楊文靜, 呂麗華, 姚嘉怡, 王 皓, 張春燕, 王蓓麗, 潘柏申, 郭 瑋
(1.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院檢驗(yàn)科,上海 200032;2.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院廈門醫(yī)院檢驗(yàn)科,福建 廈門 361015)
外泌體是由多種細(xì)胞分泌的、粒徑為30~150 nm的小膜泡,存在于血液、尿液、腦脊液、唾液和乳汁等體液中。外泌體內(nèi)容物廣泛,包括蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和核酸[DNA、mRNA、微小RNA(microRNA,miRNA)、環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)等][1]。circRNA是一類以共價(jià)封閉環(huán)為特征,無5'和3'末端頭尾結(jié)構(gòu),廣泛存在于真核細(xì)胞中的特殊RNA分子,與多種人類疾病的發(fā)病機(jī)制相關(guān)[2]。LI等[3]的研究結(jié)果顯示,血漿外泌體中穩(wěn)定存在大量circRNA。本文對(duì)外泌體來源的circRNA在腫瘤中的生物學(xué)功能,及其作為腫瘤早期診斷和預(yù)后評(píng)估標(biāo)志物的潛在應(yīng)用作一綜述。
外泌體最早于1983年在綿羊網(wǎng)織紅細(xì)胞中被發(fā)現(xiàn),1989年由Johnstone命名。外泌體的形成是一個(gè)連續(xù)性的過程,主要包括內(nèi)吞、融合和外排,即膜內(nèi)陷形成動(dòng)態(tài)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的多囊體,多囊體有2種結(jié)局:(1)與溶酶體融合,其內(nèi)的管腔狀囊泡發(fā)生降解;(2)與細(xì)胞膜融合,其內(nèi)的管腔狀囊泡再次凹陷,以內(nèi)出芽方式形成顆粒狀小囊泡,并被釋放入細(xì)胞外環(huán)境,即外泌體[4]。
外泌體的主要功能是在生理和病理?xiàng)l件下通過其內(nèi)容物介導(dǎo)細(xì)胞間通信。另外,外泌體在凝血、抗原提呈、免疫調(diào)節(jié)和病毒復(fù)制等方面也發(fā)揮了一定作用。外泌體內(nèi)容物,如蛋白質(zhì)、mRNA、miRNA等被證實(shí)可在受體細(xì)胞中起作用,從而激活多種信號(hào)通路[5]。腫瘤細(xì)胞可比正常細(xì)胞分泌更多的外泌體,且內(nèi)容物有一定差異,腫瘤細(xì)胞來源的外泌體可為腫瘤的發(fā)展提供合適的微環(huán)境,如細(xì)胞增殖、血管生成和轉(zhuǎn)移、耐藥及轉(zhuǎn)移前微環(huán)境的形成[6]。
circRNA和線性RNA都起源于前體mRNA,但是與經(jīng)典剪接產(chǎn)生的線性RNA相反,circRNA通常是通過反向剪接形成的。circRNA源自基因組的所有區(qū)域,包括基因間、內(nèi)含子、反義和非翻譯區(qū)。根據(jù)其來源,circRNA可分為三大類:外顯子circRNA、外顯子-內(nèi)含子circRNA和環(huán)狀內(nèi)含子RNA。由于circRNA具有共價(jià)閉環(huán)的特殊化學(xué)結(jié)構(gòu),因此不易被核酸外切酶降解,比線性RNA更穩(wěn)定[2]。
circRNA起初被認(rèn)為是由剪接錯(cuò)誤而產(chǎn)生的無功能的副產(chǎn)物。隨著高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)研究的發(fā)展,在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)大量circRNA,充分表明其具有結(jié)構(gòu)穩(wěn)定、高度保守、表達(dá)量豐富的特征[7]。circRNA的主要生物學(xué)功能包括:(1)競爭性結(jié)合miRNA,調(diào)控靶基因表達(dá);(2)與RNA結(jié)合蛋白相互作用,調(diào)控基因表達(dá);(3)調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄或剪接;(4)翻譯蛋白質(zhì);(5)調(diào)節(jié)表觀遺傳。有研究結(jié)果顯示,circRNA與多種人類疾病的發(fā)病機(jī)制相關(guān),包括神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心血管疾病、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和糖尿病等。circRNA在腫瘤生長、轉(zhuǎn)移、干性和治療抗性中起關(guān)鍵作用,可作為癌癥診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物[8]。
外泌體參與了腫瘤轉(zhuǎn)移前微環(huán)境和腫瘤微環(huán)境的形成。另外,通過介導(dǎo)免疫抑制和免疫監(jiān)視,外泌體與腫瘤復(fù)發(fā)和腫瘤細(xì)胞的存活相關(guān)[9]。LI等[3]發(fā)現(xiàn)多種癌細(xì)胞系(結(jié)腸癌、肺癌、胃癌、乳腺癌和宮頸癌)衍生的外泌體中穩(wěn)定存在著大量circRNA,并可在患者血清、尿液和腫瘤組織中被檢測到。已有大量研究證實(shí)circRNA可能與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有關(guān),可調(diào)控細(xì)胞增殖、腫瘤轉(zhuǎn)移以及化療藥物耐藥,見表1。
增殖失調(diào)是腫瘤轉(zhuǎn)化中重要的因素之一,因此細(xì)胞周期的調(diào)控機(jī)制日益受到關(guān)注。近年來,越來越多的外泌體circRNA在各類癌癥中調(diào)控腫瘤細(xì)胞增殖的作用被揭示。如:外泌體來源的circRASSF2可促進(jìn)喉鱗狀細(xì)胞癌的進(jìn)展,與對(duì)照組相比,在腫瘤組織中circRASSF2的表達(dá)顯著且持續(xù)增加,下調(diào)外泌體circRASSF2通過miRNA-302b-3p/IGF-1R軸可顯著抑制細(xì)胞增殖[10]。
長期暴露于亞砷酸鹽會(huì)誘導(dǎo)人肝上皮細(xì)胞(L-02)發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化,并引起circ_100284過度表達(dá),circ_100284可能會(huì)通過外泌體從轉(zhuǎn)化的L-02細(xì)胞轉(zhuǎn)移到正常細(xì)胞中。在正常細(xì)胞中,外泌體circ_100284通過與miRNA-217相互作用,加速了細(xì)胞周期并促進(jìn)細(xì)胞增殖。這表明外泌體circRNA在細(xì)胞間的通信中起信使的作用,并提示了亞砷酸鹽誘導(dǎo)的致癌機(jī)制[32]。外泌體circDB在高體脂率的肝細(xì)胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者中上調(diào),脂肪細(xì)胞分泌的外泌體circDB可通過抑制miRNA-34a并激活USP7/Cyclin A2信號(hào)通路,調(diào)節(jié)HCC中的去泛素化,從而促進(jìn)細(xì)胞生長并減少DNA損傷[11]。
在結(jié)直腸癌中,circIFT80通過進(jìn)入外泌體促進(jìn)結(jié)直腸癌的發(fā)展,通過miRNA-1236-3p/HOXB7軸,促進(jìn)DNA合成和抑制細(xì)胞凋亡[12]。結(jié)直腸癌患者血清外泌體中circFMN2呈高表達(dá)并與miRNA-1182水平呈負(fù)相關(guān),circFMN2與miRNA-1182結(jié)合可顯著促進(jìn)結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖,這提示外泌體circFMN2在促進(jìn)結(jié)直腸癌腫瘤生長中起重要作用[13]。
此外,外泌體來源的circNRIP1作為miRNA-149-5p的海綿,可影響AKT1/mTOR信號(hào)通路,并促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖[14];外泌體來源的circ_0044516作為miRNA-29a-3p海綿,可促進(jìn)前 列腺癌細(xì)胞增殖[15]。
表1 外泌體來源的circRNA在腫瘤中的生物學(xué)功能
外泌體可介導(dǎo)原發(fā)性腫瘤部位和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移部位之間的分子通訊及物質(zhì)轉(zhuǎn)移,通過調(diào)節(jié)包括上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)在內(nèi)的一系列細(xì)胞活動(dòng),外泌體在腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲中起重要作用[33]。
WANG等[16]發(fā)現(xiàn)外泌體circPTGR1有助于HCC的轉(zhuǎn)移,circPTGR1的高表達(dá)與臨床分期和預(yù)后有關(guān),敲除外泌體circPTGR1的表達(dá)顯著抑制了腫瘤在非轉(zhuǎn)移和低轉(zhuǎn)移細(xì)胞系中的侵襲和轉(zhuǎn)移。外泌體circPTGR1還可與MET相互作用,靶向競爭miRNA449a,從而導(dǎo)致腫瘤微環(huán)境失調(diào),并促進(jìn)HCC的發(fā)展。外泌體circ_100338參與了HCC中血管生成和轉(zhuǎn)移的調(diào)控,與HCC的進(jìn)展密切相關(guān)[17]。此外,過表達(dá)circCdr1as的HCC細(xì)胞可通過外泌體的傳遞加速周圍正常細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移能力[18]。
外泌體circRNA與胃癌的相關(guān)研究結(jié)果顯示,circNRIP1可通過外泌體在胃癌細(xì)胞之間傳遞,并作為miRNA-149-5p海綿影響Akt1/mTOR信號(hào)通路,從而促進(jìn)胃癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移[14]。circRanGAP1在胃癌患者癌組織和血漿外泌體中均顯著上調(diào),該分子通過miRNA-877-3p/VEGFA軸可增強(qiáng)胃癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲能力[19]。最新的研究結(jié)果[20]顯示,來自胃癌細(xì)胞的外泌體將ciRS-133傳遞到前脂肪細(xì)胞中,通過激活PRDM16和抑制miRNA-133來促進(jìn)前脂肪細(xì)胞向褐色樣細(xì)胞分化;進(jìn)一步敲低ciRS-133可使小鼠的癌癥惡病質(zhì)明顯減少,提示外泌體傳遞的ciRS-133參與了白色脂肪組織褐變并在癌癥相關(guān)惡病質(zhì)中起關(guān)鍵作用。
某些外泌體circRNA的表達(dá)在胰腺癌的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中起重要作用。LI等[21]發(fā)現(xiàn)外泌體circPED8A在胰腺癌組織中呈高表達(dá),且與淋巴管浸潤、TNM分期和低生存率有關(guān),circPDE8A可通過上調(diào)MET(上皮性腫瘤的關(guān)鍵癌基因之一)來促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的生長。此外,腫瘤細(xì)胞分泌的circPDE8A可通過外泌體被釋放到血液循環(huán)中,作為miRNA-338海綿調(diào)節(jié)MACC1,并通過MET/絲裂原活化蛋白激酶1(mitogenactivated protein kinase 1,MAPK1)或蛋白激酶B途徑促進(jìn)侵襲性轉(zhuǎn)移。此外,還有學(xué)者[22]發(fā)現(xiàn)由胰腺癌細(xì)胞分泌的外泌體中的circIARS在胰腺癌組織中廣泛表達(dá),其表達(dá)水平與肝轉(zhuǎn)移、血管侵犯和TNM分期呈正相關(guān)(肝轉(zhuǎn)移:P=0.011;血管侵犯:P=0.020;TNM:P=0.023)。CircIARS可通過衍生自胰腺癌細(xì)胞的外泌體進(jìn)入人微血管靜脈內(nèi)皮細(xì)胞,下調(diào)miRNA-122和緊密連接蛋白-1(zonula occludens 1,ZO-1)的水平,上調(diào)RhoA和RhoA-GTP的水平,增加F-肌動(dòng)蛋白的表達(dá)和黏著斑,使內(nèi)皮單層通透性增加,促進(jìn)腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移。
CHEN等[23]分離了膀胱尿路上皮癌患者血清和尿液中的外泌體,結(jié)果顯示,這些外泌體中的circPRMT5均顯著上調(diào),circPRMT5可充當(dāng)miRNA-30c海綿,通過circPRMT5/miRNA-30c/SNAIL1/E-鈣黏蛋白1途徑促進(jìn)EMT。有研究結(jié)果顯示,血清和尿液外泌體中高表達(dá)的circPRMT5與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和晚期腫瘤進(jìn)展呈正相關(guān)(P<0.05)。在卵巢癌中,外泌體通過轉(zhuǎn)移circPUM1和circWHSC1,作用于腹膜間皮細(xì)胞,從而促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移[24-25]。除此之外,結(jié)直腸癌[12,26]、膽管癌[27]相關(guān)研究也發(fā)現(xiàn)了外泌體circRNA促進(jìn)腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移的作用。
對(duì)化療藥物耐藥是腫瘤治療的巨大障礙。有研究結(jié)果顯示,外泌體可在癌細(xì)胞之間傳遞耐藥性[34],其內(nèi)容物circRNA在化療耐藥傳遞中的重要作用也逐漸被揭示。LI等[28]的研究結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,小細(xì)胞肺癌組血清外泌體FLI1外顯子circRNA(FECR1)異常上調(diào),且與患者低生存率相關(guān)。circCdr1as參與了卵巢癌順鉑耐藥的形成,作為miRNA海綿下調(diào)miRNA-1270,而SCAI是miRNA-1270的靶基因,可增強(qiáng)卵巢癌細(xì)胞對(duì)順鉑的敏感性。順鉑耐藥組的血清外泌體circCdr1as與順鉑敏感組相比異常下調(diào),且circCdr1as的表達(dá)水平與miRNA-1270的表達(dá)水平呈顯著負(fù)相關(guān)(r=-0.679,P=0.000)[29]。由此可見,外泌體circRNA失調(diào)與化療藥物耐藥之間可能存在一定的聯(lián)系。
外泌體circRNA在調(diào)節(jié)化療藥物耐藥中發(fā)揮著重要作用。circ_0000338是來自FCHSD2基因的circRNA,該基因參與編碼內(nèi)吞作用和膜受體內(nèi)在化的蛋白質(zhì)。circ_0000338通過耐奧沙利鉑HCT116細(xì)胞系(HCT116-R)分泌的外泌體選擇性轉(zhuǎn)移到共培養(yǎng)的親本HCT116細(xì)胞系(HCT116-P)后,與對(duì)照細(xì)胞相比,HCT116-P細(xì)胞在藥物治療中的生存力顯著提高[30]。外泌體中circ_0000338上調(diào)可作為早期預(yù)測結(jié)直腸癌化療藥物耐藥性的潛在生物標(biāo)志物[30]。
惡性腫瘤通常依靠有氧糖酵解來產(chǎn)生三磷酸腺苷,以實(shí)現(xiàn)快速生長和化療藥物的耐藥性。M2-PK在催化糖酵解中起關(guān)鍵作用。有研究結(jié)果顯示,M2-PK在結(jié)直腸癌細(xì)胞中的表達(dá)有異質(zhì)性,即在耐奧沙利鉑的結(jié)直腸癌細(xì)胞中較高,在奧沙利鉑敏感的細(xì)胞中相對(duì)較低。miRNA-122與化學(xué)抗性呈正相關(guān),耐奧沙利鉑細(xì)胞的外泌體將ciRS-122傳遞至敏感細(xì)胞,通過吸附miRNA-122和上調(diào)M2-PK來促進(jìn)糖酵解和耐藥性,這種細(xì)胞間的信號(hào)傳遞可提示潛在的新型治療靶點(diǎn),并為外泌體在耐藥性結(jié)直腸癌中的臨床應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)[31]。
circRNA在外泌體中富集并具有良好的穩(wěn)定性,可從人血清、尿液等體液中檢測到。腫瘤患者體內(nèi)外泌體circRNA的表達(dá)譜與健康人群有一定區(qū)別[9]。因此,外泌體circRNA具有極大的潛力作為某些腫瘤非侵入性早期診斷和預(yù)后評(píng)估的分子標(biāo)志物。
與含有野生型和G13D突變體KRAS等位基因細(xì)胞系(DLD-1)和K-ras突變型結(jié)直腸癌細(xì)胞(DKO-1)相比,K-ras野生型結(jié)直腸癌細(xì)胞DKs-8中外泌體circRNA水平顯著上調(diào),提示外泌體circRNA或可作為結(jié)直腸癌的生物標(biāo)志物[35]。有研究結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,不同TNM分期的結(jié)直腸癌患者血清外泌體circ_0004771均顯著上調(diào)(P=0.017),circ_0004771診斷結(jié)直腸癌的曲線下面積(area under curve,AUC)為0.88,敏感性為80.91%,特異性為82.86%;Ⅰ~Ⅱ期結(jié)直腸癌患者血清外泌體circ_0004771顯著高于正常對(duì)照組(P<0.001),且診斷Ⅰ~Ⅱ期結(jié)直腸癌的AUC為0.86,敏感性為81.43%,特異性為80.00%[36]。BARBAGALLO等[37]發(fā)現(xiàn),結(jié)直腸癌患者血清外泌體circHIPK3顯著上調(diào),診斷結(jié)直腸癌的AUC為0.771,敏感性為71%,特異性為80%。SHAO等[38]發(fā)現(xiàn),早期胃癌(early gastric cancer,EGC)患者血漿外泌體circ_0065149顯著低于健康對(duì)照者(P<0.001),篩查EGC的AUC為0.64,敏感性(48.7%)和特異性(90.2%)均高于傳統(tǒng)的腫瘤標(biāo)志物(癌胚抗原、糖類抗原19-9和糖類抗原125)。另外,外泌體來源的circ_0051443表達(dá)在HCC患者血漿中下調(diào),可抑制HCC的進(jìn)展,其診斷HCC的AUC為0.808 9[39]。
LI等[28]發(fā)現(xiàn),小細(xì)胞肺癌患者血清外泌體FECR1異常上調(diào),發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的患者外泌體FECR1表達(dá)水平更高,且血清FECR1水平與小細(xì)胞肺癌患者的化療反應(yīng)密切相關(guān)。因此,F(xiàn)ECR1可作為評(píng)估小細(xì)胞肺癌進(jìn)展的生物標(biāo)志物。WANG等[40]發(fā)現(xiàn)肺腺癌患者血清外泌體circ_002178顯著上調(diào),通過吸附miRNA-34和miRNA-28-5p增強(qiáng)細(xì)胞程序性死亡配體1(programmed cell death ligand 1,PDL1)表達(dá),circ_002178可作為肺腺癌的非侵入性診斷標(biāo)志物,其AUC為0.996 7。CHEN等[41]全面分析了肺腺癌組和健康對(duì)照組血漿外泌體circRNA的表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)circ_0001492和circ_0001346的表達(dá)水平在早期肺腺癌中上調(diào),但在健康對(duì)照組的血漿外泌體中幾乎檢測不到,這提示circ_0001492和circ_0001346或可作為新型肺腺癌早期候選診斷標(biāo)志物。
有學(xué)者采用生物信息學(xué)分析和實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)發(fā)現(xiàn)circ_00005795和circ_0088088可能起競爭內(nèi)源性RNA的作用,通過對(duì)比乳腺癌患者和健康對(duì)照者血清外泌體circRNA的表達(dá),2種circRNA對(duì)乳腺癌均具有重要的診斷價(jià)值,為預(yù)測乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移提供了理論基礎(chǔ)[42-43]。除此之外,外泌體來源的circRNA對(duì)前列腺癌[15]、胰腺癌[21-22]、膀胱尿路上皮癌[23]、膽管癌[27]、子宮內(nèi)膜癌[44]、甲狀腺癌[45]、食管鱗狀細(xì)胞癌[46]等惡性腫瘤也有重要的診斷價(jià)值。這為尋找針對(duì)不同腫瘤的強(qiáng)有力的診斷標(biāo)志物提供了新的方向。盡管外泌體circRNA成為新型腫瘤標(biāo)志物的潛力巨大,但目前對(duì)外泌體circRNA的了解仍處于起步階段,而且大部分研究只是提出了新思路,這些分子是否可以成為腫瘤標(biāo)志物仍需要進(jìn)一步研究驗(yàn)證。circRNA在不同腫瘤中的應(yīng)用見表2。
表2 外泌體來源的circRNA在不同腫瘤中的應(yīng)用
續(xù)表2
外泌體circRNA可調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的增殖、轉(zhuǎn)移和耐藥,是腫瘤研究的新熱點(diǎn)。更重要的是,circRNA具有高度保守的特征和組織/發(fā)育特異性表達(dá)模式,可在外泌體中富集,能從體液中檢測到。因此,除了揭示腫瘤的發(fā)病機(jī)制外,探索外泌體和circRNA的聯(lián)系還有助于尋找新的潛在的腫瘤生物標(biāo)志物或治療靶點(diǎn)。目前,僅有少數(shù)circRNA具有確定的功能或臨床應(yīng)用價(jià)值。與mRNA和miRNA相比,我們對(duì)外泌體circRNA的認(rèn)識(shí)還是有限的:大量的外泌體circRNA及其作用機(jī)制尚未被發(fā)現(xiàn)和揭示;在現(xiàn)有的一些研究中,外泌體circRNA對(duì)不同腫瘤的診斷價(jià)值尚缺乏實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證;與循環(huán)游離circRNA相比,外泌體circRNA的優(yōu)勢也尚未被驗(yàn)證。因此,外泌體circRNA作為未來研究的熱點(diǎn)之一,其臨床應(yīng)用價(jià)值還需要有足夠的理論研究結(jié)果來支持。