劉春辰, 林慧嫻, 鄭 磊
(南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東 廣州 510515)
細(xì)胞外囊泡(extracellular vesicle,EV)是細(xì)胞分泌至胞外的一種含脂質(zhì)雙分子層的膜性囊泡,依據(jù)其形成機(jī)制與直徑差異,可分為外泌體、微囊泡與凋亡小體三大亞群,EV內(nèi)含特異性蛋白質(zhì)、活性核酸和脂質(zhì),有望成為揭示疾病發(fā)生機(jī)制和應(yīng)用于臨床診療領(lǐng)域的一種新型標(biāo)志物[1]。在機(jī)體中,EV以非均一膜性囊泡的結(jié)構(gòu)廣泛散在于各類(lèi)體液中,包括血漿、血清、唾液、乳汁和尿液等[2]。作為“液體活檢”的后起之秀,EV豐度遠(yuǎn)高于循環(huán)腫瘤細(xì)胞,且受膜形式的保護(hù),其內(nèi)容物穩(wěn)定性較好,克服了體液樣本中ctDNA易降解等弊端[3]。相對(duì)于組織病理檢查,基于血液等樣本的EV檢測(cè)具有無(wú)創(chuàng)、取樣簡(jiǎn)便等優(yōu)勢(shì),患者依從性更高,便于病情監(jiān)測(cè),易于及時(shí)調(diào)整治療方案;與傳統(tǒng)血清游離核酸與蛋白標(biāo)志物檢測(cè)相比,EV檢測(cè)具有靶向性顯著、信息量更豐富、檢測(cè)基質(zhì)干擾小等優(yōu)勢(shì)[4-5]。因此,EV對(duì)疾病的早期診斷和療效監(jiān)測(cè)有重要的臨床價(jià)值。本文對(duì)目前常用的EV分離富集和鑒定技術(shù),以及EV不同內(nèi)容物的檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)和臨床應(yīng)用進(jìn)行綜述。
基于EV大小、密度等物理性質(zhì)及其特有的蛋白質(zhì)生物學(xué)特性,去除體液樣本中雜質(zhì)蛋白、脂質(zhì)等復(fù)雜成分的干擾,實(shí)現(xiàn)EV的分離富集,是其內(nèi)容物準(zhǔn)確分析的前提。EV分離富集的回收率、純度及其活性直接影響著EV后續(xù)鑒定與內(nèi)容物檢測(cè)。目前EV常用的分離富集技術(shù)及其優(yōu)缺點(diǎn)見(jiàn)表1。超速離心法是目前被廣泛認(rèn)可的EV分離富集的金標(biāo)準(zhǔn)。TIAN等[6]對(duì)包括超速離心法在內(nèi)的尺寸排阻色譜法等6種EV分離富集技術(shù)進(jìn)行了EV純度與分離效率的綜合評(píng)估,證實(shí)超速離心法分離所得的EV純度最高,可有效用于后續(xù)內(nèi)容物的檢測(cè)和分析。
鑒于體液樣本成分的復(fù)雜性,體液樣本中存在許多干擾EV檢測(cè)的物質(zhì),包括某些蛋白質(zhì)和顆粒性組分,且部分雜質(zhì)在大小與密度上與EV存在重疊,如脂蛋白等,可能會(huì)與EV共分離。為保證EV的準(zhǔn)確檢測(cè),同時(shí)也為了保證不同研究結(jié)果的可信度與可重復(fù)性,有必要對(duì)分離出的EV進(jìn)行鑒定。依照國(guó)際細(xì)胞外囊泡協(xié)會(huì)(the International Society for Extracellular Vesicles,ISEV)發(fā)布的EV研究最低要求國(guó)際研究指南的要求,應(yīng)對(duì)EV進(jìn)行形態(tài)學(xué)特征、濃度、粒徑等非特異性鑒定和特定蛋白質(zhì)分子的特異性鑒定,可累加EV內(nèi)組分的拓?fù)滂b定[7],為后續(xù)EV的準(zhǔn)確檢測(cè)提供必要保障。具體鑒定技術(shù)見(jiàn)表1。
表1 EV常用的分離富集與鑒定技術(shù)及其優(yōu)缺點(diǎn)
EV可選擇性包裹活性核酸、蛋白質(zhì)和脂質(zhì),運(yùn)載眾多信號(hào)分子,經(jīng)胞膜直接融合、配體-受體特異性結(jié)合以及胞吞等方式與靶細(xì)胞結(jié)合,通過(guò)釋放其內(nèi)容物發(fā)揮特定的生物學(xué)作用。因此,EV內(nèi)容物的檢測(cè)和分析是剖析EV功能的關(guān)鍵環(huán)節(jié),對(duì)揭示EV在疾病中的具體作用機(jī)制及EV的臨床應(yīng)用具有重要意義。目前,基于EV的臨床診斷技術(shù)的開(kāi)發(fā)也大多聚焦于不同亞群特異性內(nèi)容物的檢測(cè),主要包括核酸、蛋白質(zhì),以及以脂質(zhì)為代表的代謝分子三大領(lǐng)域。
EV的核酸內(nèi)容物包括RNA[mRNA、微小RNA(microRNA,miRNA)和其他非編碼RNA等]及DNA[21],目前以RNA類(lèi)的研究居多,主要反映EV實(shí)行具體功能的轉(zhuǎn)錄及其調(diào)控層面的信息。
針對(duì)RNA類(lèi)內(nèi)容物,傳統(tǒng)的檢測(cè)技術(shù)包括瓊脂糖凝膠電泳、免疫印跡法、聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)(熒光定量PCR[22]、液滴式數(shù)字PCR[23])以及芯片技術(shù)、二代測(cè)序技術(shù)[22]等。其中芯片技術(shù)與測(cè)序技術(shù)適用于對(duì)樣本的RNA進(jìn)行高通量檢測(cè),主要用于疾病特異性標(biāo)志物的篩選。PCR的靈敏度高,但易發(fā)生偏性擴(kuò)增,應(yīng)避免因污染而產(chǎn)生的假陽(yáng)性現(xiàn)象;同時(shí),受引物合成技術(shù)的限制,PCR只能對(duì)已知序列的特定RNA進(jìn)行分析。
近年來(lái),一系列針對(duì)EV的RNA內(nèi)容物的新型檢測(cè)平臺(tái)被開(kāi)發(fā)出來(lái),檢測(cè)原理呈多樣化趨勢(shì),其中以熒光探針類(lèi)研究居多,融合了納米技術(shù)、微流控技術(shù),以及仿生學(xué)等不同學(xué)科的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。基于多色熒光PCR的EV-lncRNA分析芯片[24]和功能化金納米熒光探針[25]均可通過(guò)熒光直接實(shí)現(xiàn)對(duì)靶RNA的高效檢測(cè);其中功能化金納米熒光探針可實(shí)現(xiàn)外泌體miRNA-1246的原位檢測(cè),可區(qū)分乳腺癌人群與健康人群。部分平臺(tái)則先通過(guò)疾病相關(guān)的特異性蛋白分子對(duì)靶外泌體實(shí)現(xiàn)捕獲,再檢測(cè)其RNA內(nèi)容物,進(jìn)一步提高特異性。YANG等[26]設(shè)計(jì)的免疫生物芯片通過(guò)靜電作用將含分子信標(biāo)的陽(yáng)離子脂質(zhì)體與捕獲的外泌體融合,隨著分子信標(biāo)的注入實(shí)現(xiàn)miRNA-21和TTF-1 mRNA的高效檢測(cè),可用于肺癌診斷。近期有研究報(bào)道的匯集了仿生學(xué)優(yōu)勢(shì)的微流控芯片——NanoVilli芯片,可有效提升肺癌EV中RNA的檢測(cè)靈敏度和特異性[27]。以上EV核酸檢測(cè)技術(shù)的總結(jié)與應(yīng)用見(jiàn)表2。
EV富含蛋白質(zhì)類(lèi)標(biāo)志物,如熱休克蛋白、膜聯(lián)蛋白、整合蛋白、黏附分子、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)因子等[21]。蛋白質(zhì)作為生物學(xué)功能的主要執(zhí)行者,其攜帶的翻譯后分子水平信息,相對(duì)于核酸攜帶的轉(zhuǎn)錄水平信息,更契合EV的功能狀態(tài),并可更直接地反映這一狀態(tài)。
傳統(tǒng)的檢測(cè)方法,如免疫印跡法[28]、ELISA[29]、流式細(xì)胞術(shù)[30]及質(zhì)譜[31]等可對(duì)EV中的蛋白質(zhì)類(lèi)內(nèi)容物進(jìn)行定性和/或定量檢測(cè)。免疫印跡法和ELISA基于抗原-抗體特異性結(jié)合的原理,特異性好,但其受抗體制備技術(shù)的限制,且針對(duì)的僅是樣本總蛋白層面的特定蛋白分子;傳統(tǒng)的流式細(xì)胞術(shù)無(wú)法對(duì)小于200 nm的粒子進(jìn)行分析,限制了流式分析的在EV檢測(cè)中的應(yīng)用。近年來(lái),傳統(tǒng)流式細(xì)胞術(shù)的改進(jìn)[32]和高敏流式細(xì)胞術(shù)[33]的出現(xiàn),大大提高了儀器的檢測(cè)性能,使單個(gè)EV水平的多參數(shù)分析成為可能。質(zhì)譜[20]作為一種高通量技術(shù),可同時(shí)檢測(cè)EV的多種蛋白質(zhì)標(biāo)志物,具有靈敏度高、分析速度快等優(yōu)勢(shì)。
蛋白質(zhì)標(biāo)志物作為剖析EV功能的重要組分,對(duì)其檢測(cè)的靈敏度、特異性及臨床有效性要求日益提升。近年來(lái),不同原理的新技術(shù)平臺(tái)逐漸被應(yīng)用于EV的蛋白質(zhì)檢測(cè)中,并逐步用于臨床疾病的診療、病情監(jiān)測(cè)及預(yù)后評(píng)估等。陳賢華等[34]構(gòu)建的外泌體雙膜蛋白共表達(dá)檢測(cè)平臺(tái),先用修飾有CD63抗體的磁珠實(shí)現(xiàn)外泌體的捕獲,再聯(lián)合適配體特異性結(jié)合與發(fā)夾催化自組裝信號(hào)放大技術(shù)(catalytic hairpin assembly,CHA)實(shí)現(xiàn)外泌體膜上的CD63和上皮細(xì)胞黏附分子(epithelial cell adhesion molecule,EpCAM)2種蛋白質(zhì)標(biāo)志物的同時(shí)檢測(cè),可用于區(qū)分乳腺癌來(lái)源和正常乳腺上皮來(lái)源的外泌體。LIU等[35]報(bào)道了一種新技術(shù)——液滴數(shù)字外泌體酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(exosome-counting enzyme-linked immunosobent assay,ExoELISA),該技術(shù)通過(guò)抗原-抗體特異性結(jié)合原理捕獲表達(dá)磷脂?;嫉鞍拙厶?1(glypican-1,GPC-1)的外泌體,并形成酶促分子標(biāo)記的ELISA夾心復(fù)合物,固定于磁性微珠上,最后將其包裹進(jìn)液滴中,實(shí)現(xiàn)了對(duì)靶外泌體的絕對(duì)定量。此外,集適體結(jié)合與滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)于一體的熒光生物傳感平臺(tái)[36]、融合了聲學(xué)傳感優(yōu)勢(shì)的納米金標(biāo)記放大表面聲波(surface acoustic wave,SAW)傳感器[37],以及電化學(xué)領(lǐng)域的Aptasensor[38]、微流控領(lǐng)域的Exodisc-B/P[39]等技術(shù),在檢測(cè)EV的靈敏度與特異性方面均有明顯提升,部分檢測(cè)平臺(tái)已可用于疾病的診斷、預(yù)后評(píng)估等。以上新技術(shù)的總結(jié)見(jiàn)表2。
除活性核酸與蛋白質(zhì)外,EV中還含有以脂質(zhì)為代表的一系列代謝分子,包括膽固醇、神經(jīng)酰胺、磷脂酰絲氨酸(phosphatidylserine,PS)等[21]。目前,針對(duì)脂質(zhì)的檢測(cè)方法相對(duì)較少,主要為脂質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)方法,如全反射傅里葉變換紅外光譜[40]、熒光測(cè)定法(使用DiR等親脂性熒光染料)[41]、薄層色譜法、高效液相色譜法及高通量質(zhì)譜[42]等。SMITH等[43]利用拉曼光譜以及主成分分析技術(shù)發(fā)現(xiàn)癌性與非癌性細(xì)胞系衍生的外泌體在膽固醇與磷脂的相對(duì)表達(dá)上存在差異,提示外泌體中的脂質(zhì)有成為腫瘤標(biāo)志物的潛力[43]。還有研究者通過(guò)高通量質(zhì)譜技術(shù)對(duì)前列腺癌患者及健康人尿液樣本中的外泌體脂質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)PS(18:1/18:1)與乳糖神經(jīng)酰胺(lactosylceramide,LacCer)(d18:1/16:0)等9種脂質(zhì)水平存在差異,其中LacCer(d18:1/16:0) /PS(18:1/18:1)比值與PS(18:0-18:2)/PS(18:1/18:1)比值聯(lián)合檢測(cè)區(qū)分前列腺癌患者與健康人的敏感性為93%、特異性為100%[42]。相關(guān)檢測(cè)技術(shù)及其應(yīng)用見(jiàn)表2。
表2 EV內(nèi)容物檢測(cè)新技術(shù)
EV作為一種蘊(yùn)含豐富生物信息的循環(huán)標(biāo)志物,廣泛散布于各類(lèi)體液中,且受脂質(zhì)雙分子膜的保護(hù),內(nèi)容物穩(wěn)定,因此在豐度以及穩(wěn)定性上具有明顯優(yōu)勢(shì),在疾病的早期診斷、病情動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)及預(yù)后評(píng)估等方面均具有巨大的應(yīng)用前景。近年來(lái),各類(lèi)新型檢測(cè)平臺(tái)的不斷被開(kāi)發(fā)出來(lái),在靈敏度、特異性及檢測(cè)時(shí)間上的性能均明顯提升,對(duì)EV內(nèi)容物(核酸、蛋白質(zhì)與脂質(zhì)等)有了更深入的研究,并開(kāi)始關(guān)注單個(gè)EV水平的檢測(cè),突出其異質(zhì)性,這有利于對(duì)EV進(jìn)行更深入、更精準(zhǔn)的功能分析,進(jìn)一步推動(dòng)EV的臨床應(yīng)用進(jìn)程。然而,目前仍存在許多復(fù)雜因素,使EV檢測(cè)應(yīng)用于臨床疾病的精準(zhǔn)診療面臨諸多挑戰(zhàn),如EV在樣本采集及保存過(guò)程中是否存在影響其檢測(cè)結(jié)果的因素尚不得而知,檢測(cè)的靈敏度、特異性、經(jīng)濟(jì)成本等方面如何平衡亦值得思考。此外,EV檢測(cè)技術(shù)尚缺乏統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)操作指南,臨床統(tǒng)一的參考區(qū)間仍處于空白,質(zhì)量控制體系亦不完善,各平臺(tái)的檢測(cè)結(jié)果難以進(jìn)行橫向比對(duì),結(jié)果溯源鏈缺乏,這些問(wèn)題均限制了EV的臨床應(yīng)用。未來(lái),研究者們應(yīng)致力于充分發(fā)揮聲學(xué)、光學(xué)、電磁學(xué)、機(jī)械自動(dòng)化以及納米技術(shù)等多學(xué)科優(yōu)勢(shì),促進(jìn)EV檢測(cè)平臺(tái)向微型化、自動(dòng)化和便捷化發(fā)展,同時(shí)完善EV的質(zhì)量控制體系,加快相應(yīng)參考區(qū)間的建立,以加速推進(jìn)EV檢測(cè)的臨床應(yīng)用進(jìn)程。