郭 偉, 黃江華, 吳 蓓, 陳 芳, 何曉華
(綿陽市三臺(tái)縣人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,四川 綿陽 621100)
腸球菌是臨床重要的條件致病菌,可以引起血流感染、心內(nèi)膜炎、尿路感染、呼吸道感染、腹腔感染和傷口感染等多種嚴(yán)重感染。腸球菌比其他革蘭陽性細(xì)菌具有更強(qiáng)的天然耐藥性,且很容易通過各種機(jī)制獲得耐藥基因,進(jìn)而產(chǎn)生多重、高水平耐藥菌株,給臨床抗感染治療帶來許多困擾,尤其是萬古霉素耐藥腸球菌(vancomycin resistantEnterococcus,VRE)。
耐藥和毒力是細(xì)菌生存的主要機(jī)制。由于存活的需要,細(xì)菌更趨向于向獲得耐藥性和強(qiáng)毒力方向進(jìn)化,隨著時(shí)間的推移,高耐藥兼具高毒力菌株越來越多[1]。腸球菌的耐藥性使治療難度大增,而增強(qiáng)的毒力又促進(jìn)了細(xì)菌的定植和致人感染[2-3],導(dǎo)致患者腸球菌感染率和病死率不斷上升。本研究對(duì)腸球菌的耐藥性和毒力基因進(jìn)行分析,以期為腸球菌感染的防控和治療提供理論依據(jù)。
收集2016年1月—2018年7月分離自綿陽市三臺(tái)縣人民醫(yī)院住院和門診患者臨床樣本的非重復(fù)腸球菌889株,其中屎腸球菌485株、糞腸球菌404株。質(zhì)控菌株糞腸球菌(ATCC 29212)購自中國食品藥品檢定研究院。
1.2.1 菌株鑒定和體外藥物敏感性試驗(yàn) 采用VITEK 2 Compact自動(dòng)化鑒定藥敏儀(法國生物梅里埃公司)鑒定菌株,采用VITEK 2 Compact自動(dòng)化鑒定藥敏儀和紙片擴(kuò)散法(紙片購自英國Oxid公司)對(duì)所有分離菌株進(jìn)行20種常用抗菌藥物的體外藥物敏感性試驗(yàn),結(jié)果判讀參照美國臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(the Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)2017年標(biāo)準(zhǔn)。
1.2.2 毒力基因檢測 采用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]提取52株VRE[(耐萬古霉素屎腸球菌(vancomycinresistantEnterococcus faecium,VREfm)47株、耐萬古霉素糞腸球菌(vancomycin-resistantEnterococcus faecalis,VREfs)5株)]和31株隨機(jī)選取的萬古霉素敏感屎腸球菌(vancomycin sensitiveEnterococcus faecium,VSEfm)基因組DNA,采用NanoDrop 1000紫外分光光度儀(美國賽默飛世爾公司)測定其濃度和純度。依據(jù)文獻(xiàn)[4]設(shè)計(jì)引物(表1),委托生工生物(工程)上海有限公司合成。采用C1000 TMThermal Cycle PCR 擴(kuò)增儀(美國伯樂公司) 檢測上述菌株基因組DNA中ace、asa1、cylA、efaA、esp、gelE、acm、cpd和hyl毒力基因。反應(yīng)體系為25 μL,包括10 μL Premix Taq混合液[含dNTP、DNA聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)緩沖液](長沙芯科生物科技有限公司)、10 μmol/L上游和下游引物、100 ng DNA模板。擴(kuò)增條件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 40 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃5 min。采用溴化乙錠預(yù)染色的1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測各目的基因擴(kuò)增片段后,委托生工生物工程(上海)有限公司測序,采用Blast軟件進(jìn)行序列比對(duì)[5]。
表1 毒力基因擴(kuò)增引物序列
采用SPSS 19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料采用例或率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)或Fisher確切概率法,以P≤0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2種腸球菌對(duì)20種抗菌藥物均有不同程度的耐藥,且耐藥率和耐藥譜不同。屎腸球菌中耐紅霉素、環(huán)丙沙星、青霉素、苯唑西林、左氧氟沙星和氨芐西林的菌株所占比例較高(>70%),而糞腸球菌對(duì)克林霉素、苯唑西林、奎奴普丁/達(dá)洛平和四環(huán)素的耐藥率>70%。屎腸球菌和糞腸球菌中,VRE的檢出率分別為9.7%(47/485)和1.2%(5/404);利奈唑胺耐藥菌株檢出率分別為0.6%(3/485)和1.7%(7/405)。屎腸球菌對(duì)阿莫西林/克拉維酸、氨芐西林、氨芐西林-舒巴坦、呋喃妥因、紅霉素、環(huán)丙沙星、利福平、莫西沙星、青霉素、萬古霉素和左氧氟沙星的耐藥率顯著高于糞腸球菌(χ2值分別為296.396、385.625、316.238、25.408、156.702、23.876、111.508、409.286、28.766、188.418,P<0.001),對(duì)苯唑西林、克林霉素、奎奴普丁/達(dá)洛平和四環(huán)素的耐藥率則顯著低于糞腸球菌(χ2值分別為16.502、88.831、452.94、36.356,P<0.001),見表2。
表2 485株屎腸球菌和404株糞腸球菌的藥物敏感性 株(%)
2種V R E對(duì)替加環(huán)素均敏感;9 7.9%(46/47)的VREfm對(duì)克林霉素、紅霉素、氨芐西林、青霉素、環(huán)丙沙星和左氧氟沙星耐藥,對(duì)高濃度慶大霉素和高濃度鏈霉素的耐藥率分別為55.3%(26/47)和12.8%(6/47),檢出1株VREfm對(duì)利奈唑胺耐藥;5株VREfs對(duì)高濃度慶大霉素、高濃度鏈霉素和呋喃妥因敏感,但對(duì)克林霉素、奎奴普丁/達(dá)福普丁、紅霉素、氨芐西林和青霉素耐藥率較高,見表3。
47株VREfm均檢出esp、acm毒力基因,但均未檢出asa1、ace和cpd毒力基因;5株VREfs檢出esp、acm、efaA毒力基因,但均未檢出asa1、cylA、Ace和cpd毒力基因。廣泛分布于VRE中的5種毒力基因的陽性率由高到低依次為:esp(100%)、acm(100%)、hyl(80.77%)、efaA(40.38%)和gelE(5.77%)。VREfm的毒力基因esp、acm和hyl的檢出率明顯高于VSEfm(χ2=28.157、17.391、18.311,P<0.001)。見表4。部分基因擴(kuò)增凝膠電泳圖見圖1。
52株VRE均至少攜帶2種毒力基因。47株VREfm中esp-acm-hyl3基因攜帶率(55.32%,26/47)最高,其次為esp-acm-hyl-efaA(19.15%,9/47)和esp-acm雙基因攜帶率(10.60%,5/47)。5株VREfs均同時(shí)攜帶3~5種毒力基因。見表5 。
表3 52株VRE菌株的藥物敏感性 株(%)
表4 毒力基因檢出率 株(%)
圖1 部分VREfs基因擴(kuò)增凝膠電泳圖
表5 VRE菌株毒力基因攜帶模式
本研究分析了485株屎腸球菌和404株糞腸球菌對(duì)20種常見抗菌藥物的耐藥性,并對(duì)52株VRE和31株VSEfm進(jìn)行了毒力基因檢測,結(jié)果顯示三臺(tái)縣人民醫(yī)院腸球菌耐藥情況較嚴(yán)重,對(duì)20種常用抗菌藥物均不同程度耐藥,對(duì)青霉素類、大環(huán)內(nèi)酯類和喹諾酮類抗菌藥物的耐藥率最高,可能與這3類抗菌藥物作為臨床常用藥在臨床的長期使用有關(guān)。萬古霉素常被用于治療革蘭陽性菌感染,但由于VRE的出現(xiàn)使患者感染率迅速上升,給臨床治療帶來巨大困擾。更為嚴(yán)重的是,VRE還可以將耐藥基因水平傳遞給毒力更強(qiáng)的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistantStaphylococcus aureus,MRSA),導(dǎo)致萬古霉素耐藥金黃色葡萄球菌(vancomycin resistantStaphylococcus aureus,VRSA)的出現(xiàn),VRSA的出現(xiàn)和傳播,會(huì)給革蘭陽性菌的抗感染治療帶來更大的困難。本研究485株屎腸球菌和404株糞腸球菌中,分別有9.7%(47/485)和1.2%(5/404)為VRE,VRE分離率明顯高于既往研究[6-7]。另外,本研究檢出對(duì)治療VRE的首選藥物利奈唑胺的耐藥菌株,提示臨床應(yīng)加大規(guī)范、合理使用抗菌藥物的力度。
有研究結(jié)果顯示,屎腸球菌的耐藥性及獲得耐藥的能力均比糞腸球菌強(qiáng)[6-9]。本研究中,屎腸球菌大多對(duì)紅霉素、青霉素、苯唑西林、氨芐西林、環(huán)丙沙星和左氧氟沙星耐藥,糞腸球菌大多對(duì)克林霉素、苯唑西林、奎奴普丁-達(dá)福普丁和四環(huán)素耐藥;屎腸球菌對(duì)阿莫西林、氨芐西林、氨芐西林-舒巴坦、呋喃妥因、環(huán)丙沙星、莫西沙星、苯唑西林、萬古霉素和左氧氟沙星的耐藥率高于糞腸球菌,對(duì)苯唑西林、克林霉素、奎奴普丁/達(dá)福普丁和四環(huán)素的耐藥率則低于糞腸球菌,且VREfm比VREfs多,與相關(guān)報(bào)道[6,10]基本一致。2種VRE的耐藥率和耐藥譜不同,提示這2種菌株所面對(duì)的環(huán)境壓力可能不同,或者有可能在面對(duì)同樣的抗菌藥物選擇壓力時(shí),2種VRE選擇了不同的進(jìn)化方向。這也提示我們在臨床微生物檢驗(yàn)中需將腸球菌鑒定到種,臨床在腸球菌感染的治療過程中應(yīng)有針對(duì)性地區(qū)別用藥??傊?,長期進(jìn)行腸球菌耐藥性的監(jiān)測,觀察其分布特點(diǎn),分析其耐藥變化,對(duì)腸球菌感染的防控十分必要。
細(xì)菌耐藥性增強(qiáng)導(dǎo)致感染治療難度加大,毒力的獲得使細(xì)菌更容易在宿主體內(nèi)定植,使得近年來患者腸球菌感染率、病死率呈明顯上升趨勢。FERNANDES等[11]的研究結(jié)果表明,107株腸球菌中沒有1株是完全沒有毒力基因的分離株。本研究中,VREfm和VSEfm相比,毒力基因esp、acm和hyl的檢出率明顯升高(χ2=28.157、17.391、18.311,P<0.001)。52株VRE均表現(xiàn)為攜帶多種毒力基因,糞腸球菌全部攜帶3種及以上毒力基因,屎腸球菌攜帶3種及以上毒力基因的菌株所占比例高達(dá)89.36%(42/47)。提示三臺(tái)縣人民醫(yī)院腸球菌也已向同時(shí)獲得耐藥性和毒力進(jìn)化,臨床應(yīng)加強(qiáng)防控。
細(xì)菌的致感染能力與其毒力呈高度正相關(guān),臨床上腸球菌所致感染中以糞腸球菌感染最為多見,其次為屎腸球菌。糞腸球菌的毒力因子更為明顯,或許可以解釋其在腸球菌感染中的主導(dǎo)作用[12]。但近年來,由于屎腸球菌毒力基因的獲得能力增強(qiáng)[13]導(dǎo)致其致病力增強(qiáng),從而使得屎腸球菌感染率上升[1]。本研究中,屎腸球菌和糞腸球菌的感染率沒有顯著差異,似乎也印證了這一現(xiàn)象。另外,2種VRE攜帶的毒力基因類型都主要是esp、acm、hyl和efaA,且都表現(xiàn)為多基因攜帶,屎腸球菌3種及以上基因攜帶率為100%(5/5),糞腸球菌為89.36%(42/47)。由于本研究VREfs僅有5株,兩者間的毒力基因攜帶率差異可能被高估,提示2種VRE的毒力基因攜帶率、毒力基因攜帶數(shù)目與類型差異可能不大,表明屎腸球菌的毒力特征越來越明顯,原因可能是屎腸球菌在不斷進(jìn)化的過程中可以從外界攝取新的基因,形成新的毒力。建議密切觀察屎腸球菌毒力基因的獲得情況,重視其致病能力的增強(qiáng),為臨床治療提供參考。