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        二代測序技術(shù)在急性髓系白血病患者預(yù)后中的應(yīng)用價值

        2021-01-13 03:52:16牛曉娜葛菲郭宏崗陳香麗郭建民
        分子診斷與治療雜志 2020年12期
        關(guān)鍵詞:中位生存期基因突變

        牛曉娜 葛菲 郭宏崗 陳香麗 郭建民

        急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML)是成人中最常見急性白血病類型,以中老年人居多。AML 發(fā)病過程中,每個群體不同時間段里經(jīng)歷不同的遺傳學(xué)改變,致使染色體核型、基因突變類型及臨床特征有很大異質(zhì)性,而這些異質(zhì)性是預(yù)后差異的基礎(chǔ)[1-2]。現(xiàn)階段,臨床已將AML患者分子生物學(xué)層面納入危險度分層系統(tǒng),分為預(yù)后良好、預(yù)后中等、預(yù)后不良。隨著高通量基因測序技術(shù)的發(fā)展,國內(nèi)外學(xué)者研究了AML 相關(guān)基因突變及其在疾病發(fā)生中的機制,并已明確了一些特殊類型的突變或融合基因用于指導(dǎo)治療方案的制定[3-4]。本研究嘗試分析二代測序(Next-generation sequencing,NGS)技術(shù)下AML 患者基因突變情況,并探討具體基因突變類型對預(yù)后及生存狀況的影響。報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        選取本院2016年1月至2018年6月確診的298例AML 患者作為研究對象,男186 例,女112 例,年齡≥45 歲120 例,年齡<45 歲178 例。納入標(biāo)準(zhǔn):①均符合AML 診斷標(biāo)準(zhǔn)[5];②經(jīng)骨髓和外周血細胞形態(tài)學(xué)檢查、流式免疫分型、骨髓活檢、染色體核型分析等檢查確診;③患者知情同意。排除標(biāo)準(zhǔn):治療相關(guān)性白血病、MDS 或MPN 轉(zhuǎn)化白血病等繼發(fā)白血病患者。研究經(jīng)本院醫(yī)學(xué)倫理委員會審批同意。

        1.2 方法

        1.2.1 檢測方法

        抽取患者骨髓液4~6 mL,EDTA 抗凝,分離并收集骨髓單個核細胞,柱式抽提試劑盒提取DNA,采用AML/MDS-NGS 芯片(上海源奇生物醫(yī)藥科技有限公司)進行基因突變檢測,涵蓋ASXL1、NPM1、

        FLT3、KIT、DNMT3A、CEBPA、IDH、EZH2、TET2、RUNX1、TP53、SF3B1、PHF6、SRSF2、RAS、U2AF1、JAK等基因的熱點突變區(qū)域,測序深度3 000×。

        1.2.2 治療方法

        年齡≤60 歲者,予IA3+7 方案(去甲氧柔紅霉素8~12 mg/m2×3 d+阿糖胞苷100 mg/m2×7 d)誘導(dǎo)化療;年齡>60 歲者,予DA3+7 方案或CAG(阿克拉霉素10~14 mg/m2×4 d+阿糖胞苷10 mg/m2,2 次/d×14 d+集落刺激因子300 μg/d)等預(yù)激方案誘導(dǎo)化療。完全緩解(CR)后進入鞏固階段,予中、大劑量阿糖胞苷單藥至少4 個療程。

        1.3 觀察指標(biāo)

        ①AML 基因突變頻率及分布情況。②根據(jù)《成人急性髓系白血?。ǚ羌毙栽缬琢<毎籽。┲袊\療指南(2017年版)》[6]中預(yù)后危險度分級分為預(yù)后良好組、預(yù)后中等組、預(yù)后不良組,對比3 組臨床資料、基因突變頻率、主要基因突變類型。③基因突變與預(yù)后的關(guān)系。④伴或不伴基因突變對無病生存期、總生存期的影響。⑤不同基因突變類型對中位無病生存期的影響。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS 22.0 統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)分析;計數(shù)資料以n(%)表示,采用χ2檢驗;符合正態(tài)分布的計量資料采用(±s)表示,組間比較用獨立樣本t檢驗。預(yù)后影響因素分析應(yīng)用Logistic 回歸分析;Kaplan-Meier 生存曲線分析伴基因突變、NPM1、FLT3-ITD、DNMT3A、TET2 突變陽性與患者生存期的關(guān)系,采用Log-Rank 檢驗;P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 AML 基因突變頻率及分布情況

        298 例AML 患者中位突變數(shù)目為兩個(0~6),其中256 例可檢測到基因突變,占85.91%;≥3 種基因突變71 例,占23.83%。突變頻率最高的前5 個基因分別為NPM1、FLT3-ITD、CEBPA、DNMT3A、TET2。見圖1。

        圖1 AML 基因突變頻率及分布情況Figure 1 Frequency and distribution of AML gene mutations

        2.2 3 組臨床資料、基因突變頻率

        3 組初診骨髓原始細胞、附加染色體異常、伴基因突變、NPM1、FLT3-ITD、CEBPA、DNMT3A、TET2突變陽性比例比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表1。

        2.3 基因突變與預(yù)后不良的關(guān)系

        將初診骨髓原始細胞、附加染色體異常等其他因素控制后,伴基因突變、FLT3-ITD、DNMT3A、TET2突變陽性仍與預(yù)后不良顯著相關(guān)(P<0.05);CEBPA突變陽性與預(yù)后不良無關(guān)。見表2。

        表2 基因突變與預(yù)后不良的關(guān)系Table 2 Relationship between gene mutation and poor prognosis

        2.4 基因突變對無病生存期、總生存期的影響

        隨訪兩年,脫落8 例。伴基因突變的AML 患者中位無病生存期11.87 個月短于不伴基因突變的AML 患者15.07 個月(χ2=5.168,P=0.023)。見圖2。

        圖2 基因突變對中位無病生存期的影響Figure 2 The effect of gene mutations on median diseasefree survival

        2.5 不同基因突變類型對中位無病生存期的影響

        Kaplan-Meier 曲線分析,NPM1突變陽性的AML 患者中位生存期14.71 個月長于陰性患者11.63 個月,F(xiàn)LT3-ITD、DNMT3A、TET2突變陽性的AML 患者中位無病生存期11.06 個月、11.24 個月、11.32 個月短于FLT3-ITD、DNMT3A、TET2突變陰性的AML 患者15.73 個月、14.86 個月、14.19 個月,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=5.223、6.277、5.341、7.552,P=0.022、0.012、0.021、0.006)。見圖3。

        圖3 不同基因突變類型對中位無病生存期的影響Figure 3 The effect of different gene mutation types on median disease-free survival

        3 討論

        NGS 技術(shù)在大型綜合基因組分析的應(yīng)用極大提高了臨床對AML 發(fā)生、發(fā)展機制的認(rèn)識,重現(xiàn)性基因突變的不斷發(fā)現(xiàn)打開了相關(guān)機制研究的思路。2016年WHO 對AML 分類再次做了更新[7],NPM1、CEBPA、RUNX1等突變均已被納入AML 診斷參考,為AML 做進一步的精細分層。

        現(xiàn)階段,采用NGS 技術(shù)探索AML 患者基因突變譜的大樣本數(shù)據(jù)有限,美國癌癥基因譜研究網(wǎng)絡(luò)報道病例數(shù)為200 例,歐洲多中心數(shù)據(jù)共納入1 540例患者,國內(nèi)多個研究中心,包括蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院、上海7 家綜合性醫(yī)院等[8-11]也發(fā)表了各自數(shù)據(jù)。雖然各中心檢測的目標(biāo)基因略有不同,但都基本覆蓋了NPM1、FLT3、IDH、DNMT3A、TET2、TP53、RUNX1、RAS、WT1、CEBPA等AML 常見基因。本研究與美國多中心數(shù)據(jù)22%相近,高于上海7 家綜合性醫(yī)院報道的數(shù)據(jù)13%。從基因突變結(jié)果看,AML 伴NPM1突變患者占11.62%,與國內(nèi)其他中心數(shù)據(jù)相似,但明顯低于美國人群(27%)與歐洲人群(28%)。產(chǎn)生差異的原因尚不明確,是否與患者種族、生活方式、生活環(huán)境等有關(guān)還期待更多數(shù)據(jù)支持。伴DNMT3A突變的患者占10.15%,蘇醫(yī)一附院6%,上海7 家綜合性醫(yī)院9%,均低于美國數(shù)據(jù)(26%)。研究證實,DNMT3A突變與診斷時的高白細胞、老年和不良預(yù)后有關(guān)[12]。上海7 家綜合性醫(yī)院對入組患者進行年齡分層后發(fā)現(xiàn),50 歲以上患者DNMT3A突變頻率是50 歲以下患者的3倍以上。蘇醫(yī)一附院患者中位年齡42 歲,而美國患者中位年齡55 歲。故推測各中心患者中位年齡可能是數(shù)據(jù)差異的原因之一。

        NPMl突變在成人AML 中的中位年齡偏高,血小板、白細胞數(shù)目較高,且與CD34 和CDll7 低表達相關(guān)[13]。研究顯示,NPMl突變預(yù)示化療后易達到CR[14]。本研究發(fā)現(xiàn),NPM1突變陽性者預(yù)后好。FLT3-ITD突變的AML 患者外周血骨髓原始細胞比例、白細胞數(shù)較高,CR 率和總生存率偏都偏低,復(fù)發(fā)率偏高[15]。本研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)LT3-ITD基因突變是預(yù)后不良因素。DNMT3A基因貫穿造血干細胞自我更新、分化和抑癌基因失活、原癌基因激活的過程,該基因突變在AML 發(fā)病機制中起著舉足輕重的作用。Meta 分析顯示,DNMT3A基因突變是AML 患者第一療程緩解率和總體生存率的危險因素[16]。本研究結(jié)果提示,DNMT3A突變陽性提示預(yù)后不良。目前,TET2基因突變在評估疾病預(yù)后方面尚無統(tǒng)一結(jié)論。本研究數(shù)據(jù)顯示,TET2突變陽性者生存期短,與李佳佳等[17]研究一致,但TET2基因突變易發(fā)生在年齡偏大的患者中,而年齡不同治療方案不一,故預(yù)后可能受到年齡及治療方案影響,可能導(dǎo)致數(shù)據(jù)偏移,仍需擴大樣本數(shù)排除影響因素進行進一步分析。

        綜上可知,不同預(yù)后AML 患者基因突變頻率存在差異,伴基因突變及FLT3-ITD、DNMT3A、TET2突變陽性者生存期短,預(yù)后差,而NPM1突變陽性者與之相反。

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