,沒有產(chǎn)生2 型脊灰抗體的人很有可能被感染并有傳播引發(fā)病例的風險。2018 年新疆在環(huán)境污水中分離出了2 型脊灰疫苗衍生株[13],我們省環(huán)境中是否仍有脊灰2 型病毒的循環(huán),2 型病毒是否發(fā)生變異,是我們需要解決的問題。
表3 毒株突變位點。
本研究2018 年對青山湖區(qū)污水處理廠入水口污水樣本開展脊灰病毒監(jiān)測,發(fā)現(xiàn)所監(jiān)測污水中未分離出2 型脊灰病毒,分離出的1 型和3 型脊灰病毒均為疫苗相似株, 未監(jiān)測到WPV 株和VDPV株。PV3 型的構成比為 91.3%,可見PV3 型為江西省生活污水中的PV 優(yōu)勢株, 這與我們過去AFP病例監(jiān)測的結果是一致的[14]。
PV1 型對毒力有明顯影響的突變熱點是nt2747 和 nt2795[15]。2018 年在污水中分離到的 2株PV1 型疫苗株在這兩個位點均無突變。有1 株(JX2018JHH024R)在 nt2749 處發(fā)生(A->G) 的突變,導致甲硫氨酸(Met)替代了異亮氨酸(Ile);在nt28 31 處發(fā)生了(T->C)及 nt3346 處發(fā)生了(T->C)堿基的變異,但其所編碼的氨基酸未發(fā)生改變。PV3 型疫苗株主要突變熱點位于第2636nt 處。有兩株(JX2018JHH095L、JX2018JHH097L)在 nt2636 處發(fā)生了(G->A)的變異,導致了極性氨基酸替代了疏水氨基酸,需繼續(xù)持續(xù)監(jiān)測毒株變異情況。
當前全球流行的脊灰野病毒只有Ⅰ型,并且流行國家都是中國的鄰國,野病毒輸入的風險一直存在[16]。bOPV 的使用有VDPV 的出現(xiàn)和循環(huán)的風險。要最終消滅 VDPV,就需全面停用OPV,改為全程接種 IPV,才有可能最終消滅脊灰[17]。在無脊灰證實階段,保持 AFP 病例監(jiān)測的敏感性,并將外環(huán)境監(jiān)測作為AFP 病例監(jiān)測的有力補充,加強對PV 的監(jiān)測,控制可能出現(xiàn)的VDPV 傳播,對全球消滅脊灰行動最終目標的盡快實現(xiàn)具有重要意義。