張敏敏, 王敬華, 葛 平, 王慶忠, 徐 蓉, 劉學(xué)杰, 崔 琳, 錢誠凱, 夏啟航, 陳 蓉
(上海市臨床檢驗中心,上海 200126)
近年來,基質(zhì)輔助激光解析/電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于臨床常見致病微生物的鑒定工作中,與傳統(tǒng)病原微生物鑒定方法相比,MALDI-TOF MS技術(shù)具有操作簡單、檢測快速、特異性高、穩(wěn)定性好、準(zhǔn)確率高、耗能低等優(yōu)點。MALDI-TOF MS可通過對病原微生物蛋白指紋圖譜進(jìn)行同源性分析及時確定致病微生物種屬,對疾病診斷具有重要意義,有望成為臨床微生物實驗室檢測工作的重要組成部分[1-2]。
上海市臨床檢驗中心(Shanghai Center for Clinical Laboratory,SCCL)是上海市臨床檢驗質(zhì)量控制組織評價機(jī)構(gòu),2015年開始開展質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)量評價(簡稱室間質(zhì)評)活動。本研究旨在通過分析2015—2019年質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評活動反饋結(jié)果,了解上海市及部分其他地區(qū)臨床實驗室(包括獨立實驗室)微生物質(zhì)譜檢測開展情況及檢測質(zhì)量。
將脫脂牛奶110 ℃條件下15 min高壓蒸汽滅菌,冷卻后分裝0.3 mL到無菌凍存管中備用。選取美國標(biāo)準(zhǔn)菌種庫(American type culture collection,ATCC)菌株,將其保存到脫脂牛奶保存管內(nèi),置-80 ℃冰箱冷凍,制備成凍干品,低溫保存。
1.2.1 室間質(zhì)評方案設(shè)計 對參加SCCL質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評活動的臨床實驗室發(fā)放室間質(zhì)評樣本。每年進(jìn)行2次室間質(zhì)評活動,每次發(fā)放5份樣本。要求參評實驗室根據(jù)臨床標(biāo)本來源選擇相應(yīng)的培養(yǎng)基,有臨床意義的病原菌菌株采用質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行鑒定,并在規(guī)定日期內(nèi)(樣本接收后10 d內(nèi))將檢測結(jié)果上報至SCCL數(shù)據(jù)庫,超過規(guī)定時間系統(tǒng)將不再接收數(shù)據(jù)。
1.2.2 結(jié)果評價 依據(jù)回報的檢測結(jié)果與預(yù)期結(jié)果的符合性統(tǒng)計各實驗室的得分。合格判定原則:菌株正確鑒定到種水平得20分;正確鑒定到屬水平,而種水平錯誤,得10分??偝煽儭?0分為合格。對成績進(jìn)行匯總,并對錯誤的檢測結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析。
采用EXCEL 2007軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。計數(shù)資料以例或率表示。
2015—2019年SCCL質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評活動共發(fā)放樣本50份,菌株涉及27個屬43個種。參評實驗室檢測系統(tǒng)見表1。
表1 參評實驗室檢測系統(tǒng) 家
2015年參加SCCL質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評活動的臨床實驗室有10家,2019年增加到40家,增加了300%。2015—2019年SCCL共開展10次微生物室間質(zhì)評活動,合格率均為100%。其中,2015年第1次室間質(zhì)評有4家實驗室、2017年第1次和第2次室間質(zhì)評各有1家實驗室、2018年第2次和2019年第2次室間質(zhì)評各有3家實驗室未獲得滿分,其余均獲得滿分。發(fā)放的50株菌株中,有45株鑒定結(jié)果符合率為100%,鑒定結(jié)果有誤的菌株有維羅納氣單胞菌、溫和氣單胞菌、中間葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎鏈球菌,符合率分別為60%、94.4%、95.5%、89.7%、92.5%。見表2、表3。
表2 2015—2019年SCCL質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評成績
表3 鑒定結(jié)果有誤的菌株
MALDI-TOF MS技術(shù)主要用于臨床各種送檢標(biāo)本分離培養(yǎng)后單菌落的檢測,目前已被廣泛用于分析血清/血漿、唾液和尿液標(biāo)本,以診斷疾病、識別健康狀況的潛在生物標(biāo)志物,為臨床實驗室檢測提供了一個簡單方便的診斷模型[3-5]。MALDI-TOF MS技術(shù)在臨床實驗室中的應(yīng)用不斷被拓展,在微生物鑒定和特殊耐藥微生物同源性分析方面具有一定的前景,也是研究和分析蛋白質(zhì)的有力工具[6]。
SCCL通過開展質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評活動,對上海和部分其他地區(qū)醫(yī)療機(jī)構(gòu)微生物質(zhì)譜鑒定能力進(jìn)行了評價。(1)參評實驗室由2015年的10家增加到2019年的40家,增加了300%,提示該檢測方法正逐步被醫(yī)療機(jī)構(gòu)接受,并運用到臨床致病菌的鑒定中??赡苁强紤]到儀器價格比較昂貴,目前主要是三級綜合性醫(yī)院在使用;從鑒定系統(tǒng)的分布看,雖然絕大多數(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)使用的是進(jìn)口質(zhì)譜儀,但是國產(chǎn)質(zhì)譜儀也開始逐步被醫(yī)療機(jī)構(gòu)選用。(2)5年室間質(zhì)評的合格率均達(dá)到100%,表明該項目整體檢測質(zhì)量較好。2015年第1次室間質(zhì)評有4家實驗室、2017年第1次和第2次室間質(zhì)評各有1家實驗室、2018年第2次和2019年第2次室間質(zhì)評各有3家實驗室未獲得滿分,其余均獲得滿分。發(fā)放的50株菌株中,有45株鑒定結(jié)果符合率為100%,但氣單胞菌屬、葡萄球菌屬和鏈球菌屬的鑒定結(jié)果各參評實驗室略有偏差,提示個別實驗室的檢測能力有待進(jìn)一步提高。
實驗室回報結(jié)果發(fā)生錯誤的原因可能有培養(yǎng)時間、培養(yǎng)基、前處理方法、人員操作、儀器設(shè)備的選擇和校正等多方面的因素。細(xì)菌的培養(yǎng)時間是一個非常重要的變量,不同生理條件下的細(xì)菌,如處于休眠、細(xì)胞分裂、老化等狀態(tài)的細(xì)菌,其質(zhì)譜圖會發(fā)生變化。因此,在對細(xì)菌進(jìn)行檢測時,使細(xì)菌處于一個穩(wěn)定的狀態(tài)是十分必要的。在對細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng)時,使用不同培養(yǎng)基對細(xì)菌進(jìn)行鑒別具有重要意義,選擇性培養(yǎng)基可以很容易地識別出致病菌,有效分離純化致病菌。不同的實驗室采用不同的標(biāo)本處理方法,獲得的結(jié)果也不完全相同,因此檢測細(xì)菌時,可以將未經(jīng)處理的標(biāo)本直接進(jìn)樣,但缺點是將會產(chǎn)生較少的質(zhì)譜峰。對于較干燥、細(xì)胞壁較厚的菌落,破壁效果會不理想,核蛋白不能完全被釋放出來。為了獲得較多的生物標(biāo)志物,提高細(xì)菌檢測的準(zhǔn)確率,建議在檢測前對標(biāo)本進(jìn)行處理,尤其是革蘭染色陽性菌的檢測。要規(guī)范操作流程、建立簡便而重復(fù)性良好的檢測方法,如靶板涂抹要均勻,過薄或過厚都不能形成較好的結(jié)晶。每次進(jìn)行檢測前都應(yīng)使用標(biāo)準(zhǔn)品校準(zhǔn)儀器。疑難菌株缺乏特異性峰值或峰值數(shù)量不足,無法形成圖譜錄入數(shù)據(jù)庫,因此數(shù)據(jù)庫還需要不斷完善。
質(zhì)譜細(xì)菌鑒定室間質(zhì)評是保證各臨床實驗室檢測質(zhì)量的重要手段,可以考察參評實驗室對臨床微生物項目的檢測水平,可以反映在檢測中存在的共性問題,及某些實驗室存在的特殊問題,促進(jìn)實驗室檢測水平的提高,從而更好地服務(wù)臨床。相信隨著標(biāo)本處理方法的不斷優(yōu)化,標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖庫的不斷擴(kuò)充、室內(nèi)質(zhì)量控制的不斷加強、微生物檢測實踐經(jīng)驗和理論知識的不斷豐富、相關(guān)管理制度的不斷落實,臨床實驗室微生物質(zhì)譜檢測質(zhì)量會越來越高。