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        循環(huán)長(zhǎng)鏈非編碼RNA 作為生物標(biāo)記物用于結(jié)直腸癌診斷的meta 分析

        2021-01-18 10:47:22江梅萬(wàn)臘根萬(wàn)勁華聶益軍劉淑媛呂小林張長(zhǎng)林
        關(guān)鍵詞:效應(yīng)研究

        江梅,萬(wàn)臘根,萬(wàn)勁華,聶益軍,劉淑媛,呂小林,張長(zhǎng)林

        (南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 南 昌 3 30006)

        結(jié)直腸癌是世界范圍內(nèi)常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,每年有超過(guò)60 萬(wàn)人因結(jié)直腸癌死亡[1]。若結(jié)直腸癌能夠早期發(fā)現(xiàn)和診斷,結(jié)直腸癌相關(guān)的死亡可明顯降低。結(jié)直腸癌I 期患者5 年生存率可達(dá)93%,II 期患者也超過(guò)80%, 而晚期患者少于10%[2,3]。由于早期結(jié)直腸癌患者沒(méi)有明顯的臨床癥狀,所以多數(shù)患者在確診時(shí)已經(jīng)是晚期。目前常用的早期診斷技術(shù)有結(jié)腸鏡、大便隱血試驗(yàn)、大便DNA檢測(cè)以及腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)。結(jié)腸鏡檢查被認(rèn)為是目前結(jié)直腸癌診斷的 “金標(biāo)準(zhǔn)”,但其有創(chuàng)、花費(fèi)高、有醫(yī)療風(fēng)險(xiǎn)等特點(diǎn)限制其在結(jié)直腸癌篩查中應(yīng)用。大便隱血試驗(yàn)由于無(wú)創(chuàng)、花費(fèi)少、取材方便的特點(diǎn)被廣泛地運(yùn)用到結(jié)直腸癌的篩查中,但其靈敏度低,且取材前需要苛刻的飲食控制。大便DNA 檢測(cè)由于樣本處理過(guò)程繁瑣以及花費(fèi)高等特點(diǎn)限制其在結(jié)直腸癌中的廣泛運(yùn)用[4]。腫瘤標(biāo)志物CEA 以及CA199 診斷結(jié)直腸癌的靈敏度和特異度也不理想[5]。因此,仍迫切需要尋找可用于結(jié)直腸癌早期診斷的新方法。

        長(zhǎng)鏈非編碼RNA (long non-protein coding RNA,lncRNA)是在真核生物中新發(fā)現(xiàn)的一類長(zhǎng)度大于200 個(gè)核苷酸,不具備蛋白編碼能力的非編碼RNA。越來(lái)越多的證據(jù)表明lncRNA 在腫瘤細(xì)胞增殖,凋亡,浸潤(rùn)以及轉(zhuǎn)移起重要作用[6-8]。近年來(lái),許多研究證實(shí)lncRNA 可作為生物標(biāo)記物用于結(jié)直腸癌的診斷[9-17]。但這些研究結(jié)果中l(wèi)ncRNA 的診斷效能并不完全一致,因此本研究利用 Meta 分析的方法,對(duì)lncRNA 在結(jié)直腸癌中的診斷價(jià)值進(jìn)行系統(tǒng)性評(píng)價(jià)。

        1 材料與方法

        1.1 檢索策略 兩名研究人員獨(dú)立檢索英文數(shù)據(jù)庫(kù)PubMed, Embase 以及OVIDSP, 檢索截止日期2018 年 10 月 1 日。英文數(shù)據(jù)庫(kù)主要檢索詞為(‘Lo ng Noncoding RNA’ OR ‘LncRNA’ OR ‘Long ncRNA’ OR ‘Long Non-Translated RNA’ OR ‘Lo ng Nontranslated RNA’ OR ‘Long Non-Coding RN A’ OR ‘Long Non-Protein-Coding RNA’ OR ‘Lo ng Untranslated RNA’ OR ‘Long ncRNAs’ OR ‘Lo ng Intergenic Non-Protein Coding RNA’ OR ‘LincRNAs’ OR ‘LINC RNA’ OR ‘Long Non Protein Coding RNA’) AND (‘circulating’ OR ‘serum’ OR‘sera’ OR ‘blood’ OR ‘plasma’)AND (‘colorectal’OR ‘colon’ OR ‘colonic’ OR ‘rectal’ OR ‘rectum’) AND (‘cancer’ OR ‘carcinoma’ OR ‘tumor’OR ‘neoplasm’)。此外,對(duì)原文及綜述所列出的參考文獻(xiàn)進(jìn)行手工檢索。

        1.2 文獻(xiàn)納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

        1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn) ⑴結(jié)直腸癌患者均經(jīng)結(jié)腸鏡或病理組織學(xué)確診;⑵明確給出IncRNA 診斷的靈敏度和特異度,或通過(guò)間接計(jì)算能夠得到診斷試驗(yàn)四格表數(shù)據(jù);⑶研究的樣本類型為血漿或血清;⑷國(guó)籍和種族不限,發(fā)表語(yǔ)種為英文。

        1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn) ⑴文獻(xiàn)重復(fù);⑵書信、會(huì)議報(bào)告、綜述、評(píng)論和未經(jīng)校對(duì)的論文;⑶無(wú)法計(jì)算出四格表數(shù)據(jù)或數(shù)據(jù)不全。

        1.3 數(shù)據(jù)提取 文獻(xiàn)提取信息包括第一作者姓名、發(fā)表時(shí)間、國(guó)家、病例組人數(shù)、對(duì)照組人數(shù)、樣本類型、lncRNA 的檢測(cè)方法、lncRNA 的名稱,診斷性能指標(biāo)主要包括曲線下面積 (Area under the curve,AUC)、靈敏度(Sensitivity,SEN)、特異度(Specificity,SPE)、真陽(yáng)性(True positive,TP)、假陽(yáng)性(False positive,F(xiàn)P)、假陰性(False negative,F(xiàn)N)以及真陰性(True negative,TN)。數(shù)據(jù)提取由兩名研究人員分別獨(dú)立完成,若兩人提取結(jié)果不一致,則需共同研究后達(dá)成一致。

        1.4 文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià) 納入文獻(xiàn)的質(zhì)量評(píng)價(jià)參照Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies 2(QUADAS-2)[18]。QUADAS-2 是在 QUADAS 的基礎(chǔ)上改進(jìn)后用于診斷性試驗(yàn)的質(zhì)量評(píng)價(jià)工具,由四個(gè)域組成(patient selection,index test,reference standard 以及 flow and timing)。前三個(gè)域的標(biāo)志性問(wèn)題按“high”、“unclear”、“l(fā)ow”評(píng)分以判斷偏倚風(fēng)險(xiǎn)及適用性。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用雙變量隨機(jī)效應(yīng)模型合并靈敏度(SEN)、特異度(SPE)、陽(yáng)性似然比(PLR)、陰性似然比(NLR)、診斷比值比(DOR)[19],同時(shí)合并總的受試者工作特征曲線 (SROC) 并計(jì)算出曲線下面積(AUC)。異質(zhì)性檢驗(yàn)包括閾值效應(yīng)檢驗(yàn)和非閾值效應(yīng)檢驗(yàn)。閾值效應(yīng)通過(guò)Spearman 相關(guān)系數(shù)和 SROC 曲線形態(tài)評(píng)價(jià)。若 SROC 曲線呈現(xiàn)“肩臂狀”分布,則存在閾值效應(yīng);若 SROC 曲線不呈“肩臂狀”分布且 Spearman 相關(guān)系數(shù) P>0.05,則不存在閾值效應(yīng)。非閾值效應(yīng)由 Cochran’s Q 檢驗(yàn)和I2(inconsistency index )檢測(cè),若 P<0.05 或 I2>50%提示存在非閾值效應(yīng)。亞組分析和Meta 回歸用于分析異質(zhì)性原因。Deek’s 檢驗(yàn)用于發(fā)表偏倚判斷和評(píng)估[20]。所有數(shù)據(jù)采用Meta-Disc 和STATA 12.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析[21]。P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果以及納入研究的基本特征 按標(biāo)準(zhǔn)篩選文獻(xiàn)流程,最終納入9 篇文獻(xiàn),其中包括17 項(xiàng)研究。文獻(xiàn)的篩選流程見(jiàn)圖1,納入研究的基本特征見(jiàn)表1。文獻(xiàn)共包括 833 例結(jié)直腸癌患者和688 例對(duì)照。8 篇文獻(xiàn)的結(jié)直腸癌患者均經(jīng)結(jié)腸鏡或病理組織學(xué)確診,1 篇文獻(xiàn)未說(shuō)明[14],我們與作者聯(lián)系后確認(rèn)了該研究中的所有結(jié)直腸癌患者均經(jīng)病理組織學(xué)確診。因此,833 例結(jié)直腸癌患者均通過(guò)“金標(biāo)準(zhǔn)”確診。文獻(xiàn)的發(fā)表年限為2011 年至2017 年。其中以中國(guó)人為研究對(duì)象的文獻(xiàn)有8 篇,以澳大利亞白人為研究對(duì)象的1 篇。5 篇文獻(xiàn)的樣本類型為血漿,其余4 篇文獻(xiàn)的樣本類型為血清。17 項(xiàng)研究中15 項(xiàng)是評(píng)價(jià)單一IncRNA 的診斷價(jià)值,1 項(xiàng)是評(píng)價(jià)聯(lián)合三種IncRNAs 的診斷價(jià)值,1項(xiàng)是評(píng)價(jià)聯(lián)合四種IncRNAs 的診斷價(jià)值。所有的研究都是采用定量PCR (quantitative PCR ,qPCR)方法檢測(cè)。

        圖1 文獻(xiàn)篩選流程

        2.2 質(zhì)量評(píng)價(jià) 納入研究均采用QUADAS-2 進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià)。如圖2A 以及2B 所示,主要的偏倚發(fā)生在“patient selection”,所有納入文獻(xiàn)的質(zhì)量達(dá)到相對(duì)較高的水平。

        2.3 循環(huán)lncRNAs 在結(jié)直腸癌中的診斷價(jià)值 圖3A 以及3B 分別為lncRNA 診斷結(jié)直腸癌的合并SEN,合并SPE 的森林圖。結(jié)果顯示IncRNA 診斷結(jié)直腸癌的合并SEN、合并SPE、合并 PLR、合并NLR 以及合并 DOR 分別為 0.77 (95%CI:0.72~0.8 1),0.83(95%CI:0.76~0.88),4.5 (95%CI:3.2~6.4),0.28 (95%CI:0.22~0.35)以及 16 (95%CI:9~27)。圖4 為 SROC 曲線圖,結(jié)果顯示 AUC 為 0.86(95%CI:0.83~0.89), 結(jié)果提示循環(huán) lncRNA 在結(jié)直腸癌中的診斷價(jià)值較高。

        表1 納入研究的基本特征

        圖2 偏倚風(fēng)險(xiǎn)和適用性問(wèn)題圖(A)以及偏倚風(fēng)險(xiǎn)和適用性問(wèn)題總結(jié)圖(B)

        2.4 異質(zhì)性檢驗(yàn),Meta-回歸以及亞組分析 閾值效應(yīng)是導(dǎo)致異質(zhì)性的重要原因之一,它是指診斷試驗(yàn)各研究間陽(yáng)性結(jié)果和陰性結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn)存在差異所引起的異質(zhì)性。Spearman 相關(guān)系數(shù)是分析閾值效應(yīng)的一種有效方法[22,23]。在本研究中,Spearman相關(guān)系數(shù)為-0.287,P= 0.264 (P>0.05),提示不存在閾值效應(yīng)。SROC 曲線未呈現(xiàn)肩臂狀效應(yīng),進(jìn)一步說(shuō)明納入研究不存在閾值效應(yīng)。采用Cochran’s Q檢驗(yàn)和I2 檢驗(yàn)分析有無(wú)非閾值效應(yīng),結(jié)果顯示,靈敏度I2、特異度I2、陽(yáng)性似然比I2、陰性似然比I2、診斷比值比I2 分別為80.61%(P=0.00),85.22%(P=0.00),81.25%(P=0.00),86.00%(P=0.00) 以及100%(P=0.00),提示存在顯著非閾值效應(yīng)。為進(jìn)一步尋找引起異質(zhì)性的原因,根據(jù)樣本量(>60 vs≤60)、種族(亞洲人 vs 白人)、IncRNA 研究模式(聯(lián)合 vs 單一)、樣本類型(血漿vs 血清)做亞組分析,結(jié)果顯示異質(zhì)性主要來(lái)源于樣本量以及樣本類型, 樣本量≤60組的特異度優(yōu)于樣本量>60 組(0.87vs0.81),樣本類型為血漿組的靈敏度優(yōu)于血清組(0.79vs0.74)。見(jiàn)圖 5、表 2。

        圖3 循環(huán)lncRNAs 診斷結(jié)直腸癌的合并靈敏度(A),合并特異度(B)的森林圖

        圖4 循環(huán)lncRNAs 診斷結(jié)直腸癌的SROC 曲線

        2.5 發(fā)表偏倚 Deek’s 檢驗(yàn)用于發(fā)表偏倚判斷和評(píng)估。P 值為0.80,提示各研究間不存在發(fā)表偏倚,見(jiàn)圖6。

        3 討論

        表2 循環(huán)lncRNAs 診斷結(jié)直腸癌亞組分析的靈敏度和特異度

        圖5 循環(huán)lncRNAs 診斷結(jié)直腸癌亞組分析的靈敏度和特異度

        近年來(lái),有不少研究報(bào)道lncRNA 在腫瘤細(xì)胞增殖,凋亡,浸潤(rùn)以及轉(zhuǎn)移發(fā)揮重要作用[6-8]。并且,lncRNAs 不僅在腫瘤組織扮演重要角色,而且可作為循環(huán)標(biāo)記物用于腫瘤診斷,如結(jié)直腸癌的診斷[9-17]。然而,它們的診斷效能仍不明確。目前國(guó)內(nèi)外未見(jiàn)關(guān)于循環(huán)IncRNA 在結(jié)直腸癌中診斷價(jià)值的系統(tǒng)性評(píng)價(jià)。本研究利用 Meta 分析的方法,對(duì)循環(huán)lncRNA 在結(jié)直腸癌中的診斷效能進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。

        圖6 Deek’s 檢驗(yàn)用于發(fā)表偏倚判斷和評(píng)估

        在本研究中,納入的9 篇文獻(xiàn)共包括 833 例結(jié)直腸癌患者和688 例對(duì)照。使用雙變量隨機(jī)效應(yīng)模型合并 SEN、SPE、PLR、NLR、DOR 分別為 0.77(95%CI:0.72 ~0.81),0.83 (95%CI:0.76 ~0.88),4.5(95%CI:3.2~6.4),0.28 (95%CI:0.22~0.35)以及 16(95%CI:9~27)。SROC 曲線 圖顯 示 AUC 為 0.86(95%CI:0.83~0.89)。有文獻(xiàn)報(bào)道[24],CEA 以及 CA1 99 診斷結(jié)直腸癌的靈敏度僅僅為11.1%和7.7%,Wang J 等研究結(jié)果顯示CEA 以及CA199 診斷結(jié)直腸癌的 AUC 值也僅為 0.649 以及 0.598[25]。循環(huán)miRNAs 作為一種新的血液標(biāo)記物,在結(jié)直腸癌診斷中也有相對(duì)較高的診斷價(jià)值,靈敏度,特異度以及 AUC 值分別為 78% 、79%、 0.87[26]。我們研究發(fā)現(xiàn)lncRNAs 的診斷效能與miRNAs 相似, 但是與lncRNAs 相比,miRNAs 的逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程更為繁瑣耗時(shí)。因此,我們得出結(jié)論與其它無(wú)創(chuàng)性血液標(biāo)記物相比,有著高靈敏度以及特異度的循環(huán)lncRNAs 在診斷結(jié)直腸癌中更為優(yōu)越。診斷結(jié)直腸癌的陽(yáng)性似然比PLR 以及陰性似然比NLR 為4.5 (95%CI:3.2~6.4),0.28(95%CI:0.22~0.35),結(jié)果提示循壞 lnc RNAs 確診或排除結(jié)直腸癌的能力相對(duì)較弱。DOR作為一個(gè)綜合診斷指標(biāo), 其值在0 至無(wú)限大之間[27],DOR=1 提示該檢測(cè)不能很好地將結(jié)直腸癌患者組和對(duì)照組區(qū)別開(kāi)。DOR 值越高,檢測(cè)的診斷效能越好。在本研究中,DOR 為16,結(jié)果提示循環(huán)lnc RNAs 作為潛在的生物學(xué)標(biāo)記物在結(jié)直腸癌中的診斷價(jià)值較高。

        總的來(lái)說(shuō),異質(zhì)性主要來(lái)源于閾值效應(yīng)以及非閾值效應(yīng)。幸運(yùn)的是,本研究中的異質(zhì)性并非來(lái)自閾值效應(yīng),而是來(lái)源于非閾值效應(yīng)。為進(jìn)一步尋找引起異質(zhì)性的原因,根據(jù)樣本量(>60 vs≤60)、種族(亞洲人 vs 白人)、IncRNA 研究模式(聯(lián)合 vs 單一)、樣本類型(血漿vs 血清)做亞組分析,結(jié)果顯示異質(zhì)性主要來(lái)源于樣本量以及樣本類型, 樣本量≤60組的特異度優(yōu)于樣本量>60 組(0.87vs0.81)。納入研究的結(jié)直腸癌患者數(shù)量是在15 至220 之間,樣本量的差異可能導(dǎo)致異質(zhì)性。為了增加研究數(shù)量,我們對(duì)樣本量沒(méi)有嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)。另外,樣本類型為血漿組的靈敏度優(yōu)于血清組(0.79vs0.74)。血漿除含有凝血因子以外,其它成分基本與血清相同。在診斷性試驗(yàn)中,血漿和血清都是常見(jiàn)的樣本類型,血漿或血清在循環(huán)lncRNAs 的檢測(cè)中哪一個(gè)更優(yōu)越尚不明確。因此,仍然需要進(jìn)一步的研究證實(shí)循環(huán)lncRNAs 的檢測(cè)與樣本類型相關(guān)。本研究結(jié)果顯示種族或IncRNA 研究模式的差異并不會(huì)導(dǎo)致異質(zhì)性,這與以往的研究發(fā)現(xiàn)IncRNA 的聯(lián)合檢測(cè)診斷價(jià)值更高的結(jié)論不一致[16]。而在本次系統(tǒng)性評(píng)價(jià)中,只有兩篇文獻(xiàn)是IncRNA 的聯(lián)合檢測(cè),納入的研究數(shù)量較少。因此,仍然需要進(jìn)一步的研究證實(shí)IncRNA 聯(lián)合檢測(cè)的診斷價(jià)值。

        盡管本研究結(jié)果顯示循環(huán)lncRNAs 可作為潛在的生物標(biāo)記物用于結(jié)直腸癌的診斷,但仍存在一些局限性。第一,納入的研究數(shù)量相對(duì)較少,仍需更多的研究才能給出肯定性的結(jié)論。第二,本研究存在一些偏倚, 所有納入的研究都為病例對(duì)照研究,另外,大多數(shù)納入的研究對(duì)于是否是連續(xù)性樣本還是隨機(jī)樣本以及研究是否避免了不恰當(dāng)?shù)呐懦龥](méi)有明確說(shuō)明,這些都導(dǎo)致了文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)‘patient selection’域偏倚為高風(fēng)險(xiǎn),進(jìn)一步的研究需要避免這些偏倚。第三,納入的研究中除了一項(xiàng)研究來(lái)自澳大利亞其余都來(lái)自中國(guó),因此,納入研究的患者大多數(shù)都是亞洲人。白種人以及非洲人的研究也是必不可少的。

        綜上所述, 循環(huán)IncRNAs 對(duì)結(jié)直腸癌具有較高的診斷價(jià)值, 可作為結(jié)直腸癌診斷的潛在生物標(biāo)記物。但仍需要進(jìn)一步大樣本的研究來(lái)證實(shí)我們的結(jié)論。

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